Actinopterygian time tree based on the whole mitochondrial genome sequences Jan. 27. 2015. Jun Inoue Orders #17–60 (Nelson 2006) Genus Chondrostei Actinopterygii 428(417-448) Azuma 08 19.Lepisosteiformes Holostei Azuma 08 339(315-360) (personal com.) Actinopteri 381(364-392) Azuma 08 (personal com.) 17.Polypteriformes Polypteridae ポリプテルス科 Inoue 05 82(66-101) Polyodontidae ヘラチョウザメ科 18.Acipenseriformes Acipenseridae チョウザメ科 114(92-144) Inoue 05 65(47-89) 20.Amiiformes Hiodontidae ハイオドン科 21.Hiodontiformes Osteoglossomorpha Pantodontidae パントドン科 22.Osteoglossiformes 253(228-277) Inoue 09 アロワナ目 Osteoglossidae 201(176-226) 142(120-165) 162(138-186) 24.Albuliformes ソトイワシ目 Inoue 04 228(199-262) Inoue 05 Notopteridae ナギナタナマズ科 Elopidae カライワシ科 Megalopidae イセゴイ科 Albulidae ソトイワシ科 Albulidae Notacanthiformes ソコギス目 Notacanthidae 23.Elopiformes カライワシ目 Inoue 04 Teleostei 324(300-344) Azuma 08 (personal com.) Gymnarchidae ギムナーカス科 Mormyridae モルミルス科 Mormyroidea 179(155-204) Neopterygii 360(339-376) Azuma 08 Elopomorpha Lepisosteidae ガーパイク科 33(24-44) Muraenidae ウツボ科 Congridae アナゴ科 25.Anguilliformes Ophichthidae ウミヘビ科 ウナギ目 Inoue 01 Inoue 04 Anguillidae ウナギ科 Eurypharyngidae フウセンウナギ科 26.Saccopharyngiformes Elopocephala 307(282-328) Azuma 08 (personal com.) Muraenesocidae ハモ科 Engraulidae カタクチイワシ科 Clupeidae ニシン科 27.Clupeiformes ニシン目 Otomorpha (Otocephala) 244(216-271) Azuma 08 (personal com.) Alepocephaliformes セキトリイワシ目 28.Gonorynchiformes ネズミギス目 Ostariophysi Reedfish Bichir Polyodon Scaphirhynchus Acipenser Paddlefish Shovelnose sturgeon Sturgeon Lepisosteus Atractosteus Amia Spotted gar Alligator gar Amia Hiodon Pantodon Arapaima Osteoglossum Goldeye ロープフィッシュ ポリプテルス ヘラチョウザメ チョウザメ ガーパイク アミア ハイオドン Butterflyfish Arowana パントドン アロワナ Gymnarchus Gnathonemus Notopterus ジムナーカス モルミルス ナギナタナマズ Elops Megalops Albula Pterothrissus Aldrovandia Notacanthus Gymnothorax Deep-sea spiny eel Moray eel Conger Ophisurus Conger eel Snake eel カライワシ イセゴイ ソトイワシ ギス トカゲギス ソコギス ウツボ アナゴ ウミヘビ Muraenesox Anguilla Eurypharynx Freshwater eel Engraulis Sardinops Anchovy Sardine ウナギ フクロウナギ カタクチイワシ マイワシ ( ニシン科 ) Cobitoidea Balitoridae タニノボリ科 29.Cypriniformes コイ目 Nakatani 11 32.Gymnotiformes 248(227-268) Nakatani 11 Clupeocephala 276(250-301) Azuma 08 Common name Erpetoichthys Polypterus Cyprinidae コイ科 Azuma 08 139(111-169) Ctenoluciidae Characidae 30.Characiformes カラシン目 226(206-245) Nakatani 11 31.Siluriformes ナマズ目 Pimelodidae ピメロドゥス科 Formosania Loach Cyprinus Danio Carp Zebrafish Boulengerella Astyanax Pike-characid Cave fish Pimelodus Long-whiskered catfish Esox Coregonus Salvelinus Oncorhynchus Northern pike Lake whitefish Salvelinus Rainbow trout Plecoglossus Chauliodus Sigmops Ayu Ateleopus Jellynose fish Chlorophthalmus Harpadon Greeneye ( タニノボリ科 ) コイ ゼブラフィッシュ ( コイ科 ) ドウクツギョ ( カラシン科 ) Lepidogalaxiiformes 36.Esociformes カワカマス目 Esocidae Protacanthopterygii Ishiguro 03 35.Salmoniformes サケ目 Ishiguro 03 Ishiguro 03 33.Argentiniformes ニギス目 Plecoglossidae アユ科 34.Osmeriformes キュウリウオ目 Stomiatii Chauliodontidae ホウライエソ科 37.Stomiiformes ワニトカゲギス目 Gonostomatidae ヨコエソ科 Euteleostei Miya 14 249(223-274) Azuma 08 38.Ateleopodiformes シャチブリ目 Ateleopodidae シャチブリ科 Chlorophthalmidae Synodontidae エソ科 39.Aulopiformes ヒメ目 40.Myctophiformes ハダカイワシ目 Myctophidae ハダカイワシ科 Neoteleostei Miya 14 Regalecidae リュウグウノツカイ科 Lampridae アカマンボウ科 41.Lampriformes アカマンボウ目 Eurypterygii Miya 14 Paracanthopterygii Miya 07 Ctenosquamata Miya 14 Acanthomorpha 191(166-216) Azuma 08 52.Stephanoberyciformes クジラウオ目 Percomorpha ≈58.Perciformes Miya M, Nishida M. (2014). The mitogenomic contributions to molecular phylogenetics and evolution of fishes: A 15-year retrospect. Ichthyological Research 61:1–43. ––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– Azuma 08: Azuma Y, Kumazawa Y, Miya M, Mabuchi K, Nishida M (2008) Mitogenomic evaluation of the historical biogeography of cichlids toward reliable dating of teleostean divergences. BMC Evol Biol 8:215. Inoue 05: Inoue JG, Miya M, Venkatesh B, Nishida M (2005) The mitochondrial genome of Indonesian coelacanth Latimeria menadoensis (Sarcopterygii: Coelacanthiformes) and divergence time estimation between the two coelacanths. Gene 349:227–235 Inoue 09: Inoue JG, Kumazawa Y, Miya M, Nishida M (2009) The historical biogeography of the freshwater knifefishes using mitogenomic approaches: a Mesozoic origin of the Asian notopterids (Actinopterygii: Osteoglossomorpha). 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Nakatani 11: Nakatani M, Miya M, Mabuchi K, Saitoh K, Nishida M (2011) Evolutionary history of Otophysi (Teleostei), a major clade of the modern freshwater fishes: Pangaean origin and Mesozoic radiation. BMC Evol Biol 11:177 Poulsen 13: Poulsen JY, Byrkjedal I, Willassen E, Rees D, Takeshima H, Satoh TP, Shinohara G, Nishida M, Miya M (2013) Mitogenomic sequences and evidence from unique gene rearrangements corroborate evolutionary relationships of Myctophiformes (Neoteleostei). BMC Evol Biol 13:111. Song 14: Song HY, Mabuchi K, Satoh TP, Moore JA, Yamanoue Y, Miya M, Nishida M (2014) Mitogenomic circumscription of a novel percomorph fish clade mainly comprising ‘‘Syngnathoidei’’ (Teleostei). Gene 542:146–155 Stm 09: Setiamarga DHE, Miya M, Inoue JG, Ishiguro NB, Mabuchi K, Nishida M (2009) Divergence time of the two regional medaka populations in Japan as a new time scale for comparative genomics of vertebrates. 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Batrachoidiformes 59.Pleuronectiformes カレイ目 Paralichthyidae ヒラメ科 E Carangiformes Carangidae アジ科 Song 14 Miya 03 Arripidea F Nomeidae エボシダイ科 Pelagia Scombriformes Scombridae サバ科 Miya 13 Apogonidae テンジクダイ科 Kurtiformes Near 13 Gobiidae ハゼ科 Gobiiformes C 154 (131-177) Azuma 08 Serranoidei Notothenioidei 55.Gasterosteiformes G Song 14 57.Scorpaeniformes カサゴ目 Serranidae ハタ科 Nototheniidae ノトセニア科 Gasterosteidae トゲウオ科 Scorpaenidae フサカサゴ科 Labridae ベラ科 Azuma 08 Chaetodontiformes Chaetodontidae チョウチョウウオ科 Sparidae タイ科 Azuma 08 Near 13 H Song 14 47.Lophiiformes アンコウ目 Ogcocephalidae アカグツ科 Tetraodontidae フグ科 70 (55-86) 60.Tetraodontiformes Monacanthidae カワハギ科 Yamanoue 08 Azuma 08 アユ ホウライエソ ヨコエソ シャチブリ アオメエソ ミズテング ( エソ科 ) スズキハダカ ( ハダカイワシ科 ) Regalecus Lampris Ribbonfish Opah Polymixia Beardfish Zeus Caelorinchus Theragra Gadus Hoplostethus Monocentris John dory Beryx Sargocentron Poromitra Rondeletia loricata Alfonsino Squirrelfish Paralichthys Microstomus Seriola Flatfishes Dover sole Jack マトウダイ ムグラヒゲ ( ソコダラ科 ) タラ ヒウチダイ キンメダイ カブトウオ アカチョッキクジラウオ ( アンコウイワシ科 ) Katsuwonus Pterapogon Tridentiger ヒラメ マアジ クロマグロ ( サバ科 ) タイセイヨウサバ カツオ トビハゼ Dactyloptena タウナギ Killifish Splitfin Pupfish Platyfish Neotropical silverside ボラ プラティー Blue eye Saury Flyingfish Halfbeak サンマ トビウオ Medaka メダカ Anemonefish Tilapia ティラピア Epinephelus Notothenia Gasterosteus Helicolenus Grouper Atlantic icefish Stickleback Scorpion fish Cheilinus Pseudolabrus Halichoeres Chaetodon Wrasse Tetraodon Tekifugu Stephanolepis アカマンボウ ギンメダイ Pinecone fish Katsuwonus Pagrus Ogcocephalus ツノハダカ ( ハダカイワシ科 ) リュウグウノツカイ Alaska pollack Cod Pterapogon Tridentiger Song 14 Near 13 ニジマス Myctophum Dactylopteridae D Syngnathiformes ヨウジウオ目 Song 14 Dactyloptena Synbranchidae タウナギ科 A 56.Synbranchiformes タウナギ目 Monopterus albus Mugilidae ボラ科 48.Mugiliformes Mugil Aplocheilidae Aplocheiloidei Aplocheilus 51.Cyprinodontiformes Goodeidae B Xenotoca カダヤシ目 Cyprinodontidae Jordanella Stm 09 Cyprinodontoidei Poeciliidae カダヤシ科 Xiphophorus 124 (personal com.) Atherinopsidae Menidia (115-138) 49.Atheriniformes AtherinoMelanotaeniidae morpha Melanotaenia トウゴロウイワシ目 Isonidae ナミノハナ科 136 Iso (115-159) Scomberesocidae サンマ科 Cololabis Azuma 08 Exocoetidae トビウオ科 Exocoetus ダツ目 Hemiramphidae Hyporhamphus Stm 09 50.Beloniformes O.luzonensis Oryzias Northern 118(106-130) O.latipes (HNI) Southern 41(33-50) O.latipes (Hd-rR) 18(13-24) Abudefduf Pomacentridae スズメダイ科 Azuma 08 Amphiprion 159 (136-183) Indo/Sri Lanka 127 Etroplus 87(69-106) Azuma 08 Madagascar Azuma 08 (107-149) Paretroplus Etroplinae Etroplinae Paratilapia Madagascar Ptychochrominae Ptychochromoides Cichlidae Hypselecara カワスズメ科 South America Cichlasomatinae;Heroini Astronotinae;Astronotini Astronotus 96(78-115) Tylochromini Tylochromis Oreochromini 89(72-108) Africa Oreochromis Pseudocrenilabrinae Tropheini Tropheus Neolamprologus Julidochromis Lamprologini Sturmbauer 10 Az 08 カワカマス タイセイヨウサケ タマカイ ( ハタ科 ) イトヨ ユメカサゴ メガネモチノウオ ( ベラ科 ) Butterflyfish Red seabream Batfish タイ ミドリフグ Threadsail filefish トラフグ カワハギ
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