SoftMax® Pro ソフトウェアバージョン 6.0 ソフトウェアリリースノート Introduction SoftMax® Pro ソフトウェアバージョン 6.0 アップデートはメジャーなアップデートです。以前の バージョン 5.4 X と比較してこのバージョンで取り入れられた変更点のまとめを以下に表記い たします。 • SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 での新規項目, ページ 1 • SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 での変更点, ページ 4 • 注意と警告, ページ 6 • よくある質問, ページ 7 SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 での新規項目 強化されたユーザーインターフェース ユーザーインターフェースの改善に焦点を合わせ、アプリケーションは初めから再設計されまし た。以下におもな改善点を列記します: • Template Editor: テンプレート編集ダイアログはユーザーのワークフローと一致しより 直観的にレイアウトできるように再設計されました。 • Reduction Dialog: レダクションダイアログはデータに適用される順序に従って表示され るように再設計されました。 • Microsoft Office 2007 Ribbon interface: リボンはタスクを完了させる必要があるコ マンドを迅速に見出せるように援助します。コマンドは論理グループに組織され、それぞれ のタブの元に集約されました。 • Context-sensitive help: コンテキストヘルプが追加されました。種々のダイアログから SoftMax Pro ソフトウェアアプリケーションヘルプの関連ページへダイレクトに移行できま す。 • Right-click shortcuts: アプリケーション全般にわたって右クリックコンテキストメニュー があります。 • Navigation Tree: ナビゲーションツリーがドキュメント内の全てのセクションを表示し、セ クション名をクリックすることでそのセクションへ移動することができます。 Formula 記述における Syntax Helper Formula 編集ダイアログの新しい Syntax Helper は最初の文字を入力すると同時に想定さ れる accessors, 演算子、関数名と同時にパラメータータイプを提示します。 SpectraMax® Paradigm® 装置のサポート SpectraMax® Paradigm® マルチモードマイクロプレート検出プラットホームとそのカートリッジ がサポートされます。サポートされるカートリッジに関する情報は SoftMax Pro Software User Guide or をご参照ください。 1 リアルタイム入力評価 入力値のリアルタイムフィードバックを示す入力評価の改善が行われ、無効なエントリーはすぐに 修正可能となりました。 Plate クローニング プレートクローニング機能によりプレートセクション内に複数のサブプレートセクションが作成でき、 そのサブプレートセクションごとにテンプレート (グループ) 設定やレダクション計算が行えます。 このことは一組の生データに関して複数の計算やレダクションが行え、別のグループやレダクショ ン計算のためにプレート間でのデータのコピーを行う必要がなくなりました。 新しい Curve Fits と Fitting オプション 新しい回帰計算式が追加。 • 直行双曲線 • 2-Parameter Exponential • Bi-exponential • Bi-rectangular Hyperbola • Two-site competition 直線回帰に対してはパラメーターに固定値を設定することが可能になりました。非直線回帰に関 しては各パラメーターに対して初期 (シード) 値または固定値を設定することが可能になりまし た。各プロットに対して異なったカーブフィットの選択が可能、パラメーターの独立性も計算できま す。T- プロファイル機能に基づく新しい T-分布信頼区間方法が追加されました。 詳細な Curve Fit レポート Curve Fit 計算式、パラメーター値、標準誤差、信頼区間がグラフセクション内に全て表示可能 となりました。設定すれば EC50 も表示されます。 Excel へのエクスポート プレートデータと (グループ) テンプレート配置はテキストや XML フォーマットに加えて *.xls のエクセルフフォーマットにもエクスポート可能となりました。 強化されたノートセクション テキスト編集機能は拡張され、レイアウト機能が拡張するとともにイメージも含めることができま す。 データ回復 アプリケーションは五分ごとに未保存データを自動的に保存し、突然のシステムないしアプリケー ション故障の際はこれらのファイルを回復します。 改善されたプレートとキュベットの表示 プレートとキュベットのデータはデータ取得中及び終了後オートスケールされます。エリアスキャ ンは胃炎のグレーイスケールに代わりカラー表示されます。 2 再設計されたテンプレート編集 テンプレート編集ダイアログはユーザーのワークフローと一致しより直観的にレイアウトできるよ うに再設計されました。第二サンプル記述子が使用可能。規定されていた色分けではなく自由に 色分けの設定が可能。シリーズに対して N 数を 2x2 のブロックのように X と Y 両方向にも 設定可能。シリーズを逆順にも設定可能。テンプレート編集内のみならず外側にも直感的なテン プレートセクションのコピーペーストが可能。 強化されたグループテーブル機能 マウスによるコラムのドラッグドロップ対応。スクロールバーにより横幅の広いグループテーブル の全てのコラムが閲覧可能。 追加エクスポート機能 生プレートデータ、まとめられたプレートデータ、または両者のエクスポートオプション、そして全て のプレートや全てのグループではなくエクスポートするセクションを個々に選択が可能。 Enhancements to Printing 印刷プレビュー機能追加。プリント出力時、グループテーブルのページ付け。 新しいプロトコル 以下のプロトコルが追加: • Derivative spectra.spr The protocol uses the new plate clone feature to allow multiple reductions and displays with a single data set. The displays include: ・ Standard spectral display (OD, RFU, RLU) ・ First derivative of the original spectrum ・ Second derivative of the original spectrum • Equilibrium Binding.spr The protocol uses the Rectangular hyperbola curve fit to estimate directly total binding and dissociation constant (Kd) without the need to transform the data. • Kinetic with smoothing.spr The protocol uses a 5-point, second-order Savitzky-Golay filter to produce a smoothed data set. The smoothing function assumes that the data points are equally spaced. • AlphaScreen 384 HTS.spr This protocol contains default settings suitable for detecting AlphaScreen and AlphaLISA assays on the SpectraMax Paradigm microplate reader using the ALPHA-384 HTS Detection Cartridge. 3 • BRET2.spr This protocol contains default settings suitable for BRET2 assays on the SpectraMax Paradigm microplate reader using the Dual Color Luminescence (LUM-BRET2) Detection Cartridge. • GeneBLAzer.spr This protocol contains default settings suitable for detecting GeneBLAzer assays on the SpectraMax Paradigm microplate reader using the GeneBLAzer Detection Cartridge. This cartridge was designed to be used with Invitrogen’s GeneBLAzer assays. • HTRF.spr This protocol contains default settings suitable for detecting HTRF assays with Europium cryptate on the SpectraMax Paradigm microplate reader using the HTRF Detection Cartridge. • IMAP FP FAM.spr This protocol is designed to simplify data acquisition and analysis of fluorescence polarization (FP) data in conjunction with a SpectraMax Paradigm microplate reader with the Fluorescence Polarization (FPFLUO) Detection Cartridge. • MultiTox-Fluor.spr This protocol contains default settings suitable for detecting MultiTox-Fluor assays on the SpectraMax Paradigm microplate reader using the MultiTox-Fluor Detection Cartridge. This cartridge was designed to be used with Promega’s MultiTox-Fluor cell viability assay. Additional protocols are available for downloading. For more information about available downloads, contact Molecular Devices customer support. その他の改善点 • プリント出力時のヘッダーとフッターの設定。 • Comparing sections within a document in the Comparison view. • Comparing documents using the Vertical or Horizontal Tab groups. • 右下にあるスライドバーによるドキュメントまたはセクションの拡大・縮小。 • Zooming within the graph body, both in the Zoomed Well dialog and a Graph section. • ドキュメント閲覧に際してのマウススクロール。 • Selecting from a list of recently opened documents. • Setting precision and output format for formula results. • グループセクションの各コラムの表示非表示を自由に選択。 • 一次および二次微分に対する新規 formulas とデータのスムージング。 4 SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 での変更点 ライセンス管理 SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 ライセンスはインストール後 14 日以内にアクティベーション が必要。オンラインとオフラインのアクティベーションが選択可能。 自動化 (Robotic) インターフェース The automation interface (technology) has been changed from Windows Messaging to the Microsoft .NET-based assembly. Sample codes and scripts are included in the SoftMax Pro Software v6.0 installer. The SoftMax Pro Automation API Reference Guide and SoftMax Pro Automation Sample Application are available from the Windows Start menu at Start > AllPrograms > Molecular Devices > SoftMax Pro 6.0 > Automation SDK. Protocol Manager Multiple protocol locations or folder paths can be assigned, and protocol files from those locations can be viewed in a single drop-down list. Group Blank Subtraction Group blank behavior is now flexible. Group blanks can be either subtracted from raw data, like plate blanks, or after post-reduction calculations as in SoftMax Pro Software v5.4.2. This can simplify the Fluorescence Polarization protocols. Curve Fits The mathematical libraries used for curve fitting have been upgraded, which might create different results from previous versions. Internal testing has shown that the changes are statistically insignificant. In the case of the Exponential fit, previous versions had an option to choose a “linearized” method. This option is no longer available. Formula Editor Formulas are now case sensitive. In previous versions, including v5.x, formulas were not case sensitive. 自動保存 自動保存設定は各ドキュメント内に保存されます。 吸光測定におけるプレ‐リード プレートブランク 吸光測定におけるプレリードプレートブランクオプションは困惑を引き起こすので削除されました。 現在入手可能な UV プレートではウェル間のばらつき補正がもはや不要だからです。 設定 最短カイネティック間隔の計算がより正確になりました。 装置接続 いつでも接続された装置のリストを閲覧及びリフレッシュできます。 シミュレーションデータ シミュレーションモードでは新しいより現実的なデータが作成されます。. 5 プロトコル 全てのプロトコルは *.spr (SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 プロトコル) 形式に変更。以下 のプロトコルファイルが更新: • Michaelis Menten ・ Parameters are now estimated directly using the rectangular hyperbola curve fit. • Fluorescence Polarization ・ All fluorescence polarization protocols were greatly simplified by using the new group blank feature. For more complete information about the changes made to a specific protocol, see the revision information in the Notes section of the protocol. Other Modifications • Data entry for PathCheck plate background constants has been moved from the Instrument Settings dialog to the Reduction dialog. • AutoRead settings have been moved from the Instrument Settings dialog to a centralized dialog accessible from the Operations tab. Only one delay value is allowed for all plates. • The FP display modes Polarization and Anisotropy have been moved from the Display dialog to the Reduction dialog. • The Kinetic “Peak” reduction has been renamed to “Maximum.” • If a file contains plate settings that are incompatible with the currently selected instrument, the file cannot be opened. 注意と警告 Anti-Virus Programs Molecular Devices recommends that you disable your anti-virus program before installing SoftMax Pro Software, as it might interfere with the installation process. If you have anti-virus programs installed, Molecular Devices recommends that you add the SafeNet HASP License Manager Service (hasplms.exe) to the list of trusted applications in your anti-virus programs. Always On Power Option Allowing your computer to hibernate or turn off during data acquisition can interrupt the transfer of data from the instrument to the software and result in data loss. To prevent this, go to Control Panel > Power Options and set the following power options: • Turn off hard disks: Never • System standby: Never • System hibernates: Never 6 よくある質問 What are the minimum system requirements for running SoftMax Pro Software v6.0? SoftMax Pro Software version 6.0 can be installed on a computer with the following system specifications. Minimum Requirements Software • Windows XP, 32-bit (x86), with Service Pack 3 • Windows 7, 32-bit or 64-bit (x86 or x64) • .NET Framework 3.51 • Internet connection or external USB drive Hardware • Computer that has a 2 GHz or faster processor • 2 GB RAM • 100 MB of available hard disk space • 1024 x 768 or higher-resolution display • CD-ROM Drive Recommended Requirements Software • Windows 7, 32-bit or 64-bit (x86 or x64) • .NET Framework 3.51 • Internet connection Hardware • Computer that has a 2 GHz or faster processor with quad core or higher CPU2 • 4 GB RAM2 • 500 MB of available hard disk space • 1280 x 1024 or higher-resolution display • CD-ROM Drive 1 .NET Framework 3.5 is installed automatically by the SoftMax Pro installer if necessary. 2 If running in a virtual machine, we recommend a quad-core or faster processor with at least 6 GB of RAM. 既に SoftMax Pro ソフトウェア v5.4 以前をインストール済みのコンピュータ に SoftMax Pro ソフトウェア v6.X をインストール可能か? はい。SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 は SoftMax Pro ソフトウェア v5.4 以前とは無関係 にインストール可能で、以前にインストールされたバージョンの操作に干渉しません。このことは 同じコンピュータに二つの異なったバージョンをインストールできることを意味します。 7 SoftMax Pro ソフトウェア v5.x プロトコルやデータファイルを SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 で開くことができるのか? SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 では新しいファイル形式; プロトコルファイルには *.spr そ してデータファイルには *.sda を採用していますが、SoftMax Pro ソフトウェア v5.x ファイ ル (*.ppr と *.pda) はdirectly in SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 で直接開くことができ ます。開くダイアログにてファイル形式の選択が可能で、SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 はオ ープン可能なファイル形式 (v4 以上) を表示します。しかしながら、SoftMax Pro ソフトウェア v5.x ファイル形式で保存することや、SoftMax Pro ソフトウェア 6.0 ファイルを SoftMax Pro ソフトウェア v5.x で開くことはできません。. Can I use the same formula (syntax) in SoftMax Pro Software v6.0 as SoftMax Pro Software v5.x? Yes. SoftMax Pro Software v6.0 uses the same formula syntax as SoftMax Pro Software v5.x. Can I run SoftMax Pro Software v6.0 on Apple MacOS? No. SoftMax Pro Software v6.0 supports only the Microsoft Windows operating system. However, there are tools that enable you to run Windows applications on a Mac OS. Which instruments does SoftMax Pro Software v6.0 currently support? SoftMax Pro Software v6.0 supports the following microplate readers: • SpectraMax® Plus 384 Absorbance Microplate Reader • SpectraMax® M2 and M2e Multi-Mode Microplate Readers • SpectraMax® M3 Multi-Mode Microplate Reader • SpectraMax® M4 Multi-Mode Microplate Reader • SpectraMax® M5 and M5e Multi-Mode Microplate Readers • SpectraMax® Paradigm® Multi-Mode Detection Platform 最初の 6.0 リリースでサポートされていない多くのリーダーは引き続く 6.x リリースでサポート されます。 アクティベーションせずに SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 を使用できるのか? SoftMax Pro ソフトウェア v6.0 はインストール後 14 日間は使用できます、それ以降はアク ティベーションしなければなりません。一つのプロダクトキーにて四 (4) 台までのコンピュータを アクティベートできます。 8
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