Quick View

NextBioは簡単な操作で様々な種類の情報を公開データベースから検索できます。
遺伝子、疾患名、人名などのキーワードを使って文献やClinicalTrial、NEWSはもちろん、
遺伝子発現解析データや各種のEpigenetic changeの解析データなどを検索閲覧することが
可能です。 キーワードの入力は、データベースの登録用語を利用したAutoComplete機能によって、スペルの補完はもちろん
シノニム、ホモニムの識別など最適な語句を簡単に選べるようになっています。
NextBioはキーワードの種類に応じて検索した各種
解析データとキーワードとの相関が導き出します。
たとえば、BCL2はSpleen(脾臓)で強く発現が確認さ
れる遺伝子でLymphomaとの発症時により大きく変
動が確認されています。
検索により得られ結果の概要をQuick View画面でまとめてみることができ、見ることができる結果の種類はAPIアイコンのカ
ラー表示で確認できます。アイコンは、さらに詳細な内容を確認するためのスイッチになっていて様々な画面から関係のあ
るキーワードの検索を並行して行うことができるように設計されています。
Curated Studies: キーワードに関連した公開データを探します。
Body Atlas
各種健常組織細胞におけるキーワードに含まれる遺伝子(群)の発現値の相対的
傾向を検証します。
Disease Atlas
キーワードに選んだ遺伝子(群)の発現変動と相同性を持つ疾患に関係する
発現解析データを探して疾患との相関を検証します。
Pharmaco Atlas キーワードに選んだ遺伝子(群)の発現変動と相同性を持つ薬物投与に関係する
発現解析データを探して薬物との相関を検証します。
Knockdown Atlas キーワードに選んだ遺伝子(群)の発現に影響を及ぼす遺伝子ノックアウトテストの
発現解析データを検索し、遺伝子間の相関を検証します。
Genetic Markers キーワードに選んだ遺伝子化合物、疾患に関する発現解析データを検索し、
薬物投与、疾患などに特異的に変動を示す遺伝子(群)を探します。
Biogroups
キーワードに選んだ遺伝子化合物、疾患に関する発現解析データを検索し、
薬物投与、疾患などに特異的に変動を示す遺伝子群の関与する代謝系などの
Gene Ontology を推定します。
Genome Browser キーワード(遺伝子 or 発現解析データ )を染色体(ゲノム)マップ上に表示し、
該当領域および周辺に存在する各種の公知の情報を検索します。
Literature
キーワードに関連した論文、報告、記事を探します。
Clinical Trials
キーワードに関連した治験情報(NCBI-Clinical Trial)を検索します。
Meta Analysis
発現解析データを任意に組み合わせて遺伝子やBiogroupの変動パターンを
比較検証します。 発現解析データは最大50まで選択することができ、各々の
発現解析データごとに変動の上下有無の条件を設定することができます。
キーワード検索は、公開データベースの情報欄を利用し
て辞書としても機能します。
遺伝子についての情報を調べると、オルソログ情報をは
じめ代謝系との関係、Transcript情報やSNPに関する詳
細な情報を見ることができます。
化合物、代謝系他のキーワードからも同様の辞書機能が機能します。
辞書機能はNextBioの操作画面中でも機能して検索をしやすくサポート
します。