BIO1502/1403 Proteins in the cell Μοριακές Σαπερόνες Τάσος Οικονόµου http://ecoserver.imbb.forth.gr/teaching502.html Το κεντρικο δογµα της Βιολογιας Mεταφράζω = πολυµερίζω αµινοξεα απο ΝH2 προς COOH καθως διαβαζω mRNA κατά τη φορά 5' -> 3' Το ριβοσωµα σε ωρα δουλειας Θέση Δέσµευσης Ριβοσώµατος ή Ribosome Βinding Site ή Aλληλουχία Shine-Dalgarno συνήθως: AGGAGGU ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΑΣΗ ΠΕΡΙΟΧΗΣ SHINE-DALGARNO ΜΕ ΡΙΒΟΣΩΜΑ 5'-X XX AG G A G G G A U U C 3 ' OH A UUCCUC XXXX CAC 30S 16S RNA XXAUGX XX...- 3' mRNA Μεταφραση Μεταφραση δες CD-ROM Μεταφραση Ο γενετικος κωδικας Δοµή πρωτεινών (πρωτοταγης) NH2-Ala-Leu-Arg-Phe-Gly-Asp-AspGlu-Arg-Met etc.------COOH Πεπτιδικος δεσµος Δοµή πρωτεινών (δευτεροταγης) α-ελικα/α-ελικα Δοµή πρωτεινών (τριτοταγης) M. genitalium Γονίδιο 1 Γονίδιο 2 Γονίδιο 3 mRNA 1 mRNA 2 mRNA 3 Πολυπεπτίδιο 1 Πολυπεπτίδιο 2 Πολυπεπτίδιο 3 Πρωτο+ δευτεροταγής δοµή Τριτοταγής δοµή-Aναδίπλωση τροποποιήσεις Υποκυτταρική στόχευση κ ή Mη χ α ν ή Mο ρ ι α ή Πο λ υ µ ε ρ ι κ ό Eν ζ υ µ ο εν έ ρ γ ε ι α Tεταρτοταγής δοµή ζω ή θε ρ µ ό τ η τ α Tεταρτοταγής δοµή Excluded volume Tι εί ν α ι το κύ τ τ α ρ ο ? …ενα In t e r a c t o m e Mo l e c u l a r Cr o w d i n g Πως αποκταει η νεογεννητη πρωτεινη την εγγενη της δοµη? Αναδίπλωση ή συσσωµάτωση Συσσωµάτωση µέσω Διαµοριακών επαφών Ενεργειακά τοπία Ιδανικά οµαλό Ενεργειακό Ελάχιστο= Εγγενής µορφή Αδρό µε κινητικές παγίδες Αναδιπλωση πρωτεινών µε βοηθεια σαπερονων Αναδιπλωση πρωτεινών µε βοηθεια σαπερονων Αναδιπλωση in vivo Η ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΤΟΥ ΘΕΡΜΙΚΟΥ ΠΛΗΓΜΑΤΟΣ 42οC 37οC DnaK σ32 σ32 DnaK DnaK πρωτεάση RNA πολ σ32 DnaK πρωτεάση σ32 σ32 σ32 σ32 DNA dnaK DNA σ32 σ32 σ32 σ32 DnaK DnaK πρωτεάση DnaK πρωτεάση DnaK DnaK DnaK πρωτεάση πρωτεάση Αναδιπλωση θερµοευαισθητων πρωτεινων Οι σαπερονίνες H σαπερονη-GroEL-ES Top view into the cavity of the top ring. The domain rotation caused by nucleotide binding continues into the large movement accompanying GroES binding. Bottom view. Different pattern of movement in the lower ring. The upper ring (at the back of the images) performs a continuous twisting motion, but the lower ring opens and shuts with radial movements of the domains in addition to the twisting. H σαπερονη-GroEL-ES Oι σαπερόνες Hsp70-Hsp90 Oι σαπερόνη Hsp70 Oι σαπερόνη Hsp70 Oι σαπερόνη Hsp70 Energy-independent chaperones:! The SecB protein! (Xu et al., 2000 NatStructBiol)!
© Copyright 2024 Paperzz
