HiSeq® 2500, 1500 e 2000 Guida alla preparazione della sede di installazione SOLO A USO DI RICERCA Cronologia revisioni Introduzione Consegna e installazione Requisiti di laboratorio Requisiti elettrici Vincoli ambientali Computer di controllo dello strumento Considerazioni relative alla rete informatica Elaborazione e analisi dei dati Apparecchiature e materiali di consumo forniti dall'utente Assistenza tecnica DI PROPRIETÀ DI ILLUMINA N. codice 15006407 Rev. I ITA Agosto 2014 3 4 5 6 8 10 11 12 14 16 Questo documento e il suo contenuto sono di proprietà di Illumina, Inc. e delle aziende a essa affiliate ("Illumina") e sono destinati esclusivamente a uso contrattuale da parte dei clienti di Illumina per quanto concerne l'utilizzo dei prodotti qui descritti con esclusione di qualsiasi altro scopo. Questo documento e il suo contenuto non possono essere usati o distribuiti per altri scopi e/o in altro modo diffusi, resi pubblici o riprodotti in alcun modo, senza preventiva approvazione scritta da parte di Illumina. Mediante questo documento Illumina non trasferisce alcuna licenza sui propri diritti su brevetti, marchi di fabbrica, copyright, o diritti secondo il diritto consuetudinario, né alcun diritto similare di alcun terzo. Al fine di assicurare un uso sicuro e corretto dei prodotti qui descritti, le istruzioni riportate in questo documento devono essere scrupolosamente ed esplicitamente seguite da personale qualificato e adeguatamente addestrato. Leggere e comprendere a fondo tutto il contenuto di questo documento prima di usare tali prodotti. LA LETTURA INCOMPLETA DEL CONTENUTO DEL PRESENTE DOCUMENTO E IL MANCATO RISPETTO DI TUTTE LE ISTRUZIONI IVI CONTENUTE PUÒ CAUSARE DANNI AL PRODOTTO, LESIONI PERSONALI A UTENTI E TERZI E DANNI MATERIALI. ILLUMINA NON SI ASSUME ALCUNA RESPONSABILITÀ DERIVANTE DALL’USO IMPROPRIO DEI PRODOTTI QUI DESCRITTI (COMPONENTI E SOFTWARE INCLUSI) O DA QUALSIASI USO DI TALI PRODOTTI NON ESPLICITAMENTE CONTEMPLATO NELLE LICENZE SCRITTE O NELLE AUTORIZZAZIONI CONCESSE DA ILLUMINA IN OCCASIONE DELL’ACQUISIZIONE DEI PRODOTTI STESSI DA PARTE DEL CLIENTE. SOLO A USO DI RICERCA © 2010–2014 Illumina, Inc. Tutti i diritti riservati. Illumina, 24sure, BaseSpace, BeadArray, BlueFish, BlueFuse, BlueGnome, cBot, CSPro, CytoChip, DesignStudio, Epicentre, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, HiSeq X, Infinium, iScan, iSelect, ForenSeq, MiSeq, MiSeqDx, MiSeq FGx, NeoPrep, Nextera, NextBio, NextSeq, Powered by Illumina, SeqMonitor, SureMDA, TruGenome, TruSeq, TruSight, Understand Your Genome, UYG, VeraCode, verifi, VeriSeq, il colore arancione zucca e il design a basi streaming Genetic Energy sono marchi o marchi registrati di Illumina, Inc. negli Stati uniti e/o altri paesi. Tutti gli altri nomi, loghi e marchi qui contenuti sono di proprietà dei rispettivi titolari. N. codice Revisione Data 15006407_ITA I Agosto 2014 Descrizione della modifica Aggiornato il n. di catalogo VWR per le salviette imbevute di alcool a 95041-714. Aggiornate le raccomandazioni per l'antivirus del software per includere i nomi del drive e delle cartelle. Aggiunte le informazioni sulla configurazione degli aggiornamenti di Windows. Spostate le raccomandazioni sulla connessione di rete in una nuova sezione sul supporto di rete. Aggiornate le raccomandazioni sulla connessione di rete per includere i rischi possibili di compatibilità seguenti: • Rimozione di Group Policy Objects (GPO). • Attivazione del Firewall di Windows e del Defender di Windows. • Cambiamento dei privilegi degli utenti preconfigurati. Aggiornato il collegamento SDS a support.illumina.com/sds.html. Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 3 Cronologia revisioni Cronologia revisioni Introduzione La presente guida fornisce le specifiche e le linee guida per la preparazione della sede per l'installazione e per il funzionamento del sistema HiSeq® Illumina®. } Requisiti di spazio di laboratorio } Requisiti elettrici } Vincoli ambientali } Requisiti del computer } Apparecchiature e materiali di consumo forniti dall'utente Configurazione del sistema Il sistema HiSeq include lo strumento, un monitor, un computer di controllo dello strumento, uno scanner per codici a barre, una tastiera, un mouse e un alimentatore universale. Il computer di controllo dello strumento è un sotto sistema dedicato dello strumento e non è previsto come computer per uso generico. Documentazione È possibile scaricare ulteriore documentazione dal sito Web Illumina. Fare riferimento alla pagina interna della quarta di copertina di questa guida per maggiori informazioni. 4 N. codice 15006407 Rev. I ITA Il personale autorizzato Illumina consegna lo strumento, disimballa il sistema e lo posiziona sul banco da laboratorio. Lo spazio e il banco da laboratorio devono essere preparati prima della consegna. ATTENZIONE Lo strumento può essere disimballato, installato o spostato unicamente da personale debitamente autorizzato da Illumina. Una manipolazione non appropriata dello strumento può incidere sull'allineamento o danneggiarne i componenti. Un rappresentante Illumina installerà e preparerà lo strumento. Nel caso sia previsto il collegamento dello strumento a un sistema di gestione dei dati o a una destinazione in rete, è necessario definire il percorso per l'archiviazione dei dati prima della data dell'installazione. Questo permette al rappresentante di Illumina di testare il processo del trasferimento dati durante l'installazione. ATTENZIONE Non spostare lo strumento dopo l'installazione e la preparazione dello stesso da parte del rappresentante Illumina. Uno spostamento dello strumento non eseguito correttamente può alterare l'allineamento ottico e compromettere l'integrità dei dati. Nel caso sia necessario spostare lo strumento, rivolgersi al rappresentante Illumina. Dimensione e contenuto degli imballaggi HiSeq e i suoi componenti sono spediti in tre casse. Utilizzare le dimensioni riportate di seguito per determinare la larghezza minima richiesta della porta per fare entrare le casse di spedizione. } Cassa n. 1: contiene lo strumento. } Cassa n. 2: contiene un gruppo di continuità, UPS (versione specifica per Giappone, America del nord o una versione internazionale). } Imballaggio n. 3: contiene i seguenti oggetti: • Computer di controllo dello strumento, monitor e braccio del monitor • Flacone degli scarti e rack reagenti • Pannelli dello strumento • Cavi di alimentazione: un cavo di alimentazione specifico per gli Stati Uniti o tre cavi di alimentazione internazionali (Regno unito, Unione Europea e Cina). Misura Cassa n. 1: Strumento Cassa n. 2: UPS Cassa n. 3: Computer, coperchi e cavi di alimentazione Larghezza 165 cm 78 cm 115 cm Altezza 122 cm 51 cm 102 cm Profondità 107 cm 61 cm 82 cm Peso 312 kg 81 kg 125 kg Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 5 Consegna e installazione Consegna e installazione Requisiti di laboratorio Utilizzare le specifiche e le linee guida seguenti per determinare lo spazio di laboratorio richiesto. Dimensioni dello strumento HiSeq e il computer di controllo dello strumento presentano, dopo l'installazione, le dimensioni seguenti. Dimensione Larghezza Altezza Profondità Peso Strumento Computer di controllo dello strumento 118,6 cm Il flacone degli scarti si estende per ulteriori 10 cm sul lato destro dello strumento. 18 cm 94 cm minimo L'altezza dello strumento è regolabile per ulteriori 1,27 cm. 45 cm 76 cm Il vano contenente la tastiera si estende per ulteriori 19 cm dal pannello anteriore. 28 cm 221,4 kg 34 kg Requisiti per il posizionamento I requisiti seguenti assicurano l'accesso all'interruttore di alimentazione dello strumento e alla presa elettrica, consentono una ventilazione adeguata e forniscono accesso sufficiente per la manutenzione dello strumento. } Posizionare lo strumento in modo che il personale possa raggiungere il lato destro dello strumento per premere l'interruttore di alimentazione situato sul pannello posteriore vicino al cavo di alimentazione. } Posizionare lo strumento in modo da poter staccare rapidamente il cavo di alimentazione dalla presa. } Assicurarsi che lo strumento sia accessibile da tutti i lati. Lasciare pertanto uno spazio libero intorno allo strumento pari alle dimensioni elencate di seguito. Accesso Lati Retro Parte superiore Spazio libero minimo Lasciare almeno 61 cm di spazio libero a entrambi i lati dello strumento. Lasciare almeno 10,2 cm di spazio libero dietro lo strumento. Lasciare almeno 61 cm di spazio libero sopra lo strumento. Se lo strumento è posizionato sotto un ripiano, accertarsi di lasciare lo spazio libero minimo indicato. Linee guida per l'allestimento del banco da laboratorio Illumina raccomanda di posizionare lo strumento su un banco da laboratorio mobile con ruote piroettanti con blocco che disponga di un ripiano inferiore in grado di sostenere il 6 N. codice 15006407 Rev. I ITA Larghezza 152,4 cm Altezza 76,2-91,4 cm Profondità 76,2 cm Ruote piroettanti con blocco Sì Per i clienti del Nord America, Illumina consiglia il seguente banco da laboratorio mobile: Bench-Craft (www.bench-craft.com), n. codice HS-30-60-30 P2 con ruote piroettanti. • HS indica il banco standard • 30-60-30 indica 76,20 cm di larghezza x 152,4 di lunghezza x 76,20 cm di altezza • P2 indica le prese nella parte posteriore del banco Linee guida relative alle vibrazioni ATTENZIONE Il sistema HiSeq è sensibile alle vibrazioni. Attenersi alle seguenti linee guida per ridurre al minimo le vibrazioni durante il sequenziamento e ottimizzare le prestazioni: } Collocare lo strumento su un banco da laboratorio solido e immobilizzato. } Non collocare sul banco altre apparecchiature che potrebbero produrre vibrazioni, quali agitatori, vortex, centrifughe o strumenti con ventole pesanti. } Non installare lo strumento in prossimità di porte di frequente passaggio. L'apertura e la chiusura ripetute delle porte possono indurre vibrazioni. } Non installare un ripiano estraibile per tastiera sotto il banco. } Durante il sequenziamento, non toccare lo strumento o aprire lo scomparto reagenti o lo scomparto della cella a flusso. } Non posizionare oggetti sopra lo strumento. Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 7 Requisiti di laboratorio computer di controllo dello strumento. Il banco deve sostenere il peso dello strumento e il computer di controllo dello strumento. Requisiti elettrici Le specifiche seguenti descrivono i requisiti elettrici necessari per il funzionamento dello strumento. Specifiche elettriche Tipo Specifica Tensione di rete 100-240 V c.a a 50/60 Hz Potenza assorbita Massimo 1500 W Prese di alimentazione L'impianto elettrico del laboratorio deve essere dotato delle seguenti caratteristiche. } Per alimentazione a 110 V c.a.: è richiesta una linea elettrica dedicata da 20 A, dotata di massa, con tensione e impianto di messa a terra adeguati. Nord America e Giappone - Presa: NEMA 5-20 Presa Interpower Corp., n. codice 88030080 (o equivalente) } Per alimentazione a 220-240 V c.a.: è richiesta una linea elettrica dedicata da almeno 10 A, dotata di massa, con tensione e impianto di messa a terra adeguati. In base alle necessità, utilizzare un rating superiore secondo i requisiti della regione geografica. } Se si riscontrano fluttuazioni di tensione superiori al 10%, è necessario installare un regolatore di tensione. Messa a terra protettiva Lo strumento è collegato alla messa a terra protettiva attraverso il telaio. Il conduttore di protezione del cavo di alimentazione riporta il limite della messa a terra protettiva a un valore di riferimento sicuro. Il conduttore di messa a terra del cavo di alimentazione deve essere in buono stato di funzionamento quando si utilizza questo dispositivo. Cavi di alimentazione Lo strumento è dotato di un connettore con standard internazionale IEC 60320 C13 ed è fornito di un cavo di alimentazione specifico per il paese. I livelli di tensione pericolosi vengono eliminati dallo strumento solo quando il cavo di alimentazione è scollegato dalla fonte di alimentazione c.a. Per acquistare connettori o cavi di alimentazione equivalenti conformi alle normative locali, rivolgersi a un fornitore terzo come Interpower Corporation (www.interpower.com). ATTENZIONE Non utilizzare mai una prolunga per collegare lo strumento alla presa di alimentazione. 8 N. codice 15006407 Rev. I ITA Solo i tecnici dell'assistenza (FSE) Illumina sono qualificati per la sostituzione dei fusibili interni. Il modulo di ingresso alimentazione include due fusibili di ingresso sulle linee di ingresso ad alta tensione. I fusibili sono da 5 mm x 20 mm e del tipo 10 A, 250 V c.a, slow-blow. Gruppo di continuità (UPS) HiSeq è spedito con un gruppo di continuità (UPS) specifico per la regione geografica. } Giappone: APC SmartUPS 2200VA modello SUA2200JB } Nord America: APC SmartUPS 2200VA modello SUA2200XL } Internazionale: APC SmartUPS 2200VA modello SUA2200XLI Specifica Giappone Nord America Internazionale 1980 W 1980 W 1980 W Corrente massima 2200 VA 2200 VA 2200 VA Tensione in ingresso (nominale) 100 V c.a 120 V c.a. 230 V c.a. NEMA L5-30P NEMA 5-20P IEC-320 C20 Schuko CEE 7/EU116P British BS1363A 28,5 minuti 28,5 minuti 28,5 minuti 10,4 minuti 10,4 minuti 10,4 minuti Watt massimi Connessione in ingresso Autonomia media (carico del 50%) Autonomia media (carico del 100%) Per acquistare un gruppo di continuità equivalente conforme alle normative locali nei paesi al di fuori delle regioni geografiche indicate, rivolgersi a un fornitore terzo come Interpower Corporation (www.interpower.com). Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 9 Requisiti elettrici Fusibili Vincoli ambientali Elemento Temperatura Umidità Elevazione Qualità dell'aria Ventilazione Specifica Mantenere nel laboratorio una temperatura compresa tra 19 °C e 25 °C (22 °C ± 3 °C). Questa è la temperatura operativa dello strumento. Durante una corsa, evitare che la temperatura ambiente subisca sbalzi superiori a ±2 °C. Mantenere l'umidità relativa, senza condensa, nell'intervallo 20-80%. Installare lo strumento a un'altitudine inferiore a 2000 metri. Utilizzare lo strumento in un ambiente con Grado di inquinamento 2 o migliore. La definizione "Grado di inquinamento 2" si applica ad ambienti che presentano solo sostanze inquinanti non conduttive. Rivolgersi al dipartimento del laboratorio per i requisiti di ventilazione in base alle specifiche di dissipazione termica dello strumento. Emissioni acustiche Le emissioni acustiche sono di 65 dB a 1 metro di distanza dalla parte anteriore dello strumento. Dissipazione termica La tabella seguente elenca la dissipazione termica per uno strumento HiSeq con computer di controllo dello strumento e monitor. Componente Strumento Computer e monitor Totale Potenza misurata (Watt) Uscita termica (BTU/h) 750 750 1500 2600 1400 4000 ATTENZIONE Non far funzionare HiSeq se un qualsiasi pannello è rimosso. Non toccare la stazione termica nello scomparto di imaging. Il riscaldatore a effetto Peltier utilizzato nell'area del piano è di solito controllato tra la temperatura ambiente (22 °C) e 85 °C. L'esposizione a temperature al limite superiore di questo range potrebbero causare bruciature. 10 N. codice 15006407 Rev. I ITA HiSeq è consegnato con un computer di controllo dello strumento personalizzato con i più recenti requisiti di sistema. Per maggiori informazioni sulle specifiche del computer, rivolgersi all'Assistenza tecnica Illumina. Il computer di controllo dello strumento è un sottosistema dedicato dello strumento che non è pensato né supportato come computer per uso generico. Il caricamento e l'uso di software di terze parti può causare elaborazione lenta, perdita di dati o dati non validi. Connessioni per i dati HiSeq presenta quattro connessioni al computer di controllo: } Una connessione USB per la comunicazione tra HiSeq e il computer. È utilizzato un connettore standard USB di stile tipo A/B. } Due connessioni CameraLink a segnale differenziale di bassa tensione (LVDS, Low Voltage Differential Signaling) per le due videocamere principali. Sono utilizzati cavi CameraLink standard. Le videocamere trasferiscono i dati non elaborati da HiSeq al computer. Software antivirus Illumina raccomanda di acquistare e installare un software antivirus a scelta per proteggere il computer di controllo dello strumento. Illumina ha testato Symantec su Windows 7 con le impostazioni seguenti. Al fine di evitare perdita di dai o interferenze con il funzionamento dello strumento, configurare il software antivirus come segue: } Impostare le scansioni manuali. Non abilitare le scansioni automatiche. } Eseguire le scansioni manuali solo quando lo strumento non è in uso. } Impostare gli aggiornamenti affinché vengano scaricati ma non installati senza l'autorizzazione dell'utente. } Non eseguire l'aggiornamento durante il funzionamento dello strumento. Eseguire l'aggiornamento solo quando lo strumento non è in funzione e quando è sicuro eseguire il riavvio del computer dello strumento. } Non riavviare automaticamente il computer dopo l'aggiornamento. } Escludere la directory delle applicazioni e i drive dei dati dalla protezione dei file di sistema in tempo reale, nello specifico C:\Illumina e i drive D:\ e E:\. Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 11 Computer di controllo dello strumento Computer di controllo dello strumento Considerazioni relative alla rete informatica Illumina non fornisce servizi di installazione o assistenza tecnica per la connessione in rete del computer di controllo dello strumento. Tuttavia, è possibile configurare e mantenere una connessione in rete sul computer di controllo dello strumento dopo l'installazione dello strumento. } Usare una connessione da 1 gigabyte tra il computer di controllo dello strumento e il sistema di gestione dati. Questa connessione può essere diretta o realizzata mediante uno switch di rete. } Se si utilizza BaseSpace, Illumina raccomanda una velocità di connettività di rete minima di 10 Mbps. NOTA Illumina non raccomanda o supporta l'utilizzo di una connessione superiore a 1 gigabyte per il computer di controllo dello strumento, come la scheda PCI Fiber Channel. } Al momento della connessione a una rete, configurare Windows Update in modo che HiSeq non esegua automaticamente gli aggiornamenti. Illumina raccomanda di attendere almeno un mese dopo una release Windows prima di permettere un aggiornamento. Assistenza tecnica di rete Illumina non fornisce servizi di installazione o assistenza tecnica per la connessione in rete dello strumento. Rivedere le attività di manutenzione della rete per eventuali rischi di compatibilità con il sistema Illumina, inclusi i rischi seguenti: } Rimozione di Group Policy Objects (GPO): i GPO possono incidere sul sistema operativo (OS) delle risorse Illumina collegate. I cambiamenti al sistema operativo possono disturbare il software proprietario nei sistemi Illumina. Gli strumenti Illumina sono stati testati e verificati per funzionare correttamente. Dopo aver eseguito i collegamenti GPO del dominio, alcune impostazioni potrebbero incidere sul software dello strumento. Se il software dello strumento non funziona correttamente, consultare l'amministratore IT del laboratorio per le possibili interferenze causate dai GPO. } Attivazione del Firewall Windows e del Defender Windows: questi prodotti Windows possono incidere sui sistemi operativi delle risorse che accedono al software Illumina. Illumina consiglia di acquistare e installare un software antivirus a scelta per proteggere il computer di controllo dello strumento. Per maggiori informazioni, vedere Software antivirus a pagina 11. } Modifiche ai privilegi degli utenti preconfigurati: Illumina raccomanda di mantenere i privilegi esistenti per gli utenti preconfigurati. Tuttavia, gli utenti preconfigurati possono essere resi non disponibili. 12 N. codice 15006407 Rev. I ITA } Se strumenti di sequenziamento multipli inviano dati allo stesso server, l'unità del server potrebbe non essere sufficiente per gestire l'entità del trasferimento dati. Prendere in considerazione la possibilità di configurare gli strumenti in modo che trasmettano dati a server diversi. } Se strumenti di sequenziamento multipli condividono una connessione per inviare dati ai server di destinazione, la connessione potrebbe non essere sufficiente per gestire il trasferimento dei dati. Prendere in considerazione la possibilità di configurare gli strumenti in modo che utilizzino connessioni diverse. Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 13 Considerazioni relative alla rete informatica Strumenti multipli Elaborazione e analisi dei dati Se il cliente non dispone di un sistema di calcolo ad alte prestazioni (HPC, High Performance Computing) adatto alle proprie esigenze di sequenziamento, o nel caso di dubbi sul sistema esistente, Illumina offre una soluzione di elaborazione dati ottimizzata: IlluminaCompute. IlluminaCompute è un'architettura di calcolo scalabile per elaborazione e analisi dei dati genomici su scala umana. IlluminaCompute fornisce una soluzione completa di elaborazione dei dati genomici che comprende hardware, software e servizi di supporto dispiegabile in tempi molto ridotti e senza una infrastruttura di computer preesistente. La tabella seguente descrive i pacchetti IlluminaCompute standard. La tabella contiene inoltre informazioni utili per stimare il tipo di soluzione più adatta alle esigenze del laboratorio. Per ulteriori informazioni rivolgersi a Illumina o al proprio rappresentante vendite. La tabella seguente descrive le soluzioni IlluminaCompute standard. La tabella contiene informazioni utili per stimare il tipo di soluzione più adatta alle esigenze del laboratorio. Per ulteriori informazioni rivolgersi a Illumina o al proprio rappresentante vendite. Tabella 1 Soluzioni IlluminaCompute Sistema standard Numero di sistemi HiScanSQ™ supportati Numero di sistemi HiSeq® 1500 supportati Numero di sistemi HiSeq® 2500 supportati Archiviazione espandibile Calcolo espandibile Configurazione e installazione in sede Suite software IlluminaCompute* Genomi archiviati (BAM umani)† Dati per giorno 4 Sistema avanzato 8 2 4-14 8-592 1 (corsa da 100 Gb) 2-7 4-296 Sì Sì Sì No Sì Sì Sì Sì Sì Sì Sì Sì 200–400 220–770 660–280.000 100 Gb/0,8 genomi 200-1000 Gb/1,7-8,3 genomi 15 ore/1,5 giorni 500-35.500 Gb/4,2-296 genomi** 4 ore/1 giorno Sistema Elite 16 Giorni per corsa su 1 giorno/5,5 giorni CASAVA (100 Gb/600 Gb)‡ * Identificazione delle basi offline, allineamento, identificazione delle varianti, software per la gestione della configurazione e installazione dei nodi e monitoraggio dei cluster, programmazione del lavoro † Il secondo numero corrisponde al sistema base più gli aggiornamenti ** In attesa di verifica; ‡ L'analisi CASAVA si avvia al termine di una corsa di sequenziamento; MB: megabyte, GB: gigabyte, TB: terabyte, PB: petabyte, Gb: gigabase. 14 N. codice 15006407 Rev. I ITA Tabella 2 Informazioni sui componenti del sistema IlluminaCompute Sistema standard Segregazione dei dati in base a cartelle Isilon No e scalabilità PB Scala di lunghezze d'onda I/O da 500 MB/s a diversi GB/s No Server rack Dell con 4 GB RAM per core Sì Blade Dell con 4 GB RAM per core No Tollerante agli errori, chassis blade ad elevata disponibilità No 10 Gbit/s lunghezza d'onda No Basso consumo di energia e generazione di calore Sì CASAVA, identificazione delle basi offline, Platform Sì Cluster Manager, Open Grid Scheduler per la programmazione del lavoro Spazio su disco utilizzabile (TB) 20-40 GB di memoria 128 Gb rendimento/giorno 100 Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 Sistema avanzato Sì Sistema Elite Sì Sì Sì No No Sì Sì Sì No Sì Sì Sì Sì Sì Sì 22-77 144-624 200-1000 66-2.800 384-27.264 500−35.500 15 Elaborazione e analisi dei dati La tabella seguente descrive i componenti di IlluminaCompute. Per ulteriori informazioni rivolgersi a Illumina o al proprio rappresentante vendite. Apparecchiature e materiali di consumo forniti dall'utente I materiali di consumo e le apparecchiature qui elencati sono necessari per una preparazione della libreria, una generazione dei cluster sullo Strumento cluster e un sequenziamento su HiSeq. Per maggiori informazioni, vedere la Guida per l'utente del sistema HiSeq. Materiali di consumo Materiale di consumo 1 M NaOH Salviettine imbevute di alcol isopropilico al 70% oppure etanolo al 70% Provetta per centrifuga, 250 ml Fornitore Fornitore generico VWR, n. di catalogo 95041-714 Provette coniche, 15 ml Provette coniche, 50 ml, con base d'appoggio (facoltative) Guanti monouso, privi di polvere lubrificante Panno da laboratorio a bassissimo rilascio di particelle Carta pulente per lenti, 10x15 cm ca. Scopo Lavaggio dello strumento. Pulizia della cella a flusso e del piano portacelle. Fornitore generico Corning, n. di catalogo Lavaggio dello strumento e 430776 lavaggio per la manutenzione mensile. Corning, n. di catalogo Raccolta e misura del 430052 volume degli scarti. Corning, n. di catalogo Conservazione delle celle a 430921 flusso. Fornitore generico Uso generale. Punte per pipette, da 200 µl VWR, n. di catalogo 21905-026 VWR, n. di catalogo 52846-001 Fornitore generico Punte per pipette, da 1000 µl Fornitore generico Acqua da laboratorio Millipore Pulizia del vano portacella. Pulizia della cella a flusso. Separazione dei volumi dei kit di reagenti. Separazione dei volumi dei kit di reagenti. Rack reagenti SBS, posizione 2. Lavaggio dello strumento. Microprovette Materiale di consumo Provette per microcentrifuga da 1,5 ml Provette per microcentrifuga da 1,7 ml Fornitore VWR, n. di catalogo 20170-038, n. di catalogo 20170-650 o n. di catalogo 89000-028 Axygen, n. di catalogo MCT-150-C VWR, n. di catalogo 20170-575 Axygen, n. di catalogo MCT-175-C Sorenson BioScience, n. di catalogo 16070 Linee guida per l'acqua da laboratorio Per eseguire le procedure dello strumento usare sempre acqua da laboratorio. Non usare mai acqua di rubinetto o acqua deionizzata. Quanto segue sono esempi accettabili: } PW1 Illumina } Acqua con resistività pari a 18 MΩ (Megaohm) 16 N. codice 15006407 Rev. I ITA Apparecchiature e materiali di consumo forniti dall'utente } Acqua Milli-Q } Acqua Super-Q } Acqua sterile per biologia molecolare Apparecchiatura Apparecchio Bilancia, caricamento dall'alto, digitale, capacità 420 g Rack bottiglie, a 6 posizioni provette per centrifuga da 250 ml, con rivestimento epoxy Congelatore, da -25 °C a -15 °C Portaghiaccio Frigorifero, temperatura tra 2 °C e 8 °C Pinzette di plastica con punta quadrata Fornitore Sartorius, Modello CPA423S (o similare) LabScientific, n. di catalogo CBR 200 Fornitore generico Fornitore generico Fornitore generico McMaster-Carr, n. di catalogo 7003A22 (o similare) Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 17 Note Assistenza tecnica Assistenza tecnica Per assistenza tecnica, contattare l'Assistenza tecnica Illumina. Tabella 3 Dati di contatto generali Illumina Sito Web Illumina Email www.illumina.com [email protected] Tabella 4 Numeri di telefono Assistenza clienti Illumina Area geografica Numero di contatto Area geografica Nord America 1.800.809.4566 Italia Austria 0800.296575 Norvegia Belgio 0800.81102 Paesi Bassi Danimarca 80882346 Regno Unito Finlandia 0800.918363 Spagna Francia 0800.911850 Svezia Germania 0800.180.8994 Svizzera Irlanda 1.800.812949 Altri paesi Numero di contatto 800.874909 800.16836 0800.0223859 0800.917.0041 900.812168 020790181 0800.563118 +44.1799.534000 Schede di sicurezza (SDS) Le schede di sicurezza (SDS) sono disponibili sul sito Web Illumina all'indirizzo support.illumina.com/sds.ilmn. Documentazione dei prodotti La documentazione dei prodotti in formato PDF può essere scaricata dal sito Web Illumina. Andare al sito support.illumina.com e selezionare un prodotto, quindi fare clic su Documentation & Literature (Documentazione e letteratura). Guida alla preparazione della sede di installazione di HiSeq 2500, 1500 e 2000 Illumina San Diego, California 92122 U.S.A. +1.800.809.ILMN (4566) +1.858.202.4566 (fuori dal Nord America) [email protected] www.illumina.com
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