Winmostar™ ご紹介 https://winmostar.com/ 株式会社クロスアビリティ X-Ability Co.,Ltd. [email protected] 株式会社クロスアビリティ 2 Winmostar™とは？ WinmostarTMは、分子モデリングから量子化学計算・分子動力 学計算・固体物理計算の実行、および計算結果の表示・可視 化までをPC上で実現するソフトウェアです。 Winmostar™の機能 モデリング・可視化等の基本機能に以下が加わっています。 • ポリマービルダ（モノマー登録、ポリマービルダ、ポリマーセルビルダ） • 界面ビルダ • 結晶ビルダ、表面切り出し、スラブ作成（真空層挿入） • 点群解析(対称化および非対称単位抽出) • Balloonを活用した簡易配座探索 • SMILESによる分子構造入力 • 分子表面積/体積、アスペクト比算出 • Sterimolパラメータ算出 ＃2017年1月9日現在、自動車・電機・化学・素材・医薬品メーカー、国研・大学など507ユーザの シングルライセンス、 36機関での年間ライセンス契約、 無償版＋トライアル版は毎日平均20 ダウンロードがあります。 2017/01/20 Copyright (C) 2008-2017 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 3 Winmostar™とは？ 初期座標作成 分子モデリング、結晶モデリング MOPAC6、MOPAC7 CNDO/S UV-Vis計算ソルバ内蔵 計算ソルバー Gaussian、GAMESS、Gromacs、 LAMMPS、Amber, Quantum ESPRESSO、 FDMNES(XAFSスペクトル)とのインター フェイス GUI 解析結果 ・分子構造 ・電子状態 ・エネルギー変化 ・バンド構造 ・他 2016/10/1 赤字は分子軌道法(MO)ソルバ 青字は分子動力学法(MD)ソルバ 緑字は固体物理計算ソルバ Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 4 実行できる計算の種類 量子化学計算 • • • • • 電子密度、分子軌道 点電荷、静電ポテンシャル IR・ラマン、UV-Vis, NMRスペクト ル 反応座標（IRC）解析 遷移モーメント など 2016/10/1 固体物理計算 • • • • • • 格子定数、電子密度 点電荷、静電ポテンシャル XAFSスペクトル 仕事関数 バンド図、DOS計算 有効遮蔽媒質（ESM）法 分子動力学計算 • • • など • モル体積、熱膨張係数、比熱、体 積弾性率、エンタルピー 自己拡散係数、動径分布関数、 散乱関数 溶解度パラメータ、χパラメータ 溶媒和自由エネルギー など Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 5 MOPACのGUI Winmostar 初期構造の作成 AM1 EF PRECISE GNORM=0.05 NOINTER GRAPHF Winmostar O 0 H 1.1 H 0.96 計算ソルバー 0 0 1 0 1 101.7031 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 2 0 0 0 分子軌道法計算 計算結果の表示 Winmostar AM1 EF PRECISE GNORM=0.05 NOINTER GRAPHF Winmostar ATOM CHEMICAL BOND LENGTH NUMBER SYMBOL (ANGSTROMS) (I) NA:I 1 2 3 O H H 1.10000 * .96000 * BOND ANGLE (DEGREES) NB:NA:I TWIST ANGLE (DEGREES) NC:NB:NA:I 101.70310 * NA NB 1 1 2 NC CARTESIAN COORDINATES NO. ATOM X Y 1 O .0000 .0000 2 H 1.1000 .0000 3 H -.1947 .9400 H: (AM1): M.J.S. DEWAR ET AL, J. AM. CHEM. O: (AM1): M.J.S. DEWAR ET AL, J. AM. CHEM. 2016/10/1 Z .0000 .0000 .0000 SOC. 107 3902-3909 (1985) SOC. 107 3902-3909 (1985) Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 6 MO,UV,Charge,Dipole,NMR[import] Animation[import] Hessian,Raman 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 7 Gromacsセットアップ画面 たんぱくのモデリング Gromacs計算条件設定 acpypeでAM1-BCC電荷、GAFF及びOPLS-AA力場を自 動アサインします。 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 8 LAMMPSセットアップ画面 合金のモデリング LAMMPS計算条件設定 合金用EAMポテンシャルを自動アサインします。 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 9 系の温度、エネルギー、密度などの時間変化 2016/10/1 温度 圧力 密度 体積 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 10 アニメーション 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 11 計算ジョブ投入機能 計算ジョブ投入 SSH 計算結果 サーバー（Linuxクラスター） FOCUS,TSUBAME,京*..等 キューイングシステム LSF,PBS,SLURM,SGE,NQS,ShareTask等 計算エンジン Gaussian,GAMESS,NWChem,Gromacs, LAMMPS 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 12 ライセンス別機能一覧 モデリング機能（※１） プレゼンテーション機能（※１） 分子形状解析（※１） 半経験的量子化学計算（※１） 量子化学計算（※２） 2016/10/1 基本モデリング機能 クリーン（簡易分子力場法による構造最適化） 配座探索(Balloon) SMILES入力 3Dプリンタ(OpenSCAD) レイトレーシング(POV-Ray) GIFアニメーション 特許出願資料用表示 分子表面積/体積計算/卵形度 アスペクト比/慣性半径計算 Sterimolパラメータ計算 点群解析（表示のみ） MOPAC入力データ作成/起動 (MOPAC6内蔵) エネルギー準位／分子軌道／電荷表示 双極子／遷移モーメント表示 反応座標解析 CNDO/S計算機能 (UV/Visスペクトル表示) UV/Visスペクトル表示 Raman/IR, NMRスペクトル表示 GAMESS/Firefly入力データ作成/起動 NWChem入力データ作成/起動 Gaussian入力データ作成/起動 PIO入力データ作成/起動 点群解析 (対称化および非対称単位抽出) Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 13 ライセンス別機能一覧（続き） ジョブ管理機能 分子動力学（MD) （※３） 固体物理計算（※４） ジョブ投入インターフェース (リモート) ジョブマネージャ (ローカル) Gromacs入力データ作成/起動 LAMMPS入力データ作成/起動 Amber入力データ作成/起動 CONFLEX入力データ作成/起動 QM/MM MD計算 Gromacs各種解析ツール起動(LAMMPSコンバータ付) ポリマービルダ 界面ビルダ 自由エネルギー計算 (ER法, BAR法) 散逸粒子動力学 (DPD) 法 結晶ビルダ 表面切り出し スラブ作成 (真空層挿入) Quantum ESPRESSO入力データ作成/起動 FDMNES (XAFSスペクトル) 入力データ作成/起動 第一原理MD計算 バンド図, DOS表示 仕事関数 ESM法 （※１）無償版でも利用可能な共通機能 （※２）QMパックで利用可能 （※３）MDパックで利用可能 （※４）Solidパックで利用可能 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 14 Winmostar™ ライセンス QMパック MDパック + + Solidパック シングルライセンス（永久使用権＋１年保守） 民間企業・官公庁 教育機関 ￥360,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥270,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥150,000 ￥120,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥90,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥50,000 サイトライセンス（年間使用権＋保守） 民間企業・官公庁 ￥1,440,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥1,080,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥600,000 キャンパスライセンス（年間使用権＋保守） 教育機関 ￥960,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥720,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥400,000 学科・専攻ライセンス（年間使用権＋保守） 教育機関 ￥480,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥360,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥200,000 研究室ライセンス（年間使用権＋保守） 教育機関 ￥270,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか2つだと￥180,000 ※QM/MD/Solidパックのいずれか1つだと￥100,000 コーポレートライセンス（年間使用権＋保守） 民間企業・官公庁 個別見積 全ての機能、同一メールで同一バージョンが一回利用可能、3か月利用可能なトライアル版がございます 2016/10/1 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 15 Copyright (C) 2008-2016 X-Ability Co.,Ltd. All rights reserved. 16
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