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CURRICULUM VITAE INFORMAZIONI PERSONALI Nome

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CURRICULUM VITAE
INFORMAZIONI PERSONALI
Nome
Giampetruzzi Annalisa
Indirizzo
Via della Libertà n°17, Santeramo in colle (BA)
Telefono
cell 388/ 0496184 (080/ 3021369)
Recapito postale
Via della Libertà n°17, Santeramo in Colle (BA) 70029
E-mail
[email protected]
Nazionalità
italiana
Stato civile
coniugata
Luogo, data di nascita
Santeramo in Colle (BA), 08/12/79
ESPERIENZE LAVORATIVE E FORMATIVE
­
Assegno di ricerca post-dottorale di cui al Bando n° IVV 036 BA 2013
Periodo: 15/03/2013 - 24/12/2013 ---- 25/05/2014 -14/09/2014, (in corso)
Sede: l'Istituto di Virologia Vegetale, U.O.S. Bari, sotto la responsabilità scientifica del Dott.Pasquale Saldarelli
Lavoro di ricerca: "Caratterizzazione metagenomica di cloni e biotipi di vitigni autoctoni"
­
Incarico di docenza nell'ambito del Progetto di formazione PON "ONEV" realizzato dal C.R.A.-UTV (Turi)
Numero di ore di lezioni frontali: 2 ore,
Tema: Sequenziamento dei miRNA:preparazione delle libraries e analisi dei dati.
Data: 6/09/2013
­
Vincitrice di un grant per partecipazione al POST GRADUATE TRAINING SCHOOL ON "Functional
Annotation Of Genome Sequences in Agricultural species" COST Action TD801 "StatSeq"
Periodo: 22/04/2013-24/04/2013
Sede: Institute of Biotechnology, University of Helsinki (Finlandia)
­
Borsa di studio CNR di cui al Bando n. 126.252.BS9 del 23/07/2012
Periodo: 3/09/2012- 3/03/2013
Sede: l'Istituto di Virologia Vegetale, U.O.S. Bari, sotto la responsabilità scientifica della Dott.ssa M. Saponari
Lavoro di ricerca: "Studio dei meccanismi di cross-protection in piante infette da Citrus tristeza virus"
­
Dottorato di Ricerca in “PROTEZIONE DELLE COLTURE” (XXIV CICLO), vincitrice con borsa di studio
Scuola di Dottorato in PRODUZIONI VEGETALI, ALIMENTI E AMBIENTE
c/o Università degli Studi di Bari Aldo Moro
tutor accademico Prof. Vito Savino
tutor scientifico Dott. Pasquale Saldarelli (CNR IVV )
co-tutor Prof. Donato Gallitelli
Lavoro di tesi:
“Comparative profiling of smallRNAs in virus-infected and healthy grapevine plants”.
(dal 28 Gennaio 2009 –31 Dicembre 2011)
Conseguimento del titolo di Dottore di ricerca in data 30 Aprile 2012 con D.R. n.2553 del 21/05/2012
( Prot.n. 31119 v/8)
------------------------------------------------------------------------------------­
Attività di formazione e ricerca scientifica all’estero nell’ambito del Dottorato di Ricerca c/o
“Department of Botany and Plant Pathology and Center for Genome Research and Biocomputing” in Oregon State
University, Corvallis, Oregon-USA
Supervisors: Prof.James Carrington, Dott. Hernan Garcia Ruiz
Paper (in preparation): “Slicer activity of Arabidopsis Argonaute proteins is necessary for antiviral RNA silencing”
Hernan Garcia-Ruiz, Alberto Carbonell, Atsushi Takeda, Nicholas Lowery, John Steen Hoyer, Annalisa Giampetruzzi, and
James C. Carrington
(16 Novembre 2010 -16 Aprile 2011)
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------­
Vincitrice di borsa per lavoro di ricerca di 18 mesi nell’ambito del:
POR Puglia 2000-2006 Asse III - Misura 3.12, “Miglioramento delle risorse umane nel settore della ricerca e sviluppo
tecnologico” , Avviso n. 22/2006
Lavoro di ricerca svolto : “Produzione di anticorpi ricombinanti, nella forma di single chain Fragment variable (scFv)
per la diagnosi del virus B della vite,GVB”
c/o Istituto di Virologia Vegetale del Consiglio Nazionale delle Ricerche Sezione di Bari (CNR-IVV-BA); Agritest s.r.l.
Valenzano, Bari
(17 maggio 2007- 16 novembre 2008 )
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------­
Tirocinante presso i laboratori del DPPMA della Facoltà di Agraria dell´Università di Bari
(19 febbraio 2007- 17 maggio 2007)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------­ Master Universitario di 1° livello per “Tecnico qualificato in diagnostica fitopatologica” e conseguimento
con lode della qualifica di “Tecnico qualificato in diagnostica fitopatologica”
Principali materie / abilità professionali acquisite:
­
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­
­
­
Organizzazione e gestione di un laboratorio per la produzione di reagenti per la diagnosi fitopatologica
Organizzazione e gestione di un laboratorio di diagnosi fitopatologica
Capacità di sviluppare nuovi reagenti diagnostici di tipo sierologico e molecolare
Tecniche di diagnosi sierologica
Tecniche di diagnosi molecolare
Tecniche per la rintracciabilità di OGM e MOGM
17ottobre2005 - 20 Ottobre 2006 , durata di 1000 ore)
 Stage lavorativo nell’ ambito del Master “Tecnico qualificato in diagnostica fitopatologica” c/o Centro di
Ricerca e Sperimentazione in Agricoltura “Basile Caramia” , Locorotondo (BA)
Attività svolte: certificazione delle produzioni vivaistiche di,vite, olivo,drupacee, agrumi e di piantine
ortive:sopralluoghi in vivai orticoli saggi di laboratorio mediante tecniche di di ibridazione molecolare con sonde a
RNA per diagnosi di virus fitopatogeni delle piantine ortive isolamenti fungini, saggi ELISA Estrazione acidi nucleici
totali,PCR, RT-PCR.
(1 Marzo 2006- 30 Settembre 2006)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Corso di Perfezionamento Post-Laurea in “Biologia della nutrizione”
Principali materie / abilità professionali oggetto del corso:
Fisiologia della nutrizione, Patologie legate all’alimentazione, disordini alimentari, intolleranze alimentari, Alimenti
biologici, OGM, Nutrizione nelle diverse fasi della vita, Ristorazione collettiva, Dieta mediterranea, Igiene degli
alimenti, controllo qualità degli alimenti, HACCP, Ruolo del biologo nutrizionista.
(26 Novembre 2004 – 30 Aprile 2005)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Laurea in Scienze Biologiche, con voto 108/110 , conseguita il 22/07/04
Titolo della tesi sperimentale: “Localizzazione e possibili ruoli funzionali di un’ acquaporina, AQP8, nei mitocondri di
fegato di ratto”
svolta c/o il laboratorio di ricerca del Prof. Giuseppe Calamita, Dipartimento di Fisiologia generale ed ambientale,
Università degli Studi di Bari
 Immatricolazione al Corso di Laurea in Scienze biologiche, Università degli Studi di Bari Aldo Moro nell’anno
accademico 98/99
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Diploma di Maturità Classica conseguita nel Giugno/98 c/o Liceo Classico Statale “Cagnazzi” Altamura (BA)
________________________________________________________________________________________________
IDONEITA' CONCORSI PUBBLICI:
-- Bando N 364.118- Concorso pubblico per titoli ed esami per l'assunzione con contratto a tempo indeterminato di
quaranta unita' di personale- con profilo di collaboratore tecnico enti di ricerca - sesto livello professionale - del
Consiglio Nazionale delle Ricerche presso istituti/strutture del CNR; codice di riferimento BA41/1, sede di lavoro (IGV)
Bari;
Graduatoria (6/8/ 2012): 2° , punteggio 60,25/90
ATTIVITA' DI TUTORAGGIO A STUDENTI UNIVERSITARI:
- Tutor di laboratorio per svolgimento della tesi sperimentale in Biotecnologie fitopatologiche
"Allestimento di una libreria di piccoli RNA di Brassica rapa infetta da Turnip yellow mosaic virus (TYMV)"
Studente: Rossella Labarile,
Anno accademico 2008/2009
-Tutor di laboratorio per svolgimento della tesi sperimentale in Biotecnologie fitopatologiche:
"Sviluppo di un anticorpo ricombinante(scFv)specifico per il virus A della vite",
Studente: Maria Capodiferro,
Anno accademico 2009/2010
ABILITAZIONI:
Abilitazione alla professione di Biologo conseguita il 15/06/ 2005
Iscritta all'Ordine Nazionale dei Biologi (ONB), Albo - Sezione A, dal: 14/05/2014
Num. iscrizione: AA_071094
CAPACITÀ E COMPETENZE PERSONALI
MADRE LINGUA
ALTRA LINGUA
• Capacità di lettura
• Capacità di scrittura
• Capacità di espressione orale
Italiano
Inglese
buono
buono
buono
CAPACITÀ E COMPETENZE RELAZIONALI
.
Ottima capacità di lavorare in gruppo, di dare e chiedere informazioni in modo chiaro acquisite
nell’esperienze lavorative suddette, ottima capacità di relazione con persone aventi particolari esigenze acquisite
CAPACITÀ E COMPETENZE ORGANIZZATIVE
Ottime capacità di adattamento a diverse situazioni di lavoro e ottime competenze organizzative acquisite
nell’esperienze lavorative e formative suddette.
CAPACITÀ E COMPETENZE TECNICHE
Costruzione di librerie di smallRNAs and mRNA per sequenziamento high-throughput (tecnologia Illumina).
Analisi dei dati di sequenziamento di nuova generazione mediante software, script e pipeline bioinformatici in sistemi
operativi Linux e Windows per il preprocessing data (CASAVA, OLB, FASTX toolkit, UEA plant toolkit, Galaxy web
server, CLC genomic workbench), software di alignment e denovo assembling ( Velvet, SOAP, Bowtie) di alignment
viewer (Map Viewer, Tablet) . Ricerche in banche dati bioinformatiche, utilizzo di software per manipolazione di acidi
nucleici e protein (Geneious, VectorNTI, BioEdit). Estrazione di acidi nucleici da matrici animali e vegetali e relativo
dosaggio con metodo spettrofotometrico; separazione elettroforetica degli acidi nucleici su gel di agarosio e gel di
poliacrilammide; tecniche di amplificazione del DNA mediante PCR (RT–PCR) QT Real time PCR; clonaggio di DNA;
northen blotting; preparazioni di mitocondri e relative frazioni (mitoplasti, membrana mitocondriale esterna e
membrana mitocondriale interna); preparazioni di frazioni di membrana plasmatica e di membrane microsomiali;
dosaggio proteico; elettroforesi su gel di poliacrilammide (SDS-PAGE); western blot di proteine; purificazione di
anticorpi mediante cromatografia per affinità; immunoprecipitazione; ELISA, DTBIA-Direct Tissue Blot Immuno Assay;
Lateral Flow test; nozioni di base di bioinformatica e di consultazione di banche dati; trasformazione genetica delle
piante e rilevamento di transgeni, utilizzo di piante indicatrici per lo studio dei patogeni virali delle piante (Arabidopsis
Thaliana, Nicotiana Benthamiana) .Buona conoscenza dei software utilizzati nell’attività di laboratorio (Power Point,
Word, Excel, Adobe Photoshop, Internet Explorer, sistema operativo LINUX) e della gestione dei server informatici e
nella connessione a computer locale tramite client SFTP WinSCP.
Buona competenza nell’uso di: autoclave, pH-metro, centrifughe refrigerate, ultracentrifughe, sonicatore,
omogenizzatori, microscopio ottico, termociclatore termociclatori Real Time, Tecan Freedom EVO, spettrofotometro,
Nanodrop.
Conoscenza delle norme per la stabulazione degli animali da laboratorio.
PATENTE O PATENTI
patente B di guida, automunita
CORSI DI FORMAZIONE:
- Corso di formazione "Freedom EVOware® Standard 2.3- TECAN, Bari 11-13 Luglio 2011
- Corso di formazione per lavoratori "Servizio di prevenzione e protezione " UPP-CNR", Bari 9/10/2013
PARTECIPAZIONE AI CONGRESSI:
 BiP-Day 2013 "Prima Giornata della Bioinformatica Pugliese" BARI, 5 DICEMBRE 2013
 Bioinformatics Workshop "Evaluation of Test Cases" - 12 -14 December 2012 Milan, Italy
(comunicazione orale) "small RNA comparison of four phenotypically distinct cv. “Primitivo” grapevine clones"
 Next Generation Sequencing & Epigenomics, 4° BARI Workshop - 5-7 Dec, 2012
 COST Meeting: Phytoplasma and Virus Management in Grapevine Collections for Germplasm Conservation,
Mobilization and Evaluation, Sofia-Bulgaria 8-9 May 2012
 Citrus Research and Technology. Campinas, 7-12 November, 2010, CORDEIROPOLIS (abstract comunicazione)
 Congresso Nazionale Della Società Italiana Di Patologia Vegetale (SIPaV) Firenze 14-17 Settembre 2010
(abstract e poster comunicazioni)
 “Illumina sequencing seminar series”, Roma 23 Giugno 2010 (uditore)
 II° WORKSHOP Istituto di Virologia Vegetale UOS Bari 26-27 Novembre 2009 (comunicazione orale)

XV CONGRESSO NAZIONALE DELLA SOCIETÀ ITALIANA DI PATOLOGIA VEGETALE (SIPaV) Locorotondo, 28
Settembre – 1 Ottobre 2009 (comunicazione orale)
 "NEXT GENERATION SEQUENCING WORKSHOP" sessione teorica e pratica Bari, 16 - 18 Settembre 2009
 ICVG XVI – DIJON, France, 16th Meeting of the International Council for the Study of Virus and Virus-like
Diseases of the Grapevine 31 Aug – 4 Sept 2009
 INTERNATIONAL WORKSHOP: “Physiology and pathophysiology of lipid, water and electrolyte transport in the
hepatobiliary tract”, Bari, Luglio 2004
 SECONDO CONGRESSO DELLA SOCIETA’ DI PROTEOMICA: “Proteomics and Genomics”, Viterbo, (29/04/05 01/05/05)
ABSTRACT:

Combination of Linkage Analysis and Whole Exome Sequencing for the Identification of Risk Variants in IgA
Nephropathy
Sharon Natasha Cox, Francesco Pesce, Julia Sarah El-Sayed Moustafa, Fabio Sallustio, Grazia Serino, Annalisa
Giampetruzzi, Nicola Ancona, Mario Falchi and Francesco Paolo Schena.
The American Society of Nephrology kidney week 2014, Philadelphia - PA, 11-16 Novembre 2014 (submitted)

Investigations on a grapevine virus-like disease: enations
M. Chiumenti, A. Giampetruzzi, C. Pirolo, P. Saldarelli, A. Minafra, G. Bottalico, A. De Stradis, V. Roseti, A.
Campanale, V. Savino and G.P Martelli.
XIX Convegno Nazionale Società Italiana di Patologia Vegetale, Padova 23-25 Settembre 2013

Studies on a new grapevine disease in Trentino vineyards
P. Saldarelli, R. Beber, C. Pirolo, F. Terlizzi, A. Giampetruzzi, L. Covelli, P. Bianchedi, C. Ratti, C. Poggi Pollini, R.
Credi, U. Malossini, V. Gualandri
XIX Convegno Nazionale Società Italiana di Patologia Vegetale, Padova 23-25 Settembre 2013

Molecular characterization of Citrus tristeza virus isolates associated with stem pitting ctv cross-protection in
Peru'
R.K. Yokomi, K. Bederski, C. Roistacher, A. Giampetruzzi, G. Loconsole, and M. Saponari
XIX Conference of the IOCV (International Organization of Citrus Virologists), 28th July - 2nd August 2013
Kruger National Park, Mpumalanga, South Africa

Molecular analysis of CTV from cross-protected citrus trees after 20 years of natural challenge and evaluation
in Perú
Klaus Bederski, Paul Silvestre, Chester Roistacher, Annalisa Giampetruzzi, Giuliana Loconsole, John Hartung,
Maria Saponari and Raymond Yokomi
X Congreso Internacional De Viveristas De Cítricos, Mazatlán-Sinaloa 2014, Mexico 14-19 February 2014

Profile of small RNAs and preliminary epigenetic studies in Citrus plants upon Citrus tristeza virus infection
Fanelli V., Giampetruzzi A., Loconsole G., Di Rienzo V., Leonetti P. Montemurro C., De Giovanni C., Saponari M.
57th Annual Congress of SIGA - Italian Society of Agricultural Genetics, Foggia 16-19 Settembre 2013

Epigenetic role in olive plant architecture
A. Giampetruzzi, M. Cirilli , M. Morelli , E. Frioni, M. Saponari and R. Muleo
NEXT GENERATION SEQUENCING & EPIGENOMICS, 4° BARI Workshop - 5-7 Dec, 2012

SmallRNAs profiling in virus-infected grapevines
Giampetruzzi A., Roberto R., La Notte P., Pirolo C., Saldarelli, P.
Proceedings of the 17th Congress of ICVG, Davis, California, USA October 7–14, 2012

Approaches of Next Generation Sequencing to Investigate Grapevine Diseases of Unknown Aetiology
Chiumenti, M., Giampetruzzi, A., Pirolo, C., Morelli, M. , Saldarelli, P., Minafra, A., Bottalico, G.,La Notte, P.,
Campanale, A., Savino, V. and Martelli, G.P.
Proceedings of the 17th Congress of ICVG, Davis, California, USA October 7–14, 2012ù

Next-generation sequencing and metagenomic analysis advances in plant virus diagnosis and discovery
G. Loconsole, A. Giampetruzzi, R. Roberto, M. Saponari, F. Palmisano, M. Chiumenti, M. Morelli, A. Minafra, V.
Savino, P. Saldarelli
XVIII CONGRESSO NAZIONALE DELLA SOCIETÀ ITALIANA DI PATOLOGIA VEGETALE (SIPaV) Sassari, 24-26
Settembre 2012

Grapevine virus diseases : impact and advanced diagnosis of associated agents
P. Saldarelli, A. Giampetruzzi, A. Minafra, G. Martelli
COST Meeting: Phytoplasma and Virus Management in Grapevine Collections for Germplasm Conservation,
Mobilization and Evaluation, Sofia-Bulgaria 8-9 May 2012

Comparative profiling of small RNAs populations in virus-infected and healthy grapevine plants
A. Giampetruzzi, A. Gisel, P. La Notte and C. Pirolo P. Saldarelli
XVI Congresso Nazionale Della Società Italiana Di Patologia Vegetale (SIPaV) Firenze 14-17 Settembre 2010

Deep sequencing analysis of viral short rnas from pinot noir clone entav 115
Vitantonio Pantaleo, Pasquale Saldarelli, Laura Miozzi, Annalisa Giampetruzzi, Andreas Gisel, Simon Moxon,
Tamas Dalmay, Jozsef Burgyan
Progrès Agricole et Viticole, 2009, Hors Série – Extended abstracts 16th Meeting of ICVG, Dijon, France, 31 Aug –
4 Sept 2009

“The inner mitochondrial membrane has a water channel protein (AQP8): possible roles in the mithocondrial
volume regulation”
G. Calamita, P. Gena, D. Ferri, P. Roberti, A. Giampetruzzi, G. Modugno, N. Marinelli, G.E. Liquori, D. Thomas, and
M.Svelto
SECONDO CONGRESSO DELLA SOCIETA’ DI PROTEOMICA: “Proteomics and Genomics”, Viterbo, (29/04/05 01/05/05)
PUBBLICAZIONI:

Deep-sequencing analysis of an apricot tree with vein clearing symptoms reveals the presence of a novel
betaflexivirus
T. Elbeaino, A. Giampetruzzi, A. De Stradis, M. Digiaro
VIRUS RESEARCH, 2014, 181: 1-5.

Identification and characterization of Citrus yellow vein clearing virus, a putative new member of the genus
Mandarivirus infecting Citrus spp.
G. Loconsole, N. Önelge , O. Potere, A. Giampetruzzi, O. Bozan, S. Satar, A. De Stradis , V. Savino, R.K. Yokomi and
M. Saponari.
PHYTOPATHOLOGY 2012 102:12, 1168-1175

Next-generation sequencing and metagenomic analysis advances in plant virus diagnosis and discovery
G. Loconsole, A. Giampetruzzi, R. Roberto, M. Saponari, F. Palmisano, M. Chiumenti, M. Morelli, A. Minafra, V.
Savino, P. Saldarelli
JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY, vol 94, 2012

Citrus-CTV molecular interactions: What is the host side of the story?
Doddapaneni, H., Saponari, M., Giampetruzzi, A., Loconsole, G., Saldarelli, P., Yokomi, R.K.
PHYTOPATHOLOGY. 101:S4, 2011

Global Analyses of Small Interfering RNAs from Sour Orange seedlings Infected with Different Citrus tristeza
virus Genotypes
Saponari, M, Giampetruzzi, A, Doddapanemi, H, Loconsole, G, Xiong, Z, Saldarelli, P, Yokomi R.K
International Organization of Citrus Virologists Proceedings. 31:s64, 2010

Studies of Seedling Yellows Amelioration of Citrus tristeza virus Strain Mixtures to Elucidate Mechanisms of
Cross Protection
Saponari, M., Doddapaneni, H., Loconsole, G., Giampetruzzi, A., Saldarelli, P., Yokomi, R.K.
International Organization of Citrus Virologists Proceedings. 31:s93. 2010

First detection of Grapevine leafroll-associated virus 9 in Italy
Giampetruzzi A., Chiumenti M., Roberto R., Pirolo C., Minafra A. and Saldarelli P.
JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY (2011) 93 (4, Supplement), S4.63-S4.89

A new grapevine virus discovered by deep sequencing of virus- and viroid derived small RNAs in cv Pinot gris
Giampetruzzi A., Roumi V., Roberto R., Malossini U., Yoshikawa N., La Notte P., Terlizzi F., Credi R., Saldarelli P.,
VIRUS RESEARCH 163 (2012) 262–268

Profiling of the small RNA populations derived from sour orange seedlings cross-protected against seedling
yellows strains of Citrus tristeza virus
Saponari M, Doddapanemi H, Loconsole G, Giampetruzzi A, Saldarelli P, Yokomi RK JOURNAL OF PLANT
PATHOLOGY, (2010) 92 (4, Supplement), S4.71-S4.105

Deep sequencing of citrus affected by graft-transmissible diseases of unknown etiology leads to discovery of
two novel viruses.
G Loconsole, A Giampetruzzi, P Saldarelli, RK Yokomi, N Onelge, M Saponari
International Citrus Congress Proceedings, S14011, p. 237. 2012

Deep sequencing analysis of viral short RNAs from an infected Pinot Noir grapevine
Pantaleo V, Saldarelli P, Miozzi L, Giampetruzzi A, Gisel A, Moxon S, Dalmay T, Bisztray G, Burgyan J.
VIROLOGY 408 (2010) 49–56

An assay for the detection of grapevine leafroll-associated virus 3 using a single-chain fragment variable
antibody
Cogotzi L.; Giampetruzzi A.; Nölke G.; Orecchia M.; Elicio V.; Castellano M.A.; Martelli G.P.; Fischer R.; Schillberg
S.; Saldarelli P.
ARCHIVES OF VIROLOGY. 2009;154 (1):19-26
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