Cluster - Matrix Science

大規模・高速蛋白質同定システム
MASCOT Server
Cluster
MASCOT Server Cluster は大規模な
質量データや多量の質量データを高速に
処理できる蛋白質同定システムです。マ
スターシステムと複数のノードシステム
から構成され、各ノードシステムに配置
された MASCOT 検索エンジンがひとつ
の配列データベースを同時並行的に検索
するため、サイズの大きな配列データベ
ースも高速に検索することができます。
MASCOT Server Cluster は検索に関わる入出力情報およびデータベースを管理するマスターシステムと、検索を実行す
る複数のノードシステムで構成されています。各ノードシステムには MASCOT 検索エンジンと配列データベースが配置され、
互いにイーサネットによって並列結合されています。
MASCOT Server Cluster はひとつの検索要求(質量データ)に対してひとつの配列データを同時並行的に検索実行する
ため、数万個の MS/MS データで構成された大規模な質量データや大量の質量データを短時間に処理することができ、さらに EST
MASCOT Distiller と MASCOT Daemon
などのサイズの大きな配列データベースを高速に検索することができます。また、
を組み合わせることにより、質量分析計システムから出力される RAW データに対するピークリストの作成から蛋白質の同定まで
の流れを連続化・自動化するための大規模・高速蛋白質同定システムを構築することができます。
MASCOT Server
Cluster
Daemon
Distiller
質量分析計システム
Master System
・検索に関わるデータ入出力情報管理
・配列データベース管理
・ノードシステム管理
動作環境
Windows 2000
Windows XP Professional
Windows 2003
Linux
Internet / Intranet
UPS
GigaBit Hub
Sequences/sec
理論値
14000
実測値
10000
6000
Node System
2000
・検索エンジン
・配列データベース
0
5
10
15
20
25
Number of Processors
30
35
Node 1
プロテオミクスとともに・・・・
マトリックスサイエンス株式会社
Node 2
Node 3
Node N
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