Dr. Aktan, FBÖ332, G&BT 10/04/2015 Sorular yazarın izni olmaksızın kopyalanamaz ve kullanılamaz Ödev‐2 Çalışma Ödevi (Teslim Tarihi Yok) İSİM:__________________ Not olarak değerlendirilmeyecektir Not: Aşağıdaki sorular sizlerin genetik konularında sorgulama, analiz, modelleme, kavram değerlendirme, araştırma ve yorumlama yönlerinizin gelişmesini sağlayacak şekilde hazırlanmıştır. Lütfen hesaplamalarınızı nasıl yaptığınızı açık olarak gösteriniz. Cevaplarınızı sadece ilgili alanlara yazınız. Okunabilir olmayan, aceleyle elde yazılmış soru‐cevaplar, karalama cevaplar değerlendirilmeyecektir. Ödevler ders saati başında teslim edilmeli varsa kullandığınız kaynaklar belirtilmelidir. 1. DNA replikasyonun aşamalarını yazınız ve nasıl gerçekleştiğini kısaca açıklayınız. Bu soruya cevap verirken ilgili enzimleri ve fonksiyonlarını tanımlamak amacıyla bir replikasyon çatalı çizerek üzerinde işaretleyiniz. 2. Bir plazmid (bakteriyel DNA) belirtilen restriksiyon enzimleri ile işleme tabi tutulduktan sonra aşağıdaki büyüklüklerde parçalara ayrılmıştır: EcoRI 5.0 kbç (1 kbç = 1 kilo baz çifti yani 1000 bç) ClaI 5.0 kbç BamHI 5.0 kbç PstI 5.0 kbç EcoRI + ClaI 4.5 kbç ve 0.5 kbç EcoRI + BamHI 4.3 kbç ve 0.7 kbç EcoRI + PstI 4.0 kbç ve 1.0 kbç ClaI + BamHI 4.8 kbç ve 0.2 kbç BamHI + PstI 3.3 kbç ve 1.7 kbç. Bu plazmidin restriksiyon haritasını çizerek enzimlerin kesim noktalarını gösteriniz. 1 Dr. Aktan, FBÖ332, G&BT 10/04/2015 Sorular yazarın izni olmaksızın kopyalanamaz ve kullanılamaz 3. Bir restriksiyon enzimi olan Sau96 enzimi 5'-GG↓NCC-3' dizilimini tanır (N herhangi bir bazı, ok ise kesim noktasını temsil eder). Yaklaşık olarak eşit oranlarda A, T, C, ve G içeren 6 E. coli genomunun büyüklüğü 4,6 x 10 bç ise, E. coli genomunda yaklaşık kaç tane Sau96 tanıma bölgesi bulmayı beklersiniz? 4. Varsayalım ki yeni bir organizma keşfettiniz ve bu organizmanın azot kullanmadığını tespit ettiniz. Son yaptığınız gözlemler ise organizmanın DNA’sının parçalı-mozaik 15 13 (dispersiv) olarak kendini eşlediğini göstermektedir. Öyleyse N yerine C (karbon elementinin ağır izotopu) kullanarak bu organizmanın DNA replikasyonunu çalışmaya karar 13 12 verdiniz. Öncelikle biliyorsunuz ki C, normal karbon izotopundan ( C) %10 daha ağır ve 12 DNA ağırlığının yaklaşık %50’si karbon tarafından oluşturulmaktadır. Eğer C DNA’nın 13 yoğunluğu 1,66 g/ml ise, C DNA’nın yoğunluğu nedir? 12 Bu organizmanın hücreleri öncelikle normal izotoplu ( C) ortamda bir kez büyüdükten 13 13 sonra ağır izotoplu ortama ( C) alınmıştır. Aşağıdaki figürde DNA’nın C ortamına alınmadan önceki yoğunluğunu işaretleyiniz. Bir önceki kısımdaki yoğunluk değerini kullanabilirsiniz. Organizmanın hücrelerinin ağır izotoplu ortamda bir nesil büyütüldükten sonra DNA bandının pozisyonunun nerede olacağını işaretleyiniz. DNA’nın dispersiv replike olduğunu hatırlayınız. 2 Dr. Aktan, FBÖ332, G&BT 10/04/2015 Sorular yazarın izni olmaksızın kopyalanamaz ve kullanılamaz Hücrelerin ağır izotoplu ortamda iki nesil büyüdükten sonra DNA bandı ya da bantlarının pozisyonlarının nerede olacağını işaretleyiniz. Yine parçalı replike olduğunu unutmayın ve DNA bantlarının görünümü (kalınlığı) nasıl olacak düşününüz. II. BÖLÜM Aşağıdaki sorular sizin bazı temel olasılık, ihtimal, kavramlarını hatırlamanıza yardımcı olmak için hazırlanmıştır. Eğer bu konuda tekrar yapma ihtiyacı duyarsanız, matematik ve/veya istatistik ders notlarınıza bakmanızı tavsiye ederim. İpucu: “Ve ve Veya Kuralı”, Eğer X ve Y birbirinden bağımsız iki olay/durum ise; X ve Y’nin olma/gerçekleşme olasılığı, X*Y’dir (yani X’in olma olasılığı çarpı Y’nin olma olasılığıdır). Ayrıca X veya Y’nin olma/gerçekleşme olasılığı, X + Y’dir (yani X’in olma olasılığı ile Y’nin olma olasılığının toplamıdır). 1) Eğer eşit ağırlıklı, dengeli sıradan altı yüzlü bir zarı (bir zar çiftini değil) üç kez atarsanız; ilk atışta 3 gelme olasılığı, ikinci atışta 5 gelme olasılığı, ve üçüncü atışta 1 gelme olasılığı nedir? 2) Herhangi bir sırayla (yani önce 3, 5 ya da 1 hangisinin geldiğinin bir önemi yok), bir 3, bir 5 ve bir de 1 atma olasılığı nedir? 3) İlk atışta 3 gelme olasılığı, ikinci atışta 3 gelme olasılığı, ve üçüncü atışta 3 gelme olasılığı nedir? 4) İki atışın ilkinde 3 ve ikincisinde 1 hariç herhangi bir sayıyı atma olasılı nedir? İpucu: X haric herhangi bir sayıyı atma olasılığı, 1-X’ın olma olasılığıdır. Diğer bir değişle mümkün olan bütün ihtimallerin toplamı 1’dir. 5) Beş adet iki yüzlü, dengesiz bir dağılıma sahip, yani attığınız zaman %60 yazı yüzü gelen, metal paralarınız vardır. Bu dengesiz paraları atarak, 5’inde de tura gelme olasılığı nedir? 3
© Copyright 2024 Paperzz
