天然物化学

NP1
天然物化学
天然物の定義:生物(主に植物)由来の(有機)化合物
一次代謝産物:生体の各組織を構成、エネルギー源
タンパク質、アミノ酸、炭水化物、脂質、核酸(生化学で扱う)
二次代謝産物:情報伝達、調節など(天然物化学でも扱う)
性質
生体機能調節(ホルモン、ビタミン、、、、)
情報伝達(フェロモン)
毒(薬)
香料:バニリン、リモネン、メントール、、、
色素:カロテノイド、フラボノイド、、
分類
1.脂肪酸、ポリケチドの誘導体:プロスタグランジン、マクロライド
O
R1O
HO
COOH
HO
OR2
O
OH
O
O
プロスタグランジンE2
HO
エリトロマイシンA
C2H5
HO
2.イソプレノイド:テルペノイド、ステロイド、カロテノイド
リモネン
2
β-カロテン
コレステロール
HO
3.芳香族化合物
バニリン、サリチル酸、桂皮酸、フラボノイド、、、
OH
HO
COOH
CHO
HO
O
CH3O
OH
OGlu
バニリン
OGlu
桂皮酸
シアニン(Glu: Glucose)
4.含窒素化合物(アルカロイド)
エフェドリン、ニコチン、キニン、モルフィン、、、、
H3C
OH
NHCH3
CH3
エフェドリン
N
N
COOCH3
N
H CH3
ニコチン
O
HO
H
N
O
コカイン
N
キニン
NP2
5.ビタミン(補酵素の原料)
構造の特徴を中心に概要を紹介する
**(参考)生合成の流れ
一次代謝産物
二酸化炭素→(植物)→糖、アミノ酸、脂肪酸の原料(acetyl CoA)など→
(動植物)→炭水化物、タンパク質、脂質、核酸など
二次代謝産物
一次代謝産物→多種多様な化合物
1.脂肪酸、ポリケチドの誘導体
1.1.脂肪酸の生合成
H3C
C
活性メチレン
CO2
SCoA
CH2 C
HOOC
O
SCoA
+
O
H3C
C
-CoAS-
SCoA
O
malonyl CoA
acetyl CoA
COOH
H3C
C
O
CH
C
SCoA
-CO2
O
還元
H3C
C
CH2 C
O
O
SCoA
malonyl CoA
acetoacetyl CoA
H3C
H2
C
malonyl CoA
CH2 C
ポリケチド
H3C
SCoA
H2
C
H2
C
C
SCoA
nO
O
炭素数は偶数
還元が不完全だとOHが残り、不飽和脂肪酸になる。
1.2.プロスタグランジン
アラキドン酸(C19H31COOH)から生合成される
COOH
アラキドン酸
O
COOH
HO
OH
PGE2
各種の細胞調節機能
安定性低い。体内では微量存在(役割を果たしたら分解される)。
1969年全合成(E.J.Corey、1990年ノーベル化学賞)
NP3
COOH
種類
プロスタン酸(基本骨格)
鎖状部
環状部
HO
O
O
O
OH
HO
O
O
A
B
C
O
O
HO
D
E
HO
Fα
COOH
COOH
OH
O
OH
1
B
J
A
COOH
トロンボキサン
(TX)
3
OH
2
O
HO
1.3.ポリケチド誘導体
脂肪酸合成の途中で生成したケトンを還元せず、炭素鎖を伸ばす。
malonyl CoA
H3C
C
CH2 C
O
O
H3C
SCoA
-CoAS-
H2
C
C
H
C
H
SCoA
nO
マクロライド系
抗生物質
n
n
大環状ラクトン
(分子内エステル)
(3.芳香族化合物)
O
OR3
R1O
HO
OR2
12
14 R
O
O
OR1
C2H5 R O
C
polyketide
OH
HO
H2
C
O
acetoacetyl CoA
H
C
C
HO
メチマイシン
OAc
O
OHC
O
OCH3
16
O
O
R
C2H5
HO
OH
ロイコマイシンA3
エリトロマイシンA
(malonylCoAのCOOHを脱炭酸せずに還元するとCH3になる)
OH
OH
O
S
HO
O
OH
OH
38
OH
OH
O
H
OR4
Streptomyces属から
得られる抗生物質
OH
COOH
アンホテリシンB
NP4
2.イソプレノイド
2.1. 天然の脂肪族炭化水素
(C5H8、イソプレン:天然ゴムの構成単位)
C10H16:モノテルペン
C15H24:セスキテルペン
C20H32:ジテルペン
(C25H40:セスタテルペン)
C40H64:カロテン
ステロイド(C27)
C30H48:トリテルペン
イソプレン則:イソプレン骨格の繰り返し構造
nD-nR (二重結合の数-環の数)
多数の構造異性体
IHD
C10H16:モノテルペン 3 3-0
C15H24:セスキテルペン 4 4-0
C20H32:ジテルペン 5 5-0
C25H40:セスタテルペン 6 6-0
C30H48:トリテルペン 7 7-0
0-3(4通り)
0-4(5通り)
0-5(6通り)
0-6(7通り)
0-7(8通り)
これらに水が付加したり、さらに酸化された化合物:テルペノイド
OH
O
2.2.イソプレノイドの生合成
O
O
OH
OH
SCoA
SCoA
HOOC
HOOC
O
OH
SCoA
(R)-メバロン酸
O
-CO2,-OH
OPP
OH
OPP
OOC
OPP
OPP
PP:ピロリン酸
OPP
セスキテルペンetc.
モノテルペン
NP5
2.3.モノテルペノイド
植物の精油、香りの成分
2.3.1.鎖状化合物
OPP
ミルセン
OH
OH
O
シトロネラール(柑橘臭)
シトロネロール(柑橘臭)
ゲラニオール
OH
O
O
ネロール
α-シトラール(柑橘臭)
β-シトラール(柑橘臭)
2.3.2.環状化合物
1
2
3
4
2
OPP
1
カルボカチオンの挙動
3
カレン(マツ)
4
リモネン(柑橘臭)
HO
ボルネオール
(ショウノウ臭)
HO
ほとんどはイソプレン則を
みたしている。
メントール(ハッカ臭、清涼感)
HO
O
ヒノキチオール
(野副鉄男、1943)
ピネン(マツ)
O
ショウノウ
(カンファー)
NP6
2.4.セスキテルペノイド
OPP
OH
ファルネソール
O
O
O
セリネン
(セロリ)
サントニン
(キク科、駆虫薬)
O
O
ゲルマクロン
(フクロソウ)
OH
グアイオール
(ヒノキ科)
ヌートカトン
(グレープフルーツ)
OH
エレモール
(カンラン科)
2.5.ジテルペノイド
イソプレン則を満たしているものも少なくない。
AcO
O
O
RO
O
O
OH
HO
O
O
AcO
O
アビエタジン
(マツ)
Head-to-tailになっていない
モミラクトン
(イネ)
○
タキソール(イチイ)
イソプレン則が成り立つか?
NP7
2.6.トリテルペノイド
C15ユニットがtail-to-tailで結合
スクアレン
E
E X
環化
X
H
H
H
HO
O
骨格転位の繰り返し
H
HO
HO
HO
ラノステロール(羊毛)
β-アミリン
(エンドウ)
ルペオール
(ノボリフジ)
ステロイドへ
H
H
H
O
OH
H
H
H
OH
O
O
H
H
H
H
H
O
HO
O
プロゲステロン
(黄体ホルモン)
コレステロール
各種のステロイドホルモン
の原料
コルチゾン
(副腎皮質ホルモンの一つ)
OH
OH
H
H
H
H
H
H
H
HO
O
テストステロン
(男性ホルモン)
エストラジオール
(卵胞ホルモンの一つ)
NP8
C20ユニットがtail-to-tailで結合
2.7.カロテノイド
各種の色素(長い共役系)
リコペン(トマト)
環化
β-カロテン(ニンジン)
OH
HO
視覚とビタミンA
ルテイン(黄葉)
OH
レチノール(ビタミンA)
不足すると夜盲症→失明
7
O
10 11
8
9
hν
レチナール
O
11-cis-レチナール
視覚タンパク質ロドプシンの成分
2.8. 植物ホルモン
(1)ジベレリン:生長促進、休眠の覚醒
(2)アブシジン酸:生長抑制、落葉、休眠促進
H
OH
HO
COOH
COOH
ジベレリンA14
COOH
O
セスキテルペノイド
ジテルペノイド
(3)エチレン:果実の熟成・落果の促進、落葉の促進
NH2
S
COOH
メチオニン
NH2
COOH
H2C
CH2
+
CO2
+
HC
HC O
N
OH
+ NH3