SCIEX X500 QTOFシステム
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
2016年2月
本書はSCIEX機器をご購入され、実際に使用されるお客様にむけてのものです。本書の著作権は保護さ
れています。本書および本書の一部分を複製することは、SCIEXが書面で合意した場合を除いて固く禁
止されています。
本機器は研究専用です。診断手段としての使用は想定されていません。実験室用診断への使用を推奨
します。保証は後述の通りです。
すべての国で販売されているわけではありません。このような使用はいかなる場合も、これらの製造
業者による製品をSCIEXの供給機器として扱う場合に限り、その権利やライセンスの使用、またはその
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または取引の過程または商慣習から生じるかどうかに関わらず、特定の目的のための市場性または適
合性の保証を含むがこれらに限定されず明示的・黙示的を問わず、いかなる種類の他の保証も行わな
い。そのすべては明示的に放棄されている。またAB Sciexは購買者による使用、またはそれから生じる
逆境が原因の間接的または必然的な損害を含め、一切の責任または偶発債務を負わないものとしま
す。
研究専用。 診断手段としての使用は想定されていません。
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内容
章 1 操作上の予防措置および制限事項..................................................................................................8
一般的な安全情報..................................................................................................................................................8
監督法規の遵守......................................................................................................................................................8
オーストラリアおよびニュージーランド...................................................................................................8
カナダ.................................................................................................................................................................9
欧州.....................................................................................................................................................................9
米国.....................................................................................................................................................................9
国際的.................................................................................................................................................................9
電気系統に関する注意........................................................................................................................................10
交流主電源.......................................................................................................................................................10
接地 アース による保護................................................................................................................................10
化学的注意事項....................................................................................................................................................11
システムの安全流体......................................................................................................................................12
換気に対する注意事項........................................................................................................................................13
環境に対する注意................................................................................................................................................14
電磁環境...........................................................................................................................................................14
停止および廃棄..............................................................................................................................................15
機器の利用と変更................................................................................................................................................15
資格のある技術者................................................................................................................................................16
お問い合わせ先....................................................................................................................................................16
テクニカルサポート............................................................................................................................................17
章 2 ハザードシンボル..........................................................................................................................18
労働安全衛生のシンボル....................................................................................................................................18
シンボル、インジケータおよびラベル 包装.................................................................................................20
記号、インジケータ、ラベル 質量分析装置.................................................................................................22
文書内の記号と規約............................................................................................................................................23
章 3 操作の原則....................................................................................................................................24
システム概要.........................................................................................................................................................24
ハードウェア概要................................................................................................................................................25
パネルシンボル..............................................................................................................................................27
動作原理.................................................................................................................................................................27
データの取り扱い..........................................................................................................................................28
動作原理—SCIEX OSソフトウェア.....................................................................................................................28
ソフトウェア概論..........................................................................................................................................28
スキャンの技術..............................................................................................................................................29
定量分析...........................................................................................................................................................31
解析...................................................................................................................................................................31
結果表...............................................................................................................................................................31
キャリブレーションカーブ..........................................................................................................................32
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内容
回帰方程式.......................................................................................................................................................32
重み付け係数...................................................................................................................................................33
回帰種類...........................................................................................................................................................34
定性分析...........................................................................................................................................................36
章 4 取扱説明書—ハードウェア...........................................................................................................40
システムの起動....................................................................................................................................................40
システムのシャットダウン................................................................................................................................41
ダイバーター バルブ...........................................................................................................................................42
インジェクターモードでのダイバーターバルブ配列............................................................................42
ダイバーターモードでのダイバーターバルブ配列................................................................................44
キャリブラント供給システム...........................................................................................................................45
CDSボトルの交換............................................................................................................................................45
CDSの開始.........................................................................................................................................................46
CDSの停止.........................................................................................................................................................46
CDSのフラッシュ............................................................................................................................................47
章 5 デバイスを設定.............................................................................................................................49
デバイスの追加....................................................................................................................................................49
デバイス設定の編集............................................................................................................................................49
デバイスを削除....................................................................................................................................................50
デバイスを無効にする........................................................................................................................................50
章 6 ソフトウェアへのアクセスを設定................................................................................................52
Users (ユーザー) 概要............................................................................................................................................52
役割と権限.......................................................................................................................................................52
Analytics (分析物) 機能へのアクセス...........................................................................................................54
ユーザーの追加..............................................................................................................................................57
ユーザーを無効にする..................................................................................................................................58
ユーザーの削除..............................................................................................................................................58
全画面モードの有効化........................................................................................................................................58
実験室情報管理システム(LIMS) の設定の選択................................................................................................58
キューオプションの選択....................................................................................................................................59
地域設定を選択....................................................................................................................................................59
化合物ライブラリの管理....................................................................................................................................60
LibraryViewパッケージのインポート...........................................................................................................60
化合物データベースのインポート.............................................................................................................61
Cliquidパッケージのインポート...................................................................................................................62
Excelファイルのインポート..........................................................................................................................63
ライブラリデータベースのスナップショットのインポート ..............................................................64
サードパーティーのライブラリパッケージのインポート ..................................................................64
ライセンスのあるLibraryViewパッケージのインポート..........................................................................65
化合物の不一致 .............................................................................................................................................67
化合物の追加...................................................................................................................................................69
化合物へのマススペクトルの追加.............................................................................................................69
章 7 取扱説明書 – ソフトウェア...........................................................................................................71
Home Page (ホームページ) について..................................................................................................................71
リボンとランチャーについて...........................................................................................................................72
状態パネルについて............................................................................................................................................74
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内容
プロジェクトの追加......................................................................................................................................76
プロジェクトを選択......................................................................................................................................77
デバイス状態のControl (制御) ......................................................................................................................77
状態パネルの表示..........................................................................................................................................77
状態パネルを非表示にする..........................................................................................................................77
データ取得パネル................................................................................................................................................77
ユーザーワークフロー........................................................................................................................................79
Analysts..............................................................................................................................................................79
メソッドディベロッパー..............................................................................................................................79
管理者...............................................................................................................................................................80
Reviewers............................................................................................................................................................80
バッチおよびキューワークスペース...............................................................................................................80
バッチを管理...................................................................................................................................................81
バッチをからインポート..............................................................................................................................81
LIMSからバッチをインポート......................................................................................................................83
バッチを手動で作成します。.....................................................................................................................84
プレートレイアウト機能を使用してバッチを作成する........................................................................87
イオン参照表の作成......................................................................................................................................89
システムの平衡化..........................................................................................................................................89
キューの管理...................................................................................................................................................90
1つのサンプルをキューに提出...................................................................................................................92
複数のサンプルをキューに提出.................................................................................................................93
列の表示または非表示..................................................................................................................................93
キューアイコン..............................................................................................................................................94
「MSメソッド」ワークスペース......................................................................................................................94
MSメソッドの作成.........................................................................................................................................94
MSメソッドの実験.........................................................................................................................................95
MSメソッドについて.....................................................................................................................................97
MSメソッドのパラメータ.............................................................................................................................98
MSメソッドの動的衝突エネルギーを計算する.....................................................................................111
「LCメソッド」ワークスペース......................................................................................................................112
LCメソッドの作成.........................................................................................................................................112
「Explorer エクスプローラ 」ワークスペース..............................................................................................112
分析物の存在の確認....................................................................................................................................112
イオンの抽出.................................................................................................................................................114
トータルイオンクロマトグラムを開く...................................................................................................116
ベースピーククロマトグラムを開く.......................................................................................................119
データおよびピーク表の表示...................................................................................................................122
サンプル情報の表示....................................................................................................................................124
グラフ選択情報の表示................................................................................................................................125
グラフの設定の編集....................................................................................................................................130
グラフでのデータの操作............................................................................................................................132
ダブルペインの操作ツールを使用する...................................................................................................137
ペインまたはウィンドウの移動...............................................................................................................139
ガウシアンスムーズの実行........................................................................................................................141
しきい値データ............................................................................................................................................143
サブセットデータ グラフ選択へ .............................................................................................................144
ベースライン補正クロマトグラム...........................................................................................................146
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内容
クロマトグラムのオフセット...................................................................................................................147
スペクトルの重心作成................................................................................................................................149
テキストとしてデータをエクスポートする..........................................................................................150
テキストとしてピークリストをエクスポートする..............................................................................152
データの印刷.................................................................................................................................................153
オプションのリセット................................................................................................................................154
オプションの設定........................................................................................................................................154
Analytics (分析物) ワークスペース...................................................................................................................157
プロジェクトの安全エクスポート設定を設定......................................................................................157
プロジェクトの修正されたピーク警告の有効化..................................................................................157
プロジェクトのデフォルト設定を定義...................................................................................................158
処理メソッドの作成....................................................................................................................................158
結果表について............................................................................................................................................159
ピークのレビュー........................................................................................................................................181
統計ペインについて....................................................................................................................................189
キャリブレーションカーブ オプション..................................................................................................192
メトリックプロットを使用してデータを分析する..............................................................................194
監査証跡.........................................................................................................................................................196
積分アルゴリズムのパラメータ.....................................................................................................................199
MQ4積分アルゴリズムのパラメータ.......................................................................................................199
AutoPeak積分アルゴリズムのパラメータ................................................................................................202
レポートテンプレートの編集.........................................................................................................................202
Reporterテンプレート...................................................................................................................................204
MS Tune (MSチューン).........................................................................................................................................206
クイック状態チェックの実行...................................................................................................................206
検出器の最適化............................................................................................................................................207
Q1のチューニング........................................................................................................................................208
TOF MSのチューニング................................................................................................................................209
Q1 Highのチューニング................................................................................................................................210
高度なトラブルシューティングの実行...................................................................................................210
装置データの復元........................................................................................................................................211
Event Log (イベントログ) ワークスペース......................................................................................................212
ログを表示.....................................................................................................................................................212
ログの印刷.....................................................................................................................................................212
ログをアーカイブ........................................................................................................................................212
章 8 サービスおよびメンテナンス情報..............................................................................................213
推奨されるメンテナンススケジュール.........................................................................................................213
表面のクリーニング..........................................................................................................................................215
フロントエンドのクリーニング.....................................................................................................................215
汚染の兆候.....................................................................................................................................................216
必要な材料.....................................................................................................................................................216
最良の慣行.....................................................................................................................................................217
質量分析装置の準備....................................................................................................................................218
カーテンプレートのクリーニング...........................................................................................................219
オリフィスプレートの前面を洗浄...........................................................................................................220
質量分析装置の運転を再開........................................................................................................................221
イオン源排気ドレインボトルを空にする.....................................................................................................221
チェックバルブおよび流量モジュールの交換............................................................................................223
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内容
の保管および取扱..............................................................................................................................................224
質量分析装置の移動..........................................................................................................................................224
サポートパッケージの生成..............................................................................................................................229
章 9 質量分析装置のトラブルシューティング....................................................................................230
付録 A 推奨キャリブレーションイオン..............................................................................................232
APCIキャリブレーションイオン......................................................................................................................232
ESIキャリブレーションイオン.........................................................................................................................234
付録 B 正確な質量および化学式.........................................................................................................237
改訂履歴..............................................................................................................................................238
インデックス......................................................................................................................................239
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操作上の予防措置および制限事項
1
注 システムを操作する前に、本ガイドのすべてのセクションを注意してお読みください。
このセクションには、一般の安全関連の情報が含まれており、規制対応の情報が提供されて
います。 また、システムに関する潜在的な危険および関連する警告および危険を最小限にす
るために採るべき予防措置も説明されています。
研究室環境、システムおよび本文書内で使用されている記号と約束事に関する情報について
は、このセクションに加えて、ハザードシンボル 該当ページ 18 を参照してください。 設置
条件要求事項については設置計画概要書を参照してください。ここには交流主電源、イオン
源排気、換気、圧縮空気、窒素および粗引きポンプ要件が含まれています。
一般的な安全情報
個人レベルの傷害やシステムの損傷を防ぐには、この文書および質量分析装置のラベルに記
載されているすべての安全注意、警告をよく読み、理解し、それに従ってください。 これら
のラベルは、国際的に認められた記号で表示されています。 これらの警告に留意しない場
合、重傷に至る可能性があります。
この安全情報は、連邦、州、地方、および地域環境、衛生および安全 EHS 規制を補足するも
のです。 提供される情報は、質量分析装置の操作に関してシステム関連の安全をカバーして
います。 練習する必要のあるすべての安全手順を説明しているわけではありません。 最終的
に、連邦、州、地方、そして地域の EHS規則等の遵守、および安全な研究環境の維持に対す
る責任は、ユーザーと組織にあります。
適切なラボ参考資料と標準業務手順書を参照してください。
監督法規の遵守
本システムは、本セクションに記載されている規制および標準に準拠しています。 日付のあ
る情報については、システムおよび個々のシステムコンポーネント同梱の適合宣言書を参照
してください。 適応ラベルはシステムに貼られています。
オーストラリアおよびニュージーランド
• 電磁両立性 EMC 1992年無線通信法に以下の標準として制定
• 電波障害—AS/NZS CISPR 11/ EN 55011/ CISPR 11 (Class A) 。 電磁妨害 該当ページ 15を参照
してください。
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操作上の予防措置および制限事項
• 安全性 AS/NZ 61010-1、およびIEC 61010-2-061
カナダ
• 電波障害 EMI CAN/CSAA CISPR11。 このISM機器は、カナダICED-001に適合しています。 電
磁妨害 該当ページ 15を参照してください。
• 安全性 CAN/CSA C22.2 No. 61010-1、およびCAN/CSA C22.2 No. 61010-2-061
欧州
• 電磁両立性 EMC 以下の標準で実行されている電磁両立性指令 2004/108/EC
• EN 61326-1
• EN 55011 Class A
電磁両立性 該当ページ 14を参照してください。
• 安全性 以下の標準で実行されている低電圧指令 2006/95/EC
• EN 61010-1
• EN 61010-2-061
• 廃棄物、電気および電子機器 WEEE 廃電気電子機器指令 2012/96/EEC EN 40519で実施され
る通り 廃電気電子機器指令 該当ページ 15を参照してください。
• 梱包および梱包廃棄物 PPW 梱包および梱包廃棄物指令 94/62/EC
米国
• 無線送信妨害規制 47 CFR 15 FCC Part15で実施される通り クラスA
• 安全性 職業安全衛生法、29 CFR 1910 以下の標準で実施される通り
• UL 61010-1
• IEC 61010-2-061
国際的
• 電磁両立性 EMC
• IEC 61326-1
• IEC CISPR 11 クラスA
• IEC 61000-3-2
• IEC 61000-3-3
電磁両立性 該当ページ 14を参照してください。
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操作上の予防措置および制限事項
• 安全性
• IEC 61010-1
• IEC 61010-2-061
電気系統に関する注意
警告 感電の危険性。 カバーを取り外さないでください。 カバーを取り外すと、傷
害またはシステムの故障が発生する場合があります。 定期的なメンテナンス、点
検、または調整のためにカバーを取り外す必要はありません。 カバーを取り外す必
要がある修理については、SCIEXのフィールドサービス担当者 FSE にお問い合わせ
ください。
システムの電気仕様についての詳しい情報は、設置計画概要書を参照してください。
交流主電源
本ガイドの指示の通り、システムを互換性のある交流主電源に接続します
警告 感電の危険性。 すべての電気機器および接続器のインストールは必ず有資格
者が実施し、すべてのインストールが現地規制および安全規格に従うようにしてく
ださい。
警告 感電の危険性。 緊急時にはシステムをAC主電源コンセントから外せるように
してください。 AC 装置主電源コンセントの周囲には物を置かないでください。
警告 感電の危険性。 質量分析装置に付属の電源コードのみを使用してください。
このシステムの操作には、適切な定格ではない電源コードを使用しないでください。
定格の情報については、設置計画概要書を参照してください。
外部ライン変圧器は質量分析装置または粗引きポンプには不要です。
接地 アース による保護
装置主電源には、保護接地 アース が正常に組み込まれていなければいけません。 システム
を接続する前に、資格のある技師により必ず保護接地 アース を設置または確認してくださ
い。
警告 感電の危険性。 接地保護導体系を意図的に妨害しないでください。 接地保護
導体の妨害が生じると、感電の危険性が発生します。
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操作上の予防措置および制限事項
警告 感電の危険性 保護接地 接地ケーブル がサンプルループとイオン源の適切な接
地ポイントの間に接続されていることを確認してください。 この補足的な接地は、
SCIEXによって指定された安全構成を強化するものです。
化学的注意事項
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 クリーニングやメンテナン
ス前に、汚染除去が必要かどうかを判断します。 放射性物質、生物学的病原
体、または有害化学物質が質量分析装置に使用された場合、お客様はクリー
ニングまたはメンテナンス前にシステムに対して汚染除去を行う必要があり
ます。
警告 環境の危険性。 システムコンポーネントを一般廃棄物として処分しないでく
ださい。 コンポーネントを処分する際は、地域の規制に従います。
警告 生物学的危害、有害化学物質の危険性。 漏れを防ぐために、ドレイン
チューブを質量分析装置とイオン源排気ドレインボトルに正しく接続します。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 廃棄物コンテナの廃液にドレインチュー
ブの末端を入れないでください。
• サービスや定期保守の前に、システムに使用された化学物質を特定してください。 化学
物質について遵守する必要がある健康および安全性に関する注意については安全性データ
シートを参照してください。
• 通気性の良いエリアで作業を行ってください。
• パウダーフリーのネオプレン製またはニトリル製手袋、安全メガネ、白衣など、割り当て
られた個人用防護具を常に着用してください。
• 電気安全作業習慣に従ってください。
• イソプロパノール、メタノール、その他可燃性溶剤などの可燃性物質を用いて作業を行う
際には、発火源を避けてください。
• 化学製品の使用および廃棄については十分注意してください。 化学製品の取扱および廃
棄について正しい手順が守られない場合には、個人レベルの傷害の危険性があります。
• クリーニングの間、および使用後の手洗いの際には化学物質が肌に触れないようにしてく
ださい。
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操作上の予防措置および制限事項
• 病原体、毒性、または放射性物質の保管、取扱、廃棄については、地域のすべての規制を
遵守してください。
•
推奨 発生する恐れがある化学物質流出に対処するために、粗引きポンプ、溶剤ボトル、
および廃棄物収集容器の下に二次封じ込めトレイを使用します。
システムの安全流体
以下の流体は、システムを使用すれば安全に使用できます。安全な洗浄液についての情報は、
必要な材料 該当ページ 216 を参照してください。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 他の流体は、SCIEXによって危険がない
ことが確認されるまで、使用しないでください。 これは完全なリストではありません。
• 有機溶剤
• MSグレード アセトニトリル 最大100
• MSグレード メタノール 最大100
• イソプロパノール 最大100
• HPLC-レベルまたはそれ以上の水 最大100
• テトラヒドロフラン 最大100
• トルエンおよびその他芳香溶媒 最大100%
• ヘキサン 最大100
• バッファ
• 酢酸アンモニウム 1 未満
• ギ酸アンモニウム 1 未満
• 燐酸塩 1 未満
• 酸と塩基
• ギ酸 1%未満
• 酢酸 1%未満
• トリフルオロ酢酸 TFA 1%未満
• ヘプタフルオロ酪酸 HFBA 1%未満
• アンモニア 水酸化アンモニウム 1%未満
• リン酸 1%未満
• トリメチルアミン 1 未満
• トリエチルアミン 1 未満
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操作上の予防措置および制限事項
換気に対する注意事項
ガスの排気や廃棄物の処理は必ず連邦政府、州、区域、地域の保健規制や安全規制を遵守し
てください。 地域の保健規制や安全規制に準拠して空気の品質を維持することは、お客様の
責任です。
イオン源排気システムおよび粗引きポンプは、設置計画概要書に推奨されているように、必
ず専用の実験室用ドラフトチャンバーまたは外部排気システムに通気してください。
警告 火災の危険性。 可燃性蒸気がイオン源にたまるのを防ぐため、イオン源排気
システムが接続され機能していることを確認してください。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 排気ガスを専用の実験室用
ドラフトチャンバーまたは排気システムで通気するよう注意して、換気チュー
ブがクランプで固定されていることを確認します。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 システムは、必ず現地規制
に準拠し、実施した作業に対して適切な換気が行われる通気の良い検査室環
境で使用してください。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 イオン源排気管や粗引きポ
ンプ排気ホースが検査室の換気システムに適切に接続されていない場合、質
量分析装置を操作しないでください。 排気チューブを定期的に点検して、漏
れがないようにします。 適切なシステムの換気をせずに質量分析装置を使用
すると、健康を害し、重度の傷害を引き起こす恐れがあります。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 イオン源で使用する有害物
質や障害性物質の適正使用、汚染、排気に関する知識や訓練を受けている場
合に限り、イオン源を使用します。
警告 穿刺災害、放射線障害、生物学的危害、あるいは有害化学物質の危険
性。 イオン源のウィンドウがひび割れたり破損したりした場合、イオン源の
使用を中止して、SCIEXフィールドサービス担当者 FSE にお問い合わせくだ
さい。 装置に導入された有害物質や障害性物質は、イオン源排気出力に存在
します。 認定を受けた検査室安全手順に従い、鋭利物を処分します。
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操作上の予防措置および制限事項
環境に対する注意
送電線、加熱装置、換気装置、配管の供給および固定などのインストールについては資格の
ある担当者にお問い合わせください。 すべての設置が地方条例および有害物質規制を順守し
ていることを確認してください。 システムの環境条件への要求事項に関する情報は、設置計
画概要書を参照してください。
危険 爆発の危険性。 爆発性ガスを含む環境でシステムを操作しないでください。
システムは爆発の危険がある環境での操作を意図していません。
警告 生物学的危害。 生物学的有害物質を使用する場合、危険性評価・制御、およ
び危険物取扱に関する現地規制を必ず遵守します。 本システム、あるいはそのいか
なる部分も、生物学的封じ込めとして機能することを意図していません。
注意 潜在的質量シフト。 周辺温度を安定した状態に保ってください。 温度が2 °C以上変
化すると、分解と質量キャリブレーションに影響する可能性があります。
電磁環境
電磁両立性
基本的電磁環境 公共メインネットワークからの低電圧で直接供給されているという特徴があ
る場所に存在する環境。
性能基準A 基準A 機器は、テスト中またはテスト後に性能の低下なしおよび機能の損失なし
に想定どおりに操作できるものとします。
性能基準B 基準B 機器は、テスト中に機能を損失 1つ以上 する場合があるが、テスト後に性
能がいくらか低下して機能が自己回復可能で想定どおりに操作できるものとします。
性能基準C 基準C 機器は、テスト中に機能を損失 1つ以上 する場合があるが、テスト後に性
能がいくらか低下して機能がオペレータによって回復可能で想定どおりに操作できるものと
します。
機器は、基本的電磁環境での使用を前提としています。
電磁環境耐性条件における予想される性能損失は、総イオンカウント TIC の変化が20%未満で
す。
装置と互換性のある電磁環境が整備されており、装置が想定どおりに使用できることを確認
してください。
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操作上の予防措置および制限事項
電磁妨害
クラスA機器 家庭用施設および住宅用に使用される建物に供給する低電圧電源供給ネットワー
クに直接接続する施設以外のすべての施設内での使用に適する機器 [CISPR 11:2009, 5.3より派
生] クラスA機器はクラスAの制限を満たすものとします。
この装置はクラスAデジタル機器の制限に準拠したテストを行っており、FCC Federal
Communications Commission 連邦通信委員会 コンプライアンス規制パート15の基準を満たして
います。
これらの制限は、装置が商業環境下で用いられた場合に、妨害行為から装置を適切に保護す
る必要性を考慮したものです。 この装置は高周波エネルギーの生成、使用および放出を行い
ます。オペレーターズマニュアルに従ってインストールが行われなかった場合は、ラジオ通
信に障害を発生させるおそれがあります。
住宅地域でのこの装置の操作は、発生した場合に自己負担で妨害を修正する必要がある有害
な妨害を引き起こす恐れがあります。 製造業者によって認可のない変更や調節を行った場
合、装置を使用する権限を剥奪される場合があります。
停止および廃棄
停止の前に、システムを地域の規制に従って汚染除去を行います。
システムをサービスから外す際は、国または地域の換気用規制に従って、異なる素材を分別
およびリサイクルしてください。
注 SCIEXは洗浄フォームの記入のない場合、システムの引き取りはお受けしかねます。フォー
ムのコピーが必要な場合は、FSEにお問い合わせください。
分類していない一般廃棄物としてコンピュータの部品を含むシステムのコンポーネントおよ
びサブアセンブリを廃棄しないでください。
廃電気電子機器指令
WEEE 廃棄物、電気および電子機器 の環境への影響を軽減するため、適切な廃棄規定の地域
の一般廃棄物命令に従ってください。 この機器を安全に廃棄するために、お近くのカスタ
マーサービスに連絡し、無料の機器引き取りおよびリサイクルをご利用ください。
機器の利用と変更
警告 人的危害の危険。 製品の設置、調整、または移設が必要な場合は、SCIEXの担
当者に連絡してください。
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操作上の予防措置および制限事項
警告 感電の危険性。 カバーを取り外さないでください。 カバーを取り外すと、傷
害またはシステムの故障が発生する場合があります。 定期的なメンテナンス、点
検、または調整のためにカバーを取り外す必要はありません。 カバーを取り外す必
要がある修理については、SCIEXのフィールドサービス担当者 FSE にお問い合わせ
ください。
警告 人的危害の危険。 SCIEXが推奨する部品のみを使用してください。 SCIEXが推
奨しない部品を使用したり、用途以外の目的で部品を使用すると、測定者が危険に
晒されたり、システムの性能に悪影響を及ぼしたりする可能性があります。
システムは設置計画概要書で推奨されている環境条件下にある実験室内で使用してください。
システムが製造業者の規定に反した環境および方法で使用された場合、機器の安全性は保障
されません。
システム上で認定外の変更や動作を行ったために個人レベルの負傷や機器の破損が発生した
場合は、保障が適用されない可能性があります。 システムが推奨環境条件下で正しく使用、
および認定外の変更を行って使用されたどちらの場合でも、正常でないデータが生成される
ことがあります。 システムサービスに関する情報は、FSEにお問い合わせください。
資格のある技術者
資格のあるSCIEXエンジニアのみが、装置の設置、検査、およびサービスを行うようにしてく
ださい。システムのインストール後、フィールドサービスエンジニア FSE はカスタマー習熟
チェックリストを使用し、お客様にシステムの動作、クリーニング、基本のメンテナンスを
ご説明します。
製造業者によって認定された技術者のみが、装置のメンテナンスを行うようにしてください。
認定済の実験室では、資格のあるメンテナンス技術者 QMP とともに設置時の手順について習
熟度を深めることもできます。QMPとは、研究室の機器へのサービスに関連する電気および
化学物質のリスクに関して適切な意識のある担当者です。
お問い合わせ先
SCIEX
• sciex.com/contact-us
• sciex.com/request-support
お客様のトレーニング
• 北米 [email protected]
• ヨーロッパ [email protected]
• ヨーロッパおよび北米以外 sciex.com/educationのお問合せ情報を参照してください。
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操作上の予防措置および制限事項
オンライン学習センター
• training.sciex.com
テクニカルサポート
SCIEXおよびその代理店は、十分に訓練を受けた保守/技術専門要員を世界中に配備していま
す。 システムまたは起こり得る技術的問題に関するご質問にお答えします。 詳細は、SCIEX
のウェブサイトsciex.comをご覧ください。
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ハザードシンボル
2
このセクションは、ラボ環境、システム、およびドキュメントで使用されるハザードシンボ
ルと表記規則を示します。
労働安全衛生のシンボル
このセクションでは、ドキュメントや実験室環境で見られるいくつかの労働安全衛生のシン
ボルについて説明します。
表 2-1 一般的警告シンボル
安全シンボル
説明
個人レベルの傷害の危険
持ち上げ操作の危険
表 2-2 化学物質警告シンボル
安全シンボル
定義
病原体の危険
爆発の危険
有毒化学品の危険
火災の危険
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ハザードシンボル
表 2-3 電気系統の警告シンボル
安全シンボル
定義
感電の危険
表 2-4 加圧ガス系統の警告シンボル
安全シンボル
定義
加圧ガスの危険
表 2-5 機会系統の警告シンボル
安全シンボル
定義
高温面の危険
穿刺災害の危険
表 2-6 放射線障害に関する警告シンボル
安全シンボル
定義
イオン化放射の危険
レーザー放射線障害の危険
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ハザードシンボル
シンボル、インジケータおよびラベル 包装
表 2-7 質量分析装置の梱包上のラベル
ラベル シンボル
定義
チルトインジケータ
コンテナが傾斜または誤った取扱いをされていない
かを示します。
または
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船荷証券に記載し、損傷がないか点検してくださ
い。 傾斜に関するあらゆる苦情には、通知が必要
です。
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ハザードシンボル
表 2-7 質量分析装置の梱包上のラベル (続き)
ラベル シンボル
定義
上部を上にしてください
インパクトインジケータ
インジケータが働いている場合、このコンテナは落
下したか、誤って取り扱われています。
船荷証券に注意書きを行い、損傷を確認してくださ
い。 衝撃による損傷に関するあらゆる苦情には通
知が必要です。
または
重要
荷物を受け取る前に、傾いた「IMPACT-O-GRAPHイン
ジケータ」または「TIP-N-TELLインジケータ」を含む
目に見える損傷を貨物運送状に記録してください。
お近くのSCIEXカスタマーサポートエンジニアにす
ぐに通知してください。
乾燥状態を保ってください。
壊れ物
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ハザードシンボル
記号、インジケータ、ラベル 質量分析装置
表 2-8 質量分析装置のラベル
ラベル
定義
警告 ユーザーは内部部品の修理を行わないで
ください。 修理が必要な場合は、資格のある
サービス担当者にお問い合わせください。
使用説明書を参照してください。
FCC準拠。 この装置は、FCC規制のパート15に
準拠しています。 操作は以下の条件を満たす
ものとします (1) この装置は有害な混信を発
生させることがない、および(2) この装置は望
ましくない操作を引き起こす可能性がある混
信を含むいかなる受信した混信も受け入れな
ければならない。
研究専用。 診断手段としての使用は想定され
ていません。
分別されていない一般廃棄物として機器を廃
棄しないでください WEEE 。
警告 持ち上げ操作の危険
この装置を持ち上げるには9人が必要です。
警告 高温面の危険
使用説明書を参照してください。
警告 高圧 感電の危険
保護設置 アース
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ハザードシンボル
表 2-8 質量分析装置のラベル (続き)
ラベル
定義
交流
A
アンペア 電流
V
ボルト 電圧
VA
ボルトアンペア 皮相電力
警告 最初にボトルキャップが確実に固定され
ていることを確認せずに、操作しないこと。
この警告は、イオン源排気排出ボトルに添付
されています。
文書内の記号と規約
このガイド内では以下の記号と規約が適用されます。
危険 「危険」は致命傷や死を引き起こす行動を指します。
警告 「警告」は、注意点を守らなかった場合に個人レベルの負傷を引き起こす可能
性のある行動を指します。
注意 「注意」は注意点を守らなかった場合にシステム損傷やデータ損失を引き起こす可能
性のある行動を指します。
注 「注記」は手順および説明内の重要な情報を指します。
ヒント 「ヒント」は本文記載の技術および手順の応用に役立つ情報です。特別なニーズが
ある場合、手順を短縮する場合の補足事項として使用ください。手順を完了するために必
須のものではありません。
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3
操作の原則
SCIEX X500 QTOFシステムは、化学種の定性・定量分析のために設計されています。
このセクションには、質量分析装置およびSCIEX OSソフトウェア内でハードウェアプロファイ
ルを有効または無効にします。 イオン源の概要に関しては、『イオン源オペレータガイド』
を参照してください。
システム概要
システム構成は以下となります。
• SCIEX X500 QTOF質量分析装置、粗引きポンプを装備。
TM
• Turbo V イオン源 ツインESIプローブまたはツイン大気圧化学イオン化 APCI プローブのい
TM
ずれかを使用 。『Turbo V イオン源オペレータガイド』を参照してください。
• SCIEX提供のコンピュータおよびモニタ、SCIEX OS を機器の最適化、収集メソッド開発、
データ収集のために搭載。コンピュータの仕様と要件については、リリースノート SCIEX
OS
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システムユーザーガイド
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操作の原則
ハードウェア概要
図 3-1 正面および右側のビュー
項目
説明
詳細な情報については…
1
ダイバーターバルブ 標準の位置
フィールドサービスエンジニア
FSE にお問い合わせください。
2
ダイバーターバルブの他の取り付け位置 左側
FSEにお問い合わせください。
3
イオン源
イオン源オペレータガイドを参照
してください。
4
キャリブラントボトル
CDSボトルの交換 該当ページ 45
を参照してください。
5
パネルシンボル
パネルシンボル 該当ページ 27を
参照してください。
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操作の原則
図 3-2 背面および左側のビュー
項目
説明
詳細な情報については…
1
左側バルクヘッド
FSEにお問い合わせください。
2
「Vent 大気開放 」ボタン
システムのシャットダウン 該当
ページ 41を参照してください。
3
ソース接続。 いくつかのイオンソースは、この FSEにお問い合わせください。
ポートに接続します。
4
AUX I/O接続。 オプションのLCシステム開始信号 FSEにお問い合わせください。
は、このポートに接続します。
5
イーサネット接続
FSEにお問い合わせください。
6
窒素供給
FSEにお問い合わせください。
7
排気排出
イオン源排気ドレインボトルを空
にする 該当ページ 221を参照して
ください。
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操作の原則
項目
説明
詳細な情報については…
8
ゼログレードエア供給
FSEにお問い合わせください。
9
排気ガス供給
FSEにお問い合わせください。
10
真空ホースの接続
FSEにお問い合わせください。
11
質量分析装置のコンビニエンススイッチ
システムの起動 該当ページ 40ま
たはシステムのシャットダウン
該当ページ 41を参照してくださ
い。
12
TDCカード用Infinibandケーブル接続 コンピュー FSEにお問い合わせください。
タ
パネルシンボル
表 3-1 は質量分析装置のステータスLEDについて説明します。
表 3-1 パネルシンボル
LED
カ
名称
ラー
説明
緑色 電力
システムに電源が入ったときに点灯します。
緑色 真空
適切な真空 レベルに 到達すると点灯します。真空が適切な レベ
ルに達していない場合は点滅します ポンプダウンおよび通気中 。
緑色 準備完了 システムが準備完了状態にあるときに点灯します。 システムは
作動準備ができた状態である必要があります。
青色 スキャニ システムがデータを取得しているときに点滅します。
ング
赤色 失敗
システムに障害が発生した場合に点灯します。
システムの電源を入れると電源LEDが点灯し、障害LEDが数秒間点滅します。その後、真空LED
が点滅を開始します。適切な真空レベルに到達すると、このLEDは点灯したままになります。
動作原理
質量分析装置はイオンの質量電荷比を測定して、化合物を同定および定量化します。
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操作の原則
SCIEX X500 QTOFシステムには一連の四重極フィルターが搭載されており、質量電荷比 m/z に
®
従ってイオンを伝達します。その中で最初の四重極となるのがQJet イオンガイドであり、オ
®
リフィスプレートとQ0領域の間に配置されています。QJet イオンガイドはイオンを濾過しま
せんが、Q0領域に入る前にイオンにフォーカスします。より幅の広いオリフィスプレートに
®
より作られたより大きなイオン流量に事前にフォーカスされることにより、QJet イオンガイ
ドはシステム感度を増加させ、SN比を向上させます。Q0領域において、イオンはQ1四重極に
通過していく前に再度フォーカスされます。
Q1四重極はQ2衝突セルに入る前にイオンを選別します。Q1四重極は、以下の2種類のモード
で動作します。
• 指定されたm/z範囲内のすべてのイオンをQ2衝突セルに通過させる。これはTOF MSスキャ
ンです。すべてのイオンがTOFシステムによって分析されます。
• 指定されたm/z比を持つ1つのイオンをQ2衝突セルに通過させる。これはTOF MS/MSスキャ
ンです。選択されたイオンだけが分析されます。
Q2衝突セルでは、ガス分子との衝突によってイオンの内部エネルギーが増加され、分子結合
の破壊によるプロダクトイオンの生成に至ります。この手法によってプロダクトイオンのm/z
比を測定し、親イオンの成分を特定することで、分子の構造と化学的性質に関する情報を提
供する実験を設計することができます。
Q2衝突セルの通過後、イオンはTOF領域に入り、さらに質量分析が行われます。検出器への
到達にかかる時間は、それぞれのm/z比によって異なります。検出器では、イオンは電圧パ
ルスに変換される電流を生成します。 このような電圧パルスはカウントされ、パルス数は検
出器に入ったイオン量に直接的に比例します。質量分析装置は電圧パルスを信号に変換し、
その信号を各イオンが検出器に到達するまでにかかった時間と相関させます。信号はイオン
の強度を表し、検出器への到達にかかった時間は具体的なm/z比を表します。質量分析装置
は、このデータを質量スペクトルとして表示します。
データの取り扱い
SCIEX OSを使用するには、Windows 7 64ビットOS搭載のコンピュータが必要です。コンピュー
ターおよび関連するシステムは、システムおよびデータ取得を制御するシステムコントロー
ラーおよび関連するファームウェアによって作動します。 システムの操作中、取得された
データはSCIEX OSへ送信されます。そこでデータは完全な質量分析スペクトル、時間経過に伴
う単一または複数イオンの強度、または時間経過に伴う合計イオン電流として表示すること
ができます。
動作原理—SCIEX OSソフトウェア
ソフトウェア概論
SCIEX OSでは、機器の制御、データの取得、データの処理、およびレポーティング機能などす
べてが1つのパッケージにまとめられています。
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スキャンの技術
本装置は、液体サンプルの液体クロマトグラフィー質量分析を実施して、化合物の同定、定
量、検査ができる多目的で信頼できるシステムです。
本装置は以下の質量分析技術を用いてサンプルの分析を行います
• 単一質量分析 MS の2モード
• 四重極形単一質量分析 Q1キャリブレーションのみ
• 飛行時間型単一質量分析
• タンデム質量分析 MS/MS の1モード
• プロダクトイオン質量分析
さまざまなデータビュー
以下の図は、トータルイオンクロマトグラム TIC および抽出イオンクロマトグラム XIC という
2種類のデータビューの例を示したものです。
TIC 全イオンの強度を時間の関数としてプロットしたものです。
図 3-3 TICの例
XIC 一連のマススペクトルスキャンにおいて、単一または複数の質量値あるいは質量範囲の
強度値によって作成されたイオンクロマトグラムです。これは、該当する質量または質量範
囲の振る舞いを時間の関数として示したものです。
システムユーザーガイド
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29 の 240
操作の原則
図 3-4 XICの例
クロマトログラム
たとえば、ある一連のマススペクトルスキャンを複数回繰り返し実行するように装置がプロ
グラムされている場合、クロマトログラムには、繰り返しの実験における時間を基準とした
一定量の変動が表示されます。クロマトログラムのデータは、データの強度がゼロの場合で
も連続したデータになります。クロマトログラムは装置によって直接生成されるわけではな
く、マススペクトルから生成されます。
クロマトグラムのグラフでは、1秒当たりのカウント cps で表した強度がy軸として表示され、
時間がx軸として表示されます。ピークには自動的にラベルが付けられます。
LC-MSの場合、多くの場合クロマトグラムは時間の関数として表示されます。この時間は特定
のスキャンが取得された時間であり、スキャン番号から参照できます。
クロマトグラムはデータの全体像を提供し、LCカラムを使用している場合は一般的に時間に
依存しますが、ピークのコンポーネントに関する情報を提供します。たとえば、クロマトグ
ラムにピークが1つしか表示されていない場合でも、そのピークが複数の化合物を表す場合が
あります。つまり、質量が異なるということです。
あるサンプルでクロマトグラムの条件が変化した場合、クロマトグラムのデータは時間と強
度の両面で変化が発生する場合があります。
スペクトル
スペクトルとは装置から直接取得されたデータであり、通常は特定の質量電荷比 m/z で検出
されたイオンの数を表します。スペクトルは、m/z値を示すx軸と強度 cps を示すy軸のグラフ
として表示されます。
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操作の原則
MS/MSデータの場合、強度はすべての質量、前駆体、およびフラグメントイオンに関連付け
られています。
データをスペクトルとして表示すると、化合物に関する質量固有の情報が取得されます。ス
ペクトルは特定のピークに注目したものであり、対応する化合物のm/z値を提供します。こ
れは、より具体的な情報を特定する目的で使用できます。たとえばスペクトルにより、各質
量の強度など、ピークを構成するすべての質量が示されます。
スペクトル強度は変化する場合がありますが、化合物の質量は変化しないため、質量は固定
されます。
スペクトルデータを生成する方法は、以下の2通りです。
• スキャンが1つしか取得されていない場合、そのデータはスペクトルとして表示されます。
• クロマトグラムから生成されます。
一般的なスペクトルは分子量とともに表示され、m/z 質量電荷比 のラベルが付けられてx軸
として示されます。強度はy軸として示されます。
定量分析
定量分析はサンプル中の特定の物質の濃度を発見するために使用されます。 未知のサンプル
を分析しそれを既知濃度 基準 を持つ同一物質を含む他のサンプルと比較することによって、
本ソフトウェアは未知のサンプルの濃度を算出することができます。 プロセスには、基準を
使用してキャリブレーションカーブを作成すること、次いで未知のサンプルの濃度を算出す
ることが含まれます。 各サンプルの算出された濃度は次いで結果表の形で利用できます。
解析
LC-MS/MSデータでは、解析とは、特定の化合物に関連したビークのカーブ下にあるエリアを
取得することを意味します。 質量トランジション、予測保管期間、内部標準、解析、および
回帰パラメータを指定する処理メソッドを開発することにより、ソフトウェアは自動で特定
のサンプルセットのピークを解析することができるようになります。
特定のサンプルセットの定量または定性情報をまとめたものが結果表です。結果表 該当ペー
ジ 31を参照してください。
結果表
結果表は、サンプルセットに関連した定量情報および定性情報をまとめたものです。これに
は、キャリブレーション 標準 カーブを補間した結果によって決定される濃度および精度の計
算が含まれます。 結果表には、ライブラリ検索の結果、式検出の結果、およびその他の定性
分析の結果も表示されます。面積、高さ、および他の数値特性が表示されます。 結果表内の
列の番号および種類を編集して、簡素化した表示にすることができます。
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操作の原則
キャリブレーションカーブ
キャリブレーションカーブは、標準濃度カーブとも呼ばれ、不明なサンプルと濃度が分かっ
ている標準サンプルを比較することにより、不明なサンプル内の物質濃度を決定する方法で
す。 キャリブレーションカーブは、装置が分析物 測定が行われる物質 の濃度の変化にどう
反応するか 分析信号 に関するプロットです。 オペレータは、不明なサンプル内の分析物の
予想濃度に近い濃度範囲の一連の標準液を準備します。
キャリブレーション標準は、キャリブレーションカーブの形成に使用されます。 キャリブ
レーションサンプルの正確でない読み取り、または読み取りの欠如は、分析実行に問題があ
ることを示唆している場合があります。 文書に記載されている許容される方法、および規制
当局のガイダンスに従ってキャリブレーションカーブを作成してください。 キャリブレー
ションカーブの準備におけるグッドプラクティスの例には、以下が含まれます
• 分析物の測定を行うブランクのマトリクスにキャリブレーション標準を準備します。
• 測定する各分析物に対し、キャリブレーションカーブを生成します。
• 代表的標本、および非定型標本を含め、分析物の推定濃度範囲を網羅するようにします。
• カーブの生成に、6 8の標準を使用します。
これは包括的なリストではありません。実験室におけるキャリブレーションカーブの作成に
関するベストプラクティスを決定する際には、他のガイダンスも参照する必要があります。
注 分析実行において、1点キャリブレーション標準が使用される場合もあります。 1点キャ
リブレーションは、マトリクスブランクサンプル、および つの標準濃度を使用して実行し
ます。 装置の反応および分析物濃度の間の関係は、これら2つの点で作成される線によって
決定されます。 収集メソッドおよび処理メソッドのどちらも、目的の用途に対する許可を
得る前に検証を行う必要があります。
回帰方程式
このセクションでは、回帰曲線の計算に使用する式について説明します。以下の各式では、
xは「Standard 標準 」サンプルにおける分析物濃度を表し、yは対応するピークの面積また
は高さを表します。回帰に使用する正確な変数は、表 3-2に示すように、内部標準が使用され
ているかどうか、およびピーク面積とピーク高さのどちらが使用されているかによって異な
ります。
表 3-2 回帰変数
内部標準濃度の
使用
面積の使用
x
y
はい
はい
Ca / Cis / DF
Aa / Ais
はい
いいえ
Ca / Cis / DF
Ha / His
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操作の原則
表 3-2 回帰変数 (続き)
内部標準濃度の
使用
面積の使用
x
y
いいえ
はい
Ca/ DF
Aa
いいえ
いいえ
Ca/ DF
Ha
各値の意味
• Ca = 実際の分析物濃度
• Cis = 内部標準の濃度
• DF = 希釈係数
• Aa = 分析物のピーク面積
• Ais = 内部標準のピーク面積
• Ha = 分析物のピーク高さ
• His = 内部標準のピーク高さ
重み付け係数
表 3-3 は、重み付け係数 (式にあるw) を7種類の重み付けのそれぞれで計算する方法を示しま
す。
表 3-3 重み付け係数
重み付けの種類
重み (w)
なし
常に1.0
1/x
|x| < 10 の場合、w = 10 そうでない場合、w = 1 / |x|
2
-5
5
-5
10
-8
8
-8
16
2
1/x
|x| < 10 の場合、w = 10 そうでない場合、w = 1 / x
1/y
|y| < 10 の場合、w = 10 そうでない場合、w = 1 / |y|
2
2
1/y
|y| < 10 の場合、w = 10 そうでない場合、w = 1 / y
ln x
x < 0の場合、エラーが生成 x < 10 の場合、w = ln 10 そうでない場
合、w = |ln x|
ln y
y < 0の場合、エラーが生成 y < 10 の場合、 = ln 10 そうでない場
合、w = |ln y|
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-5
-8
5
8
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操作の原則
回帰種類
キャリブレーションカーブ標準の分析物ピークの面積は、既知の濃度に対してプロットされ
ます。 それに続き、線がポイントにフィッティングされます。 この回帰線は未知サンプルの
濃度を計算するために使用されます。
分析物ワークスペースで、以下の種類の回帰がキャリブレーションカーブのために利用でき
ます
• 直線 (y = mx + b)
• 0を通る直線 (y = mx)
• 平均レスポンスファクター
• 二次式 (y = a2 + bx + c)
• 電力
• Wagner
• Hill
同様に、以下を含む異なる種類の重み付けが回帰のために利用できます
• なし
• 1/x
2
• 1/x
• 1/y
2
• 1/y
• ln(x)
• ln(y)
線型
線型キャリブレーション方程式
y = mx + b
傾きおよび切片は以下のように計算されます
場所
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操作の原則
ゼロ点を通る線型
ゼロ点を通る線型キャリブレーション方程式
y = mx
傾きは以下のように計算されます
平均レスポンスファクター
平均応答要素キャリブレーション
y = mx
これは、ゼロ点を通る線形用方程式と同じものです。 しかし、以下の通り、傾きは別個に算
出されます
応答要素の標準偏差
場所
注 xの値が0であるポイントは、合計から除外されます。
ポイントの線に直線性および湾曲が見られる場合、それらの間で線を作成する際に線型回帰
または二次回帰の代わりに指数回帰を使用してください。
二次
二次キャリブレーション方程式
2
y = a2x + a1x + a0
多項式係数は以下のように計算されます
a2 = (b2/b0 - b5/b3) / (b1/b0 - b4/b3)
a1 = b5/b3 - a2b4/b3
場所
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操作の原則
電力
べき関数キャリブレーション方程式
p
y = ax
線型キャリブレーション用の方程式が上記の説明に従って使用され、傾き m および切片 b の
計算が行われます。ただし、この方程式中のxはln xに、yはln yに置き換えられます。この場
合、aおよびpは以下のように計算されます
b
a=e
p=m
または の値のいずれかが負の数、またはゼロである場合、エラーが報告されます。
Wagner
ワグナーキャリブレーション方程式
2
ln y = a2 (ln x) + a1 (ln x) + a0
二次キャリブレーション用の方程式が上記の説明に従って使用され、a0, a1、およびa2の計算
が行われます。ただし、この方程式中のxはln xに、yはln yに置き換えられます。
または の値のいずれかが負の数、またはゼロである場合、エラーが報告されます。
Hill
ヒルキャリブレーション方程式
n
n
y = (a + bx ) / (c + x )
a、b、c、およびnについて解くための解析関数を提供することはできません。 その代わり、
レーベンバーグ・マーカート反復法を使って係数が決定されます。
定性分析
定性分析とは、ターゲット化合物または未知の化合物を同定することです。質量分析では、
質量精度、保持時間、同位体パターン、ライブラリ検索、式の検出を使用して、どの化合物
が存在するのかを特定します。このようなツールをすべて組み合わせて使用することで、未
知のサンプルに含まれるターゲット化合物および非ターゲット化合物の両方の同定において
信頼性を高めることができます。
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操作の原則
質量精度
サンプル中の既知のターゲット化合物を同定する場合は、化合物の質量精度に注目し、その
化合物に対して可能性のある「ヒット」の質量精度が、一定の許容範囲内に収まっているか
どうかを確認すると便利です。たとえば、イマザリルの化学式はC14H14Cl2N2Oで、小数点以下
4桁まで求めた質量は296.0483です。プロトン化された付加物は正電荷を持つイオンであり、
通常は正確な飛行時間型質量分析計を使用して検出します。イマザリルのプロトン化された
付加物の質量は297.0556です。サンプルにイマザリルの含有が疑われる場合は、検出された
化合物の質量とプロトン化されたイマザリルの質量を比較し、両者がどのくらい類似してい
るかを確認します。化合物の類似性が高い ppmまたはDa ほど、ターゲット化合物と一致する
可能性が高くなります。
保持時間
ほとんどの高精度質量分析システムは、何らかの種類のクロマトグラフィーを使用していま
す。SCIEX X500 QTOFシステムで使用しているのは、液体クロマトグラフィー LC です。LCシス
テムでは、化合物に対応する既知の標準を使用した保持時間が設定されています。この時間
を使用して、サンプル中の既知のターゲット化合物を同定します。未知のサンプルに特定の
化合物が含まれると思われる場合、その保持時間と標準から設定された保持時間が近いほど、
未知の化合物を同定できる可能性が高くなります。保持時間は変更が可能で、更新する必要
があります。
同位体パターン
正確な質量システム上で化合物から得たフルスキャンのマススペクトルは、分子式に基づく
明確な同位体パターンを持ちます。図 3-5は、イマザリルの同位体パターンを示したもので
す。
図 3-5 同位体パターン
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操作の原則
ライブラリ検索
未知のサンプルから取得したMS/MSスペクトルを、基準スペクトルを持つ化合物のデータベー
スと比較するという手法は、定性分析における最も強力なツールの1つです。この手法ではラ
イブラリ検索アルゴリズムを使用し、サンプルの未知のスペクトルを比較してから、そのス
ペクトルと既知のスペクトルおよびデータベースのスペクトルとの一致を試みます。一致の
結果が類似していて、報告されるスコアが高いほど、その化合物を同定できている可能性が
高くなります。
純度、適合性、逆適合性は、以下のように計算されます。
• 補正された ライブラリスペクトルと 補正された 未知のスペクトルの両方で、特定の質量
にピークが存在する場合で、その強度比がユーザー指定の制限内である場合、ライブラリ
スペクトルでのピークの強度は未知のスペクトルの強度と同じ値に設定されます。
• 純度は以下のように計算されます。
2
100.0 (ULtotal) / (Utotal•Ltotal) 各値の意味
Utotal = ∑ Um•Um
Ltotal = ∑ Lm•Lm
ULtotal = ∑ Um•Lm
合計には、強度UmおよびLmが質量で重み付けされた、つまり補正された未知のエントリお
よびライブラリエントリの平方根であるすべての質量が含まれます。純度は常に0から100
の範囲に収まり、ライブラリスペクトルと未知のスペクトルの類似性を示す尺度となりま
す。
• 適合性は純度とまったく同じ方法で計算されますが、合計に含まれるのがライブラリスペ
クトルに出現する質量だけである点が異なります。合計から何らかの項が削除されるわけ
ではないため、LtotalまたはULtotalに影響が及ぶことはありません。適合性は、ライブラリス
ペクトルが未知のスペクトルに含まれる程度を示す尺度となります。適合性が高く純度が
低い場合、その未知のスペクトルは純度が低いものの、ライブラリの化合物を含む可能性
が高いことを示します。
• 逆適合性も純度と同じ方法で計算されますが、合計に含まれるのが未知のスペクトルに出
現する質量だけである点が異なります。逆適合性は、未知のスペクトルがライブラリスペ
クトルに含まれる程度を示す尺度となります。
式の検出
式の検出アルゴリズムでは、正確な質量数を使用して化合物に対応する化学式を予測しよう
とします。これは、正確な質量と質量分析装置から生成されたMSおよびMS/MSスペクトルに
基づいたものです。そのため、Formula Finderのスコアが高いからといって、サンプル中の化
合物が必ずしもFormula Finderによって同定されたものではないことを認識しておくことが重
要です。多くの場合は数ppmの質量誤差の範囲内で複数の式が一致します。注意を払い、他
の確認テストを実行してから、Formula Finderを使用して化合物を同定する必要があります。
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操作の原則
可能性のある式のリストは、前駆体質量の精度、同位体パターン、およびMS/MSフラグメン
テーションを使用して特定します。提示される式には、前駆体質量の精度と一致するフラグ
メントの平均MS/MS質量精度に基づいてスコアが付けられます。
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4
取扱説明書—ハードウェア
警告 システムを使用する際は、ドキュメントに記載された指示に従ってください。
装置がSCIEXによって規定された方法で使用されない場合、装置による保護機能が損
なわれることがあります。
システムの起動
警告 感電の危険性。 緊急時にはシステムをAC主電源コンセントから外せるように
してください。 AC 装置主電源コンセントの周囲には物を置かないでください。
注 装置を操作する前に、操作上の予防措置および制限事項 該当ページ 8に記載の安全性
に関する情報をお読みください。
必要条件
• 設置計画概要書に規定されている施設要求事項に適合していること。設置計画概要書に
は、主電源および接続、圧縮空気、窒素、粗引きポンプ、換気、排気、施設の清掃の各
要件に関する情報が掲載されています。
• イオン源排気ガス、圧縮空気、窒素ガスが質量分析装置に接続されていること。
• 4 Lドレインボトルが質量分析装置の背面にある排気連結部、および研究所の換気システ
ムに接続されていること。
• イオン源排気ホースが質量分析装置、ドレインボトル、換気連結部にしっかりと固定さ
れていること。
• 質量分析装置のコンビニエンススイッチがオフになっていて、主電源ケーブルが質量分
析装置に差し込まれていること。
• 質量分析装置および粗引きポンプの主電源ケーブルが200 VAC 240 VAC主電源に差し込ま
れていること。
1. 粗引きポンプの電源を入れます。
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取扱説明書—ハードウェア
図 4-1 粗引きポンプ – 開始 停止スイッチ
「開始/停止」スイッチは粗引きポンプの主電源接合部の隣にあります。
2. 質量分析装置のコンビニエンススイッチをオンにします。図 3-2を参照してください。
3. コンピュータの電源を入れます。
4. SCIEX OSソフトウェアを起動します。
システムのシャットダウン
注 ガスチューブを外す前に、ガス通路の圧力を下げます。
ヒント 質量分析装置を一定期間使用しない場合は、イオン源をすぐ使用できる状態にした
ままスタンバイモードにしておいてください。質量分析装置をシャットダウンさせるには、
以下の手順に従ってください。 ターボポンプの回転が止まるまで、粗引きポンプを停止さ
せないでください。
1. 継続中のスキャンを完了させるか、停止してください。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 システムをシャットダウンする前に、
サンプル流量を切ります。
2. システムのサンプルフローを停止します。
3. ソフトウェアを閉じます。
4. 必要な場合 「Vent 大気開放 」ボタンを3秒間押します。システムを15分間大気開放しま
す。
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取扱説明書—ハードウェア
注 真空インターフェースのフルクリーニング実行前、Q0領域のクリーニング前、およ
び粗引きポンプオイルの交換前にシステムを大気開放してください。詳細については、
資格のあるメンテナンス技術者 QMP またはFSEにお問い合わせください。
ターボポンプの回転速度が落ち始めます。
5. 質量分析装置のコンビニエンススイッチを切ります。
6. 粗引きポンプの電源を切ってください。
スイッチは粗引きポンプの主電源接合部横にあります。
7. 質量分析装置の主電源ケーブルを、主電源コンセントから取り外します。
8. 粗引きポンプの電源供給ケーブルを、装置主電源から取り外します。
9. 質量分析装置の大気開放を行い、8時間以上使用しない場合は、ニトロゲンガス供給を切
ります。
ガス供給を切るまでは、装置がシャットダウンされて大気開放されても4 L/minの割合で
カーテンプレートからニトロゲンガスが流れ続けます。
ダイバーター バルブ
ダイバーターバルブは、2つのポジションと6つのポートを持つバルブです。インジェクター
モードまたはダイバーターモードで配管することができます。 インジェクターモードでは、
サンプルループを使用して構成し、サンプル注入に対応することができます。ダイバーター
モードでは、各LCランの開始時にサンプルを廃棄に転換するように構成できます。
インジェクターモードでのダイバーターバルブ配列
注意 潜在的に正しくない結果。 運転中、ダイバーターバルブボタンを押さないでくださ
い。 データが不正確になる場合があります。
バルブが位置Aの場合、サンプルが外部ループを流れます。図 4-2を参照してください。 バル
ブを位置Bに変更すると、サンプルが注入されます。図 4-3を参照してください。
• インジェクターモードのバルブを配列します。
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取扱説明書—ハードウェア
図 4-2 ダイバーターバルブ インジェクターモード位置A
図 4-3 ダイバーターバルブ インジェクターモード位置B
表 4-1 図の凡例
項目
説明
1
サンプルイン
2
消耗する
3
サンプルループ ポート3および6
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取扱説明書—ハードウェア
表 4-1 図の凡例 (続き)
項目
説明
4
モバイルフェーズイン
5
カラムに対して カラムが取り付けられていない場合は、質量分析装置に対し
て
ダイバーターモードでのダイバーターバルブ配列
注意 潜在的に正しくない結果 運転中、ダイバーターバルブボタンを押さないでください。
データが不正確になる場合があります。
バルブが位置Aの場合、 サンプルが外部ループを流れます。図 4-4を参照してください。 バ
ルブを位置Bに変更すると、 サンプルが注入されます。図 4-5を参照してください。
• ダイバーターモードのためにバルブを測定してください。 図 4-5を参照してください。
図 4-4 ダイバーターバルブ ダイバーターモード位置A
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取扱説明書—ハードウェア
図 4-5 ダイバーターバルブ ダイバーターモード位置B
表 4-2 図の凡例
項目
説明
1
質量分析装置用
2
カラムから
3
消耗する
キャリブラント供給システム
キャリブラント供給システム CDS では、質量分析装置の自動質量キャリブレーションにキャ
リブレーション溶媒を導入することで、バッチ測定全体を通して装置の質量精度を維持しま
す。
キャリブレーションには約1分半しかかからないため、キャリブレーションは頻繁に実行する
ことをお勧めします。
CDSボトルの交換
警告 有害化学物質の危険性。 化学製品の安全データシートを参照し、化学物質の
取り扱い、保管、処理についての全ての安全ガイドラインに従ってください。 安全
衛生対策は、化学的注意事項 該当ページ 11を参照してください。
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取扱説明書—ハードウェア
CDSは、最大で2本のキャリブラントボトルに対応しています。ボトル1はポジティブキャリブ
ラント溶液で使用し、ボトル2はネガティブキャリブラント溶液で使用します。二次汚染を防
ぐため、ボトルは正しい方向で取り付けてください。
1. ボトルを反時計回りに回して、CDSから取り外します。
2. 新しいボトルを時計回りに回して取り付けます。
CDSの開始
CDSをフラッシュする場合、またはチューニング中に溶液を導入する場合は、ダイレクトコ
ントロール機能を使用して手動でCDSを開始します。
1. 状態パネルで、「Direct CDS Control ダイレクトCDSコントロール 」アイコン
クします。
をクリッ
「Device Control デバイス制御 」ダイアログが表示されます。
図 4-6 Device Control デバイス制御 CDS
2. 「Start 開始 」をクリックします。
CDSの停止
1. 状態パネルで、「Direct CDS Control ダイレクトCDSコントロール 」アイコン
クします。
をクリッ
2. 「Stop 停止 」をクリックします。
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取扱説明書—ハードウェア
CDSのフラッシュ
警告 有害化学物質の危険性。 化学製品の安全データシートを参照し、化学物質の
取り扱い、保管、処理についての全ての安全ガイドラインに従ってください。 安全
衛生対策は、化学的注意事項 該当ページ 11を参照してください。
別のキャリブラント溶液を取り付ける前に、必ずCDSチューブをフラッシュして既存のキャ
リブラントを取り除いてください。この手順は、両方のCDSボトルに適用されます。
必要な材料
• 洗浄溶液のボトル 水とアセトニトリルを1:1で混合
• 廃棄物コンテナ
1. キャリブラントボトルを取り外します。
2. キャリブラントチューブの両端を廃棄物コンテナに入れます。チューブを液体に浸さない
ように注意してください。
装置から排出される溶液に対応できるように、コンテナは最低でも20 mLの溶液を余分に
保持できる必要があります。
3. SCIEX OSで、次のステップに従ってCDSを洗浄モードに移行します。
a. 状態パネルで、「Direct CDS Control ダイレクトCDSコントロール 」アイコンをクリッ
クします。
「Device Control デバイスコントロール 」ダイアログが表示されます。
図 4-7 Device Control デバイスコントロール CDS
b. 「Wash Mode 洗浄モード 」を選択します。
これにより、ボトルセンサーによってポンプを制御できるようになります。
4. ボトルセンサーのスイッチを1分間押したままにして、ポンプを始動します。
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取扱説明書—ハードウェア
CDSが空気を吸い込み、液体を排出します。ポンプを停止するには、スイッチの押下をや
めます。
5. 廃液を廃棄します。
6. 吸入チューブ 左側 を洗浄液のボトルに入れます。
7. リターンチューブ 右側 を廃棄ボトルに入れます。
8. ソフトウェアが洗浄モードのままであることを確認します。
9. ボトルセンサーのスイッチを1分間、または20 mLの溶媒が廃棄物コンテナに溜まるまで押
し続けます。
10. 廃液を廃棄します。
11. ステップ 2からステップ 5を繰り返して、洗浄液をパージします。
12. オプション 吸入チューブを新品のキャリブラント溶液のボトルに入れ、ステップ 6からス
テップ 9を繰り返して新品のキャリブラントでCDSをフラッシュします。サンプルを保護
するため、パージは10秒間だけ、または2 mL 3 mLの溶液が廃棄物コンテナに溜まるまでの
間に留めてください。
ヒント 新品のキャリブラントをキャリブラントボトルで再循環させる前に、新品のキャ
リブラント溶液でチューブをフラッシュしておくことをお勧めします。
13. SCIEX OSで、「Wash Mode 洗浄モード 」をクリアします。
14. リターンチューブをキャリブラントボトルに入れ、ボトルを取り付けます。
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5
デバイスを設定
Configuration (構成) をワークスペースとして使用して以下を行います
• デバイスを有効または無効にする
• デバイスを追加または削除する
• デバイス設定を編集する
• デバイスをテストする
デバイスの追加
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの Devices (デバイス) をクリックします。
3. Deactivate (無効) をクリックします。
4. Add (追加) をクリックします。
Device (デバイス) ダイアログが開きます。
5. Type (種類) リストで、必要な種類を選択します。
選択した種類は、「モデル」フィールドに表示されます。
6. Settings (設定) をクリックして、設定の編集またはデフォルト値の復元を行います。
7. Test Device (デバイスのテスト) をクリックして、デバイスが正しく設定されていて使用
可能であることを確認します。
8. Saveをクリックします。
9. Activate Devices (デバイスを有効にする) をクリックします。
Devices (デバイス) リストで選択されているすべてのデバイスが有効にされます。
デバイス設定の編集
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの Devices (デバイス) をクリックします。
3. Deactivate (無効) をクリックします。
4. 統合システムまたは質量分析装置のいずれかを選択します。
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デバイスを設定
Included (含まれる) チェックボックスが選択されます。
5. Edit (編集) をクリックします。
「デバイス」ダイアログが表示されます。
6. 必要に応じてデバイスを編集します。
• Settings (設定) をクリックして、デバイスコンポーネントについての情報を見て、デ
バイスのデフォルト値を復元し、デバイスをテストします。
• Test Device (デバイスのテスト) をクリックして、デバイスが正しく設定されていて使
用可能であることを確認します。
7. Test Device (デバイスのテスト)をクリックします。
テストに成功した場合、緑色の情報メッセージが表示されます。 そうでない場合は、情
報メッセージは構成が無効で更新が必要であることを示します。
8. Saveをクリックします。
9. Activate Devices (デバイスを有効にする) をクリックします。
Devices (デバイス) リストで選択されているすべてのデバイスが有効にされます。
デバイスを削除
注 削除中のデバイスが統合システムの一部である場合、統合システムのすべてのデバイス
が削除されます。 ユーザーは、統合システムの中の1つのデバイスを削除することはできま
せん。
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます
2. 左側のパネルの Devices (デバイス) をクリックします。
3. Deactivate (無効) をクリックします。
4. デバイスを選択します。
5. Delete (削除) をクリックします。
6. Activate Devices (デバイスを有効にする) をクリックします。
Devices (デバイス) リストで選択されているすべてのデバイスが有効にされます。
デバイスを無効にする
1. 「Configuration 構成 」ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの「Devices デバイス 」をクリックします。
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デバイスを設定
3. 「Deactivate 無効 」をクリックします。
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6
ソフトウェアへのアクセスを設定
このタスクを実行できるのは、管理者またはメソッドディベロッパーの役割が割り当てられ
ているユーザーだけです。
Users (ユーザー) 概要
ユーザーがこの機能へのアクセス権を持っている場合、タイトルに「Users ユーザー 」とい
うラベルが付けられます。ユーザーがアクセス権を持っていない場合、タイトルは非表示に
なります。
役割と権限
ユーザーには2つ以上の役割を割り当てることができます。
表 6-1 役割と権限
権限
管理者
メソッド開発
者
Analyst
レビューア
「キュー」ワークスペースへ
のアクセス
はい
はい
はい
いいえ
「バッチ」ワークスペースへ
のアクセス
はい
はい
はい*
いいえ
以下の定量化設定へのアクセ
ス
はい
いいえ
いいえ
いいえ
• プロジェクトの安全エクス
ポート設定
• プロジェクトの修正された
ピーク警告の有効化
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ソフトウェアへのアクセスを設定
表 6-1 役割と権限 (続き)
権限
管理者
メソッド開発
者
Analyst
レビューア
はい
はい
いいえ
いいえ
LISに移動
はい
はい
いいえ
はい
以下の基本定量化設定および
機能へのアクセス
はい
はい
はい
いいえ
結果のレビュー
はい
はい
はい
はい
LCメソッド
はい
はい
いいえ
いいえ
MSメソッド
はい
はい
いいえ
いいえ
データの探索
はい
はい
はい
はい
ログを見る
はい
はい
はい
はい
ログをアーカイブ
はい
いいえ
いいえ
いいえ
LISを設定
はい
はい
いいえ
いいえ
デバイスを設定
はい
はい
はい
いいえ
以下のアドバンスト定量化設
定および機能へのアクセス
• プロジェクト積分のデフォ
ルト
• プロジェクト単位 キャリブ
レーションのデフォルト
• 処理メソッドの作成
• 結果表の定量化メソッドを
*.qmethodとしてエクスポー
ト
• ロック解除された結果表を
エクスポートして保存
• レポートを作成してロック
解除された結果表を保存
• 列設定の修正
• カスタム列の追加
• 結果表のロック解除
• 結果表の作成
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ソフトウェアへのアクセスを設定
表 6-1 役割と権限 (続き)
権限
管理者
メソッド開発
者
Analyst
レビューア
デバイスアドバンストオプ
ションを設定
はい
はい
いいえ
いいえ
Users (ユーザー) ワークスペー
スにアクセスして、ユーザー
と割り当てられた役割を追加
します。
はい
いいえ
いいえ
いいえ
質量分析装置の最適化
はい
はい
いいえ
いいえ
プロジェクトの追加
はい
はい
いいえ
いいえ
*アナリストはロックされたMSおよびLCメソッドを用いてのみデータを取得できます
Analytics (分析物) 機能へのアクセス
注 Analyticsワークスペースから制御されるデータ出力方法は、結果表のエクスポート、LIMS
へのデータ転送、およびレポーティングです。 その他の出力データソース 結果表からのコ
ピーや貼り付けなど は制御されていません。 規制上、制御されていない出力メソッドを使
用しないでください。
表 6-2 Analytics (分析物) 機能へのアクセス
権限
管理者
メソッド開発者
Analyst
レビューア
セッションファ
イルの作成
はい
はい
はい
いいえ
処理メソッドの
作成
はい
はい
いいえ
いいえ
処理メソッドの
修正
はい
はい
いいえ
いいえ
ロック解除され
た結果表のレ
ポートのエクス
ポートおよび作
成
はい
はい
いいえ
いいえ
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ソフトウェアへのアクセスを設定
表 6-2 Analytics (分析物) 機能へのアクセス (続き)
権限
管理者
メソッド開発者
Analyst
レビューア
保存するときに
既存の結果表を
置き換える
はい
はい
いいえ
はい
デフォルトの処
理メソッドの設
定を変更
はい
はい
いいえ
いいえ
デフォルトの処
理メソッドの積
分アルゴリズム
の変更
はい
はい
いいえ
いいえ
デフォルトの処
理メソッドの積
分パラメータの
修正
はい
はい
いいえ
いいえ
プロジェクトの
修正されたピー
ク警告の有効化
を許可
はい
いいえ
いいえ
いいえ
プロジェクトの
安全エクスポー
ト設定を許可
はい
いいえ
いいえ
いいえ
結果表にサンプ
ルを追加
はい
はい
はい
いいえ
結果表からサン
プルを削除
はい
はい
はい
いいえ
サンプル名の修
正
はい
はい
いいえ
いいえ
サンプル種類の
修正
はい
はい
はい
いいえ
サンプルIDの修正
はい
はい
いいえ
いいえ
実際の濃度の修
正
はい
はい
はい
いいえ
希釈係数の修正
はい
はい
はい
いいえ
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ソフトウェアへのアクセスを設定
表 6-2 Analytics (分析物) 機能へのアクセス (続き)
権限
管理者
メソッド開発者
Analyst
レビューア
コメントフィー
ルドの修正
はい
はい
いいえ
いいえ
手動積分を許可
はい
はい
はい
いいえ
ピークに設定が
見つからないを
許可
はい
はい
はい
いいえ
結果表にピーク
を含めるまたは
そこから除外
はい
はい
はい
いいえ
濃度の単位およ
びフィッティン
グと重み付けの
ための回帰設定
を修正
はい
はい
いいえ
いいえ
1つのクロマトグ
ラムのための結
果表の積分パラ
メータを修正
はい
はい
はい
いいえ
結果表の化合物
のための処理メ
ソッドを修正
はい
はい
はい
いいえ
結果表のメト
リックプロット
の作成、使用、
またはエクス
ポート
はい
はい
はい
はい
カスタム列の追
加、名前変更、
または修正
はい
はい
いいえ
いいえ
カスタム列の削
除
はい
はい
いいえ
いいえ
結果表の列設定
の修正
はい
はい
いいえ
いいえ
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システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
表 6-2 Analytics (分析物) 機能へのアクセス (続き)
権限
管理者
メソッド開発者
Analyst
レビューア
列設定をプロ
ジェクトのデ
フォルトとして
保存
はい
はい
いいえ
いいえ
結果表をロック
して保存
はい
はい
はい
はい
結果表をロック
解除して保存
はい
はい
いいえ
いいえ
結果表をレ
ビューして保存
はい
はい
いいえ
はい
バーコードの修
正
はい
はい
いいえ
いいえ
外部キャリブ
レーションのエ
クスポート、イ
ンポート、また
は削除
はい
はい
いいえ
いいえ
比較サンプル割
り当ての変更
はい
はい
いいえ
いいえ
MSMSスペクトル
をライブラリに
追加
はい
はい
いいえ
いいえ
ユーザーの追加
1. 「Users ユーザー 」ワークスペースを開きます。
2. Add User (ユーザーの追加) をクリックします。
「ユーザーの選択」または「グループ」ダイアログが開きます。
3. OKをクリックします。
4. 左側のパネルでユーザーまたはグループをクリックします。
5. 役割を選択します。
ヒント ユーザーには2つ以上の役割を割り当てることができます。
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57 の 240
ソフトウェアへのアクセスを設定
6. Saveをクリックします。
ユーザーを無効にする
1. 「Users ユーザー 」ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルでユーザーまたはグループをクリックします。
3. Active (有効化) チェックボックスをクリアします。
4. Saveをクリックします。
ユーザーの削除
この手順を使用して、ユーザーをソフトウェアから削除します。 ユーザーをMicrosoft Windows
から削除した場合、そのユーザーはSCIEX OSからも削除する必要があります。
1. 「Users ユーザー 」ワークスペースを開きます。
2. Users (ユーザー) リストでユーザーまたはグループをクリックします。
3. Remove User (ユーザーの削除) をクリックします。
全画面モードの有効化
この機能を選択して、SCIEX OSソフトウェアを主要アプリケーションとして使用します。 ユー
ザーは、ソフトウェアを閉じたり、その他のソフトウェアプログラムにアクセスしたりする
ことはできません。
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの General (一般) をクリックします。
3. General (一般) から、Enable (有効化) を選択してFull Screen Mode (全画面モード) を有
効にします。
4. Saveをクリックします。
実験室情報管理システム(LIMS) の設定の選択
この機能を使用して、LISサーバーに接続します。 ユーザーは、バッチ情報をLISからインポー
トでき、またそこに結果をエクスポートすることもできます。
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルのLIMS Communication (LIMS通信) をクリックします。
3. 「LISMS Server LISMSサーバー 」フィールドにサーバーアドレスを入力します。
4. Enabled (有効) チェックボックスを選択します。
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58 の 240
システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
5. Saveをクリックします。
キューオプションの選択
キューは、保留中の送信済みサンプルのリスト、または手動で送信されたサンプルを1つずつ
進行させます。各サンプルは、選択された測定メソッドを使用して実行されます。すべての
サンプルの測定が完了するとキューが停止し、システムは準備完了状態になります。また、
「Instrument Idle Time 装置のアイドル時間 」フィールドに設定されている時間が経過すると、
システムはスタンバイ状態になります。スタンバイ状態では、LCポンプとカラムオーブン、
さらには質量分析装置の一部のコンポーネントの電源がオフになります。ただし、サンプル
の劣化を防ぐため、オートサンプラーの温度制御はオンの状態が保たれます。
最後の測定が完了した後にキューの実行状態を保つ時間の長さを変更できるのは、管理者ま
たはメソッドディベロッパーに割り当てられているユーザーだけです。この時間が経過する
と、装置はスタンバイ状態になります。
1. 「Configuration 構成 」ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの「Queue キュー 」をクリックします。
3. 「Instrument idle time 装置のアイドル時間 」フィールドに、システムが準備完了状態を
保つ時間を分単位で入力します。この時間が経過すると、スタンバイ状態に移行します。
4. 「Maximum number of acquired samples allowed 測定するサンプルの最大数 」フィー
ルドに数値を入力します。
5. 「If a sample is missing, proceed to the next sample サンプルが見つからない場合は次
のサンプルに進む 」チェックボックスを選択します。サンプルが見つからない場合、
キューは次のサンプルに進みます。
6. 「If calibration fails, proceed to the next sample キャリブレーションに失敗した場合は
次のサンプルに進む 」チェックボックスを選択します。キャリブレーションに失敗した
場合、キューは次のサンプルに進みます。
7. 「Save calibration data (in the current project) キャリブレーションデータを現在のプロ
ジェクトに保存する 」チェックボックスを選択します。
8. 「Save 保存 」をクリックします。
地域設定を選択
この機能は、Control Panel (コントロールパネル) で選択された地域設定と言語設定を適用しま
す。 ピリオド「.」 またはカンマ「,」のみが小数点の記号として使用できます。 桁のグルー
ピングには対応していません。
1. Configuration (構成) ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの General (一般) をクリックします。
システムユーザーガイド
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59 の 240
ソフトウェアへのアクセスを設定
3. Regional Settings (地域設定) の下のGeneral (一般) パネルで、Apply (適用) をクリックし
ます。
Windowsオペレーティングシステムで設定されている地域設定は、コンピュータを再起動
した後にソフトウェアに適用されます。
4. Saveをクリックします。
5. コンピュータを再起動します。
化合物ライブラリの管理
LibraryViewパッケージのインポート
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「LibraryView Package (*.lbp)
LibraryViewパッケージ *.lbp 」をクリックします。
5. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
6. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
7. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
8. 「Next 次へ 」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
9. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
10. 「Finish 完了 」をクリックします。
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システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
化合物データベースのインポート
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 次のいずれかを実行します。
• 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「DiscoveryQuant Compound
Database (*.mdb) DiscoveryQuant化合物データベース *.mdb 」をクリックします。
• 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Analyst Compound Database
(*.mdb) Analyst化合物データベース *.mdb 」をクリックします。
5. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
6. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
7. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
8. 次のいずれかを実行して、ライブラリに化合物を追加します。
• 「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リストから適切なライブラリ
を選択します。
• ライブラリの名前を「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リスト
フィールドに入力します。
9. 「Next 次へ 」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
10. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
11. 「Finish 完了 」をクリックします。
システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
Cliquidパッケージのインポート
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Cliquid Package (*.clq) Cliquid
パッケージ *.clq 」をクリックします。
5. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
6. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
7. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
8. 次のいずれかを実行して、ライブラリに化合物を追加します。
• 「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リストから適切なライブラリ
を選択します。
• ライブラリの名前を「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リスト
フィールドに入力します。
9. 「Next 次へ 」をクリックします。
10. 必要に応じて、「Instrument Name 装置名 」ダイアログの「Instrument Name 装置名 」
フィールドに質量分析装置の名前を入力します。
11. 「OK」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
12. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
13. 「Finish 完了 」をクリックします。
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62 の 240
システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
Excelファイルのインポート
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Excel file (*.xls) Excelファイ
ル *.xls 」をクリックします。
5. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
6. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
7. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの目的の「Excel worksheet to
import インポート対象のExcelワークシート 」を選択します。
8. ワークシートに列ヘッダーが含まれている場合は、「Selected Excel Worksheet has
headers 選択したExcelワークシートには列ヘッダーが含まれています 」チェックボック
スを選択します。
9. 必要に応じて、「Instrument Name for Transition 移行する装置名 」フィールドに質量
分析装置の名前を入力します。
10. 情報の各列に対して適切な見出しを選択します。
ヒント 「Compound:CompoundId 化合物 化合物ID 」および「Compound:Name 化合
物 名前 」は必須の選択肢です。必要のない情報については、「---[not used]--- 未使用 」
を選択します。
11. 「Next 次へ 」をクリックします。
12. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
13. 次のいずれかを実行して、ライブラリに化合物を追加します。
• 「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リストから適切なライブラリ
を選択します。
• ライブラリの名前を「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リスト
フィールドに入力します。
システムユーザーガイド
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ソフトウェアへのアクセスを設定
14. 「Next 次へ 」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
15. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
16. 「Finish 完了 」をクリックします。
ライブラリデータベースのスナップショットのインポート
TM
注意 データ損失の発生要因。このパッケージの情報によって、LibraryView ソフトウェ
アデータベースのすべての既存データが上書きされます。インポートの開始後は、操作を
取り消すことはできません。この手順を実行する前に、現在のデータベースのバックアッ
プを作成しておくことをお勧めします。
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Overwrite Database with
Library Snapshot (*.lbp) ライブラリのスナップショット *.lbp でデータベースを上書き
する 」をクリックします。
5. 「Warning 警告 」ダイアログで「Yes はい 」をクリックします。
6. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
7. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
8. 「Finish 完了 」をクリックします。
サードパーティーのライブラリパッケージのインポート
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Import インポート 」アイコンをクリックします。
4. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Third Party Library Package
(*.tplp) サードパーティーのライブラリパッケージ *.tplp 」をクリックします。
5. 「開く」ダイアログで、目的のファイルまで移動します。
6. ファイルを選択して「Open 開く 」をクリックします。
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ソフトウェアへのアクセスを設定
7. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
8. 次のいずれかを実行して、ライブラリに化合物を追加します。
• 「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リストから適切なライブラリ
を選択します。
• ライブラリの名前を「Add to Compound Library 化合物ライブラリに追加 」リスト
フィールドに入力します。
9. 「Next 次へ 」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
10. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
11. 「Finish 完了 」をクリックします。
ライセンスのあるLibraryViewパッケージのインポート
TM
注 LibraryView ソフトウェアがインストールされている必要があります。
ライセンスのあるライブラリは、DVDから、またはSCIEXのWebサイトからダウンロードした.zip
アプリケーションファイルからインストールできます。アプリケーションファイルには、化
合物名、化合物トランジション情報、化合物ライブラリスペクトルを含めることができます。
1. 管理者権限を持つMicrosoft Windowsのユーザーとしてコンピュータにログオンします。
2. 次のいずれかを実行します。
• ライブラリをDVDからインストールする場合は、DVDドライブにDVDを挿入してステッ
プ5に進みます。
• ライブラリをダウンロードしたファイルからインストールする場合は、ステップ3に進
みます。
3. 必要な.zipファイルをSCIEXのウェブサイトからダウンロードします。
システムユーザーガイド
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65 の 240
ソフトウェアへのアクセスを設定
ヒント インストール時の問題を避けるため、ファイルはコンピュータデスクトップ以外
の場所に保存してください。
4. ダウンロードが完了したら、ダウンロードしたファイルを右クリックして「Extract All す
べて展開 」をクリックします。
5. 展開したファイルまたはDVDにブラウズして、Library.exeをダブルクリックします。
ヒント 「ユーザーアカウント制御」ダイアログが開いた場合は、「はい」をクリックし
ます。
ヒント 「LibraryView Setup LibraryViewのセットアップ 」の 応答していません メッセージ
ダイアログが開いた場合は、メッセージダイアログを閉じ、Library.exeファイルを右ク
リックして「管理者として実行」オプションを選択し、インストールを再度開始します。
6. 「LibraryViewPackages Feature Unavailable LibraryViewパッケージの使用できない機能 」ダイア
ログで「Software Activation ソフトウェアの有効化 」をクリックします。
「LibraryViewPackages Activation LibraryViewパッケージの有効化 」ダイアログが開きます。
7. 表示されるフィールドにライセンスキーを正確に入力します。
ライセンスキーを入手できない場合は、sciex.com/request-supportにお問い合わせください。
8. 「Generate Computer ID コンピュータIDの生成 」をクリックします。
この操作により、ワークステーションの一意の識別子が作成されます。
9. 「Copy ID to Clipboard IDをクリップボードにコピーする 」をクリックします。
10. 指示に従ってライセンスを取得します。
注 ライセンスを取得するにはインターネットへのアクセスが必要です。コンピュータが
インターネットに接続されていない場合は、生成されたコンピュータIDをメモしておき
ます。インターネットに接続されているコンピュータでSCIEXウェブサイトのライセンス
ページにアクセスし、指示に従ってライセンスを取得します。
必要な情報を送信すると、指定したすべてのメールアドレスにライセンスファイルが配信
されます。
11. ブラウザウィンドウを閉じます。
12. ライセンスファイルが添付されたメールを受信したら、ライセンスファイルをワークス
テーションのデスクトップにコピーします。
13. 「LibraryViewPackages Activation LibraryViewパッケージの有効化 」ダイアログで「Install
License File ライセンスファイルのインストール 」をクリックします。
14. 「Select the new license file to be installed インストールする新しいライセンスファイルの選
択 」ダイアログで、ライセンスファイルにブラウズして選択します。
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66 の 240
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ソフトウェアへのアクセスを設定
15. 「Open 開く 」をクリックします。
「Select the new license file to be installed インストールする新しいライセンスファイルの選
択 」ダイアログおよび「LibraryViewPackage Activation LibraryViewパッケージの有効化 」ダイ
アログが両方とも閉じます。
16. 次のいずれかを実行します。
• すべての化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダ
イアログの「Compound 化合物 」列の上にある「All すべて 」をクリックします。
• 個別の化合物をインポートするには、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの目的の行内をクリックします。
ヒント 「Search 検索 」フィールドを使用すると、目的の化合物を簡単に探すことが
できます。検索条件を入力すると、表示されている列が検索され、指定した条件と一
致する情報だけを表示するように更新されます。
17. 「Next 次へ 」をクリックします。
注 データベースにすべての化合物がコピーされる前にインポートをキャンセルした場合
でも、すでにインポート済みの化合物はそのままデータベースに保持されます。インポー
ト前の状態に戻されることはありません。
18. 必要に応じて不一致を解消します。次を参照してください 化合物の不一致 該当ページ 67
を参照してください。
19. 「Finish 完了 」をクリックします。
化合物の不一致
化合物のグループを含むライブラリのインストールまたは個別の化合物のインストールを行
う際は、ソフトウェアはパッケージにある化合物と同じ名前または式を持つ化合物がないか
データベースを検索します。そのような化合物が見つかると、ソフトウェアはパッケージに
ある対応する化合物にフラグを立て、ユーザー入力の継続を待ちます。
ユーザーが持つオプション
• 化合物情報を統合する。 パッケージにある化合物の新しいスペクトル、遷移、および保
持時間が、データベースに保存されている化合物情報に追加されます。
• 化合物情報を上書きする。 パッケージの化合物情報は、データベースに保存されている
化合物情報に置き換れられます。
• 化合物情報を維持する。 データベースにある化合物情報は保持され、パッケージの化合
物情報は破棄されます。
不一致の情報は、ユーザーが正しい選択をするのに役立つよう利用可能です。
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ソフトウェアへのアクセスを設定
化合物の不一致の表示
1. 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの化合物の隣にある「Resolve 解
決 」をクリックして、不一致の詳細を表示します。
2. 次のいずれかを実行します。
• 既存の化合物情報を保持し、新しい情報を破棄するには、「Keep Original 元の化合物
を維持 」をクリックします。
• 既存の化合物情報を新しい情報で置き換えるには、「Use New 新しい化合物を使用 」
をクリックします。
3. 化合物ごとにステップ1と2を繰り返します。
4. すべての不一致が解消されたら、「Finish 完了 」をクリックします。
化合物の統合
1. 次のいずれかを実行します。
• 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Merge 統合 」をクリック
して、インポートパッケージの個別の化合物の新しいスペクトル、トランジション、
および保持時間を、データベースに保存されている対応する化合物と統合します。
• 「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの「Merge All すべて統合 」を
クリックして、インポートパッケージのすべての化合物の新しいスペクトル、トラン
ジション、および保持時間を、データベースに保存されている対応する化合物と統合
します。
2. すべての不一致が解消されたら、「Finish 完了 」をクリックします。
化合物の上書き
1. 次のいずれかを実行します。
• データベースに保存されているすべての化合物情報をインポートパッケージからの化
合物情報で上書きする場合は、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログ
の「Overwrite All すべて上書き 」をクリックします。
• データベースに保存されている個別の化合物情報をインポートパッケージからの化合
物情報で上書きする場合は、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイアログの
目的の化合物の隣にある「Resolve 解決 」をクリックし、「Use New 新しい化合物を
使用 」をクリックします。
2. すべての不一致が解消されたら、「Finish 完了 」をクリックします。
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68 の 240
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ソフトウェアへのアクセスを設定
元の化合物の維持
1. 次のいずれかを実行します。
• データベースに保存されているすべての化合物情報を維持し、インポートパッケージ
からの化合物情報を破棄する場合は、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイ
アログの「Keep All Original 元の化合物をすべて維持 」をクリックします。
• データベースに保存されている個別の化合物情報を維持し、インポートパッケージか
らの化合物情報を破棄する場合は、「Library Importer ライブラリのインポート 」ダイア
ログの「Keep Original 元の化合物を維持 」をクリックします。
2. すべての不一致が解消されたら、「Finish 完了 」をクリックします。
化合物の追加
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 「Add 追加 」アイコンをクリックします。を参照してください。
注 化合物名は必須です。その他の情報は、すべてオプションです。
4. 「Details 詳細 」タブの各フィールドに、必要な情報を入力します。
5. 「Save 保存 」をクリックします。
化合物へのマススペクトルの追加
1. 「Manage 管理 」ペインで「Compounds 化合物 」リストを展開します。
2. 「All Compounds すべての化合物 」をクリックします。
3. 目的の化合物をダブルクリックします。
4. 「MS Spectra MSスペクトル 」タブをクリックします。
5. 「Edit Mode 編集モード 」アイコンをクリックします。
6. 「Add Spectra スペクトルの追加 」アイコンをクリックします。
7. 「Add Mass Spectrum from *.wiff file to Compound *.wiffファイルから化合物にマススペクトル
を追加する 」ダイアログで「Open *.wiff file *.wiffファイルを開く 」をクリックしま
す。
8. 「Open 開く 」ダイアログで、目的の.wiffファイルまたは.wiff2ファイルにブラウズして選
択します。
9. 「Open 開く 」をクリックします。
システムユーザーガイド
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SCIEX X500 QTOFシステム
69 の 240
ソフトウェアへのアクセスを設定
10. 次のいずれかを実行します。
• IDAデータの場合はサンプルを展開し、左側のナビゲーションペインで目的の化合物を
選択します。
• EPS、MRM、ループデータの場合は、目的のサンプルを選択します。
11. 次のいずれかを実行して、化合物にスペクトルを追加します。
• IDAデータの場合は、「Acquired Spectrum 取得したスペクトル 」ペインで「Add
Spectrum スペクトルの追加 」をクリックします。
• EPS、MRM、ループデータの場合はTICをダブルクリックし、「Acquired Spectrum 取得
したスペクトル 」ペインで「Add Spectrum スペクトルの追加 」をクリックします。
12. 追加するスペクトルごとにステップ7 11を繰り返します。
13. 「Save 保存 」をクリックします。
14. 「MS Spectra MSスペクトル 」タブで「Save 保存 」をクリックします。
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70 の 240
システムユーザーガイド
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7
取扱説明書 – ソフトウェア
Home Page (ホームページ) について
ホームページは、機能に分割されたワークスペースタイル、状態パネル、リボン、およびラ
ンチャーで構成されています。 ワークスペースへのアクセスは、ユーザーに割り当てられて
いる役割およびソフトウェアライセンスによって決められます。 各ワークスペース内で、
ユーザーは手動で測定を開始、または測定されているデータを見て探索することができます。
図 7-1 ホームページ
項目
説明
1
ダークブルーのタイルの左側にあるライトブルーの垂直な線は、ワークスペー
スが開かれ、ワークが進行中で、ユーザーが機能へのアクセスを持っているこ
とを示します。 開いているワークスペースの状態は、タイルに表示されます。
2
ダークブルーのタイルは、ワークスペースが閉じられていることを示します。
システムユーザーガイド
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SCIEX X500 QTOFシステム
71 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
項目
説明
3
灰色のタイルは、ワークスペースが有効でないことを示します。
4
ワークスペースが開いているときは、閉じるのアイコン (X) が右上隅に表示され
ます。
5
ランチャーへのアクセス ランチャーには、すべてのワークスペースのリストが
含まれています。 アイコンの右側の
す。
6
をクリックして、ランチャーを開きま
リボン。 リボンとランチャーについて 該当ページ 72を参照してください。 別
のワークスペースに移動するには、リストからワークスペースをクリックしま
す。現在開いているワークスペースは有効のままで、ワークスペースアイコン
がリボンに表示されます。有効なワークスペースを閉じるには、
します。 ホームページに戻るには、
をクリック
をクリックします。
7
機能 測定、処理、および管理。 アクセスは、ユーザーに割り当てられた役割ま
たはライセンスに依存します。
8
システムの状態。 タイトルバーをクリックして、状態パネルを表示、または非
表示にします。
9
状態パネル。 状態パネルについて 該当ページ 74を参照してください。
リボンとランチャーについて
図 7-2 リボン
項目
説明
1
別のワークスペースに移動するには、リストからワークスペースを選択しま
す。 現在開いているワークスペースは有効のままで、ワークスペースアイコ
ンがリボンに表示されます。 図 7-3を参照してください。
2
有効なワークスペースの名前を表示します。
3
ホームページに戻るには、
をクリックします。
4
有効なワークスペースに進むには、「ワークスペース」アイコンをクリック
します。
5
現在ログインしているユーザーを表示します。
SCIEX X500 QTOFシステム
72 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
項目
説明
6
システム状態を表示します。 状態パネルについて 該当ページ 74を参照して
ください。
7
ヘルプを開くには、「 」をクリックします。
図 7-3 ランチャー
項目
説明
1
ワークスペースのリストを表示するには、
2
有効なワークスペースの名前を表示します。
3
ワークスペースの状態を表示します。 ダークブルーの背景は、ワークスペースが
閉じられていることを示します。 左側にあるライトブルーのバーは、ワークス
ペースが有効であることを示します。 ライトブルーの背景は、ワークスペースが
開いていることを示します。
4
有効なワークスペースを閉じるには、
5
開いているワークスペースを閉じるには、
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
をクリックします。
をクリックします。
をクリックします。
SCIEX X500 QTOFシステム
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取扱説明書 – ソフトウェア
状態パネルについて
ステータスバーのアイコンおよび色の変化により、システムのステータスが示されます。 状
態パネルを使用して、以下を行います
• プロジェクトを追加または選択します。
• キューに残っているサンプルおよびバッチを測定するために残っている予想時間を見ま
す。
• 構成 ワークスペースのデバイスリストで有効にされた個々のデバイスのシステムステー
タス、またはステータスを表示します。
• ダイレクトデバイスコントロールにアクセスします。
• デバイスの詳細を表示します。
• 質量分析装置、またはLCをスタンバイモードにします。
• TOF MSおよびTOF MS/MSモードの確認およびキャリブレーションを実行します。
• システムの平衡化を行います。
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図 7-4 SCIEX OSステータスパネル
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取扱説明書 – ソフトウェア
項目
1
説明
システムの状態を表示します。 タイトルバーをクリックして、状態パネル
を表示、または非表示にします。
• 準備完了の場合は緑になります
• オフラインが灰色で示されます。
• 平衡化、実行中、および読み込み中の場合は青になります。
• 停止済み、または停止中の場合は黄色になります。
• 故障の場合は赤になります
2
現在のプロジェクトを表示します。 矢印をクリックして、既存のプロジェ
クトを選択します。 プラス記号をクリックして、プロジェクトを追加しま
す。 プロジェクトの追加 該当ページ 76を参照してください。
3
キューにあるサンプルの状態を表示します。
4
デバイスの状態を表示します。 デバイスのタイトルをクリックすると、デ
バイスの詳細ダイアログが開き、詳細が表示されます。
5
ダイレクトデバイスコントロールアイコンをクリックすると、デバイスのコ
ントロールにアクセスできます。 オプションのシリンジは、デバイスコン
トロールダイアログで開始、または停止することができます。
6
デバイスのステータスを表示します。 アイコンはデバイスのステータスを
表示するのみのインジケータです。
7
クリックしてMSチューニング手順にアクセスし、TOF MSおよびTOF MS/MSモー
ドの確認およびキャリブレーションを実行します。
8
該当するボタンをクリックして、システムを平衡化するか、またはスタンパ
イモードにします。
プロジェクトの追加
プロジェクトには、測定メソッド、データ、バッチ、定量化メソッド、定量化の結果などが
保存されます。 各プロジェクトに対して別々のプロジェクトフォルダを使用することを推奨
します
SCIEX OSソフトウェアの外部にプロジェクトを作成したり、ファイルをコピーまたは貼り付け
したりしないでください。
1. 状態パネルのProjects (プロジェクト) リストの隣にあるプラス記号をクリックします。
2. 名前を入力します。
3. OKをクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
プロジェクトを選択
• 状態パネルのProjects (プロジェクト) リストからプロジェクトを選択します。
デバイス状態のControl (制御)
この手順を使用して、デバイスの状態の詳細なフィードバックを取得します。 例えば、温
度、圧力、電圧などです。 デバイス状態を監視するには、デバイスのタイトルの一番右側に
あるアイコンをクリックします。
1. 状態パネルで、デバイスのタイトルの右側にあるDirect Device Control (直接デバイス制
御) アイコンをクリックします。
Device Control (デバイス制御)ダイアログが表示されます。
2. 必要に応じて、デバイスを開始、停止、または更新します。
3. OKをクリックします。
状態パネルの表示
• 最小化した状態パネルの一番上にある色が付いたバーをクリックします。
状態パネルを非表示にする
• 状態パネルの一番上にある色が付いたバーをクリックします。
状態パネルはワークスペースの右側に最小化されます。
データ取得パネル
「Data Acquisition データ取得 」パネルを使用して、リアルタイムのデータ取得を開始して監
視します。ユーザーは、リアルタイムのデータ取得の間に測定メソッドパラメータを編集す
ることもでき、さらに「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースでデータを保存したりデー
タを開いたりすることもできます。
ヒント Data Acquisition (データ取得) パネルの一番上を上下に Click (クリック) して、目次の
サイズを変更します。
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77 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-5 データ取得パネル
項目 ラベル
説明
1
MSタブ
2
DADタブ (DADデバイ TWCとスペクトルを表示します。
スが有効な場合にの
み利用可能)
3
「キャリブレーショ キャリブレーション オン システムが、選択した参照表にある質
ン オン」または「ラ 量を使用して質量分析器のキャリブレーションを行っているこ
ンピング オン」
とを示します。
TICとスペクトルを表示します。
ランピング オン パラメータのランプが行われていることを示し
ます。パラメータのランピングは、サイクル毎にパラメータの
値を増減させる間に、自動的に実験を循環させることから構成
されます。
4
開始
クリックすると、手動測定を開始します。
5
停止
クリックすると、手動測定を停止します。
6
保存
クリックすると、データを保存できます。
7
—
クリックすると、データを探索できます。
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78 の 240
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取扱説明書 – ソフトウェア
ユーザーワークフロー
Analysts
表 7-1 Analystワークフロー
タスク
ソフトウェアアクセス
メイン画面およびステータスパネルを表示し Home Page (ホームページ) について 該当ペー
て、システムのステータスを確認します。 ジ 71 および 状態パネルについて 該当ページ
74を参照してください。
Excelスプレッドシート、LIMSを使って、また バッチおよびキューワークスペース 該当ペー
は手動でバッチを作成して送信します。 LCお ジ 80を参照してください。
よびMSメソッドは、Analystsによってバッチ
の作成・送信が行われる前に、メソッドディ
ベロッパーがロックする必要があります。
キュー内のサンプルを表示および管理しま
す。
バッチおよびキューワークスペース 該当ペー
ジ 80を参照してください。
結果表のデータを処理およびレビューしま
す。
Analytics (分析物) ワークスペース 該当ページ
157を参照してください。
データを探索します。
「Explorer エクスプローラ 」ワークスペース
該当ページ 112を参照してください。
メソッドディベロッパー
表 7-2 メソッドディベロッパーワークフロー
タスク
ソフトウェアアクセス
システムを構成します。
以下を参照してください
• 取扱説明書—ハードウェア 該当ページ 40およびデバイス
を設定 該当ページ 49。
• プロジェクトのデフォルト設定を定義 該当ページ 158。
• 結果表のための列を選択 該当ページ 165。
質量分析装置をチューニング MS Tune (MSチューン) 該当ページ 206を参照してください。
します。
LCデバイスを構成します。
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取扱説明書—ハードウェア 該当ページ 40を参照してくださ
い。
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79 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-2 メソッドディベロッパーワークフロー (続き)
タスク
ソフトウェアアクセス
LCメソッドを作成します。
「LCメソッド」ワークスペース 該当ページ 112を参照してく
ださい。
MSメソッドを作成します。
「MSメソッド」ワークスペース 該当ページ 94を参照してく
ださい。
処理方法を開発します。
処理メソッドの作成 該当ページ 158を参照してください。
管理者
表 7-3 管理者ワークフロー
タスク
ソフトウェアアクセス
LIMSを構成します。
実験室情報管理システム(LIMS) の設定の選択
該当ページ 58を参照してください。
ソフトウェアにユーザーを追加し、役割を割 ソフトウェアへのアクセスを設定 該当ページ
り当てます。
52を参照してください。
ログをアーカイブします。
ログをアーカイブ 該当ページ 212を参照して
ください。
Reviewers
表 7-4 Reviewerワークフロー
タスク
ソフトウェアアクセス
処理された結果のレビューを行 Analytics (分析物) ワークスペース 該当ページ 157を参照して
います。
ください。
データを探索します。
「Explorer エクスプローラ 」ワークスペース 該当ページ 112
を参照してください。
ログのレビューを行います。
ログを表示 該当ページ 212を参照してください。
バッチおよびキューワークスペース
「Batch バッチ 」ワークスペースには、分析対象のサンプルに関する情報のコレクションが
表示されます。バッチは、サンプルを分析する順序をソフトウェアに伝達します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
「Queue キュー 」ワークスペースには、キュー、バッチ、およびサンプルの状態が表示され、
ユーザーはキュー内のサンプルとバッチを管理することができます。また、ワークスペース
でサンプルをダブルクリックして開き、キュー内の特定のサンプルからデータにアクセスす
ることもできます。
デフォルトでは、サンプルはキューに表示されません。 サンプル情報は、バッチ名の下で折
り畳まれています。バッチの状態、バッチ名、バッチ内のサンプルの数、および現在のバッ
チを測定するための残り時間が表示されます。バッチに含まれるキャリブレーションサンプ
ルは、「Sample Name サンプル名 」列のキューで「Cal」と表示されます。
バッチを管理
必要に応じて、「バッチ」ワークスペースで以下の機能を使用します。
この作業を行うに
は...
...この作業を行う
行の切り取り
Manage (管理) > Cut (切り取り) をクリックします。
行のコピー
Manage (管理) > Copy (コピー) をクリックします。
行の貼り付け
Manage (管理) > Paste (貼り付け) をクリックします。
行を挿入する
Manage (管理) > Insert Row (行の挿入) をクリックします。
行の削除
Manage (管理) > Delete Row (行の削除) をクリックします。
列を選択
Manage (管理) > Select Columns (列を選択) をクリックします。列の
表示または非表示 該当ページ 93を参照してください。
バッチを印刷
ワークスペースメニューからPrint (印刷) をクリックします。
バッチを保存
バッチを現在のプロジェクトに保存するには、ワークスペースメニュー
からSave (保存) > Save (保存) またはSave (保存) > Save As (以下とし
て保存) をクリックします。
バッチをエクスポー バッチを.txtまたは.csvファイルとして保存するには、ワークスペース
ト
メニューからSave (保存) > Export (エクスポート) をクリックします。
バッチをからインポート
バッチの内容は、サンプルを提出する前に必ずレビューしてください。ピリオド「.」だけが
小数点の記号としてインポートされる.csvまたは.xslファイルに対応しています。
必要に応じてユーザーはインポートしたバッチを編集することができます。
ヒント 切り取り、コピー、貼り付け、行の追加、および行の削除の各機能にアクセスする
には、「Manage 管理 」をクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
1. Batch (バッチ) ワークスペースを開きます。
2. オプション 「Batch バッチ 」ワークスペースに表示される列を選択します。
3. 「開く」 > 「ファイルからインポート」をクリックします。
4. Browse (ブラウズ)をクリックします。
5. 目的のファイルに移動します。
6. Openをクリックします。
7. オプション 必要に応じて、「Append to current batch 現在のバッチに加える 」チェッ
クボックスを選択またはクリアします。
注 「Append to current batch 現在のバッチに加える 」オプションを選択していない場合、
グリッド内の既存のデータはすべて上書きされます。
8. Import (インポート) をクリックします。
9. (オプション) Save (保存) をクリックします。
10. Save As (以下として保存) をクリックします。
Save As Batch (バッチとして保存)ダイアログが開きます。
11. File Name (ファイル名) フィールドにファイル名を入力し、次にSave (保存) をクリックし
ます。
12. サンプル位置を選択または確認する基準としてプレートレイアウトを使用するには、「Plate
Layout プレートレイアウト 」をクリックします。
プレートレイアウトにより、未割り当てサンプルのウェルおよびバイアルの位置が自動的
に提供されます。
13. オプション キャリブレーションサンプルをバッチに含めるには、以下の操作を実行しま
す。
a. 「Batch-Automatic Calibration Editor バッチ - 自動キャリブレーションエディタ 」ダイアロ
グを開くには、「Auto-Calibrate 自動キャリブレーション 」をクリックします。
b. 指定した頻度で自動的に適用するイオン参照およびキャリブラント供給の設定を選択
します。
c. 「OK」をクリックします。
d. 「Auto-Calibrate 自動キャリブレーション 」ボタンの左側にあるチェックボックスを
選択します。
14. バッチを提出する前に、カラムオーブンの温度に到達していることを確認してください。
15. システムが、同じMSおよびLCメソッドを使用して平衡化されていることを確認します。
16. 提出 をクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
画面の一番上にエラーが表示される場合は、エラーを解決してから「Submit 提出 」を再
度クリックします。バッチにあるすべてのエラーは、バッチの提出前に解決されなければ
なりません。
サンプルの分析を開始する前に、キューが開始していることを確認します。 キューが開
始していない場合は、「Queue キュー 」ワークスペースに移動して、メニューバーの「Start
開始 」をクリックします。
測定は、サンプルが「Batch バッチ 」ワークスペースから提出された後に始まります。
LIMSからバッチをインポート
バッチの内容は、サンプルを提出する前に必ずレビューしてください。
実験室情報管理システム(LIMS) の設定の選択 該当ページ 58を参照してください。
ヒント 切り取り、コピー、貼り付け、行の追加、および行の削除の各機能にアクセスする
には、「Manage 管理 」をクリックします。
1. Batch (バッチ) ワークスペースを開きます。
2. オプション 「Batch バッチ 」ワークスペースに表示される列を選択します。
3. 「開く」 > 「LIMSからインポート」をクリックします。
バッチファイルのインポートダイアログが開きます。
4. 次を実行します。
a. ファイルの場所、またはファイル名を入力します。
b. オプション 現在のバッチに追加チェックボックスをクリックします。
c. インポートをクリックします。
5. サンプル位置を選択または確認する基準としてプレートレイアウトを使用するには、「Plate
Layout プレートレイアウト 」をクリックします。
プレートレイアウトにより、未割り当てサンプルのウェルおよびバイアルの位置が自動的
に提供されます。
6. オプション キャリブレーションサンプルをバッチに含めるには、以下の操作を実行しま
す。
a. 「Batch-Automatic Calibration Editor バッチ - 自動キャリブレーションエディタ 」ダイアロ
グを開くには、「Auto-Calibrate 自動キャリブレーション 」をクリックします。
b. 指定した頻度で自動的に適用するイオン参照およびキャリブラント供給の設定を選択
します。
c. 「OK」をクリックします。
d. 「Auto-Calibrate 自動キャリブレーション 」ボタンの左側にあるチェックボックスを
選択します。
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83 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
7. バッチを提出する前に、カラムオーブンの温度に到達していることを確認してください。
8. 提出 をクリックします。
画面の一番上にエラーが表示される場合は、エラーを解決してから「Submit 提出 」を再
度クリックします。バッチにあるすべてのエラーは、バッチの提出前に解決されなければ
なりません。
サンプルの分析を開始する前に、キューが開始していることを確認します。 キューが開
始していない場合は、「Queue キュー 」ワークスペースに移動して、メニューバーの「Start
開始 」をクリックします。
測定は、サンプルが「Batch バッチ 」ワークスペースから提出された後に始まります。
バッチを手動で作成します。
バッチの内容は、サンプルを提出する前に必ずレビューしてください。
ヒント 切り取り、コピー、貼り付け、行の追加、および行の削除の各機能にアクセスする
には、「Manage 管理 」をクリックします。
1. Batch (バッチ) ワークスペースを開きます。
2. オプション 「Batch バッチ 」ワークスペースに表示される列を選択します。
ヒント 既存のバッチを使用するには、「Open 開く 」 > 「Open 開く 」をクリックし
ます。
3. Newをクリックします。
4. 「MS Method MSメソッド 」リストからMSメソッドを選択します。
5. (オプション) LC Method (LCメソッド) リストからLCメソッドを選択します。
6. サンプル位置を選択または確認する基準としてプレートレイアウトを使用するには、「Plate
Layout プレートレイアウト 」をクリックします。
プレートレイアウトにより、未割り当てサンプルのウェルおよびバイアルの位置が自動的
に提供されます。
7. バッチの情報をグリッドに入力します。
8. (オプション) Save (保存) をクリックします。
9. バッチを提出する前に、カラムオーブンの温度に到達していることを確認してください。
10. システムが、同じMSおよびLCメソッドを使用して平衡化されていることを確認します。
11. 提出 をクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
画面の一番上にエラーが表示される場合は、エラーを解決してから「Submit 提出 」を再
度クリックします。バッチにあるすべてのエラーは、バッチの提出前に解決されなければ
なりません。
サンプルの分析を開始する前に、キューが開始していることを確認します。 キューが開
始していない場合は、「Queue キュー 」ワークスペースに移動して、メニューバーの「Start
開始 」をクリックします。
測定は、サンプルが「Batch バッチ 」ワークスペースから提出された後に始まります。
バッチインポートのセットアップ
選択したオートサンプラーについて、ラックコード、ラック位置、プレートコード、プレー
ト位置、およびバイアル位置はすべて相互に依存しており、特定の値だけが有効になります。
表 7-5 バッチインポートのセットアップ
列名
定義
フィールド値の要件
Sample Name サンプル名
サンプルの名前。
50文字未満。サンプル名に次の無
効な文字を含めることはできませ
ん \ / : * ? " < > |=
Sample ID サンプルID
サンプルに付けるカスタ 50文字未満。サンプルIDに次の無
ム番号などの識別子。
効な文字を含めることはできませ
ん \ / : * ?" < > |=
Barcode ID バーコードID
サンプル固有のID。
50文字未満。
MS Method MSメソッド
メソッドの名前。
MSメソッドは、現在のプロジェク
トに存在している必要がありま
す。このフィールドでは、大文字
と小文字が区別されません。
LC Method LCメソッド
メソッドの名前。
LCメソッドは、現在のプロジェク
トに存在している必要がありま
す。このフィールドでは、大文字
と小文字が区別されません。
Rack Code ラックコード
オートサンプラーのラッ LCメソッドで指定したオートサン
クの種類。
プラーに対して有効ないずれかの
選択肢でなければなりません。
Rack Position ラック位置
トレイでのラックの位
置。
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数値。
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表 7-5 バッチインポートのセットアップ (続き)
列名
定義
フィールド値の要件
Plate Code プレートコード
オートサンプラーでの
LCメソッドで指定したオートサン
ウェルプレートの位置。 プラーに対して有効ないずれかの
選択肢でなければなりません。
注 ラックコードでバイ
アルが指定されている場
合、この列は使用できま
せん。
Plate Position プレート位置
ラックでのプレートの位 事前定義されたオートサンプラー
置。
のプレート位置のいずれかと一致
している必要があります。
Vial Position バイアル位置
プレートでのバイアルの 数値。最大値がトレイのバイアル
位置。
数を超えていてはなりません。
Sample Type サンプル種類
サンプルの種類。
Dilution factor 希釈係数
個別のサンプルの希釈係 SCIEXが開発したメソッドの場合、
数。
値は1.0でなければなりません。
サンプルの種類が、事前定義され
ているいずれかのサンプルの種類
と一致していることを確認してく
ださい。一致していない場合は、
自動的に「Unknown 不明 」に置き
換えられます。
小数点以下6桁のゼロよりも大きな
値。デフォルト値は1.000000です。
フィールドを空白にしないでくだ
さい。
Data File データファイル
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86 の 240
取得されたデータの保存 252文字未満でなければなりませ
先となるファイル名。
ん。合計文字数には、データサブ
フォルダパスの文字数も含まれま
す。データファイルに次の無効な
文字を含めることはできません \ /
: * ?" < > |=
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表 7-5 バッチインポートのセットアップ (続き)
列名
定義
フィールド値の要件
Comments コメント
テキスト
50文字未満でなければなりませ
ん。このフィールドに次の無効な
文字を含めることはできません \ /
: * ?" < > |=
Compound Name for MRM HR
MRM HRの化合物名
MRMメソッドで定義され
た化合物の名前。バッチ
には最大で500個の化合物
名列を含めることができ
ます。化合物の名前は、
ユーザーが作成するバッ
チインポートファイルで
列名として使用されま
す。
MSメソッドで以前に定義された名
前でなければなりません。この名
前は、MSメソッドの作成中に検証
されます。
プレートレイアウト機能を使用してバッチを作成する
プレートレイアウト機能ではラックとプレートの構造がグラフィック表現で表示され、「Batch
バッチ 」ワークスペースのグリッドに入力する目的で使用できます。
1. 「Batch バッチ 」ワークスペースを開きます。
2. LCメソッドを選択します。
プレートレイアウト機能は、N/Aがアクティブになっていないと使用できません。
3. 「Plate Layout プレートレイアウト 」をクリックします。
「Plate Layout プレートレイアウト 」ウィンドウが開き、デフォルトでは、ラックコードの
グラフィック表現が表示されます。それに続いて、最後に使用されたラックコードや現在
強調表示されているサンプルに対して指定されているラックコードが表示されます。
4. ラックコードを変更するには、「Rack Code ラックコード 」フィールドの矢印をクリッ
クし、目的のラックコードをリストから選択します。
ウィンドウが更新され、選択したラックコードのグラフィック表現が表示されます。
5. グラフィック表現で、サンプルの位置をクリックします。
選択したサンプルの位置は、グラフィック表現では完全に強調表示されて表示されます。
「Batch バッチ 」ワークスペースが更新され、サンプル位置の定義が不完全な行が最初に
表示されます。定義が不完全な行とは、ラックコード、プレートコード ウェルを使用す
る場合 、バイアル位置の各値が含まれていない行です。グリッドには、この情報に従っ
てサンプル位置が表示されます。
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6. 必要に応じてグラフィック表現でサンプル位置の選択を続行し、「Batch バッチ 」ワーク
スペースでグリッドに入力します。
「Batch バッチ 」ワークスペースのグリッドにサンプル位置を直接入力すると、それに従っ
てグラフィック表現が更新されます。
7. 選択したサンプル位置に対して繰り返し注入を指定するには、Ctrlキーを押しながらグラ
フィック表現でサンプル位置をクリックします。
グラフィック表現には、繰り返し注入のサンプルの位置が色付きの輪郭で表示され、「Batch
バッチ 」ワークスペースのグリッドには、それに対応するデータが表示されます。図 7-6
を参照してください。
図 7-6 「Plate Layout プレートレイアウト 」—繰り返し注入
8. グラフィック表現でサンプルインデックスを確認するには、サンプル位置にマウスのカー
ソルを合わせます。
サンプルインデックスがツールチップで表示されます。
9. 位置を削除するには、選択したサンプル位置をグラフィック表現でクリックします。
グラフィック表現ではサンプル位置が強調表示されなくなり、「Batch バッチ 」ワークス
ペースのグリッドからデータが削除されます。
10. 指定したラックコードに関連付けられたすべてのデータを削除するには、「Clear All すべ
てクリア 」をクリックします。
選択したラックコードでプレートが示されている場合は、「Clear All すべてクリア 」の
下のメニューに「Clear Front 前方向にクリア 」および「Clear Back 後方向にクリア 」という
項目が表示されます。
指定したラックコードについて、グラフィック表現で選択したすべてのサンプル位置がク
リアされ、すべてのデータが「Batch バッチ 」ワークスペースのグリッドから削除されま
す。
注 グラフィック表現に繰り返し注入のサンプル位置が含まれている場合は警告メッセー
ジが表示され、確認を求められます。
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11. すべての位置を割り当てたら、「Plate Layout プレートレイアウト 」ウィンドウで「Close
閉じる 」をクリックし、「Batch バッチ 」ワークスペースで「Save 保存 」をクリックし
ます。
イオン参照表の作成
1. 「Batch バッチ 」ワークスペースを開きます。
2. 「Auto-Calibrate 自動キャリブレーション 」をクリックします。
「Batch - Automatic Calibration Editor バッチ - 自動キャリブレーションエディタ 」ダイアログ
が開きます。
3. 「Edit 編集 」をクリックします。
「Ion Reference Table Editor イオン参照表エディタ 」ダイアログが開きます。
4. 「New 新規 」をクリックします。
ヒント Tabキーを使用してセルを移動し、Enterを押して行を追加します。
5. 「Reference Ions for TOF MS Calibration TOF MSキャリブレーションのための参照イオ
ン 」グリッドで、前駆体質量を入力します。
「Compound Name 化合物名 」フィールドはオプションです。
6. 必要に応じて行を追加します。
7. 「Use 使用する 」列で、使用するイオンを選択します。
8. MS/MSで使用する前駆体質量について、「Use for MS/MS MS/MSで使用する 」ラジオボ
タンを選択します。
9. ステップ7で選択した前駆体質量について、「CE for MS/MS MS/MSのCE 」および「DP
for MS/MS MS/MSのDP 」の各フィールドに値を入力します。
10. 「Reference Ions for MS/MS Calibration MS/MSキャリブレーションのための参照イオ
ン 」グリッドで、2つ以上のフラグメント質量を追加して選択します。
「Fragment Name フラグメント名 」フィールドはオプションです。
11. 「OK」をクリックします。
12. 「Save Reference Table 参照表の保存 」ダイアログで名前を入力して「OK」をクリックしま
す。
システムの平衡化
1日の最初にシステムの平衡化を行った後に、新しいメソッドの実行、またはバッチの提出を
行います。 平衡化は、次のサンプルまたはバッチのために、質量分析器をウォームアップさ
せ、準備を行います。
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1. 状態パネルで Equilibrate (平衡化) をクリックします。
「Equilibrate 平衡化 」ダイアログが開きます。
2. 「MS Method MSメソッド 」リストからMSメソッドを選択します。
3. 「LC Method LCメソッド 」リストからLCメソッドを選択します。
4. 「Time(min) 時間 分 」フィールドに、平衡化時間を分単位で入力します。
5. OKをクリックします。
キューの管理
測定は、サンプルがBatch (バッチ) ワークスペースから提出された後に始まります。 バッチの
提出前に、システムが平衡になっていることを確認してください。 システムの平衡化 該当
ページ 89を参照してください。
注 サンプル測定中に異常終了した場合は、サンプルを再することを推奨します。 停電に
よって異常な終わり方をした場合、オートサンプラトレイの温度が持続されず、サンプル
の完全性が損なわれる恐れがあります。
1. Queue (キュー) ワークスペースを開きます。
注 サンプル測定の間は、バルブ位置を手動で変更しないでください。
2. 表 7-6にある機能を使用して、 キューにあるサンプルとバッチを管理します。
注 測定されていない単一のバッチまたはサンプルのみが移動できます。
表 7-6 「キュー」ワークスペース機能
この作業を行うには...
...この作業を行う
バッチにあるすべてのサンプル
を見ます。
をクリックします。
バッチにあるすべてのサンプル
を折り畳みます。
をクリックします。
測定を開始します。
Start (スタート)をクリックします。 サンプルのランを行
う前にシステムの平衡化を行います。
選択したサンプルを再測定しま a. サンプルをクリックします。
す。
b. Manage (管理) > Reacquire samples (サンプルを再
測定) をクリックします。
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表 7-6 「キュー」ワークスペース機能 (続き)
この作業を行うには...
...この作業を行う
選択したサンプルを削除しま
す。
a. サンプルをクリックします。
b. Manage (管理) > Delete samples (サンプルを削除)
をクリックします。
選択したサンプルの下のすべて a. サンプルをクリックします。
のサンプルを削除します。
b. Manage (管理) > Delete samples below row
selection (列選択の下のすべてを削除) をクリックし
ます。
すべての測定したバッチまたは Manage (管理) > Clear queue (キューをクリア) をクリッ
サンプルのキューをクリアしま クします。
す。
すべての測定済みの選択した a. 必要に応じて、サンプルまたはバッチを選択します。
バッチまたはサンプルのキュー
b. 「Manage 管理 」 > 「Clear all selections すべての
をクリアします。
選択をクリア 」をクリックします。
選択したバッチまたはサンプル a. バッチのヘッダーをクリックします。
をキューの一番上に移動しま
b. Manage (管理) > Move row to top(行を一番上に移
す。
動) をクリックします。
キュー内の選択したサンプルを a. サンプルをクリックします。
上に移動します。
b. Manage (管理) > Move row up (行を上に移動) をク
リックします。
キュー内の選択したサンプルを a. サンプルをクリックします。
下に移動します。
b. Manage (管理) > Move row down (行を下に移動) を
クリックします。
すべてのサンプルとバッチを折 Manage (管理) > Collapse all rows (すべての行を折り畳
り畳みます。
む) をクリックします。
すべてのサンプルとバッチを表 Manage (管理) > Expand all rows (すべての行を拡張す
示します。
る) をクリックします。
測定が進行中のデータを見ま
す。
システムユーザーガイド
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• 測定が進行中のサンプルをダブルクリックします。
• Explorer (エクスプローラ) ワークスペースアイコンをク
リックします。
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91 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-6 「キュー」ワークスペース機能 (続き)
この作業を行うには...
...この作業を行う
測定されたサンプルのデータを 測定されたサンプルをダブルクリックします。
見ます。
スキャンされているバーコード a. Manage (管理) > Select Columns (列を選択) をクリッ
バイアルを見ます。
クします。
b. Select Columns (列の選択) ダイアログのBarcode (バー
コード) およびScanned barcode (スキャンしたバー
コード) チェックボックスを選択します。 列の表示ま
たは非表示 該当ページ 93を参照してください。
c. OKをクリックします。
列を表示または非表示にしま
す。
a. Manage (管理) > Select Columns (列を選択) をクリッ
クします。
b. 必要に応じて、Select Columns (列の選択) ダイアログの
列チェックボックスを選択またはクリアします。 列
の表示または非表示 該当ページ 93を参照してくださ
い。
c. OKをクリックします。
キューを停止します。
a. Stop (停止) をクリックします。
b. Stop (停止) ダイアログで、測定を停止させる方法を選
択します。
c. OKをクリックします。
キューを印刷します。
ワークスペースメニューからPrint (印刷) をクリックしま
す。
1つのサンプルをキューに提出
1. 各サンプルの行インデックス番号を選択します。
2. バッチの提出前に、システムが平衡になっていることを確認してください。
3. 提出 をクリックします。
画面の一番上にエラーが表示される場合は、エラーを解決してから「Submit 提出 」を再
度クリックします。バッチにあるすべてのエラーは、バッチの提出前に解決されなければ
なりません。
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システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
サンプルの分析を開始する前に、キューが開始していることを確認します。 キューが開
始していない場合は、「Queue キュー 」ワークスペースに移動して、メニューバーの「Start
開始 」をクリックします。
測定は、サンプルが「Batch バッチ 」ワークスペースから提出された後に始まります。
複数のサンプルをキューに提出
1. 次のいずれかを実行します。
• Ctrlと各サンプルのサンプル行インデックス番号をクリックします。
• インデックス番号のリストを上下にドラッグします。
注 サンプルは、選択されるために提出され、バッチで表示されるためではありませ
ん。
2. バッチの提出前に、システムが平衡になっていることを確認してください。
3. 提出 をクリックします。
画面の一番上にエラーが表示される場合は、エラーを解決してから「Submit 提出 」を再
度クリックします。バッチにあるすべてのエラーは、バッチの提出前に解決されなければ
なりません。
サンプルの分析を開始する前に、キューが開始していることを確認します。 キューが開
始していない場合は、「Queue キュー 」ワークスペースに移動して、メニューバーの「Start
開始 」をクリックします。
測定は、サンプルが「Batch バッチ 」ワークスペースから提出された後に始まります。
列の表示または非表示
1. 「Batch バッチ 」ワークスペースで、「Manage 管理 」 > 「Select Columns 列の選択 」
をクリックします。
2. 必要に応じて、「Select Columns 列の選択 」ダイアログの列チェックボックスを選択ま
たはクリアします。
3. 「OK」をクリックします。
システムユーザーガイド
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93 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
キューアイコン
表 7-7 キューおよび測定状態のアイコン
アイコン 名称
説明
合格
サンプルまたはバッチ全体の測定に成功しました。
警告
サンプルは測定されましたが、ユーザーが測定を停止または延長
しました。
失敗
サンプルまたはバッチのサンプルの測定に失敗しました。
失敗
キャリブレーションサンプルが合否基準を満たしていませんでし
た。アイコンをダブルクリックして、ステータスレポートを確認
してください。
進行中
サンプルまたはバッチは測定中です。
待機中
サンプルまたはバッチはまだ測定されていないか、測定が進行中
です。
バーコード警 バーコードの読み取りエラーまたはバーコードスキャンおよびサ
告
ンプルの不一致がありました。
展開矢印
バッチにあるサンプルを表示します。
折り畳み矢印 バッチにあるサンプルを非表示にします。
「MSメソッド」ワークスペース
MSメソッドの作成
必要に応じて、次を参照してください。
• MSメソッドの実験 該当ページ 95
• MSメソッドについて 該当ページ 97
• MSメソッドのパラメータ 該当ページ 98
• MSメソッドの動的衝突エネルギーを計算する 該当ページ 111
• ヘルプシステム
1. 「MS Methods MSメソッド 」ワークスペースを開きます。
2. 「New 新規 」をクリックし、メソッドをクリックします。
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94 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
3. オプション 「Advanced アドバンスト 」をクリックし、必要に応じて以下の項目を選択
します。
• Apply experiment scheduling 実験スケジューリングの適用 実験の実行時に保持時間ウィン
ドウを適用する場合に選択します。ループ実験の場合、いずれかの実行開始時間が0
で、いずれかの実行停止時間がメソッドの持続時間と等しくなければなりません。
• Show advanced parameters アドバンストパラメータの表示 タイムビン合計やチャネルな
ど、アドバンストパラメータを表示する場合に選択します。
• Ramp ランプ パラメータをランプする場合に選択します。パラメータのランプは、パラ
メータの値を増減させながら自動的に実験を実行するという処理で構成されます。ラ
ンプできるパラメータは1回に1つだけで、ステップは同じ向きでなければなりません
開始値または停止値の範囲内で増加または減少のどちらか 。このダイアログでは、パ
ラメータのランプを行うための基準を設定できます。ユーザーは、開始電圧および終
了電圧と、その間のステップのサイズを設定できます。ランプは、イオンに対してパ
ラメータを最適化する目的で使用できます。TOF MSメソッドでは、DPパラメータをラ
ンプできます。TOF MSMSメソッドでは、DPまたはCEのいずれかのパラメータをランプ
できます。ランプは、「Apply ramping to the compound parameter 化合物パラメータのラン
プを適用 」を選択することで有効にできます。
• Calibrate キャリブレート スペクトルと装置を稼働中にキャリブレートする場合に選択
します。このダイアログでは、キャリブレートで使用する適切なイオン参照表を選択
できます。この機能は一般的にキャリブラント供給システムと組み合わせて使用しま
す。キャリブレーション結果を表示するには、「Queue キュー 」ワークスペースに移
動して、キャリブレーション実行の取得状態アイコンをクリックします。
• Dynamic collision energy 動的衝突エネルギー 「Dynamic Collision Energy 動的衝突エネル
ギー 」ダイアログが開きます。
4. 必要に応じて、フィールドに値を入力します。
5. オプション 「Add Experiment 実験の追加 」をクリックします。
ヒント 「Experiment 実験 」フィールドの隣にあるリストを使用して、実験を変更または
削除します。
6. 次のいずれかを実行します。
• 「Save 保存 」 > 「Lock Method メソッドのロック 」をクリックして、MSメソッドを
保存およびロックします。
• 「Save 保存 」 > 「Save 保存 」をクリックします。
• 「Save 保存 」 > 「Save as 名前を付けて保存 」をクリックします。
MSメソッドの実験
MSメソッドのパラメータ 該当ページ 98を参照してください。
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95 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
MSメソッドを作成または編集する場合は、「MS Method MS メソッド 」ワークスペースを使用
します。MSメソッドには、1つまたは複数の実験を含めることができます。デフォルトでは、
新規TOF MSメソッドには1つの実験が含まれています。
使用できるMS実験の種類は、以下のとおりです。
• 3種類の基本的なメソッドの実験 TOF MS、TOF MSMS、Q1
HR
• 3種類の複合的なメソッドの実験 IDA、SWATH、MRM
HR
さらに、ステップごとの手順を使用して、MRM 実験を容易に作成できます。手順が完了し
HR
たら、パラメータを使用してMRM メソッドに入力します。
表 7-8 基本的なメソッドの実験
種類
定義
TOF MS
TOF領域を使用した質量分析。イオンのm/z値は、TOF領域の飛行時間に基づいて
保持されます。
TOF MSMS 四重極質量フィルターを使用して、前駆体イオンが選択されます。フラグメント
イオンのm/z値は、TOF MS領域の飛行時間に基づいて返されます。この実験は、
化合物の構造を特定する目的で使用します。
Q1
四重極質量フィルターを使用したデータ取得。イオン強度はスキャン範囲での質
量に対して返されます。
表 7-9 複合的なメソッドの実験
種類
定義
IDA
IDA 情報依存採取 実験では、データを取得しながら分析を行い、分析結果に応じ
て実験条件を変更します。依存スキャンの実行対象となる質量は、結果の分析に
よって決定されます。ユーザーは、IDA実験がアクティブになる条件と、アクティ
ブになったIDA実験のパラメータを全体的に制御できます。
SWATH
SWATH 測定では、LCタイムテーブル上の広範な質量範囲にわたるすべての前駆体
イオンのMS/MS分析が可能です。Q1四重極は、従来のプロダクトイオン測定で使
用されていたウィンドウよりも幅の広い選択ウィンドウ 一般的には10 Da 50 Da に
設定されています。複数の連続した選択ウィンドウをステップごとに実行するこ
とで、広範な質量範囲を迅速にカバーします。結果として生成される質量スペク
トルは、対応するQ1選択ウィンドウを通過したすべての前駆体イオンのフラグメ
ントの複合体です。この手法では、サンプル中のすべての種の非ターゲットMS/MS
分析が可能です。
®
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-9 複合的なメソッドの実験 (続き)
種類
定義
MRM HR MRMHRアルゴリズムは、既知の質量と保持時間を持つ化合物から高品質なMS/MS
データを取得するのに役立ちます。このアルゴリズムは、TOF MSMSスペクトルか
ら狭い幅 0.02 Da のフラグメント質量を抽出する目的で使用できます。狭い幅の抽
出により、選択性が高まります。
HR
ガイド MRM メソッドを容易に作成できるステップごとの手順。手順の各ステップが完
HR
付きの 了したら、パラメータを使用してMRM メソッドの種類に入力します。
MRM HR
MSメソッドについて
MSメソッドは、以下の各要素で構成されています。
• イオン源やガスのパラメータなど、メソッド全体に関連するパラメータ。
• 1つまたは複数の実験。
• 各メソッドには少なくとも1つの実験が含まれていなければなりません。
• どのメソッドにも、複数の実験を含めることができます。これはループ実験と呼ばれ
ます。
• TOF MS実験およびTOF MSMS実験は、メソッド内でループさせることができます 最大10
件の実験 。Q1実験はループできません。
HR
• IDA、SWATH、MRM の各実験は、メソッド内でループさせることができます 最大2件の
実験 。
HR
注 IDA + IDAやSWATH + MRM など、使用できるのは特定の実験の組み合わせだけで
す。
• 実験ごとに固有の高度な設定が用意されています。
• 各実験内の個別のスキャン
目的の作業
実行する操作
複数の実験を持つメソッド、 「Add Experiment 実験の追加 」をクリックし、実験の種類
つまりループ実験を作成す
をクリックします。
る。
既存のMSメソッド内で実験を 「Experiment 実験 」の隣にあるリストをクリックし、実験
切り替える。
の種類をクリックします。
TOF MSMS実験をIDA実験に切 「Experiment 実験 」の隣にあるリストをクリックし、「Add
り替える。
IDA criteria IDA基準の追加 」をクリックします。
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目的の作業
実行する操作
HR
MRM 実験で、メソッドから 「Experiment 実験 」の隣にあるリストをクリックし、
TOF MSを削除する。
「Delete TOF MS (of MRM HR) MRM HRのTOF MSを削除 」
をクリックします。
注 ループ実験だけに適用されます。
メソッド内に複数の実験が存 「Experiment 実験 」の隣にあるリストをクリックし、
在する場合に実験を削除す
「Delete experiment 実験の削除 」をクリックします。
る。
以下のメソッドの構造を表示 ワークスペースの左側にある「Method Overview メソッド
する
概要 」パネルを展開したり折り畳んだりします。
• メソッドの内の実験数。
• メソッドの内の各実験のス
ケジュール期間。
• 複数の実験に対するTOF
MSMSスキャンの回数。
MSメソッドのパラメータ
パラメータ
定義
実験
Method duration
メソッドの期
間
ユーザー定義のMSメソッドの期間。
TOF MS、TOF MSMS、Q1、
SWATH、MRM HR、IDA
Total scan time 合 各サイクルの実行に必要な時間。実験時 TOF MS、TOF MSMS、Q1、
計スキャン時 間とオーバーヘッド 質量範囲間および実 SWATH、MRM HR、IDA
間
験間の切り替え時間 で構成されていま
す。合計スキャン時間は、LCピーク全体
のポイント数を推定し、良好な定量結果
を得る目的で使用します。
Add Experiment
実験の追加
クリックして実験を追加します。
Estimated cycles
推定サイクル
数
実行されるサイクル数は、「Method
TOF MS、TOF MSMS、Q1、
duration メソッドの期間 」フィールドの値 SWATH、MRM HR、IDA
に基づいて計算されます。
TOF MS、TOF MSMS、IDA、MRM
HR、SWATH
Dynamic Collision 最適な性能を実現するため、m/z値と荷電 IDA、SWATH
Energy 動的衝突 状態に基づいて衝突エネルギーが自動的
エネルギー
に計算されます。
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パラメータ
定義
実験
イオン源パラメータ
Curtain gas カー カーテンプレートとオリフィスプレート TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
TM
テンガス
間のガス流量を指定します。Curtain Gas SWATH、MRM HR
インターフェースの流れにより、イオン
光学部品の汚染を防ぎます。
Ion source gas 1 イオン源ガス1の流量を指定します。この TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
®
イオン源ガス1 パラメータにより、TurboIonSpray プロー SWATH、MRM HR
ブのネブライザガスとAPCIプローブの補
助ガスを制御します。
Temperature 温
度
イオン源またはプローブ内のヒーターガ TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
スの温度を指定します。
SWATH、MRM HR
Ion source gas 2 イオン源ガス2の流量を指定します。この TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
®
イオン源ガス2 パラメータにより、TurboIonSpray プロー SWATH、MRM HR
ブの補助ガスまたはターボガスを制御し
ます。スプレーの液滴の蒸発を促進させ
る目的で使用します。「Ion source gas 2 イ
オン源ガス2 」は、「Temperature 温度 」
パラメータと連携して機能します。
CAD gas CADガ
ス
衝突セル内のガスの圧力を制御します。 TOFMS、TOFMSMS、Q1、SWATH、
衝突ガスは、衝突セルを通過しているも MRM HR、IDA
のとして、イオンに焦点を当てるのに役
立ちます。CADパラメータのプリセット値
は、固定モードです。 スキャンの種類が
MS/MSスキャンの場合、CADガスは、前駆
体イオンを集めるのに役立ちます。前駆
体イオンが衝突ガスと衝突すると、それ
ぞれが分離してプロダクトイオンとなり
ます。
プリセット値を使用し、混合物用に最適
化します。
実験
Polarity 極性
対象となるイオンの電荷に対して適切な TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
極性を選択します。
SWATH、MRM HR
Nebulizer current APCIプローブ内のコロナ放電ニードルに TOF MS、TOF MSMS、Q1、
ネブライザ電 印加される電流を制御します。放電によ SWATH、MRM HR、IDA
流
り溶媒分子がイオン化され、それに次い
でサンプル分子もイオン化されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
パラメータ
定義
実験
Spray voltage ス
プレー電圧
サンプルをスプレー噴射するニードルに TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
印加される電圧。「Spray voltage スプレー SWATH、MRM HR、IDA
電圧 」パラメータはスプレーの安定性
と、それに伴う信号の感度に影響を与え
ます。
ITC
イオン飽和とMCPプレートの早期摩耗を TOF MS、TOF MSMS、Q1、IDA、
防ぐため、イオン伝送係数 ITC パラメータ SWATH、MRM HR
によってイオンビームを減衰します。
TOFMSモードでは、ソフトウェアによって
動的にイオン減衰が調整され、対応する
補正係数がデータ出力に適用されます。
一般的にMS/MSではビーム減衰は行われな
いため、計算は必要ありません。
Precursor ion 前
駆体イオン
TOF MSMS実験に対して選択されている候 TOF MSMS、IDA、SWATH、MRM
HR
補イオン。
Declustering
potential デクラ
スタリングポテ
ンシャル
オリフィスの電圧を制御します。これは、 TOF MS、TOF MSMS、Q1、
真空容器に入った後にサンプルイオンに SWATH、MRM HR
残る可能性がある溶媒殻を最小化し、必
要に応じて断片化させるために使用しま
す。電圧が高くなるほど、イオンに加え
られるエネルギーは高くなります。 DPパ
ラメータが高過ぎる場合、不要なフラグ
メンテーションが発生する場合がありま
す。
DP spread DPスプ 「DP spread DPスプレッド 」パラメータ TOF MS、TOF MSMS、IDA、
レッド
DPS と「Declustering potential デクラスタリ SWATH、MRM HR
ングポテンシャル 」パラメータを組み合
わせて、イオンに印加されるデクラスタ
リングポテンシャルを特定します。デク
ラスタリングポテンシャルは、低から高
にランプされます。たとえばポジティブ
モードの場合、デクラスタリングポテン
シャルはDP – DPSからDP + DPSにランプさ
れます。DPS値を入力することにより、デ
クラスタリングポテンシャルのスプレッ
ドが自動的にアクティブになります。
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取扱説明書 – ソフトウェア
パラメータ
定義
実験
Collision energy
衝突エネル
ギー
衝突エネルギーとは、エントランス電位 TOF MS、TOF MSMS、SWATH、
Q0 と衝突セル四重極 Q2 の電圧の差で
MRM HR、IDA
す。MS/MSスキャンでは、衝突エネルギー
によって衝突活性化解離 CAD のエネル
ギーが提供されます。衝突エネルギーは
化合物に固有なため、最適な値は化合物
ごとに異なります。
CE spread CEスプ 「CE spread CEスプレッド 」パラメータ
TOF MSMS、IDA、TOF MS、
レッド
CES と「Collision Energy 衝突エネルギー 」 SWATH、MRM HR
パラメータ CE を組み合わせ、プロダクト
イオンスキャンで前駆体イオンに印加さ
れる衝突エネルギーを決定します。衝突
エネルギーは、低から高にランプされま
す。たとえばポジティブモードの場合、
衝突エネルギーはCE – CESからCE + CESに
ランプされます。CES値を入力することに
より、衝突エネルギーのスプレッドが自
動的にアクティブになります。
TOF start mass
TOF開始質量
スキャン範囲の開始質量を入力します。 TOF MS、TOF MSMS、IDA、
SWATH、MRM HR
TOF stop mass
TOF停止質量
スキャン範囲の停止質量を入力します。 TOF MS、TOF MSMS、IDA、
SWATH、MRM HR
Accumulation time 装置が1つのTOFスペクトルを測定するの TOF MS、TOF MSMS、IDA、
蓄積時間
に必要な時間。蓄積時間を調整すること SWATH、MRM HR
で、合計スキャン時間を最適化できます。
Start mass 開始
質量
Q1スキャン範囲の開始質量を入力します。 Q1
Stop mass 停止質 Q1スキャン範囲の停止質量を入力します。 Q1
量
Scan time スキャ Q1質量範囲をスキャンするのに必要な時 Q1
ン時間
間。
Auto Fill SWATH クリックすると、「Autofill SWATH Windows SWATH
windows 自動入 自動入力SWATH Windows 」ダイアログが
力SWATH
開きます。詳細については、ヘルプを参
Windows
照してください。
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取扱説明書 – ソフトウェア
パラメータ
定義
実験
Import and
auto-fill イン
ポートと自動入
力
MRM HR
クリックすると、「Import and Auto-fill
MSMS Scan Information MSMSスキャン情報
のインポートと自動入力 」ダイアログが
開きます。詳細については、ヘルプシス
テムを参照してください。
Start run time 開 実験の開始時間を入力します。
始実行時間
TOF MS、TOF MSMS、MRM HR、
IDA、SWATH
Stop run time 停
止実行時間
実験の停止時間を入力します。
TOF MS、TOF MSMS、MRM HR、
IDA、SWATH
Apply fragment
ion mass フラグ
メントイオン質
量の適用
HR
各MRMトランジションに対してMRM を MRM HR
適用する場合に選択します。フラグメン
トイオンは、フラグメント質量を中心と
した+/- 10 Daの範囲のウィンドウを表しま
す。
Apply TOF
start/stop mass
TOF開始/停止質
量の適用
前駆体イオンおよび指定したフラグメン MRM HR
HR
ト質量範囲にMRM を適用する場合に選
択します。ユーザーは、フラグメント質
量範囲に対する開始質量と停止質量を入
力できます。
Apply Scan
Schedule スキャ
ンスケジュール
の適用
各MRM実験を指定した時間に実行できる MRM HR
ように、個別のMRMトランジションに保
持時間ウィンドウを適用する場合に選択
します。複雑なサンプルを処理する場合
は、最大500件のスケジュールされた
HR
MRM トランジションを入力できます。
Sort by precursor 測定前にMS表で前駆体の質量を昇順で並 MRM HR
ion 前駆体イオ べ替えます。状況によっては、MRMトラ
ンで並べ替え ンジションを昇順で測定することによっ
てMRM感度が改善する場合があります。
高度な実験設定
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取扱説明書 – ソフトウェア
パラメータ
定義
実験
Q1 resolution Q1 近接するコンポーネントの分離に使用す TOF MSMS、Q1、IDA
解像度
る解像度を選択します。Q1解像度は、四
重極の分解能です。MSMS実験で求められ
る感度が高い場合は、解像度設定を低減
して、分析の対象となるイオン数を増や
すことができます。Q1解像度の設定を
「Low 低 」または「Open オープン 」に設
定することで、結果として生成される信
号の強度を増加させたり、任意の同位体
パターンでC12以外の同位体を表示したり
できます。解像度を「Open オープン 」に
設定することで信号強度が高くなるため、
より多くの同位体を表示することができ
ます。
Step size ステッ スキャン間隔のサイズをダルトン単位で Q1
プサイズ
入力します。
Time bins to sum スペクトルの蓄積に使用するタイムビン TOF MS、TOF MSMS、IDA、MRM
タイムビン合 のサイズを定義するための値を選択しま HR、SWATH
計
す。インタクトプロテイン分析では、タ
イムビン合計の値を増加させて感度を改
善することができます。
Channels 1 to 4
チャネル1 4
時間-デジタル変換器 TDC のチャネル数を TOF MS、TOF MSMS、IDA、MRM
選択します。イオンは、各チャネルで計 HR、SWATH
数されます。4チャネルすべてを選択 デ
フォルト設定 した場合、全4チャネルが
合計イオン数として合算されます。
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103 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-10 IDA Criteria IDA基準
ラベル
説明
IDA Criteria IDA基 IDA基準とは、調査実験、つまりTOFMS実験に適用されるフィルターです。
準
IDA基準に一致するイオンだけが、MS/MS実験でトリガーされます。各アプ
リケーションウィンドウでは、適切なIDA基準が選択され、UI上に表示され
ます。また、ユーザーがすべてのワークフローを選択し、目的の基準を選
択することもできます。
Maximum
candidate ions 最
大候補イオン
数
サイクルごとに実行されるTOF MSMS実験の回数を指定します。存在する候
補イオン数が、入力された最大候補イオン数よりも少ない場合、MS/MSに
費やされる時間は候補イオン間で分散されます。つまり、測定全体を通じ
て、合計サイクル時間は相対的に一定に保たれます。返されるTOF MSMSス
ペクトルは、すべてcpsに正規化されます。ソフトウェアでは、サイクルご
とに最大100件のTOF MSMS実験を追加できます。
Dynamic
background
subtraction 動的
バックグラウン
ドサブトラク
ション
TOF MSスペクトルで強度を高めているイオンを優先し、強度の低下が始ま
る前にMS/MS測定に対してトリガーします。このフィルターによって、一
定したバックグラウンドイオンが候補リストから削除され、小規模であり
ながら強度を高めているイオンがトリガーされます。シグナル対ノイズ比
が高い場合、このようなイオンは複数回トリガーされる可能性がありま
す。動的バックグラウンドサブトラクションフィルターは、IDA基準セク
ションで他の標準フィルターと組み合わせて使用することができます。
Intensity threshold TOF MSMS実験での候補イオンの最小強度 秒あたりのイオン数 を指定しま
exceeds 下限強 す。
度しきい値
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Exclude former
以前の候補イオンを無視する条件のオプションを選択します。
candidate ions 以 • For (sec) 時間 秒
前の候補イオン
TOF MSMS実験に対して選択された候補イオンは、それ以降X秒はMS/MS
を除外する
で候補の対象となりません。この値はLCピーク幅の半分に設定し、候補
イオンがピーク頂点でトリガーされるようにすることをお勧めします。
• After _ occurrences _回の出現後
「For (sec) 時間 秒 」との組み合わせ 後続サイクルのX秒の間、候補イオ
ンがMS/MSに対してY回選択されるようにします。その後は、候補リス
トから除外されるようになります。
注 動的除外ルーチンでは、MWを使用します m/z比ではありません 。
同じMW 質量許容範囲内 を持ち、荷電状態が異なる候補イオンは、同
一の候補とみなされます。繰り返し回数の条件に一致しない場合は、
最も強度が高い荷電状態が候補リストに残ります。候補イオンがMSMS
に対して1回選択されていて、それ以上トリガーされないようにする場
合は、「For (Sec) 時間 秒 」フィールドにメソッドの期間を秒単位で入
力します。
Dynamic CE for
m/z値とイオンの荷電状態に基づいて、衝突エネルギーが自動的に計算さ
MS/MS MS/MSの れます。MSメソッドの動的衝突エネルギーを計算する 該当ページ 111を参
動的CE
照してください。
動的CEは、CEスプレッドと組み合わせて使用できます。衝突エネルギース
プレッド CES は、計算された衝突エネルギーを中心として適用されます。
Charge State 荷電 候補イオンの荷電状態範囲を指定します。これにより、一価のバックグラ
状態
ウンドイオンや未知の荷電イオンを排除することができます。このフィル
ターは、一般的にペプチドの用途で使用します。荷電状態の基準を選択し
た場合は、モノアイソトピックイオンだけがMS/MSに対して選択されます。
高度な基準
Dynamic
accumulation 動
的蓄積
「Dynamic Accumulation 動的蓄積 」では、強度が低いイオンに対する蓄積時
間を長く、強度が高いイオンに対する蓄積時間を短くすることで、高品質
なMS/MSデータの取得に役立てます。また、前駆体の強度に基づいてMSMS
蓄積時間を適用する機能を使用することで、MS/MSスペクトルの品質を改
善することができます。このオプションを選択すると、蓄積時間が調整さ
れます。つまり、最も強度が高い候補には最短の蓄積時間が割り当てら
れ、候補イオンの強度が低いほど長い蓄積時間が割り当てられることにな
ります。また、測定全体を通じて、合計サイクル時間は相対的に一定に保
たれます。
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Candidate mass
range 候補質量
範囲
候補イオンのm/z範囲を指定します。候補質量範囲は、常にTOF MS質量範
囲に収まります。
Exclude isotopes
within +/- Da +/Da以内の同位体
を除外する
同位体の除外ウィンドウを指定する場合に選択します。このウィンドウ
は、MS/MSに対して選択された候補イオンを中心とした左右対称のウィン
ドウです。入力する値は、ウィンドウの半分の幅になります。つまり、値
4を入力した場合、ウィンドウM-4 M+4の範囲内に収まる任意のピークは、
Mと同一のサイクルにおいてMS/MSに対して選択されません。この機能が
アクティブの場合、Peak Finderでは未知のピークがモノアイソトピックで+1
の荷電状態とみなされます。これは、小分子の用途に最適化されていま
す。
Adjust CE when CEの大きさを自動的に9 V増加させます。このフィールドを選択すると、
®
using iTRAQ
「Dynamic CE for MS/MS MS/MSの動的CE 」チェックボックスが自動的に選択
reagent iTRAQ試 され、使用できなくなります。
薬の使用時はCE
を調整する
Mass tolerance +/質量許容範囲
+/mDa
ppm
質量許容範囲ウィンドウを指定します。このウィンドウは、MS/MSに対し
て選択された候補イオンを中心とした左右対称のウィンドウです。ウィン
ドウの半分の幅を入力してください。たとえば、入力した値が50 mDaの場
合、ウィンドウM-50 mDa M+50 mDaの範囲に収まるピークは、Mと同じピー
クとみなされます。Mはイオンのm/z値です。ユーザーはppmかmDaのいず
れかを選択できます。質量許容範囲は、動的除外を持つ分子量またはイオ
ンのm/z値に適用できます。
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Inclusion List 含め IDAの「含めるリスト」基準を使用する場合は、チェックボックスを選択し
るリスト
ます。リンクをクリックしてIDAの「Inclusion List 含めるリスト 」ダイアロ
グを開き、基準を編集します。
含めるリストに存在し、含めるリストの基準と一致する候補イオンは、
MS/MSに対して優先的に選択されます。
• Compound name 化合物名 候補イオンの名前。名前には任意の文字を含
めることができ、一意である必要はありません。化合物名は、ファイル
情報に記録されます。このフィールドは空白のままにしておくことがで
きます。
• m/z (Da) MS/MSを優先的に実行する対象となるイオンのm/z値を入力しま
す。
• Retention time 保持時間 分 対象となるイオンのLC保持時間を入力しま
す。指定した保持時間でイオンが検出された場合、そのイオンはMS/MS
に対して優先的に選択されます。値として0を入力すると、測定全体を
通じてイオンが優先的に選択されます。
• Retention time tolerance 保持時間許容範囲 +/-秒 指定した保持時間を中心
とした+/-の時間ウィンドウです。許容範囲は、LC保持時間で発生するド
リフトに対応するのに役立ちます。含めるリストに存在するイオンが、
指定した保持時間を中心としたウィンドウの範囲内で検出された場合、
そのイオンはMS/MSに対して優先的に選択されます。
• Intensity 強度 cps 含めるリストのイオンについて、強度のしきい値を指
定します。候補イオンがしきい値 cps単位 を上回っている場合、そのイ
オンはMS/MSに対して優先的に選択されます。
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Exclusion List 除
外リスト
IDAの「除外リスト」基準を使用する場合は、チェックボックスを選択しま
す。リンクをクリックしてIDAの「Exclusion List 除外リスト 」ダイアログを
開き、基準を編集します。
除外リストに存在する候補イオンは、指定した保持時間でMS/MSに対して
選択されません。
• Compound name 化合物名 候補イオンの名前。名前には任意の文字を含
めることができ、一意である必要はありません。化合物名は、ファイル
情報に記録されます。このフィールドは空白のままにしておくことがで
きます。
• m/z Da MS/MSを実行しない対象となるイオンのm/z値を入力します。
• Retention time 保持時間 分 対象となるイオンのLC保持時間を入力しま
す。指定した保持時間でイオンが検出された場合、そのイオンはMS/MS
に対して選択されません。値として0を入力すると、測定全体を通じて
イオンが選択されません。
• Retention time tolerance 保持時間許容範囲 +/-秒 指定した保持時間を中心
とした+/-の時間ウィンドウです。許容範囲は、LC保持時間で発生するド
リフトに対応するのに役立ちます。除外リストに存在するイオンが、指
定した保持時間を中心としたウィンドウの範囲内で検出された場合、そ
のイオンはMS/MSに対して除外されます。
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Mass Defect Filter 「質量欠損フィルター」基準を使用する場合は、チェックボックスを選択
質量欠損フィ します。リンクをクリックしてIDAの「Mass Defect Filter 質量欠損フィル
ルター
ター 」ダイアログを開き、基準を編集します。
指定した質量欠損基準に一致する任意のイオンに対して、MS/MSがトリガー
されます。IDAアルゴリズムではイオンが分子量に変換され、分子量が質量
欠損基準と比較されます。質量欠損フィルターを適用することで、予期さ
れる分子量範囲から外れるすべてのイオンだけでなく、予期される分子量
の範囲内に収まりながら予期される質量欠損範囲を超えるイオンもフィル
タリングできます。
質量欠損 mDa = ABS 単一質量 - 公称質量
• Chemical formula 化学式 代表となる対象化合物の分子式を入力します。
複数の式を入力することで、複数の質量欠損をリアルタイムでフィルタ
リングできます。
• MW Da 化学式の単分子量はソフトウェアが生成します。
• MW tolerance MW許容範囲 +/- Da 式を入力すると、関連する分子量 MW
はソフトウェアによって自動的に計算されます。MW許容範囲 +/-Da と
は、計算されたMWを中心としたウィンドウです。候補イオンの質量欠
損が、「質量欠損±質量欠損許容範囲」の基準と一致し、MWを中心と
したウィンドウの範囲内に収まる場合は、MS/MSに対して選択されま
す。
• Mass defect 質量欠損 Da 分子式とMW許容範囲を入力します。入力され
た式の質量欠損は、ソフトウェアが計算します。
• Mass defect tolerance 質量欠損許容範囲 mDa 質量欠損に関する許容範囲
を入力します。
Use the mass defect filter with no other IDA criteria 他のIDA基準を適用せずに質量
欠損フィルターを使用する 質量欠損フィルターを排他的に使用する場合
は、このチェックボックスを選択します。MS/MSは、指定した基準の範囲
内に収まる質量欠損を持つ候補イオンに対してのみ実行されます。この
チェックボックスを選択していない場合、質量欠損基準と一致する候補イ
オンは、候補リストの中で他のイオン 指定した残りのIDA基準と一致する
イオン よりも優先順位が高くなります。ただし、含めるリストは例外で
す。含めるリストの基準を満たす候補イオンは、質量欠損基準を満たすイ
オンと同じ優先順位になります。
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
Isotopic Matching 「同位体の一致」基準を使用する場合は、チェックボックスを選択しま
同位体の一致 す。リンクをクリックして「Isotopic Matching 同位体の一致 」ダイアログを
開き、基準を編集します。
同位体の一致を選択している場合、ユーザーは同位体パターンを手動で入
力したり、「Isotopic Calculator 同位体計算機 」を使用して計算してからMS/MS
のトリガーに使用する同位体パターンを入力したりできます。パターンを
手動で入力する場合、最初のエントリは質量差が0 Daで100%の相対量でな
ければなりません。同位体パターンの中でモノアイソトピックイオンが最
も豊富なイオンでない場合、「Abundance 相対量 」列の後続のエントリは
100%よりも大きな値にすることができます。
Isotope to use for TOF MSMS TOF MSMSで使用する同位体 同位体パターンの中
で、MS/MSを実行する対象となるピークを選択します。たとえば、モノア
イソトピックイオンまたは最も強度が高いイオンを選択します。
Isotopic Calculator 同位体計算機 ユーザーが指定した式または荷電状態、さ
らに必要な場合はH+の電荷エージェントに基づいて、同位体パターンを自
動的に計算します。「Isotopic Calculator 同位体計算機 」に式を入力して、
「Calculate 計算 」をクリックします。「OK」をクリックすると、「Isotopic
Calculator 同位体計算機 」ダイアログが閉じます。「Mass Difference 質量差 」
および「Abundance 相対量 」の各列は自動的に入力されます。
注 相対量が1%未満の行は、自動的に削除されます。
Tolerance (mass) 許容範囲 質量 パターン内で指定されたピークの質量差は、
+/-の許容範囲に収まっていないとパターンに一致しません。
Tolerance (Abundance) 許容範囲 相対量 %単位で表した相対量の許容範囲で
す。パターン内で指定されたピークの相対量は、±の相対量許容範囲に収
まっていないとパターンに一致しません。
Neutral Loss 中性
損失
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表 7-10 IDA Criteria IDA基準 (続き)
ラベル
説明
「中性損失」基準を使用する場合は、チェックボックスを選択します。リ
ンクをクリックして「Neutral Loss 中性損失 」ダイアログを開き、基準を編
集します。
中性損失を選択している場合、異なるCE値 低/高CE値 を持つ2種類のTOF MS
実験の質量リストが比較され、質量差が許容範囲 質量 に収まる前駆体質
量がMS/MSに対してトリガーされます。
注 MS/MSによってトリガーされるのは、低CE調査スキャンの前駆体イオ
ンだけです。中性損失フィルターを選択している場合、中性損失イオン
がIDA実験に対して排他的に選択されます。「Neutral Loss 中性損失 」機能
を選択すると、TOF MSメソッドのCE値は使用できなくなります。
• Low CE 低CE 調査スキャン 最初のTOF MS実験に適用する衝突エネルギー
を設定します。
• High CE 高CE 2 回目のスキャン 2 回目のTOF MS実験に適用する衝突エネル
ギーを設定します。
注 正極の場合、高CEは低CEの値よりも大きくなります。負極の場合、
低CEが高CEの値よりも大きくなります。
• Tolerance (mass) 許容範囲 質量 質量差に適用する許容範囲を指定します。
デフォルト値は0.02 Daです。
MSメソッドの動的衝突エネルギーを計算する
1. 「MS Method MSメソッド 」ワークスペースを開きます。
®
2. IDA基準またはSWATH アプリケーション基準を含むMSメソッドを作成するか開きます。
3. 「Advanced アドバンスト 」 > 「Dynamic collision energy 動的衝突エネルギー 」をク
リックします。
4. 必要に応じてフィールドの情報を修正します。
5. 次のいずれかを実行します。
• 以前に保存したデフォルト値を使用して動的衝突エネルギーを計算するには、「Load
Default Settings デフォルト値のロード 」をクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
• 新しいメソッドで動的衝突エネルギーを計算する場合に使用するデフォルト値として
現在の値を保存するには、「Save as Default Settings デフォルト値として保存 」を
クリックします。
• 現在の値を現在のメソッドに適用して動的衝突エネルギーを計算するには、「Apply 適
用 」をクリックします。
• ダイアログを閉じて変更内容を破棄するには、「Cancel キャンセル 」をクリックしま
す。
「LCメソッド」ワークスペース
LCメソッドの作成
LCデバイスに付属している資料等を参照してください。
1. LC Method (LCメソッド) ワークスペースを開きます。
2. Newをクリックします。
3. 必要に応じて、左側のパネルにあるデバイスをクリックし、次にフィールドを編集しま
す。
4. ファイルを保存します。
「Explorer エクスプローラ 」ワークスペース
分析物の存在の確認
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-7 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Extract Ion Chromatogram (XIC) 抽出イオンクロマトグラム XIC 」
をクリックします。
図 7-8 「Show 表示 」メニュー—オプション
「Specify XIC Ranges XICの範囲指定 」ダイアログが開きます。
6. 「Specify XIC Ranges XICの範囲指定 」ダイアログで「Center 中心 」、「Width 幅 」、
「Compound 化合物 」の各値を入力します。イオンの抽出 該当ページ 114を参照してく
ださい。
7. 「OK」をクリックします。
8. 「Show 表示 」 > 「Data and Peaks Table データおよびピーク表 」をクリックします。
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図 7-9 「Show 表示 」メニュー—オプション
9. 化合物のピーク面積、強度、質量、および電荷を確認します。
イオンの抽出
重なっている1つ以上の抽出イオンクロマトグラム XIC を計算する目的で使用します。これ
は、保持時間を関数とした一定の質量範囲にわたる強度和のプロットです。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-10 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
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ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. 「OK」をクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Extract Ion Chromatogram (XIC) 抽出イオンクロマトグラム XIC 」
をクリックします。
図 7-11 「Show 表示 」メニュー—オプション
「Specify XIC Ranges XICの範囲指定 」ダイアログが開きます。
6. 「Center 中心 」、「Width 幅 」、「Compound 化合物 」の各値を入力するか、値をイ
ンポートします。
注 XICのデフォルトのタイトルは、特定の行のセルに表示されている化合物名で構成さ
れています。
ヒント 「Center/Width 中心/幅 」モードを使用している場合、「Center 中心 」値とし
て質量ではなく化学式を指定できます。中性の組成物 H20など を使用している場合、ポ
ジティブモードでは自動的にプロトンが加算され、ネガティブモードでは自動的に減算
+
されます 水の例の場合、ポジティブモードではH3O のm/zが使用されます 。組成の末尾
に「+n」または「-n」を付けて、明示的に電荷状態を指定します。nは電荷状態を表し、
+
+
省略した場合は1とみなされます。たとえば、H2ONa と指定されている場合、H2ONa の
m/zはそのまま使用されます。
7. 「Specify XIC Ranges XICの範囲指定 」ダイアログで右クリックし、表示される機能を使
用します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-12 「Specify XIC Ranges XIC範囲の指定 」ダイアログの右クリックメニュー
8. 「OK」をクリックします。
アクティブなグラフに、別のサンプルと重なっている系列が含まれている場合は、「Process
All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開きます。
9. 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開いた場合
は、以下のいずれかの操作を行います。
• 使用可能なすべてのサンプルについてXICのオーバーレイを生成するには、「All Overlaid
重なっているすべてのデータセット 」を選択します。
• 現在アクティブなサンプルだけでXICを生成するには、「Active Only アクティブなデー
タセットのみ 」を選択します。
「Only show this dialog again if the Shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
トータルイオンクロマトグラムを開く
トータルイオンクロマトグラム TIC は、一連の質量スキャンから得られたすべてのイオンの
強度寄与を合計することで作成されます。TICを使用して、データセット全体を単一のペイン
で表示します。TICは、クロマトグラムのペインの時間に対してプロットされたスキャンのす
べてのイオンの強度の合計で構成されています。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-13 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Total Ion Chromatogram (TIC) トータルイオンクロマトグラム TIC 」
をクリックします。
アクティブなグラフに、別のサンプルと重なっている系列が含まれている場合は、「Process
All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開きます。
6. 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開いた場合
は、以下のいずれかの操作を行います。
• 使用可能なすべてのサンプルについてXICのオーバーレイを生成するには、「All Overlaid
重なっているすべてのデータセット 」を選択します。
• 現在アクティブなサンプルだけでXICを生成するには、「Active Only アクティブなデー
タセットのみ 」を選択します。
「Only show this dialog again if the Shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
7. TICで右クリックして、図 7-14に示されている機能を使用します。
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図 7-14 「Total Ion Chromatogram トータルイオンクロマトグラム 」の右クリックメ
ニュー
項目 ラベル
説明
1
Remove Active
Trace アクティ
ブなトレース
を削除する
重なっているトレースが複数存在する場合に使用できます。現在
アクティブなトレースがグラフから削除されます。現在アクティ
ブではないトレースを削除するには、目的のトレースをアクティ
ブにしてからこの機能を選択します。
2
Remove All
Traces Except
Active アクティ
ブなトレース
を除き、ト
レースをすべ
て削除する
重なっているトレースが複数存在する場合に使用できます。現在
アクティブなトレースを除き、すべてのトレースが削除されま
す。保持するトレースが現在アクティブではない場合は、目的の
トレースをアクティブにしてからこの機能を選択します。
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項目 ラベル
3
説明
Add Caption
グラフにテキストを追加します。
キャプション
必要に応じて「Font フォント 」をクリックし、フォントのプロ
の追加
パティを調整してから「OK」をクリックします。キャプション
は、ユーザーが右クリックしてメニューを開いた x, y 位置に追加
されます。
キャプションの追加後は、ドラッグして別の場所に移動すること
ができます。x軸またはy軸にドラッグすると、ドラッグ操作が取
り消されます。
「\d」および「\u」という文字列は、特別に扱われます。前者の
場合、その直後に続く1文字が下付き文字として描画され、後者
の場合は上付き文字として描画されます。どちらの場合も、特殊
文字は表示されません。これは、化学式を表現する場合に特に便
+
利です。たとえば、「H\d3O\u+」と入力すると「H3O 」と表示さ
れます。
4
Edit Caption
キャプションの上で右クリックします。このダイアログは、キャ
キャプション プションをダブルクリックして開くこともできます。
の編集
5
Delete Caption キャプションの上で右クリックして、この機能を選択します。ま
キャプション た、キャプションをグラフの外までドラッグすると削除されま
の削除
す。
6
Delete All
グラフに1つ以上のキャプションが存在する場合に使用できます。
Captions すべて 1回の操作ですべてのキャプションが削除されます。
のキャプショ
ンを削除
7
Paste Image 画
像を貼り付け
る
8
Delete Image 画 選択した画像をグラフから削除します。
像を削除
グラフに画像を貼り付けます。
ベースピーククロマトグラムを開く
各スペクトルにおける最大ピークの強度を時間の関数としてプロットします。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-15 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Base Peak Chromatogram (BPC) ベースピーククロマトグラム BPC 」
をクリックします。
図 7-16 「Show 表示 」メニュー—オプション
「BPC Options BPCオプション 」ダイアログが開きます。
6. 図 7-17に示されている機能を使用します。
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図 7-17 「BPC Options BPCオプション 」ダイアログ
注 ベースピーククロマトグラムの生成中に、単一の選択範囲が1.0分を超えて広がって
いるクロマトグラムがアクティブになっている場合、時間範囲は、デフォルトでその選
択範囲の時間範囲になります。それ以外の場合は、最後の時間範囲が使用されます。時
間範囲を制限することで、ユーザーが手動で範囲を入力する手間を省けます。
アクティブなグラフに、別のサンプルと重なっている系列が含まれている場合は、「Process
All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開きます。
図 7-18 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログ
項目
1
ラベル
Do you want to 'Show BPCs' for all overlaid data sets or only the active one? 「BPCを表示
する」対象は、重なっているすべてのデータセットとアクティブなデータセッ
トのどちらにしますか
• All Overlaid 重なっているすべてのデータセット
• Active Only アクティブなデータセットのみ
2
Only show this dialog again if the shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこのダ
イアログボックスを再び表示する
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項目
ラベル
3
OK
4
Cancel キャンセル
7. 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開いた場合
は、以下のいずれかの操作を行います。
• 使用可能なすべてのサンプルについてXICのオーバーレイを生成するには、「All Overlaid
重なっているすべてのデータセット 」を選択します。
• 現在アクティブなサンプルだけでXICを生成するには、「Active Only アクティブなデー
タセットのみ 」を選択します。
「Only show this dialog again if the Shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
データおよびピーク表の表示
データおよびピーク表は、2種類の表で構成されています。データ表にはデータセットを構成
する生データの x、y 値が表示され、ピーク表にはピーク自体の情報が表示されます。この表
は、グラフがアクティブの場合に生成されます。
注 表示されるのは、グラフのy軸に対して青い矢印を使用して設定した現在のしきい値を
超えているピークだけです。グラフでのデータの操作 該当ページ 132を参照してください。
この機能は、現在アクティブなデータに対して2種類の表で構成されたペインを表示する目的
で使用します。2種類の表とは、生データの x、y 値が表示される表とピークのリストが表示
される表です。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-19 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Data and Peaks Table データおよびピーク表 」をクリックします。
図 7-20 「Show 表示 」メニュー—オプション
表 7-11に示されている機能を使用します。
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表 7-11 データおよびピーク表の機能
目的の作業
実行する操作
そのフィール 列見出しをクリックします。
ドを基準とし
て表を並べ替
える。
現在選択され 表内で右クリックして、「Copy コピー 」をクリックします。「Data
ているセルを データ 」タブがアクティブの場合は、選択されているx値およびy値がコ
コピーする。 ピーされます。「Peaks ピーク 」タブがアクティブの場合は、選択され
ているピーク情報がコピーされます。
選択した行だ まず行選択列でドラッグして行を選択してから、ShiftまたはCtrlキーを
けをコピーす 使用して複数の行を選択します。
る。
複数の列を選 Ctrlキーを押しながら列見出しをクリックします。単に列見出しをクリッ
択する。
クした場合は、列が並べ替えられます。
表全体をコ
ピーする。
「Edit 編集 」 > 「Select All すべて選択 」をクリックして、「Edit 編
集 」 > 「Copy コピー 」をクリックします。
テキストとし ペイン内で右クリックし、「Export Data as Text テキストとしてデータ
てデータをエ をエクスポートする 」をクリックします。
クスポートす
指定したファイルにデータリスト全体を保存します。x値とy値はタブで
る。
区切られており、各 x、y ペアの後にはキャリッジリターンが続きます。
テキストとし ペイン内で右クリックし、「Export Peak List as Text テキストとして
てピークリス ピークリストをエクスポートする 」をクリックします。
トをエクス
指定したファイルにピークリスト全体を保存します。これには、関連付
ポートする。
けられたグラフのy軸で設定されている現在のしきい値を下回っている
ピークは含まれません。各種ピークメトリックはタブで区切られており、
各ピークの後にはキャリッジリターンが続きます。
サンプル情報の表示
「Sample Information サンプル情報 」ペインには、アクティブデータの取得に使用されている
実験の説明がテキスト情報として表示されます。表示される情報は、サンプル名やデータ取
得に関する情報 実験の回数や種類など といったサンプルに固有の情報です。
異なるサンプルに関連付けられた複数の「Sample Information サンプル情報 」ペインが表示さ
れている場合は、いずれかのペインのツリービューで項目をクリックすると、他のすべての
ペインでは対応するセクションまでスクロールします。これは、すべてのペインに同じ名前
を持つセクションが存在することを前提とした機能です。この機能は、2つの類似した ただ
し同一ではない 「Sample Information サンプル情報 」ペインを比較する場合に便利です。
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取扱説明書 – ソフトウェア
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-21 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Show 表示 」 > 「Sample Information サンプル情報 」をクリックします。
グラフ選択情報の表示
このウィンドウには、クロマトグラムまたはスペクトルで選択されている領域の情報が表示
され、このようなペインのいずれかがアクティブの場合に生成されます。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-22 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Window ウィンドウ 」 > 「Graph Selection Window グラフ選択ウィンドウ 」をク
リックします。
「Graph Selection Info グラフ選択情報 」ダイアログが開きます。
図 7-23 「Graph Selection Info グラフ選択情報 」ダイアログ
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6. グラフで1つまたは複数の選択を行います。
図 7-24 グラフ選択情報
7. リストから、「Default Info デフォルト情報 」、「XY Info XY情報 」、「Standard
Deviations 標準偏差 」、「Signal/Noise 信号/ノイズ 」のいずれかのオプションを選択
します。
8. 必要に応じて表 7-12の機能を使用します。
表 7-12 グラフ選択情報
ラベル
説明
Default Info デフォルト情報
グラフで複数の選択が行われている場合、情報はそれぞれ個別に表示されます。
Selected Start and 選択した部分の左右のx値。
End 選択の開始位
置と終了位置
Selected Points 選
択したポイント
選択したx値の範囲に対応したデータポイントのインデックス。
Min and Max 最小 選択した領域内に含まれるデータポイントの最小および最大y値。
および最大
Sum 合計
選択した領域内に含まれるデータポイントのy値の合計。
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表 7-12 グラフ選択情報 (続き)
ラベル
説明
Peak ピーク
選択した部分における最大ピークのx値。グラフに関連付けられたPeak
Finderがその領域でピークを見つけられなかった場合、このフィールド
は表示されません。選択した領域でPeak Finderがピークを見つけられな
い場合は、「X at Max Y 最大Y値におけるX値 」という追加フィールド
が表示されます。このフィールドには、最大y値を持つ選択範囲内のポ
イントに対応するx値が表示されます。
Peak Width at 50% 高さの半分の位置におけるピークの幅。選択した領域でピークが見つ
50%でのピーク からなかった場合、このフィールドは表示されません。
幅
Points Across Peak 高さの半分の位置におけるデータポイントのピークの幅。選択した領
at 50% 50%での 域でピークが見つからなかった場合、このフィールドは表示されませ
ピークを横切る ん。
ポイント
Peak Width at Base ベース位置におけるピークの幅。選択した領域でピークが見つからな
ベースでのピー かった場合、このフィールドは表示されません。
ク幅
Points Across Peak ベース位置におけるデータポイントのピークの幅。選択した領域でピー
at Base ベースで クが見つからなかった場合、このフィールドは表示されません。
のピークを横切
るポイント
Peak Area ピーク 選択した部分における最大ピークの面積。選択した領域でピークが見
面積
つからなかった場合、このフィールドは表示されません。
XY Info XY情報
このビューには、「Default Info デフォルト情報 」ビューに表示される情報のサブセット
が表示されます。選択したx値 またはy値 をコピーして別の場所に貼り付ける場合は、こ
ちらのほうが便利です。
X-values X値
選択した部分にPeak Finderが検出したピークが含まれている場合、ここ
にはPeak Finderが検出したx値 選択した部分の中で最大のピークに対応
するx値 が表示されます。そうでない場合は、選択した部分の中で最
大の強度を持つデータポイントに対応するx値が表示されます。
Y-values Y値
選択した各部分の中で最大のy値。
Peak Area ピーク 選択した各部分における最大ピークのピーク面積。
面積
Standard Deviations 標準偏差
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表 7-12 グラフ選択情報 (続き)
ラベル
説明
このオプションが選択されている場合、選択した部分がおおよそ一定の強度を持つ領域
に広がっているものと想定されます。選択した領域にピークが含まれている場合は、こ
の項目を選択しないでください。
Average and Std.
Deviation 平均お
よび標準偏差
選択した領域内のy値の平均とその標準偏差。
Signal/Noise 信号/ノイズ
グラフ内で少なくとも2か所の選択を行い、1か所にはノイズ領域が含まれ、もう1か所に
は目的のピークが含まれるようにします。
そのピークの信号/ノイズ S/N 比が報告されます。最大y値を含む選択範囲にはピークが含
まれるものと想定され、その他の選択範囲にはノイズ領域が含まれるものと想定されま
す。3か所以上の領域を選択すると、最小のy値を持つ領域がノイズ領域と想定され、そ
の他の領域に目的のピークが含まれるものと想定されます。
Average and Std.
Deviation 平均お
よび標準偏差
ノイズ領域に対応するy値の平均とその標準偏差が表示されます。
Subtracted Height ピークの選択範囲 複数の選択範囲の場合も含む について、ピーク高さ
補正された高さ からノイズ領域の平均y値を差し引いた値 つまりノイズを上回る部分
のピーク高さ 。
Signal/Noise 信号/ 計算されたピークのS/N比。ピークの「Subtracted Height 補正された高
ノイズ
さ 」をノイズ領域の標準偏差で除算し、係数で乗算した値です。この
係数は、「Options オプション 」セクションで指定されているノイズ係
数です。このノイズ係数は、出力ではカッコ付きで表示されます。こ
こで定義される信号/ノイズ比は二乗平均平方根 RMS S/Nと呼ばれる場
合があります。これは、標準偏差が平均値に基づいて推定されるノイ
ズ値のRMSであるためです。
Peak-to-Peak S/N ピークの「Subtracted Height 補正された高さ 」をノイズ領域の範囲全体
ピーク対ピーク 最大Y-最小Y で除算して計算されたS/N。
S/N
9. オプション 「Options オプション 」
アイコンをクリックします。
「Graph Info Options グラフ情報オプション 」ダイアログが開きます。
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図 7-25 「Graph Info Options グラフ情報オプション 」ダイアログ
項目 ラベル
説明
1
Noise multiplier for
信号/ノイズ比では、ノイズとは、指定されたバックグラウン
S/N S/Nのノイズ係 ド領域内のポイントの標準偏差をこの係数で乗算した値として
数
定義されます。通常この値は、1 3の範囲になります。
2
Spectral height
「Sum Y Above x% x%を上回る合計Y 」および「Peak Width
percentage スペクト at x% x%でのピーク幅 」フィールドの計算で使用される高さ
ル高さの割合
の割合を変更することができます。通常はデフォルト値の50%
が適しており、変更する必要はありません。
3
Semi-transparent
(when not active) 半
透明 アクティブで
ない場合
選択すると、背後のデータが見えるように情報ウィンドウが半
透明で描画されます。この機能を使用している場合、ユーザー
がウィンドウをクリックしてアクティブにすると、そのウィン
ドウは不透明で描画されます。この機能は、グラフが情報表示
の妨げとなっている場合に使用します。
10. オプション 「Fill Peaks ピークの塗りつぶし 」
アイコンをクリックします。
アクティブなグラフで、暗部と明部が交互に変化するようにピークを塗りつぶすモード
と、そのようにしないモードを切り替えます。この機能は、「Peak Width at Base ベー
スでのピーク幅 」に対応するピークの範囲を確認する場合に便利です。
11. オプション 「Show Point Symbols ポイント記号の表示 」
す。
アイコンをクリックしま
アクティブなグラフで、データポイントをポイント記号で示すモードと、そのようにしな
いモードを切り替えます。この機能は、メインウィンドウに表示されるテキスト情報を使
用するだけでなく、ピークを細かく調べ、どのくらいのデータポイント数で構成されてい
るのかを確認する場合に便利です。
グラフの設定の編集
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-26 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Edit 編集 」をクリックし、図 7-27の機能を使用します。
図 7-27 「Edit 編集 」メニュー—オプション
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項目
ラベル
説明
1
Copy コ 現在のデータをクリップボードにコピーします。スペクトルまたはク
ピー
ロマトグラムがアクティブの場合、そのアクティブなグラフの画像が
コピーされます。
2
Copy
スペクトルまたはクロマトグラムがアクティブの場合、このオプショ
Graph グ ンを使用して、現在のグラフを画像としてクリップボードにコピーし
ラフの ます。
コピー
3
Copy
アクティブなウィンドウ全体の画像をクリップボードにコピーしま
Window す。ウィンドウのタイトルバーおよび各種ペインのツールバーは含ま
ウィン れません。
ドウの
コピー
4
Paste 貼 このオプションを使用して、データをクリップボードから現在のビュー
り付け に貼り付けます。
5
Select All 表がアクティブの場合は、表内のすべての行を選択します。テキスト
すべて ペインがアクティブの場合は、すべてのテキストを選択します。
選択
6
Options
オプ
ション
グラフの外観、ピークのラベル付けと検出、自動処理、XIC範囲の計
算に関するオプションを設定することができます。オプションの設定
該当ページ 154を参照してください。
7
Reset
Options
オプ
ション
のリ
セット
このオプションを使用して、デフォルトのエクスプローラオプション
に戻します。オプションのリセット 該当ページ 154を参照してくださ
い。
グラフでのデータの操作
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
3. 「OK」をクリックします。
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4. ピークのラベル付けや、それに伴う「Data and Peaks Table データおよびピーク表 」な
どの機能に対するしきい値を設定するには、グラフのy軸に表示される青い矢印をドラッ
グします。
図 7-28 Y軸の青い矢印
5. 図 7-29に示されている機能を使用します。
図 7-29 「Graph グラフ 」メニュー—オプション
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項目 ラベル
1
説明
Set Selection 後続の操作で処理されるグラフの部分を選択します。たとえば、ク
選択部分を ロマトグラムの領域を選択してダブルクリックし、平均スペクトル
設定
を取得します。「Set Selection 選択部分を設定 」機能を使用して
具体的なxの範囲を入力すると、カーソルを使用した場合よりも正確
に選択部分を設定することができます。
a. 「Graph グラフ 」 > 「Set Selection 選択部分を設定 」をクリッ
クします。
b. 「Set Selection 選択部分を設定 」ダイアログで、「Center 中
心 」および「Width 幅 」の各値を入力します。
c. 「OK」をクリックします。
ヒント グラフ内での選択部分を手動で設定するには、プロット領
域でカーソルをドラッグして選択を行います。Shiftキーを押すと、
現在の選択部分が保持されます。
2
Expand
Selected
Y-Values By
選択したY
値を拡大
プロットを目的として、指定した係数の範囲内でy値を拡大します。
a. データファイルを開きます。
b. グラフの部分を選択します。
c. 「Graph グラフ 」 > 「Expand Selected Y-Values by 選択した
Y値を拡大 」をクリックします。
d. 「Expand Selection 選択部分を拡大 」ダイアログで、拡大係数
を入力します。
e. 「OK」をクリックします。
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項目 ラベル
説明
3
Clear
すべての拡大範囲を解除します。
Expansion
• 拡大された範囲が存在するグラフで、「Graph グラフ 」 > 「Clear
Ranges 拡大
Expansion Ranges 拡大範囲をクリア 」をクリックします。
範囲をクリ
ア
4
Remove Active この機能は、重なっているトレースが複数存在する場合に使用でき
Trace アク
ます。現在アクティブなトレースがグラフから削除されます。
ティブなト • 重なっているトレースが複数存在するグラフで、「Graph グラ
レースを削
フ 」 > 「Remove Active Trace アクティブなトレースを削除す
除する
る 」をクリックします。
5
Remove All
Traces Except
Active アク
ティブなト
レースを除
き、トレー
スをすべて
削除する
この機能は、重なっているトレースが複数存在する場合に使用でき
ます。現在アクティブなトレースを除き、すべてのトレースが削除
されます。
• 重なっているトレースが複数存在するグラフで、「Graph グラ
フ 」 > 「Remove All Traces Except Active アクティブなトレー
スを除き、トレースをすべて削除する 」をクリックします。
6
Remove
Traces Below
Threshold し
きい値を下
回るトレー
スを削除す
る
現在のしきい値設定を下回るすべてのデータポイントについて、重
なっているトレースがグラフから削除されます。
x範囲の一部だけが表示されるようにグラフが現在ズームされている
場合は、ダイアログが開きます。このダイアログでは、範囲全体を
使用してしきい値を下回るトレースを削除するのか、現在表示され
ている部分だけを使用するのか選択できます。
• 重なっているトレースが複数存在するグラフで、「Graph グラ
フ 」 > 「Remove Traces Below Threshold しきい値を下回るト
レースを削除する 」をクリックします。
7
Fade Inactive
Traces 非アク
ティブなト
レースを
フェード
アクティブなグラフに重なっているトレースが複数存在する場合は、
現在アクティブなトレースを除き、通常よりも淡い色合いで表示し
ます。この機能は、アクティブなトレースを注視する場合に使用し
ます。アクティブではないトレースは、目立たなくなります。元の
スタイルに戻すには、もう一度この機能を選択します。
• 重なっているトレースが複数存在するグラフで、「Graph グラ
フ 」 > 「Fade Inactive Traces 非アクティブなトレースをフェー
ド 」をクリックします。
8
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項目 ラベル
Invert Second
Overlay 2番目
のオーバー
レイを反転
説明
アクティブなグラフに重なっているトレースが複数存在する場合は、
このオプションを使用すると2番目のトレースが反転します。これに
より、類似する2つのトレースを視覚的に比較しやすくなります。元
の表示に戻すには、「Invert Second Overlay 2番目のオーバーレイを反
転 」を再度選択します。
9
Sum Graph
グラフを、個別のトレースをすべて合計した単一のトレースに置き
Traces グラフ 換えます。
トレースを • 重なっているトレースが複数存在するアクティブなグラフで、
合計
「Graph グラフ 」 > 「Sum Graph Traces グラフトレースを合
計 」をクリックします。
10
Split Traces
into Separate
Panes トレー
スを個別の
ペインに分
割
個別のオーバーレイごとにグラフを作成します。たとえば、3つのト
レースが重なったグラフでこの機能を選択すると、最終的には4つの
ペインで構成されることになります。1つはオーバーレイが表示され
た元のグラフで、残りにはそれぞれ個別のデータセットが表示され
ます。
a. 重なっているトレースが複数存在するアクティブなグラフで、
「Graph グラフ 」 > 「Split Traces into Separate Panes トレー
スを個別のペインに分割 」をクリックします。
b. 「Number of Columns カラム 列 数 」ダイアログで、出力の列
数を選択します。
必要な行数は、行数と重なっているトレースの数に基づいて決定
します。
c. チェックボックスを選択して、新しいペインを新しいウィンドウ
に配置します。チェックボックスが選択されていない場合、新し
いペインは同じウィンドウ内に配置されます。
11
Set Graph
「Set Titles タイトルの設定 」ダイアログが開きます。このオプショ
Title(s) グラ ンを使用して、トレースのタイトルを手動で変更します。
フタイトル
を設定
12
Set Active
「Color カラー 」ダイアログが開きます。このオプションを使用し
Trace Color ア て、現在アクティブなグラフトレースのカラーを設定します。
クティブな
トレースの
カラーを設
定
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項目 ラベル
説明
13
Set Trace
Colors Using
Titles タイト
ルを使用し
てトレース
のカラーを
設定
「Set Trace Colors Using Pattern Matching パターン一致を使用したトレー
スカラーの設定 」ダイアログが開きます。複数のグラフトレースが
重なっている場合、各オーバーレイにはデフォルトのカラーが使用
されます。タイトルに特定のテキストが含まれているトレースに対
して特定のカラーを使用する場合は、このオプションを使用します。
14
Duplicate
Active Data ア
クティブな
データを複
製
現在アクティブなグラフデータのコピーを作成し、グラフに追加し
ます。この機能は、特定のデータ処理操作による影響を確認する目
的で使用します。たとえば、この機能を使用してデータを複製し、
2つのトレースのいずれかをスムージング処理すると、グラフには処
理前と処理後のデータが重なって表示されることになります。
• アクティブなグラフで、「Graph グラフ 」 > 「Duplicate Active
Data アクティブなデータを複製 」をクリックします。
15
Duplicate
現在アクティブなグラフのコピーを作成します。この機能は、特定
Graph グラフ のデータ処理操作による影響を確認する目的で使用します。たとえ
を複製
ば、この機能を使用してデータを複製し、2つのトレースのいずれか
をスムージング処理すると、2つの独立したグラフに処理前と処理後
のデータが表示されることになります。一方のグラフをズームする
と他方も自動的にズームされるように、x軸をリンクしておきます。
• アクティブなグラフで、「Graph グラフ 」 > 「Duplicate Graph
グラフを複製 」をクリックします。
16
Offset Traces 「Offset Traces トレースのオフセット 」ダイアログが開きます。この
in X and Y X オプションは、重なっている一連のグラフトレースから3次元の積層
およびYでト グラフを作成する場合に使用します。
レースをオ
フセット
17
Remove XY
このオプションは、生成されたオフセットをTICから削除する場合に
Offset XYオフ 使用します。
セットを削
除
ダブルペインの操作ツールを使用する
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. ペインの右端に並んでいるアイコン 表 7-13を参照 を使用して、2つのペイン ソースペイン
とターゲットペイン で操作を実行します。どのような場合でも、ソースペインでアイコ
ンをクリックして、ターゲットペインにドラッグします。
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表 7-13 ダブルペインのツール
アイコ 名称
ン
Move
Pane ペイ
ンの移
動
説明
各ペインの右上に表示されます。ペインの相対的な位置を変更しま
す。1つのペインのアイコンをクリックして、第2のペインの上、下、
左、または右側部分にドラッグします。 カーソルが解放された場所に
応じて、最初のペインは、第2のペインに関連して位置が変更されま
す。 ペインをドラッグすると、第2のペインの1辺が赤で強調表示さ
れ、最初のペインが配置される場所が示されます。
注 また、一方のウィンドウから他方のウィンドウにペインをドラッ
グすることもできます。
Add Data ポイントごとに2つのデータセットを合計する場合に使用します。最
データ 初にクリックしたソースペインのデータが、アイコンをリリースした
の加算
ターゲットペインのデータに加算されます。変更したペインのタイト
ルが更新され、データが変更されたことを示します。
注 加算できるのは、同じ種類の2つのデータセットだけです。たと
えば、クロマトグラムにスペクトルを加算することはできません。
ヒント ターゲットグラフに複数の重なっているトレースが含まれて
いる場合、デフォルトでは、ソースデータはアクティブなターゲッ
トデータだけに加算されます。ソースをターゲットペインのすべて
のデータセットに加算するには、Ctrlキーを押しながら操作します。
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表 7-13 ダブルペインのツール (続き)
アイコ 名称
ン
説明
Subtract 「Add Data データの加算 」アイコンに似ていますが、ソースデータ
Data デー がターゲットデータから減算されます。この機能を使用して、質量ス
タの減
ペクトルからバックグラウンドを減算します。
算
ヒント ターゲットグラフに複数の重なっているトレースが含まれて
いる場合、デフォルトでは、ソースデータはアクティブなターゲッ
トデータからのみ減算されます。ソースをターゲットのすべてのデー
タセットに加算するには、Ctrlキーを押しながら操作します。
ヒント 通常、ソースの強度がターゲットよりも高いデータポイント
は保持されません。つまり、負のy値は破棄されます。負の強度を持
つポイントを保持するには、Shiftキーを押しながら操作します。
Overlay
ソースグラフのアクティブなデータをターゲットグラフに重ね合わせ
Data デー ます。操作が完了すると、ターゲットグラフは、ターゲットデータの
タの重ね コピーを含む新しい系列が表示された状態になります。
合わせ
ヒント ソースグラフに複数の重なっているトレースが含まれている
場合、デフォルトでは、アクティブなデータのコピーだけがターゲッ
トグラフに移動されます。ソースグラフのすべてのデータセットの
コピーをターゲットグラフ上で重ね合わせるには、Ctrlキーを押しな
がら操作します。
ペインまたはウィンドウの移動
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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図 7-30 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Window ウィンドウ 」をクリックし、図 7-31の機能を使用します。
図 7-31 「Window ウィンドウ 」メニュー—オプション
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項目 ラベル
説明
アクティブなグラフで選択した領域の情報を表示するウィンドウが開
きます。たとえば、選択した領域のx範囲や選択したポイントの強度範
囲などです。このウィンドウがすでに表示されている場合、このメ
ニュー項目を選択するとウィンドウが閉じます。グラフ選択情報の表
示 該当ページ 125を参照してください。
1
Graph
Selection
Window グ
ラフ選択
ウィンド
ウ
2
Vertical
ウィンドウに表示される情報のレイアウトを行フォーマットから列
Mode Pane フォーマットに変更する場合は、このオプションを使用します。
Layout 垂直
モードの
ペインレ
イアウト
3
Move Pane 現在アクティブなペインをウィンドウから削除し、そのペイン単独で
To New
新規ウィンドウに配置します。
Window 新
規ウィン
ドウにペ
インを移
動
4
Tile
開いているウィンドウ 最小化されていないもの を、同じ行で隣り合う
Vertically 左 ように並べます。
右に並べ
て表示
5
Tile
開いているウィンドウ 最小化されていないもの を、同じ列で上下に重
Horizontally なるように並べます。
上下に並
べて表示
ガウシアンスムーズの実行
ガウシアンスムーズアルゴリズムを適用します。指定された幅のフィルターであり、重み付
け係数はガウシアン関数または「正規」関数に従います。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-32 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Process 処理 」 > 「Gaussian Smooth ガウシアンスムーズ 」をクリックします。
「Gaussian Smooth ガウシアンスムーズ 」ダイアログが開きます。
図 7-33 「Gaussian Smooth ガウシアンスムーズ 」ダイアログ
6. 「Smoothing width スムージング幅 」フィールドに値を入力します。
これは実際には、最大高の半分の位置におけるガウシアン関数の幅となります。計算はガ
ウシアン関数の両翼に向かって実行されるため、合計幅はさらに大きくなります。ガウシ
アンの半分の幅が1ポイント未満の場合は、小数値を使用できます。
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142 の 240
システムユーザーガイド
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7. アクティブなグラフに複数のトレースが存在する場合は、「Process all overlays (otherwise
active data only) すべてのオーバーレイを処理する 存在しない場合はアクティブなデー
タのみ 」を選択して、すべてのトレースに操作を適用します。
「Only show this dialog again if the shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
8. 「OK」をクリックします。
しきい値データ
現在のしきい値設定を下回る強度のデータポイントをすべて削除します。しきい値は、グラ
フのy軸に示されている青い矢印をドラッグして設定します。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-34 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Process 処理 」 > 「Threshold Data しきい値データ 」をクリックします。
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143 の 240
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アクティブなグラフに、別のサンプルと重なっている系列が含まれている場合は、「Process
All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開きます。
図 7-35 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログ
6. 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開いた場合
は、以下のいずれかの操作を行います。
• 使用可能なすべてのサンプルについてXICのオーバーレイを生成するには、「All Overlaid
重なっているすべてのデータセット 」を選択します。
• 現在アクティブなサンプルだけでXICを生成するには、「Active Only アクティブなデー
タセットのみ 」を選択します。
「Only show this dialog again if the Shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
サブセットデータ グラフ選択へ
この機能は、領域が1つだけ選択されているグラフがアクティブの場合のみ使用できます。選
択されている領域外のデータポイントが削除されます。この機能は、データ全体のサブセッ
トにデータ処理を集中させる場合に使用します。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-36 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. グラフで選択を行います。
6. 「Process 処理 」 > 「Subset Data (to graph selection) サブセットデータ グラフ選択
へ 」をクリックします。
アクティブなグラフに、別のサンプルと重なっている系列が含まれている場合は、「Process
All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開きます。
図 7-37 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログ
7. 「Process All Overlays? すべてのオーバーレイを処理しますか 」ダイアログが開いた場合
は、以下のいずれかの操作を行います。
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取扱説明書 – ソフトウェア
• 使用可能なすべてのサンプルについてXICのオーバーレイを生成するには、「All Overlaid
重なっているすべてのデータセット 」を選択します。
• 現在アクティブなサンプルだけでXICを生成するには、「Active Only アクティブなデー
タセットのみ 」を選択します。
「Only show this dialog again if the Shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
ベースライン補正クロマトグラム
比較的ゆっくりと変化するバックグラウンドをクロマトグラムから削除します。
クロマトグラムの各データポイントについて、ウィンドウは対応するX値の中央に配置され、
ウィンドウの範囲内で最小の強度を持つポイントの左右両側にあるデータポイントが検出さ
れます。また、これら2つのポイント間で直線が接続され、ウィンドウの中心でY値が計算さ
れます。これは、そのポイントでデータから削除されたベースラインとなります。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-38 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
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4. OKをクリックします。
5. 「Process 処理 」 > 「Baseline Subtract ベースライン補正 」をクリックします。
「Baseline Subtract ベースライン補正 」ダイアログが開きます。
図 7-39 「Baseline Subtract ベースライン補正 」ダイアログ
6. 「Subtraction half window 補正ハーフウィンドウ 」に分単位の値を入力します。
7. アクティブなグラフに複数のトレースが存在する場合は、「Process all overlays (otherwise
active data only) すべてのオーバーレイを処理する 存在しない場合はアクティブなデー
タのみ 」を選択して、すべてのトレースに操作を適用します。
「Only show this dialog again if the shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
クロマトグラムのオフセット
クロマトグラムの時間値をオフセットする目的で使用します。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-40 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「Process 処理 」 > 「Offset Chromatogram クロマトグラムのオフセット 」をクリック
します。
「Offset オフセット 」ダイアログが開きます。
図 7-41 「Offset オフセット 」ダイアログ
6. 「Total offset 合計オフセット 」フィールドに分単位の値を入力します。
7. アクティブなグラフに複数のトレースが存在する場合は、「Process all overlays (otherwise
active data only) すべてのオーバーレイを処理する 存在しない場合はアクティブなデー
タのみ 」を選択して、すべてのトレースに操作を適用します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
「Only show this dialog again if the shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
8. 時間方向にオーバーレイを分散するには、「User incremental offset (to fan out overlays)
ユーザー増分オフセット オーバーレイをファンアウト 」を選択します。
スペクトルの重心作成
マススペクトルの重心を作成します。つまり、プロファイルのスペクトルを検出されたピー
クだけの 質量、強度 ポイントで置き換えます。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-42 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. 「OK」をクリックします。
5. 「Process 処理 」 > 「Centroid Spectrum 重心スペクトル 」をクリックします。
「Centroid 重心 」ダイアログが開きます。
6. 図 7-43で示されている機能を使用します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-43 「Centroid 重心 」ダイアログ
表 7-14 「Centroid 重心 」ダイアログ - 説明
項目
説明
Intensity 強度
各ピークについて、重心のy値はピークを構成する最大データポイントの
強度を表します。
Height 高さ
この機能は、ベースラインオフセットが存在する場合は強度がベースラ
イン強度で減算される点を除き、「Intensity 強度 」機能と同じです。
Area 面積
各ピークについて、重心のy値はピークの合計面積を表します。これは、
報告される値が強度プロファイルとピーク幅の両方に依存するという観
点から真の積分といえます。
Intensity sum
above 50% 50%
を超える強度
和
各ピークについて、y値はピーク頂点強度の50%を超えるピークで構成さ
れた強度の合計を表します。この値は 「Intensity 強度 」および「Height 高
さ 」の各機能のように 単一のデータポイントだけに依存せず、ノイズや
干渉が発生しやすいピークのエッジによる影響を受けないため便利です。
7. アクティブなグラフに複数のトレースが存在する場合は、「Process all overlays (otherwise
active data only) すべてのオーバーレイを処理する 存在しない場合はアクティブなデー
タのみ 」を選択して、すべてのトレースに操作を適用します。
「Only show this dialog again if the shift key is down Shiftキーを押した場合にのみこ
のダイアログボックスを再び表示する 」チェックボックスが選択されている場合は、ユー
ザーがShiftキーを押してオプションを変更するまで、選択されているアクションが使用さ
れます。
テキストとしてデータをエクスポートする
現在アクティブなスペクトルまたはクロマトグラムが、タブ区切りのテキストファイルに保
存されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-44 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「File ファイル 」 > 「Export エクスポート 」 > 「Data as Text テキストとしてデータ
をエクスポート 」をクリックします。
スペクトルデータをエクスポートする場合は、「Add Zero Intensity Points for Export エクス
ポートでゼロ強度ポイントを追加する 」ダイアログが開きます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-45 Add Zero Intensity Points for Export エクスポートでゼロ強度ポイントを追加す
る
6. ファイル名を入力します。
7. 「Save 保存 」をクリックします。
テキストとしてピークリストをエクスポートする
現在アクティブなスペクトルまたはクロマトグラムのピークリストは、タブ区切りのテキス
トファイルとして保存できます。このファイルには、重心のx値 質量または時間 、ピーク面
積、高さなどの情報が記録されています。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-46 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. 「OK」をクリックします。
5. 「File ファイル 」 > 「Export エクスポート 」 > 「Peak List as Text テキストとしてピー
クリストをエクスポート 」をクリックします。
6. ファイル名を入力します。
7. 「Save 保存 」をクリックします。
データの印刷
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「File ファイル 」 > 「Open Multiple Samples 複数のサンプルを開く 」をクリックしま
す。
図 7-47 「File ファイル 」メニュー—オプション
3. 「Select Samples サンプルの選択 」ダイアログで、「Available 利用可能 」リストからサン
プルを選択して矢印をクリックし、ファイルを「Selected 選択済み 」リストに移動しま
す。
ヒント サンプルを1つ選択するには、ファイルを展開してサンプルをクリックし、矢印
をクリックします。
4. OKをクリックします。
5. 「File ファイル 」 > 「Print 印刷 」をクリックして、必要なオプションを選択します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
オプションのリセット
「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースのすべてのオプションは、デフォルト値にリセッ
トすることができます。これには、処理オプションだけでなく、前のセクションで説明した
オプションも含まれます。オプションのリセットによる影響を受けるのは現在ログインして
いるWindowsユーザーだけで、同じコンピュータの他のユーザーは影響を受けません。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「Edit 編集 」 > 「Reset Options オプションのリセット 」をクリックします。
オプションの設定
必要に応じて、各タブの機能を使用します。
1. 「Explorer エクスプローラ 」ワークスペースを開きます。
2. 「Edit 編集 」 > 「Options オプション 」をクリックします。
「Options オプション 」ダイアログが開き、「Graph Appearance グラフの外観 」タブが
表示されます。
3. 図 7-48に示されている機能を使用します。
図 7-48 「Options オプション 」ダイアログ—「Graph Appearance グラフの外観 」タブ
4. 「Peak Labeling & Finding ピークのラベル表示と探索 」タブをクリックします。
5. リストから「Mass Spectra 質量スペクトル 」を選択します。
6. 図 7-49に示されている機能を使用します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-49 「Options オプション 」ダイアログ—「Peak Labeling & Finding ピークのラベ
ル表示と探索 」タブ—「Mass Spectra 質量スペクトル 」
7. リストから「Chromatograms クロマトグラム 」を選択します。
8. 図 7-50に示されている機能を使用します。
図 7-50 「Options オプション 」ダイアログ—「Peak Labeling & Finding ピークのラベ
ル表示と探索 」タブ—「Chromatograms クロマトグラム 」
9. 「Auto Processing 自動処理 」タブをクリックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
10. 図 7-51に示されている機能を使用します。自動処理オプションは、動的に更新されるスペ
クトルには適用されません。
図 7-51 「Options オプション 」ダイアログ—「Auto Processing 自動処理 」タブ
11. 「XIC」タブをクリックします。
12. 図 7-52に示されている機能を使用します。
図 7-52 「Options オプション 」ダイアログ—「XIC」タブ
13. 「OK」をクリックします。
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システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
Analytics (分析物) ワークスペース
このワークスペースへのアクセスは、ユーザーに割り当てられている役割によって制御され
ます。 Analytics (分析物) 機能へのアクセス 該当ページ 54を参照してください。
注 Analyticsワークスペースから制御されるデータ出力方法は、結果表のエクスポート、LIMS
へのデータ転送、およびレポーティングです。 その他の出力データソース 結果表からのコ
ピーや貼り付けなど は制御されていません。 規制上、制御されていない出力メソッドを使
用しないでください。
番号のグルーピングは、Analytics (分析物) ワークスペースでは対応していません。 テキスト
ボックス (例えば、積分パラメータ) またはグリッド (例えば、結果表) にある番号をグルーピ
ングしないでください。
Processing (処理) メソッドには、積分のために選択したピークの定量化に使用される基準が含
まれます。
レビューアは、自身の標準操作手順 (SOPs) にあるピーク積分およびデータの合否の基準に従っ
てデータをレビューする必要があります。
プロジェクトの安全エクスポート設定を設定
このタスクを実行できるのは、管理者の役割が割り当てられているユーザーだけです。
このオプションが選択された場合、テキストファイルにあるデータはエクスポートの間に暗
号化されます。 パスワードを設定して、暗号化を有効にします。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Projects (プロジェクト) > Project secure export settings (プロジェクトの安全エクスポー
ト設定) をクリックします。
3. Encrypt Results Table when reporting for this project (このプロジェクト用にレポーティ
ングするときの結果表の暗号化) チェックボックスを選択します。
4. Password (パスワード) フィールドに、パスワードを入力します。
5. Confirm Password (パスワードの確定) フィールドに、パスワードを再度入力します。
6. OKをクリックします。
プロジェクトの修正されたピーク警告の有効化
デフォルトでは、このオプションは選択されません。 選択した場合、ユーザーが結果表にあ
るクロマトグラムに変更を行い、次にその変更を保存した場合、警告メッセージで変更が行
われたことが示されます。 ユーザーは、保存を続行するか、結果表に戻るかを選択できま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
プロジェクトのデフォルト設定を定義
このオプションでは、処理メソッドを作成する際に使用されるデフォルトのピーク検出パラ
メータを設定します。 コンポーネントが2、3個以上ある場合、クロマトグラフィーに基づい
てデフォルト値を設定し、それらをすべてのコンポーネントで個別に調整する必要がないよ
うにします。 しかし、すべてのコンポーネントにとって理想的なパラメータは1つもない可
能性が高いため、いくつかのコンポーネントのためのいくつかのパラメータを調整する必要
がある場合があります。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Projects (プロジェクト) > Project default settings (プロジェクトのデフォルト設定) をク
リックします。
Project Default Settings (プロジェクトのデフォルト設定)ダイアログが開きます。
3. Quantitative Processing (定量化処理) タブにあるIntegration Algorithm (積分アルゴリ
ズム) リストからアルゴリズムを選択します。
アルゴリズムについての情報のヘルプを参照してください。
4. Quantitative Processing (定量化処理) タブにあるLibrary Search Algorithm (ライブラリ
検索アルゴリズム) リストからライブラリ検索アルゴリズムを選択します。
アルゴリズムに関する情報については、ヘルプを参照してください。
5. Saveをクリックします。
6. Closeをクリックします。
処理メソッドの作成
処理メソッドには、データ処理のための定量および定性設定が含まれます。 非ターゲット
ワークフローは、未知のコンポーネントのために使用されます。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Process Method (処理メソッド) > New (新規) をクリックします。
ヒント 既存の処理メソッドを編集するには、Process Method (処理メソッド) > Edit
embedded method (組み込まれているメソッドを編集) をクリックし、次に以下のス
テップを行います。
3. Workflow (ワークフロー) ページを選択し、次に参照サンプルと少なくとも1つのワークフ
ローを選択します。
4. Components (コンポーネント) ページを選択し、次にコンポーネント名、質量、内部標準、
グループなどを定義します。
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158 の 240
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取扱説明書 – ソフトウェア
ヒント コンポーネントの表でグループが定義されている場合、前駆体イオンと実験的指
標が遷移について異なっている場合でも、グループ内のイオンを合計できます。合計さ
れたイオンは表には表示されませんが、「Integration 積分 」ページと結果表には「<グ
ループ名>_Sum」という形式で表示されます。この機能は、タンパク質とペプチドの定
量化に便利です。
5. Integration (積分) ページを選択し、次に各コンポーネントのための積分パラメータを選択し
ます。
6. LibrarySearch (ライブラリ検索) (ワークフローに依存) ページを選択し、次にライブラリ検索
パラメータを定義します。
7. Acceptance Criteria (合否基準) ページを選択し、次にピーク積分のための合否基準、標準の
精度と品質管理、および未知のサンプル用の計算された濃度範囲を選択します。
8. Qualitative Rules (定量ルール) (信頼限界) ページを選択し、次に質量の精度のための信号灯
設定、保持時間の差、アイソトープの一致、ライブラリのスコア、およびフォーミュラ
ファインダのスコアを定義します。
9. 「Ion Ratio イオン比 」 信頼限界 ページを選択し、次にイオン比の許容に対応する信号灯
設定を定義します。
イオン比とは、ピークレスポンスの比率です (クオリファイアおよびクオンティファイア
の面積または高さ)。
10. Formula Finder (フォーミュラファインダ) ページを選択し、次にフォーミュラファインダ設
定を選択します。
11. 「Non-targeted Peaks 非ターゲットピーク 」ページ 非ターゲットワークフローが選択され
ている場合にのみ利用可能 を選択し、非ターゲット検索パラメータを定義します。
12. Saveをクリックします。
ヒント 非ターゲットメソッドを作成する場合、ピーク解析には現在のプロジェクトのデ
フォルトパラメータが使用され、それらのパラメータがメソッドファイルに保存されま
す。処理メソッドにターゲット分析物が含まれている場合、ターゲット化合物に対して
カスタマイズされた積分パラメータが非ターゲットピーク解析に影響を与えることはあ
りません。後でプロジェクトのデフォルトパラメータに変更を加えても、変更されたパ
ラメータが既存の非ターゲットメソッドに影響を与えることはなく、メソッドの作成時
点のパラメータが引き続き含まれることになります。変更したパラメータが使用される
のは、新たに作成した非ターゲットメソッドだけです。
結果表について
結果表では、キャリブレーションカーブに基づいて、不明な各サンプル内の分析物の計算さ
れた濃度、およびライブラリヒットやFormula Finder結果などの定量分析結果などが要約され
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159 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
ます。 結果表には、キャリブレーションカーブと結果の統計も含まれます。 ユーザーは、結
果表をカスタマイズし、結果表をレイアウトで閲覧できます。
結果表のデータは、.txtファイルにエクスポートし、Microsoft Excelなどの他のアプリケーショ
ンで使用することができます。 ユーザーは、結果表内のデータすべて、または表示した列の
データのみをエクスポートすることができます。
ヒント 結果表の複数のセッションが垂直または水平にタイル化されている場合、表示 > レ
イアウトのリセットをクリックすると、結果表が元のレイアウトに戻ります。
表 7-15 右クリックメニュー
ラベル
説明
コピー
このオプションを使用して、現在のデータをクリップボードに
コピーします。
貼り付け
このオプションを使用して、データをクリップボードから現在
のビューに貼り付けます。
表全体をコピー
このオプションを使用して、表全体をクリップボードにコピー
します。
上のセルをコピー
このオプションを使用して、最初に選択した行の情報を続いて
選択したすべての行に複製を作ります。
すべての行を選択
このオプションは、現在アクティブの結果表の行をすべて選択
する際に使用します。 ユーザーが、選択された行で操作を行う
コピーなどのコマンドを後で適用したい場合に便利です。
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160 の 240
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-15 右クリックメニュー (続き)
ラベル
説明
現在の分析物の実際の濃度 分析物が1つ以上ある場合、および分析物すべてが同じ濃度のこ
をすべてに適用
れらのサンプルに存在する場合、このオプションを使うと標準
サンプルの分析物すべてに対する実際の濃度フィールドを設定
するショートカットが使用できます。 この機能を使用するには
1. コンポーネントおよびグループのリストを使うと、表の中の
特定の1つの分析物のみが表示されます。 コンポーネントと
グループのリスト 該当ページ 181を参照してください。
2. オプション サンプルの種類フィルターを使用すると、標準サ
ンプルのみが表示されます。 サンプルの種類フィルター 該当
ページ 163を参照してください。
3. 分析物のための実際の濃度を、セルへの直接入力、または列
を選択してテキストをそこに貼り付けのどちらかを行って指
定します。
4. すべてに現在の分析物の実際の濃度を適用を選択します。
必要に応じて、すべてのコンポーネントおよびすべてのサンプ
ルの種類の表示に戻します。
すべてに現在のISの実際の 内部標準が1つ以上ある場合、および内部標準すべてが同じ濃度
濃度を適用
のこれらのサンプルに存在する場合、このオプションを使うと
標準サンプルの内部標準すべてに対する実際の濃度フィールド
を設定するショートカットが使用できます。 この機能を使用す
るには
1. コンポーネントおよびグループのリストを使うと、表の中の
特定の1つの分内部標準のみが表示されます。 コンポーネン
トとグループのリスト 該当ページ 181を参照してください。
2. オプション サンプルの種類フィルターを使用すると、標準サ
ンプルのみが表示されます。 サンプルの種類フィルター 該当
ページ 163を参照してください。
3. セルに直接入力するか、または列を選択してテキストを貼り
付けるかして、内部標準の実際の濃度を指定します。
4. すべてに現在のISの実際の濃度を適用を選択します。
必要に応じて、すべてのコンポーネントおよびすべてのサンプ
ルの種類の表示に戻します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
データの処理
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Results (結果) > New (新規) をクリックします。
3. 「Process New Results 新しい結果を処理 」ページで、矢印を使用してサンプルのバッチを
選択します。
4. リストから処理メソッドを選択します。
5. 必要に応じて、New (新規) をクリックして新しい処理メソッドを作成するか、Edit (編集)
をクリックして既存の処理メソッドを編集します。処理メソッドの作成該当ページ158を
参照してください。
6. 非ターゲットワークフローのための比較サンプルを選択します。
7. Process (処理) をクリックします。
8. サンプル種類を表示または非表示にするには、Sample Type (サンプル種類) をクリック
し、次に必要なチェックボックスを選択またはクリアします。
9. 合否フィルターを設定するには、Acceptance (合否) をクリックし、次に必要なチェック
ボックスを選択またはクリアします。
10. 定量化信頼フィルターを選択するには、Confidence (信頼) 信号灯をクリックし、次に必
要なチェックボックスを選択またはクリアします。
注 AutoPeakアルゴリズムを使用して結果表を生成した場合、ユーザーがXIC幅と予測され
るRTを変更しても、新しいXIC幅と「Expected RT 予測されるRT 」の値を使用してモデルを
更新していない限り、古いアルゴリズムモデルを使用してデータが処理されます。
以下を参照してください
• サンプルの種類フィルター 該当ページ 163
• 結果表について 該当ページ 159
• 合否基準 該当ページ 164
• 信頼信号灯 該当ページ 164
サンプルの追加
このオプションで、追加的なサンプルを現在有効な Results Table (結果表) に追加します。
1. Results Table (結果表) が開いている状態で、Results (結果) > Add samples (サンプルの
追加) をクリックします。
2. Select Samples (サンプルの選択) ダイアログで、必要なサンプルを選択します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
• 「Available 利用可能 」ペインは、サブフォルダ、.wiff2ファイル、および選択したフォ
ルダのための「Data データ 」フォルダで利用可能なサンプルを示します。
• 個別のフォルダを、サブフォルダや.wiff2ファイルを見るために拡張します。.wiff2ファ
イルが拡張された場合、それが開いて利用可能なサンプルを表示します。
• 矢印を使用して、サンプルの追加や削除を行います。
• 個別のサンプルをダブルクリックする、サンプルまたはデータファイルを選択して
「=>」ボタンをクリックする、または左側のペインから右側のペインにサンプルまた
はデータファイルをドラッグすることで、サンプルを選択します。 ShiftまたはCtrlを
押して、複数のファイルまたはサンプルを、それらが移動される前に選択します。
3. OKをクリックします。
新しいサンプルが積分され、既存の表に追加される間は、進行バーが表示されます。
サンプルの種類フィルター
表 7-16 サンプルの種類フィルターの説明
フィルターの種 説明
類
Unknowns 不明
未知のサンプル 未知の濃度を持つ通常のサンプル だけが表示されます。標
準サンプルを使用すると、その濃度はキャリブレーションカーブから逆算
され、計算された濃度として結果表で報告されます。
Standards 標準
既知の濃度を持つサンプルだけが表示されます。このようなサンプルは、
キャリブレーションカーブの作成で使用されます。
Quality Controls
品質管理
品質管理サンプルだけが表示されます。このようなサンプルは既知の濃度
を持ち、キャリブレーションカーブの精度を確認する目的で使用されます
が、カーブの実際の構築には影響しません。
Blanks ブランク ブランクサンプルだけが表示されます。一般的には、内部標準化合物 使用
されている場合 を含み、分析物を含まないサンプルです。また、通常のサ
ンプル調製手順を通じて生成されたものです。このようなサンプルは、キャ
リブレーションカーブの構築では使用されません。これを含めるには、サ
ンプルの種類として「Standard 標準 」を選択し、「Actual Concentration 実際
の濃度 」を0に設定します。
Double Blanks ダ ダブルブランクサンプルだけが表示されます。内部標準と分析物のどちら
ブルブランク も含まれていないサンプルです。
Solvents 溶媒
溶媒サンプルだけが表示されます。通常のサンプル調製手順を通じて生成
されたものではないダブルブランクです。
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取扱説明書 – ソフトウェア
合否基準
合否基準を使用して認定行を定義します。 認定行は以下のフィルターの選択した基準と一致
します
• 合格 処理メソッドで定義された基準を満たす列を表示します。
• 不合格 処理メソッドで定義された基準を満たさない列を表示します。
• すべて すべての列を表示します。
ラベル
説明
積分の合否
結果表の品質列、非対称係数列、全幅列、および保持時間エ
ラー列 ( エラー列または絶対デルタ列のいずれか) の値を使
用して積分品質のためのユーザー定義の基準を表示します。
精度
標準および品質管理サンプルの許容範囲の精度を表示しま
す。
計算による濃度
下限または上限、あるいはその両方を編集して取得された未
知のサンプルのための計算による濃度範囲を表示します。
以下で行を表示 認定する 認定 積分、精度、および計算による濃度のフィルターに一致する
しない
行を表示します (合格/不合格/その他)。
信頼信号灯
信号灯は各行の信頼状態を表示します。 イオン比と定量ルールの情報についてはヘルプを参
照してください。
表 7-17 信頼信号灯
信号灯アイコ
ン
説明
どのコンポーネントが、処理メソッドで定義されている信頼レベルを満た
すかを表示します。
どのコンポーネントが、処理メソッドで定義されている限界的パーセント
差レベルを満たすかを表示します。
どのコンポーネントが、処理メソッドで定義されている許容できないパー
セント差レベルを表示します。
どの信頼パラメータが、コンポーネントに適用できないかを表示します。
SCIEX X500 QTOFシステム
164 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
結果表のための列を選択
数値フォーマットと結果表で表示される列を選択します。 列設定は、プロジェトにある結果
表のすべてに適用できます。
注 「Sample Name サンプル名 」、「Sample ID サンプルID 」、「Barcode バーコード 」など
の重要な列は、結果表の列設定をカスタマイズしたときに非表示にならないようにしてく
ださい。
列名が切り捨てられた場合、フィールドの上でカーソルを移動させて、ツールチップに列名
を表示させます。
1. 結果表が開いている状態で、「More さらに 」 > 「Table display settings 表の表示設
定 」をクリックします。
「結果表の表示設定」ダイアログが開きます。
図 7-53 「Column Settings 列設定 」ダイアログ
システムユーザーガイド
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165 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
項目
ラベル
説明
1
Import イン 「Export エクスポート 」ボタンを使用して以前に保存した列設定
ポート
ファイルを選択できます。ダイアログの各フィールドは、選択した
ファイルの情報を使用するために更新されます。
2
Export エク クリックすると、現在の列設定をファイルに保存できます。 この
スポート
ような設定は、「Import インポート 」ボタンを使用してインポート
および使用します。このオプションを使用することで、異なる列レ
イアウトを切り替えられます。
3
Column
Name 列名
4
Visible 表示 チェックマークは、列が表示されることを示します。
5
Number
Format 数字
のフォー
マット
列の名前がアルファベット順に表示されます。
数値フィールドでは、科学的ではない通知についてはフォーマット
0.00が使用され、科学的な通知についてはフォーマット0.00e0が使
用されます。少数点を変更して、表示される数の精度を示します。
ピリオド「.」だけが小数点の記号として使用できます。
注 数字のグルーピングには、対応していません。
6
LIS Supported 「LIS Supported LIS対応 」行の選択はLISによって事前定義されてお
LIS対応
り、列選択は変更できません。
7
Save as
列設定を今後の結果表で使用できます。
project
default
settings プロ
ジェクトの
デフォルト
設定として
保存
8
OK
9
Cancel キャ 変更を破棄して、ダイアログを閉じます。
ンセル
10
All Columns
すべての
列
変更を適用して、ダイアログを閉じます。
結果表の列のカテゴリを選択します。結果表に表示される列は、選
択内容に基づいてフィルタリングできます。カテゴリを選択してお
くことで、結果表の列を容易に見つけることができます。
2. 必要に応じて、「Visible 表示 」列のチェックボックスを選択またはクリアします。
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166 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列
ラベル
説明
精度
標準および品質管理サンプルの精度を表示します。その
他のサンプルの種類では、この値をN/Aに設定します。
LIS対応
Y
既知の濃度の標準については、標準サンプルおよび品質
管理サンプルの精度は100% × 計算された濃度 / 実際の濃
度 という式で導かれます。
AccuracyAcceptance 精度の合否状態を表示します。
精度の合否
N
Acq. (測定) メ
ソッド名
Y
サンプルを測定するために使用される測定メソッドの名
前を表示します。
測定の日付 時 サンプルを測定した日付と時刻を表示します。
刻
Y
実際の濃度
標準サンプルと品質管理サンプルについて、予期される
既知の濃度を表示します。
Y
面積
検出されたピークの面積を表示します。ピークが検出さ
れていない場合、この値はN/Aに設定されます。
Y
面積/高さ
検出されたピークの面積を高さで割った値を表示します。
ピークが検出されていない場合、この値はN/Aに設定され
ます。
N
面積比
内部標準を使用する分析物については、面積対IS面積の
比率を表示します。内部標準、または内部標準を持たな
い分析物については、値がN/Aに設定されます。
Y
Area Ratioof
サンプル/管理サンプルの面積比。定性分析のワークフ
Control 管理サ ローだけに適用されます。
ンプルの面積
• 管理サンプルでピークが検出されていない場合、この
比
値はN/Aになります。
N
• サンプルでピークが検出されていない場合、この値は
0になります。
非対称係数
ピークの中心線からバックスロープまでの距離をピーク
の中心線からフロントスロープまでの距離で割った値で
示します。すべての測定は、最大ピーク高さの10%で行
われています。
システムユーザーガイド
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Y
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167 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
バーコード
サンプル固有のIDを表示します。固有のIDは、データを
取得するために使用されたバッチで元々指定されている
値から初期化されたものです。
LIS対応
Y
バーコードに含める文字数は0 20文字でなければならず、
次の無効な文字を含めることはできません \ / : * ?ASCIIの
表にある" < > |= または0から31の文字。
Baseline
実際のピークの高さに対するベースラインの高さの差
Delta/Height
ピークの開始地点と終了地点 の絶対値を表示します。値
ベースライン がおよそ0.1を超える場合は、ベースラインが正しく解析
デルタ/高さ
されていない可能性があるため、ピークをレビューする
必要があります。
N
計算による濃
度
既知の濃度の標準については、キャリブレーションカー
ブから逆算された濃度の値を表示します。回帰方程式は、
様々な回帰の種類と重み付けのためにどのようにして回
帰が実施されるかを表します。 回帰方程式 該当ページ
32。
Y
Combined Score オプション 相対的な比較を目的として使用できる単精度
複合スコア
浮動小数点数のスコアを表示します。定性分析のワーク
フローだけに適用されます。
N
Comparison 比
較
コンポーネントを比較サンプルで表示します。ユーザー
は、この列を編集できません。
N
コンポーネン
トコメント
分析物または内部標準に対する任意のコメントを表示し
ます。このコメントは、すべてのサンプルに適用されま
す。
N
コンポーネン
トグループ名
分析物または内部標準に関連付けられているグループ名
を表示します 存在する場合 。
N
コンポーネン
トインデック
ス
元の定量化メソッドにある分析物または内部標準のイン
デックスを表示します。
Y
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システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
コンポーネン
ト名
分析物または内部標準の名前を表示します。
LIS対応
Y
この列は、常に結果表に表示されます。そのため、
「Column Settings 列設定 」ダイアログでは、チェックボッ
クスが用意されていません。
コンポーネント名は、0 50文字でなければなりません。
注
• コンポーネント名は、処理メソッドでのみ変更でき、
結果表では変更できません。
• この列は、LIMS転送では必須です。
濃度 単位
濃度の単位を表示します。
Y
Concentration
計算された濃度の合否状態を表示します。
Acceptance 濃度
の合否
N
濃度比
内部標準を使用する分析物については、Actual Concentration
実際の濃度 対IS Actual Concentration ISの実際の濃度 の比
率を表示します。内部標準、または内部標準を持たない
分析物については、値がN/Aに設定されます。
N
希釈係数
サンプルを希釈したときの係数を表示します。このファ
クターはキャリブレーションカーブの計算で使用されま
す。 回帰方程式 該当ページ 32。
Y
終了時間
検出されたピークの分単位の終了保持時間を表示します。
Y
10%における
終了時間
強度がピーク高さの10%のところでピークの裏側に沿っ
た分単位の時間を表示します。
N
5%における終 強度がピーク高さの5%のところでピークの裏側に沿った
了時間
分単位の時間を表示します。
N
予測されるイ
オン比
未知のサンプル、品質管理サンプル、および標準のサン
プルについて予測されるイオン比を表示します。
Y
予期されるRT
保持時間
定量化メソッドから予測される元の保持時間を分単位で
表示します。
Y
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169 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
Formula 式
オプション 有効な化学式を表示します。化学式が無効な
場合、その式はソフトウェアによって保持されません。
化学式が有効な場合、「Mass (Da) 質量 Da 」列と「Isotope
同位体 」列は自動的に入力されます。
LIS対応
Formula
Formula Finderのスコアの信号灯を表示します。定性分析
Confidence 式の のワークフローだけに適用されます。
信頼性
Formula Finder
相対的な比較を目的として使用できる単精度浮動小数点
数のスコアを表示します。
Y
N
N
この値は、ピークレビューのFormula Finderの結果表のデー
タを使用して更新できます。定性分析のワークフローだ
けに適用されます。
Formula Finder
オプション 一致する可能性が最も高いFormula Finderの結
Results Formula 果を表示します。定性分析のワークフローだけに適用さ
Finderの結果
れます。
N
Formula Finder
オプション 相対的な比較を目的として使用できる単精度
Score Formula
浮動小数点数のスコアを表示します。
Finderのスコア
Y
Found at Mass
オプション 一致するスペクトルが検出された時点で要求
質量での検出 に最も近い抽出質量 Da を表示します。定性分析のワー
クフローだけに適用されます。
Y
Fragment Mass オプション フラグメント質量を表示します。フラグメン
フラグメント トの前駆体は、「Extraction Mass (Da) 抽出質量 Da 」列の
質量
MS/MSから抽出されます。入力する場合、この値は数値
でなければなりません。
この列は、常に結果表に表示されます。そのため、
「Column Settings 列設定 」ダイアログでは、チェックボッ
クスが用意されていません。
Y
高さ
検出されたピークの高さを表示します。ピークが検出さ
れていない場合、この値はN/Aに設定されます。
Y
高さ比
内部標準を使用する分析物については、高さ対IS高さの
比率を表示します。内部標準、または内部標準を持たな
い分析物については、値がN/Aに設定されます。
Y
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170 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
インデックス
元のソートされていない順序で行のインデックスを表示
します。表が別の列に基づいてソーティングされた場合、
表はこの列をソーティングして元の順序に戻すことがで
きます。
この列は、常に結果表に表示されます。そのため、
「Column Settings 列設定 」ダイアログでは、チェックボッ
クスが用意されていません。
N
注入量
メソッドに保存され、オートサンプラーにより注入され
たサンプルの量を表示します。
Y
LIS対応
Integration
積分の外れ値を表示します。
Acceptance 積分
の合否
N
積分の種類
Y
積分の種類を表示します。
• Baseline ベースライン 通常の方法で積分された単独の
ピーク。
• Valley 谷 2つの隣接したピークがあり、信号がそれら
の間にあるベースラインに戻らなかったことを示しま
す。
• N/A ピークが検出されなかったことを示します。
• Manual 手動 ピークが手動で積分されたことを示しま
す。
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
イオン比
イオン比を表示します。
LIS対応
Y
• イオン比は、1つの分析物から少なくとも2つのMRM遷
移がグループに収集されたときに特定されます。
• サブグループにある最初のコンポーネントは、クオン
ティファイアイオンとして使用されます。残りのコン
ポーネントは、クオリファイアイオンとして使用され
ます。
• イオン比 = (クオリファイアのピーク面積または高さ)
/ (クオンティファイアのピーク面積または高さ)
• サブグループ
• グループのすべての分析物が、分析物サブグルー
プを構成します。
• グループのすべての内部標準が、ISサブグループを
構成します。
• コンポーネントがグループのメンバーではない場合、
「Ion Ratio イオン比 」の値は「N/A」に設定されます。
• ピークが見つからない場合、「Ion Ratio イオン比 」の
値は「N/A」に設定されます。
• 分析物サブグループとISサブグループの両方にあるす
べてのコンポーネントに適用されます。クオリファイ
アは、それ自体がクオンティファイアに対応していま
す。
• クオンティファイアまたはクオリファイアのピークの
どちらかで積分値が変化すると、イオン比は再度計算
されます。
• ピーク面積またはピーク高さのどちらかについて計算
できます。結果表にある最初のコンポーネント コン
ポーネントのインデックスが1 について.qmethodの回
帰部分で面積が使用されている場合、結果表全体のイ
オン比の計算ではピーク面積が使用されます。最初の
コンポーネントの回帰で高さが使用されている場合
は、ピーク高さが計算で使用されます。
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172 の 240
システムユーザーガイド
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表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
LIS対応
Ion
イオン比での信頼性のレベルを表示します。定性分析の
RatioConfidence ワークフローだけに適用されます。
イオン比の信
頼性
N
その行が内部標準かどうかを示します。チェックボック
スが選択されている場合は、行のコンポーネントが分析
物ではなく標準であることを示します。
N
ISの実際の濃度 現在の分析物に関連付けられている内部標準の実際の濃
度を表示します。内部標準、または内部標準を持たない
分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの面積
現在の分析物に関連付けられている内部標準の面積を表
示します。内部標準、または内部標準を持たない分析物
については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの面積/高さ
現在の分析物に関連付けられている内部標準の面積対高
さの比を表示します。内部標準、または内部標準を持た
ない分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISのコメント
現在の分析物に関連付けられている内部標準の任意のコ
メントを表示します。内部標準、または内部標準を持た
ない分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの終了時間
現在の分析物に関連付けられている内部標準の測定が終
了する時間を表示します。内部標準、または内部標準を
持たない分析物については、値が「N/A」に設定されま
す。
N
ISの予測される 現在の分析物に関連付けられている内部標準の予測され
RT
る保持時間を表示します。内部標準、または内部標準を
持たない分析物については、値が「N/A」に設定されま
す。
N
現在の分析物に関連付けられている内部標準の高さを表
示します。内部標準、または内部標準を持たない分析物
については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの積分の種類 現在の分析物に関連付けられている内部標準の積分の種
類を表示します。内部標準、または内部標準を持たない
分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
IS
ISの高さ
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
ISの質量情報
現在の分析物に関連付けられている内部標準の質量情報
を表示します。内部標準、または内部標準を持たない分
析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの名前
現在の分析物に関連付けられている内部標準の名前を表
示します。内部標準、または内部標準を持たない分析物
については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISのピークコメ 現在の分析物に関連付けられている内部標準のピークコ
ント
メントを表示します。内部標準、または内部標準を持た
ない分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの保持時間
現在の分析物に関連付けられている内部標準の保持時間
を表示します。内部標準、または内部標準を持たない分
析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの信号/ノイ
ズ
現在の分析物に関連付けられている内部標準の信号対ノ
イズ比を表示します。内部標準、または内部標準を持た
ない分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの開始時間
現在の分析物に関連付けられている内部標準の開始時間
を表示します。内部標準、または内部標準を持たない分
析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの全幅
現在の分析物に関連付けられている内部標準の全幅を表
示します。内部標準、または内部標準を持たない分析物
については、値が「N/A」に設定されます。
N
ISの50%での幅 現在の分析物に関連付けられている内部標準の50%での
幅を表示します。内部標準、または内部標準を持たない
分析物については、値が「N/A」に設定されます。
N
Isotope
同位体比での信頼性のレベルを表示します。定性分析の
Confidence 同位 ワークフローだけに適用されます。
体の信頼性
N
Isotope Ratio
理論的な同位体パターン 式に基づく と取得したスペクト
Difference 同位 ルの同位体パターンとの差を示します。
体比の差
定性分析のワークフローだけに適用されます。
N
Library
ライブラリヒットでの信頼性のレベルを表示します。こ
Confidence ライ れは、そのヒットのライブラリのスコアに基づいていま
ブラリの信頼 す。定性分析のワークフローだけに適用されます。
性
N
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LIS対応
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
LIS対応
Library Hit ライ 最も高いライブラリ一致の化合物名、つまり最も高い純
ブラリヒット 度スコアと要求された式と一致する式を持つ化合物の名
前を表示します。
N
この値は、ピークレビューのライブラリ検索の結果グリッ
ドのデータを使用して更新できます。定性分析のワーク
フローだけに適用されます。
Mass Error (ppm) 検出された質量と抽出質量の差をPPM 百万分率 単位の誤
質量誤差 ppm 差で表現して表示します。定性分析のワークフローだけ
に適用されます。
N
Mass Error
質量誤差の信頼性のレベルを表示します。定性分析のワー
Confidence 質量 クフローだけに適用されます。
誤差の信頼性
N
質量情報
Y
コンポーネントに関連付けられている質量情報を表示し
ます。MRM実験ではQ1/Q3であり、プロファイル フルス
キャン 実験では開始-停止です。
UV、ADC、DADの各実験では、波長 DAD またはチャネル
情報 UV/ADC です。
フラグメント質量が存在する場合は、XIC抽出で使用され
ます。
フラグメント質量が存在しない場合は、前駆体質量をXIC
抽出で使用する必要があります。
修正
ピーク検出パラメータが修正されているかどうかを示し
ます。チェックボックスが選択されている場合は、定量
化メソッドで示されているピーク検出パラメータが、
「Peak Review ピークレビュー 」ペインを使用して修正さ
れていることを示します。
Y
Non-Targeted
Peak 非ター
ゲットピーク
チェックマークは、強化されたPeak Finderによってピーク
が検出されていることを示します。定性分析のワークフ
ローだけに適用されます。
N
オペレータ名
サンプルを測定した機器のオペレータの名前を表示しま
す。
Y
元のファイル
名
ファイルの名前を表示します。
Y
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
ピークコメン
ト
行の任意のコメントを表示します。
N
プレート番号
データの取得に使用されたオートサンプラーのプレート
番号を表示します。これは、Batch Editor バッチエディタ
で示されている番号です。
Y
ベースライン
を横切るポイ
ント
ピークの開始から終了までのスキャンの数を表示します。
N
高さの半分を
横切るポイン
ト
高さの約50%でピークを横切るスキャンの数を表示しま
す。
N
Precursor mass
前駆体質量
定量化メソッドから取得された処理入力パラメータです。
N
LIS対応
この列は、常に結果表に表示されます。そのため、
「Column Settings 列設定 」ダイアログでは、チェックボッ
クスが用意されていません。
Purity score 純度 最も高いライブラリ一致の純度スコアを表示します。
スコア
この値は、ピークレビューのライブラリ検索の結果グリッ
ドのデータを使用して更新できます。定性分析のワーク
フローだけに適用されます。
N
この値は、対話式のデータレビューから更新できます。
この値は、ピークレビューのライブラリ検索の結果グリッ
ドから更新できます。
ラック番号
データの取得に使用されたオートサンプラーのラック番
号を表示します。これは、Batch Editor バッチエディタ で
指定されている番号です。
Y
相対的RT
内部標準を使用する分析物については、Retention Time 保
持時間 対IS Retention Time ISの保持時間 の比率を表示しま
す。内部標準、または内部標準を持たない分析物につい
ては、値がN/Aに設定されます。
Y
保持時間
検出されたピークの分単位の実際の保持時間を表示しま
す。
Y
Retention
「Found at RT RTでの検出 」と「Expected RT 予測されるRT 」
TimeError (%) 保 との間に見られる誤差をパーセント単位で表示します。
持時間誤差 % 定性分析のワークフローだけに適用されます。
N
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
LIS対応
RT Confidence RT 保持時間での信頼性を表示します。定性分析のワークフ
の信頼性
ローだけに適用されます。
N
サンプルコメ
ント
サンプルに対してユーザーが指定したコメントを表示し
ます。
Y
Sample ID サン サンプルに対してユーザーが指定した識別子を表示しま
プルID
す。「Sample ID サンプルID 」は、測定を目的としたサン
プル提出の前にBatch Editor バッチエディタ で指定しま
す。
Y
サンプルIDに含める文字数は0 50文字でなければならず、
次の無効な文字を含めることはできません \ / : * ?ASCIIの
表にある" < > |= または0から31の文字。
サンプルイン
デックス
現在のサンプルのインデックスを表示します。
Sample Name サ サンプルに対してユーザーが指定した名前を表示します。
ンプル名
「Sample Name サンプル名 」は、測定を目的としたサン
プル提出の前にBatch Editor バッチエディタ で指定しま
す。
Y
Y
サンプル名に含める文字数は1 50文字でなければならず、
次の無効な文字を含めることはできません \ / : * ?ASCIIの
表にある" < > |= または0から31の文字。
サンプル種類
サンプルの種類を表示します。各種フィルターの説明に
ついては、サンプルの種類フィルター 該当ページ 163を
参照してください。
Y
スキャンした
バーコード
注入の前にスキャンされたバーコードを表示します。
Y
SFモデルの
ソース
ピークのモデリングに使用されたサンプル名とコンポー
ネント名を表示します。モデリングに使用されるコンポー
ネントの名前が積分されるコンポーネントの名前と同じ
でない場合、ユーザーはモデルが適切かレビューする必
要があります。
N
SF Numピーク
アルゴリズムで検出された隣接する 入り組んだ ピークの
数を表示します。
N
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表 7-18 結果表の列 (続き)
ラベル
説明
信号/ノイズ
検出されたピークのピーク高さ対クロマトグラムに存在
するノイズの推定される比率を表示します。
LIS対応
Y
AutoPeak積分アルゴリズムを使用する場合、ノイズは計
算による相対ノイズおよびピークの頂点位置でのベース
ラインを使用して推定されます。MQ4アルゴリズムでも
同様のアプローチが使用されますが、ベースラインはク
ロマトグラム全体を使用して推定されます。
開始時間
検出されたピークの分単位の開始保持時間を表示します。
Y
10%での開始
時間
強度がピーク高さの10%のところでピークの表側に沿っ
た分単位の時間を表示します。
N
5%での開始時 強度がピーク高さの5%のところでピークの表側に沿った
間
分単位の時間を表示します。
N
テーリング係
数
ピークのフロントスロープからバックスロープまでの距
離をピークの中心線からフロントスロープまでの距離の
2倍で割った値で示します。すべての測定は、最大ピーク
高さの5%で行われています。
N
全幅
ベースラインでのクロマトグラフの分単位のピーク幅を
表示します。
Y
使用
分析物がキャリブレーションカーブの構築で使用されて
いるかどうかを示します。標準サンプルの場合、チェッ
クマークが選択されている場合は、対応する分析物がキャ
リブレーションカーブの構築に現在使用されていること
を示します。品質管理サンプルの場合は、分析物がQC統
計の計算に使用されていることを示します。その他のサ
ンプルの種類では、このフィールドは情報目的のみに使
用されます。
Y
バイアル番号
データの取得に使用されたオートサンプラーのバイアル
番号を表示します。これは、Batch Editor バッチエディタ
で指定されている番号です。
Y
10%での幅
ピーク高さの10%で測定されたピークの幅を表示します。
N
5%での幅
ピーク高さの5%で測定されたピークの幅を表示します。
N
50%での幅
頂点の強度の半分で測定された検出ピークのクロマトグ
ラフの分単位のピーク幅を表示します。
Y
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システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
3. オプション 「Number Format 数字のフォーマット 」列で、フォーマットを整数または
科学的通知に変更します。
4. オプション 「Number Format 数字のフォーマット 」列で、表示する小数点以下の桁数
を変更します。
5. 列設定をプロジェクト内のすべての結果表に適用するには、「Save as project default
settings プロジェクトのデフォルト設定として保存 」チェックボックスを選択します。
6. OKをクリックします。
新しい設定が、結果表に適用されます。このような設定は、新しい結果表を作成する場合
だけでなく、以前に保存した結果表を再度開いた場合にも適用されます。
注 列の幅と列の順序は、結果表のヘッダー行を使用して調整します。幅を変更するに
は、ヘッダーの境界線をドラッグします。列の順序を変更するには、列のヘッダーを結
果表の別の位置にドラッグします。この列の幅と順序の情報は、「Export エクスポー
ト 」ボタンを使用した場合にエクスポートされるファイルにも保存されます。
レポートの作成
1. 結果表が開いている状態で、Reporting (レポーティング) > Create Report and Save
Results Table (レポートを作成して結果表を保存) をクリックします。
「Create Report レポートの作成 」ダイアログが開きます。
2. Template name (テンプレート名) リストからテンプレートを選択します。
3. レポートフォーマットを選択します。
4. デフォルトのレポートタイトルを使用するか、Browse (ブラウズ) をクリックして別のタ
イトルを選択します。
5. 必要に応じて、Create an individual report for each sample (各サンプル用に個別のレ
ポートを作成) チェックボックスを選択します。
6. (オプション) Replace Logo (ロゴの交換) をクリックして、レポート用に別のロゴを選択し
ます。
ヒント 必要に応じて、Replace Logo (ロゴの交換) ダイアログにあるオプションを使用し
て、ロゴを修正します。
7. View Pages (ページを見る) をクリックして、レポートを見ます。
8. Create (作成) をクリックします。
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179 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
ヒント たとえば、選択した結果のレポートをPer Sample Quant、Per Sample Qual、Per Sample
Visible Rows Using Visible Analytes、Positive Hits Qualのいずれかのテンプレートを使用して作
成する場合は、フィルタを使用するか、結果表で不要な行を非表示にする必要がありま
す。
注 レポートテンプレートのレイアウトは、「Create Report レポートの作成 」ダイアログ
で「Template テンプレート 」表示をクリックして確認できます。特定のテンプレート
を表示するには、テンプレートと同じ名前で[Snapshot_X]という添え字 Xは配列内のスナッ
プショット番号 を持つ*.jpgファイルを用意する必要があります。ファイル名と添え字の
間にはスペースを入れないでください。
たとえば、All Peaks Qual.docxテンプレートの場合、ファイル名はAll Peaks Qual[Snapshot_1].jpg
All Peaks Qual[Snapshot_2].JPG All Peaks Qual[Snapshot_3].jpgのようになります。
結果表をエクスポートして保存
1. 結果表が開いている状態で、Reporting (レポーティング) > Export results (結果のエクス
ポート) > Export and save Results Table (結果表をエクスポートして保存) をクリックし
ます。
「Export エクスポート 」ダイアログが開きます。
2. 必要に応じて、フォーマット、列、行を選択します。
3. OKをクリックします。
結果表のエクスポート – メトリック
注 メーカーは、データが「Quantitation 定量化 」「Analytics 分析物 」ワークスペースからエ
クポートされた後の間接的または派生的な損害を含む偶発賠償責任に対して一切の責任を
負いません。
結果表のエクスポートは、「Quantitation 定量化 」ワークスペースでのデータ出力用に制御さ
れたメソッドの1つです。
この機能は、有効な結果表の情報を含むタブ区切りのテキストファイルを作成するために使
用されます。 情報は、すべてのサンプルおよびすべてのコンポーネントまたは1つの選択し
たメトリックやフィールド用の見ることができるコンポーネントだけのいずれかのためにエ
クスポートされます。
1. 結果表が開いている状態で、Reporting (レポーティング) > Export results (結果のエクス
ポート) > Results Table - Metric (結果表 - メトリック) をクリックします。
「エクスポート」ダイアログが開きます。
2. 必要に応じて、フォーマット、列、行を選択します。
3. OKをクリックします。
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システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
コンポーネントとグループのリスト
結果表が開くと、現在のコンポーネントとグループのリストがメインウィンドウの左側に表
示されます。 このリストを使用して、どのコンポーネントが結果およびリンクされたピーク
レビューまたはキャリブレーションカーブウィンドウで見えるようにするかの変更を行いま
す。 すべての情報が、定量化メソッドに定義されたように表示されます。
リストにある個別の項目をクリックして、その項目のためのコンポーネントのみを表示され
ます。 Shift+clickまた Ctrl+clickを使用して、例えば2つの特定の分析物などの複数の項目を
選択します。
ヒント ペインの右端を左右にドラッグして、リストの幅を変更します。
結果表の列の順序は、フィルタリングには影響されません。 表は、定量化メソッドに示され
た順序で、最初にサンプル順、次にコンポーネント順になるようにプリセットされています。
表 7-19 オプション
ラベル
説明
ISを表示
クリックすると、現在選択されている分析物と対応する内部標準物質の両
方について、結果表にある行を示します。 これは CTRL を押しながら分析
物をクリックし、内部標準物質をクリックする動作と同じです。 この方法
でも両方を選択することができます
見つける
クリックすると、指定されたテキストと一致するリストにある項目を見つ
けます。
ピークのレビュー
Peak Review (ピークレビュー) ペインを使用して、以下を行います
• ピーク検出プロセスの品質を決定できるように、生のクロマトグラムを目視で検査しま
す。
• ピーク検出パラメータを調整するか、積分の開始ポイントと終了ポイントを手動で選択す
るかのいずれかにより、正しく積分されていないクロマトグラムを訂正します。 クロマ
トグラムが再積分された後、結果表が新しいピーク面積とその他のパラメータを用いて自
動的に更新されます。
• 積分したXICについて、MSおよびMS/MSスペクトルを目視で検査します。
• 式検出の結果およびライブラリ検索の結果をレビューし、必要に応じて結果表の結果を手
動で更新します。
「Peak Review ピークレビュー 」ペインの右クリック機能については、ピークレビューオプ
ション 該当ページ 183を参照してください。「Peak Review ピークレビュー 」ペインのオプショ
ンについては、ピークレビューオプション 該当ページ 183を参照してください。
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取扱説明書 – ソフトウェア
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. 「Results 結果 」 > 「Open 開く 」を選択します。
「Open Results Table session 結果表セッションを開く 」ダイアログが開きます。
3. ファイルを選択します。
4. Openをクリックします。
5. 「Displays the peak review ピークレビューの表示 」アイコンをクリックします。
6. 左側のペインの「Components and Group コンポーネントとグループ 」リストで、コン
ポーネントをクリックします。
7. (オプション) Options (オプション) > Peak review display settings (ピークレビュー表示
設定) をクリックして、Peak Review (ピークレビュー) ペインの外観を変更します。
8. クロマトグラムに複数のピークが含まれ、不適切なピークが積分された場合は、正しい
ピークの上をドラッグして、新しい予測される保持時間を設定します。 必要に応じて、
ピーク検出パラメータと積分パラメータを調整します。
9. 新しいパラメータを同じコンポーネントのその他すべてのサンプルに適用するには、クロ
マトグラムを右クリックし、次にUpdate Quantitation Method for Component (コン
ポーネントのための定量化メソッドの更新) をクリックします。
ヒント 積分されたピークは、「Starts ‘slide show’ peak review mode 「スライド
ショー」ピークレビューモードの開始 」アイコンをクリックして確認することもできま
す。「Displays the peak review ピークレビューの表示 」アイコンをクリックし、
「Starts 'slide show' peak review 「スライドショー」ピークレビューの開始 」アイコ
ンをクリックします。
ヒント 「Set Peak to ‘Not found’ ピークを「見つからない」に設定 」をクリックして、
積分をクリアします。ユーザーは、ピークを手動で積分する前に生データを見ることが
できます。
10. 「Peak Review ピークレビュー 」ペインの「Enable Manual Integration Mode 手動積分
モードの有効化 」アイコンをクリックして、手動積分モードを使用します。
11. 興味のあるピークの一方のベースからもう一方のベースまでカーソルをドラッグします。
これでピークは手動で積分され、前回使用した積分パラメータは利用できなくなります。
ヒント ピークが修正されたばかりである場合、ピークを右クリックして元のメソッドに
回復させ、次にRevert Peak to Original Method (ピークを元のメソッドに回復) をク
リックします。
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取扱説明書 – ソフトウェア
「View 表示 」オプション
開いている「Peak Review ピークレビュー 」ペインで、「View 表示 」をクリックします。
ラベル
説明
XIC
クロマトグラムだけを表示します。
XIC side by side XICを 異なるサンプルから生成したクロマトグラムを並べて表示します。最大
並べて表示
で6つのサンプルを選択し、サンプル間のピークレスポンスを比較する
ことができます。
XIC + MS
クロマトグラムとMSスペクトルに加え、利用できる場合はFormula Finder
の結果を表示します。処理メソッドで式が定義されている場合は、理論
的なMSスペクトルも表示することができます。
XIC + MS/MS
クロマトグラムとMS/MSスペクトル 取得されている場合 に加え、利用
できる場合はライブラリ検索の結果を表示します。ライブラリヒットが
存在する場合は、ライブラリMS/MSスペクトルも表示することができま
す。
XIC + MS + MS/MS
クロマトグラム、MSスペクトル およびFormula Finderの結果 、MS/MSスペ
クトル およびライブラリ検索の結果 を表示します。利用できる場合は、
理論的なMSスペクトルとライブラリMS/MSスペクトルも表示することが
できます。
ヒント Formula Finderの結果は、MSスペクトルの下に表示されます。また、ライブラリ検索
の結果は、MS/MSスペクトルの下に表示されます。Formula Finderの結果やライブラリ検索の
結果は、ペインを拡大することでさらに多く表示できます。
ピークレビューオプション
Peak Review (ピークレビュー) ペインで、Options (オプション) をクリックします。
ラベル
説明
ピークレビュー表示設定
Peak Review Options (ピークレビューオプション) ダイアロ
グを開きます。 タブにあるオプションをクリックして、
Peak Review (ピークレビュー) ペインの外観を変更します。
ヘルプを参照してください。
%Y軸 (スペクトルのみ)
Y軸のスケールを から絶対値に切り替えます。
ピークの塗りつぶし (XICおよびス XICおよびスペクトルを青色のドットで塗りつぶします。
ペクトル)
MSスペクトルのミラーリング
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選択した2つのMSスペクトルの比較をお互いの鏡映とし
て表示します。
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183 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
ラベル
説明
MS/MSスペクトルのミラーリング 選択した2つのMS/MSスペクトルの比較をお互いの鏡映と
して表示します。
積分パラメータ
「Peak Review ピークレビュー 」ペインの左側で積分パラ
メータを表示または非表示にします。
ChemSpiderヒットカウントを取得 MSスペクトルでFormula Finderの結果を展開した後で、
ChemSpiderヒットカウントの数値を表示します。
ナビゲーションコントロールの表 ナビゲーションボタンを表示します。 ボタンをクリック
示
して、コンポーネント間の移動、サンプル間の移動、ま
たはスライドショーの開始を行います。ピークのレビュー
該当ページ 181を参照してください。
Integration (積分) パラメータをコピー
ピークレビューペインを右クリックして、このコマンドにアクセスします。 このコマンドを
Paste Integration Parameters (積分パラメータを貼り付け) と併せて使用して、ピーク検出パラメー
タを1つのクロマトグラムから別のクロマトグラムにコピーします。 このコマンドは、パラ
メータへの同じ調整をいくつかのクロマトグラムに行う必要がある場合に使用できます。
1. 有効なクロマトグラムが開いたグラフを右クリックし、次に Copy Integration Parameters
(積分パラメータをコピー) をクリックします。
2. Update Processing Method for Component (コンポーネントのために処理メソッドを更
新) コマンドを使用して、変更をコンポーネントのためのクロマトグラムに適用します。
Integration (積分) パラメータを貼り付け
1. 有効なクロマトグラムが開いたグラフを右クリックし、次に Copy Integration Parameters
(積分パタメータをコピー) をクリックします。
2. 別のクロマトグラムを右クリックし、次に Paste Integration Parameters (積分パラメー
タを貼り付け)をクリックします。
前回コピーしたパラメータが、新しいクロマトグラムに適用されます。
コンポーネントの処理メソッドの更新
特定のクロマトグラムに合わせてピーク検出パラメータを調整した後は、この機能を選択し
て、結果表で保存した処理メソッドのコピーを修正し、そのようなパラメータをコンポーネ
ントに対して使用します。
• ピーク検出パラメータを調整し、右クリックして「Update Processing Method for
Component コンポーネントのために処理メソッドを更新 」を選択します。
特定のコンポーネントについては、すべてのサンプルが新しいパラメータを使用するよう
に自動的に積分され、「Peak Review ピークレビュー 」ペインと結果表が更新されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
手動で積分したピークが存在する場合は、再積分をすべてのピークに適用するか、手動で
積分されていないピークだけに適用するかを尋ねられます。
グループの処理メソッドの更新
「Update Processing Method for Component コンポーネントのために処理メソッドを更
新 」コマンドと同様に、積分は、現在アクティブなクロマトグラムのコンポーネントと同じ
グループに属するすべてのコンポーネントに適用されることが望まれます。ユーザーが各種
コンポーネントをグループに割り当てていて、特定のグループに割り当てられたコンポーネ
ントが同じ保持時間を持つことが望まれる場合は、この機能が有用です。これは、予測保持
時間などのパラメータを、すべてのグループのすべてのコンポーネントについて一度にリセッ
トできるためです。そのため、グループのコンポーネントの保持時間が異なる場合は、有用
とはいえません。
• ピーク検出パラメータを調整し、右クリックして「Update Processing Method for Group
グループの処理メソッドの更新 」を選択します。
積分パラメータをグループ内のサンプルに適用
特定のクロマトグラムのためにピーク検出パラメータを調整した後、この機能を使用して、
結果表で保存した定量化メソッドのコピーから元のパラメータをそのクロマトグラムに適用
します。
• 特定のクロマトグラムのためにピーク検出パラメータを調整した後、右クリックして、次
にApply integration parameters to sample within a group (積分パラメータをグループ
内のサンプルに適用) をクリックします。
ピークを元のメソッドに戻す
特定のクロマトグラムに合わせてピーク検出パラメータを調整した後は、この機能を使用す
ると、結果表で保存した定量化メソッドのコピーからクロマトグラムに元のパラメータを適
用できます。
• アクティブなクロマトグラムが開かれているグラフで右クリックし、「Revert Peak to
Original Method ピークを元のメソッドに回復 」を選択します。
化合物のすべてのピークを元に戻す
何らかのクロマトグラムに合わせてピーク検出パラメータを調整した後は、この機能を使用
すると、結果表で保存した処理メソッドのコピーから、アクティブなクロマトグラムと同じ
コンポーネントのすべてのクロマトグラムに元のパラメータを適用できます。手動で積分し
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185 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
たピークが存在する場合は、再積分をすべてのピークに適用するか、手動で積分されていな
いピークだけに適用するかを尋ねられます。
• アクティブなクロマトグラムが開かれているグラフで右クリックし、「Revert All Peaks
for Component 化合物のすべてのピークを元に戻す 」を選択します。
ライブラリ検索またはFormula Finderの結果を使用したピークの分析
ヒント 「Options オプション 」 > 「Peak review display settings ピークレビュー表示設
定 」をクリックして、ペインに表示される行数を変更します。ペインの上部を上にドラッ
グして、「Peak Review ピークレビュー 」ペインのサイズを大きくすることもできます。
1. 「Peak Review ピークレビュー 」ペインで「View 表示 」をクリックして、「XIC + MS」、
「XIC + MS/MS」、「XIC + MS + MS/MS」のいずれかをクリックします。
グラフの下に検索結果が表示されます。
図 7-54 ライブラリ検索の結果
2. ライブラリヒットをさらに表示するには、青い矢印をクリックしてライブラリ検索の結果
を展開します。
この表には、選択したライブラリヒットの化学構造も表示されます。
3. 矢印をもう一度クリックすると、表が折り畳まれます。
折り畳まれた表の結果は、結果表にも表示されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
4. オプション 表で行を選択し、表の アイコンをクリックして結果表の結果を更新してか
ら、そのライブラリヒットを分析で使用します。
5. オプション
アイコンをクリックし、選択した化合物の情報で処理方法を更新します。
6. 青い矢印をクリックしてFormula Finderの結果を展開し、その他の結果を表示します。
図 7-55 Formula Finderの結果
ChemSpiderから化合物を更新している場合は、選択したFormula Finderの結果の化学構造が
表にも表示されます。
7. 矢印をもう一度クリックすると、表が折り畳まれます。
折り畳まれた表の結果は、結果表にも表示されます。
8.
をクリックし、結果表のFormula Finderの結果列を選択した化合物で更新します。
9.
をクリックし、選択した化合物の情報で処理方法を更新します。
ヒント 「Options オプション 」 > 「Get Chemspider hit count ChemSpiderヒットカ
ウントを取得 」をクリックして、グラフの下の表に「ChemSpider Hit Count ChemSpider
ヒットカウント 」列を表示します。
10.
をクリックして、ChemSpiderアプリケーションを開きます。
ChemSpider 該当ページ 188を参照してください。
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取扱説明書 – ソフトウェア
ChemSpider
注 ChemSpiderデータベースにアクセスするには、有効なライセンスファイルがワークステー
ションに登録されている必要があります。
注 下図の情報は、例示のみを目的として提供されています。
図 7-56 ChemSpiderセッション
項目
説明
1
結果ペイン 選択した式に一致する推奨される化合物のリストが表示されます。
結果は、40種類の化合物をグループとして表示されます。リスト内の次のグルー
プに進むには、右矢印を使用します。リスト内の前のグループに戻るには、左
矢印を使用します。
2
スペクトルペイン 取得したスペクトル 赤 および一致するフラグメント 青 が表
示されます。青いフラグメントが多いほど良好な一致を示します。
3
構造ペイン 結果ペインで選択された化合物の化学構造が表示されます。
4
フラグメント表ペイン、「Fragments フラグメント 」タブ 選択した化合物に対し
て一致するフラグメントの合計数が表示されます。
4
フラグメント表ペイン、「Peaks ピーク 」タブ 選択した化合物について、ピーク
の合計数、一致するピーク数、合計強度の割合が表示されます。一致するピー
クは、「Assigned 割り当て 」列のチェックボックスが自動的に選択されます。
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188 の 240
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取扱説明書 – ソフトウェア
実行する操作
発生する動作
「Filter XIC List XICリストのフィル
結果ペインが更新され、入力した基準に一致する
ター 」アイコンの横にあるフィールド 結果だけが表示されます。
に情報を入力する
結果ペインの各エントリをクリックする 残りのペインが更新され、選択内容に関連付けら
れた情報が表示されます。
フラグメント表ペインの「Fragments フ 残りのペインが更新されます。スペクトルペイン
ラグメント 」タブで、各エントリをク では、一致するフラグメント 青 の上下に赤い矢印
リックする
が表示されます。構造ペインでは、フラグメント
に一致する化学構造のコンポーネントが強調表示
されます 太字 。
フラグメント表ペインの「Peaks ピー 残りのペインが更新されます。スペクトルペイン
ク 」タブで、「Assigned 割り当て 」の では、一致するフラグメント 青 の上下に赤い矢印
各エントリをクリックする
が表示されます。構造ペインでは、フラグメント
に一致する化学構造のコンポーネントが強調表示
されます 太字 。
「ChemSpider results for 次に対応する
ChemSpiderの結果 」フィールドの右側
にある下矢印をクリックして、
「ChemSpider web site ChemSpiderの
ウェブサイト 」オプションを選択する
ChemSpiderのウェブサイト www.chemspider.com がブ
ラウザウィンドウで開きます。情報へのアクセス
方法については、ChemSpiderのヘルプを参照してく
ださい。
「ChemSpider results for 次に対応する すべての変更が破棄され、セッションが元の検索
ChemSpiderの結果 」フィールドの右側 結果に戻ります。
にある下矢印をクリックして、「Refresh
更新 」オプションを選択する
「Select 選択 」をクリックする
ChemSpiderセッションで選択した情報が、ソフト
ウェアセッションの「Formula Finder Results
Formula Finderの結果 」ペインにコピーされま
す。また、ChemSpiderセッションが終了します。
統計ペインについて
このダイアログにアクセスするには、「Analytics 分析物 」ワークスペースで結果表を開き、
「Views 表示 」 > 「Statistics pane 統計ペイン 」をクリックします。
「Statistics 統計 」ペインを使用すると、分析物の再現性に関連する情報を表示できます。表
内の各行には、関連するピークグループの平均と標準偏差などの情報 同じ反応を持つものと
予期される同じ分析物からの情報 がまとめられています。
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取扱説明書 – ソフトウェア
ラベル
説明
Row 行
行番号。
Component
分析物の名前。
Name コン
ポーネント名
Sample Name
サンプル
名 /Actual
Concentration
実際の濃度
サンプルが実際の濃度を基準としてグループ化されている場合、この列には
濃度が表示されます。サンプルがサンプル名を基準としてグループ化されて
いる場合、この列にはサンプル名が表示されます。
数値
「m of n」の形式で表示され、nは特定の実際の濃度を持つサンプルの合計数
または同じサンプル名を持つサンプルの合計数 を表します。mは、そのよう
なサンプルの中で計算に使用されているサンプルの数を表します。対応する
ピークを解析できなかった場合、または「Used 使用 」フィールドが手動で
クリアされている場合、サンプルは使用されません。
Mean 平均
使用されているサンプルの平均。
Standard
使用されているサンプルの標準偏差。
Deviation 標準
偏差
Percent CV
パーセントで表した変動係数 100 * 標準偏差 /平均。
パーセント変
動係数
Accuracy 精度 平均値を実際の濃度で除算し、パーセントで表した値 100 *平均/ 実際の濃
度 。このフィールドは、実際の濃度を基準としてグループ化している場合の
み表示され、サンプル名を基準としてグループ化している場合は表示されま
せん。
Values 値
サンプルの個別の値は、追加列に表示されます。対応するサンプルを解析で
きなかった場合は、「N/A」と表示されます。「Used 使用 」フィールドが手
動でクリアされている場合、値は取り消し線付きで表示されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
ラベル
説明
Group by
Concentration
for ... ...の濃度
別にグループ
化
このリストの項目では、統計の計算で 特定の分析物について サンプルをど
のようにグループ化するのかを指定します。以下の選択肢が用意されていま
す。
• Group by Concentration for Standards 標準の濃度別にグループ化
「Standard 標準 」のサンプルを実際の濃度別にグループ化します。
• Group by Concentration for QCs QCの濃度別にグループ化 「Quality
Control 品質管理 」のサンプルを実際の濃度別にグループ化します。
• Group by Sample Name for Standards 標準のサンプル名別にグループ
化 「Standard 標準 」の複製サンプルを「Sample Name サンプル名 」フィー
ルドを基準としてグループ化します。
• Group by Sample Name for QCs QCのサンプル名別にグループ化 「Quality
Control 品質管理 」の複製サンプルを「Quality Control 品質管理 」フィール
ドを基準としてグループ化します。
• Group by Sample Name for All Samples すべてのサンプルのサンプル名
別にグループ化 すべての複製サンプルを「Sample Name サンプル名 」
フィールドを基準としてグループ化します。
Calculated
このリストの項目では、統計の計算に使用する実際のメトリックを指定しま
Concentration す。以下の選択肢が用意されています。
計算による濃
• Calculated Concentration 計算による濃度 結果表の「Calculated
度
Concentration 計算による濃度 」フィールドが使用されます。
• Area 面積 結果表の「Area 面積 」フィールドが使用されます。
• Height 高さ 結果表の「Height 高さ 」フィールドが使用されます。
• Calibration Y-Value キャリブレーションY値 分析物に対して指定されて
いる回帰パラメータが使用されます。対応する内部標準を持たない分析
物の場合は「Area 面積 」または「Height 高さ 」のいずれかとなり、内部
標準を使用する分析物の場合は「Area Ratio 面積比 」または「Height Ratio
高さ比 」のいずれかになります。
統計を使用したデータの分析
「Statistics 統計 」ペインを使用すると、分析物の再現性に関連する情報を表示できます。表
内の各行には、関連するピークグループの平均と標準偏差などの情報 理想的には同じ反応を
持つものと予期される同じ分析物からの情報 がまとめられています。
反復プロセスを使用して、ピーク積分、キャリブレーションカーブ、サンプル統計を確認し
ます。結果表の「Actual Concentration 実際の濃度 」フィールドで設定された精度は、統計表で
も使用されます。
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取扱説明書 – ソフトウェア
注 %CVや精度など、統計で許容される値の情報については、ラボの標準業務手順書を参照
してください。
• 結果表を開き、「Views 表示 」 > 「Statistics pane 統計ペイン 」をクリックします。
統計ペインについて 該当ページ 189を参照してください。
キャリブレーションカーブ オプション
「キャリブレーションカーブを開く」ペインにある Options (オプション) をクリックして、
以下の機能を使用します
ラベル
説明
除外された標準の表示 このオプションを選択すると、除外された標準のデータポイント (あ
る場合) が白丸で描かれます。 このオプションをクリアすると、除
外された標準は表示されなくなります。
品質管理の表示
このオプションを選択すると、品質管理 (QC) サンプルのデータポイ
ントが白ダイアモンドで描かれます。 このオプションをクリアする
と、QCサンプルは表示されなくなります。
凡例の表示
このオプションを選択すると、凡例が様々なサンプル種類 (標準サン
プル用の黒丸、除外された標準用の白丸、およびQCサンプル用の白
ダイアモンド) のためのポイントのシンボルを表示するプロットの右
側に描かれます。
注 ユーザーが特定のサンプル種類を見ることができない場合、例
えば、Show quality controls (品質管理を表示) オプションが選択
されていない場合、これらのサンプル種類の入力内容は存在しま
せん。 QCサンプルと除外された標準サンプルのどちらも表示され
ない場合、このオプションは利用できず、凡例は描かれません。
パーセントY軸の使用 このオプションを選択すると、Y軸が各分析物ごとの最大のY値が付
いたデータポイントのパーセント値として独立して表されます。 こ
のオプションをクリアすると、プロットのY軸は絶対ピーク面積また
は絶対高さの単位 (または内部標準が使用されている場合はピーク面
積または高さの比率) で表されます。
2つ以上の分析物が重ねて表示され、それらの絶対レスポンスが異な
る場合に、パーセント軸の使用は便利です。なぜならそれにより、
スケール化される各トレースが、利用可能な全垂直領域を使用でき
るためです。 そうしない場合、低いレスポンスの分析物はX軸の近
くに位置して、プロットは詳細を見るために拡大しなければなりま
せん。
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取扱説明書 – ソフトウェア
ラベル
説明
Log-logプロット
このオプションを選択すると、面積対濃度のプロットのビューとと
Log (面積) 対 Log (濃度) のプロットのビューとが切り替わります。
外部キャリブレーショ このオプションを選択すると、前回エクスポートしたキャリブレー
ンの割り当て
ションが、有効な結果表に適用されます。
外部キャリブレーショ このオプションを選択すると、前回適用されたキャリブレーション
ンの削除
が、有効な結果表から削除されます。
キャリブレーションの このオプションを選択すると、有効な結果表に関連付けられている
エクスポート (および すべての分析物のキャリブレーション方程式のコピーが、外部ファ
結果の保存)
イル (*.mqcal) に保存されます。 これにより、1セットの標準サンプ
ルでのキャリブレーションが、同じ結果表の一部ではないその他の
サンプルに適用できるようになります。
キャリブレーションのエクスポート
キャリブレーションのエクスポートを使用して、有効な結果表に関連付けられているすべて
の分析物のキャリブレーション方程式のコピーを、外部ファイル (*.mqcal) に保存します。 こ
れによりユーザーは、1セットの標準サンプルでのキャリブレーションを、同じ結果表の一部
ではないその他のサンプルに適用できるようになります。
典型的なワークフロー
1. 標準のみを含むResults Table (結果表)を作成します。
2. Peak Review (ピークレビュー) ペインを使用して、積分が成功したことを確認します。
3. Export Calibration (キャリブレーションのエクスポート) コマンドを使用して、キャリブ
レーションのコピーを保存します。
4. 未知の濃度のサンプルを含む新しいResults Table (結果表) を作成します。
5. Import External Calibration (外部キャリブレーションのインポート) クリックして、エク
スポートしたキャリブレーション方程式を新しい結果表に適用します。
注 ユーザーは、キャリブレーションファイル (*.mqcal) を指定して、新しい結果表に適
用することもできます。
6. 必要に応じて、ステップ4と5を繰り返します。
元の結果表 (標準サンプル付き) に変更が行われた場合、更新したキャリブレーション方程式
を保存するために、結果表を再度エクスポートしなければなりません。 前回エクスポートし
た結果表は自動的には更新されません。
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回帰種類
キャリブレーションカーブ標準の分析物ピークの面積は、既知の濃度に対してプロットされ
ます。 それに続き、線がポイントにフィッティングされます。 この回帰線は未知サンプルの
濃度を計算するために使用されます。
分析物ワークスペースで、以下の種類の回帰がキャリブレーションカーブのために利用でき
ます
• 直線 (y = mx + b)
• 0を通る直線 (y = mx)
• 平均レスポンスファクター
• 二次式 (y = a2 + bx + c)
• 電力
• Wagner
• Hill
同様に、以下を含む異なる種類の重み付けが回帰のために利用できます
• なし
• 1/x
2
• 1/x
• 1/y
2
• 1/y
• ln(x)
• ln(y)
メトリックプロットを使用してデータを分析する
メトリックプロットを使用して、列番号または別の列のいずれかに対して、Results Table (結果
表) の列に値をプロットします。 これらのプロットは、視覚的なデータレビューに非常に役
立ちます。
1つの列が選択された場合、結果のプロットは表の列番号の関数として列の値を表示します。
2つの列が選択された場合、それらの列の値はお互いに対してプロットされます。 選択され
る2つの列の最初の列はx値を含み、2番目の列はy値を含みます。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. 結果表を開きます。
3. 1つまたは2つの列を選択します。
4. More (さらに多く) > Create Metric Plot with new settings (新しい設定でメトリックプ
ロットを作成) をクリックします。
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5. メトリックプロットで「Link リンク 」をクリックして、「Link to results table columns
結果表の列へのリンク 」または「Link to results table rows 結果表の行へのリンク 」を
クリックし、結果表でのスクロールをメトリックプロットにリンクします。
6. 必要に応じて「Options オプション 」をクリックし、以下の機能を使用します。
表 7-20 メトリックプロットの右クリックメニューオプション
メニューオ 説明
プション
Regression 回 ダイアログを使用して、回帰モデルを選択します。詳細については、ヘル
帰
プシステムを参照してください。
Display “N/A”
as 0.0
「N/A」を
0.0として表
示する
このオプションを選択すると、数値ではない値のy値としてゼロを使用して
プロットします。選択していない場合、このようなポイントはプロットか
ら省略されます。たとえば、解析できなかったピークについては、
「Retention Time 保持時間 」がN/Aと報告されます。この機能を使用する
と、そのようなピークにもポイントが存在することになるため、ユーザー
は問題の可能性があるサンプルを見つけ、ポイントをクリックして「Peak
Review ピークレビュー 」ペインにリンクすることができます。
Show sample
names サン
プル名を表
示
結果表の「Sample Name サンプル名 」フィールドのテキストを使用して、
データポイントにラベル付けするかどうかを切り替えます。重なっている
トレースが複数存在する場合は、現在アクティブなトレースだけがラベル
付けされます。
Show legend 各種サンプルに対して使用されているポイント記号に注釈を付ける凡例の
凡例の表示 表示を切り替えます。
Use percent
Y-axis パーセ
ントY軸の使
用
Y軸で絶対単位を使用するのか、最大Y値に対するパーセントを使用するの
かを切り替えます。パーセントを使用する場合、パーセント値は重なって
いるトレースごとに独立して計算されます。この機能は複数の化合物につ
いて重なっているトレースをプロットする目的で使用できるため、コンポー
ネントのメトリックに対する反応は大幅に異なります。
Start Y-Axis at Y軸をy=0で開始するか、プロットに必要な最小Y値で開始するかを切り替え
zero Y軸をゼ ます。
ロで開始す
る
Connect with データポイントを線で接続するかどうかを切り替えます。
lines 線で接
続する
Save setting 現在プロットが設定に関連付けられている場合、この機能を使用すると現
設定の保存 在の設定が保存されます。関連付けられていない場合、この機能は「Save
Setting As 名前を付けて設定を保存 」機能と同じように動作します。
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195 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-20 メトリックプロットの右クリックメニューオプション (続き)
メニューオ 説明
プション
Save setting
as 名前を付
けて設定を
保存
同じ列を頻繁にプロットする場合は、プロットのオプションを設定として
保存することができます。これにより、必要な列が現在は結果表に表示さ
れていない場合でも、迅速にプロットを生成することができます。列だけ
でなく、さまざまなプロットオプションも保存されます。設定を保存する
と、その名前は「Metric Plot メトリックプロット 」メニューに表示されま
す。
Delete setting 現在のプロットが設定に関連付けられている場合、この機能を使用すると
設定の削除 設定が削除されます。
メトリックプロットのヒント
• データポイントを左クリックすると、結果表の対応する行が自動的に選択され、ビューま
でスクロールします。また、「Peak Review ピークレビュー 」ペインが開いている場合は、
対応するクロマトグラムを表示するように更新されます。これは、外れ値のピークレビュー
を実行する場合に便利です。
• タイトル領域には、常にアクティブなトレースの名前が表示されます。複数のコンポーネ
ントのトレースが重なっている場合は、タイトルを切り替えると、すべてのトレースにつ
いて情報が表示されます。また、タイトル領域の任意の場所をダブルクリックして、アク
ティブなトレースの情報だけを表示することもできます。特定のトレースをアクティブに
するには、対応するタイトルの左側にあるカラースポットをクリックします。
監査証跡
ユーザーは、各結果表の監査証跡の記録を見ることができます。
監査証跡ビューアで監査証跡の記録を表示する
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Views (見る) > Audit trail viewer (監査証跡ビューア) をクリックします。
3. セッションファイルを開きます。
注 「Project プロジェクト 」リストをクリックし、別のプロジェクトを選択して、結果
表で監査証跡を表示するプロジェクトを変更します。
4. 他の結果表の記録を表示するには、「Sessions セッション 」リストをクリックして別の
ファイルを選択します。
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196 の 240
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ヒント プロジェクトのすべての結果表を同時に表示することもできます。
キーワード検索を使用した監査済みイベントのフィルタリング
監査済みのイベントは、監査証跡でキーワード検索を使用してフィルタリングできます。キー
ワード検索では、テキスト内で一致するすべての単語が強調表示されます。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Views (見る) > Audit trail viewer (監査証跡ビューア) をクリックします。
3. セッションファイルを開きます。
4. 検索対象の単語を「Find 検索 」フィールドに入力します。
5. 「Go 実行 」をクリックします。
一致が見つかると「Find 検索 」フィールドが緑色に変化し、一致数が表示されます。ま
た、一致する単語が黄色で強調表示されます。一致が見つからない場合は、「Find 検索 」
フィールドがピンク色に変化します。
6. 各一致を移動するには、「Next 次へ 」ボタンと「Prev 前へ 」ボタンを使用します。
指定された基準を使用する監査済みのイベントのフィルタリング
ユーザーは、指定された基準のセットに基づいて、監査証跡にある監査済みのイベントをフィ
ルタリングできます。
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Views (見る) > Audit trail viewer (監査証跡ビューア) をクリックします。
3. セッションファイルを開きます。
4. Filter (フィルター) をクリックします。
Filter Audit Trail Events (監査証跡イベントをフィルタリング) ダイアログが開きます。
5. リストを使用して、必要なフィルター基準を選択します。
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取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-57 「監査証跡イベントをフィルタリング」ダイアログ
項目 ラベル
説明
1
is ( は)
使用すると、特定の単語またはフレーズでフィルタリング
できます。
2
contains (含む)
使用すると、部分的な単語またはフレーズでフィルタリン
グできます。
3
該当なし
結果表 (.session) ファイルの名前 ユーザーは、有効なプロ
ジェクトのための1つのファイルまたはすべてのファイル
をフィルタリングできます。
4
またここで
• 説明
リストから選択し、必要に応じて以下を入力します
• イベントの種類の一部または全体を入力します。
• 試料名
• サンプル名の一部または全体を入力します。
• ユーザーのフル
ネーム
• ユーザーの名前の一部または全体を入力します。
• 通知
• Yes (はい) またはNo (いいえ) を選択します。
• 理由を入力します。
• 理由
5
ここで時刻と日付は
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198 の 240
特定の日付と時刻の間に発生したイベントをフィルタリン
グします。
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注 Results Table (結果表) フィールドは編集できません。
6. Clear (クリア) をクリックして、すべてのフィルター基準をNo filter (フィルターなし) に
リセットします。
7. OKをクリックして、イベントをフィルタリングします。
ヒント Audit Trail Viewer (監査証跡ビューア) ダイアログにあるRemove Filter (フィルター
を削除) をクリックして、フィルターを削除します。
監査証跡ビューアの印刷
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Views (見る) > Audit trail viewer (監査証跡ビューア) をクリックします。
3. セッションファイルを開きます。
4. 「Print 印刷 」をクリックします。
5. プリンターを選択します。
注 「Audit Trail Viewer 監査証跡ビューア 」ダイアログの保存済みイベントの部分だけが
印刷されます。
監査証跡ビューアにある列設定の変更
1. Analytics (分析物) ワークスペースを開きます。
2. Views (見る) > Audit trail viewer (監査証跡ビューア) をクリックします。
3. セッションファイルを開きます。
4. Column Settings (列設定) をクリックします
5. 必要に応じて、Column Settings (列設定) ダイアログの列を選択またはクリアします。 結果
表のための列を選択 該当ページ 165を参照してください。
積分アルゴリズムのパラメータ
MQ4積分アルゴリズムのパラメータ
以下の各パラメータは、目的物のピークを同定および報告する目的で使用します。使用可能
なパラメータの全リストについては、積分アルゴリズムのパラメータ 該当ページ 199を参照
してください。
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199 の 240
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ノイズ率
このパラメータは、クロマトログラムのノイズレベルを推定する目的で使用します。最小の
強度を持つ指定した割合のデータポイントがノイズとみなされます。
通常は、20% 60%の値を指定します。大きなピークが存在する状況で小さなピークが検出さ
れていない場合は、ノイズ率を下げる必要があります。図 7-58は、極端に大きなピークが存
在する状況における小さなピークの例を示したものです。ノイズ率を90%に設定している場
合、このピークは検出されませんが、ノイズ率を40%に設定すると検出されます。
図 7-58 対象のピーク
図 7-59の左側は、ノイズ率が40%のグラフです、また、右側は90%に設定した場合です。
図 7-59 ノイズレベル
ベースライン補正ウィンドウ
スムージング後であっても、その他の処理の実行前は、突出データを排除するためにクロマ
トグラムがベースライン補正されます。各データポイントについて、ベースラインは、最小
の強度 補正ウィンドウの範囲内 を持つ現在のポイントの左右両側にあるデータポイントを使
用して計算されます。
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200 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
予期されるピーク幅より少なくとも数倍大きく設定されている場合、このパラメータの正確
な値は重要ではありません。
図 7-60 ベースライン補正ウィンドウ
ピークスプリット
このパラメータでは、ノイズが発生する可能性のあるピークを単一のピークとして検出する
か、2つ またはそれ以上 の個別のピークとして検出するのかを制御します。2つの電位ピーク
間の下落が指定した値未満の場合は、単一のピークとして検出されます。そうでない場合は
2つのピークとして検出されます。
このパラメータを大きな値に設定すると、ノイズの多いピークがスプリットされず、2つの独
立したピークとして検出されなくなります。ただし、2つの溶出する 重複する 明確なピーク
が近接して存在する場合は、小さな値を使用する必要があります。
左側のグラフでは、2つのポイントにピークスプリットが設定されています。また右側のグラ
フでは、3つのポイントにピークスプリットが設定されています。
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201 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
図 7-61 ピークスプリット
AutoPeak積分アルゴリズムのパラメータ
以下の各パラメータは、目的物のピークを同定および報告する目的で使用します。
詳細は、ヘルプシステムを参照してください。
• Local peak baseline 局所ピークベースライン クロマトグラム全体を基準としたベースラ
インを計算するのではなく、ピークを中心とした局所的なベースラインに対する変化が評
価されます。
• Linear peak baseline 線形ピークベースライン ピークの特定のグループの始点と終点に
あるポイント間にラインを適合させ、ベースラインがピークを下回り、非線形となる可能
性を排除します。
Saturation correction 飽和補正 アルゴリズムによってピークの飽和が検出されると、検出
器が飽和しなかった場合はピークがどのようになっていたのかを予測するモデルを使用しま
す。これによりプロファイルがピークの最上部を超えて拡大され、検出器が飽和しなかった
場合に得られるおおよその反応が見積もられます。また、キャリブレーションカーブの線形
動的範囲が拡大される場合があります。このオプションを使用できるのは、全体的なアルゴ
リズムのデフォルト値を設定している場合で、定量化メソッドの作成時または個別のピーク
レビュー時ではない場合だけです。これは、一部のピークだけに対応した設定では、この設
定を使用しても便利ではないためです。
レポートテンプレートの編集
注意 データ損失の発生要因。 ユーザーによるテンプレートの変更を防ぐため、レポート
テンプレートは、システム管理者が書き込みのためだけにアクセスできる、安全な読み取
り専用フォルダに必ず保管してください。
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202 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
カスタムテンプレートを作成する場合は、ユーザーの責任において、そのテンプレートを検
証する必要があります。
1. .docxテンプレートを開きます。
右側にReporterテンプレートエディタが開きます。テンプレートエディタには、自動的に
タグ情報が入力されています。
図 7-62 Reporterテンプレートエディタ
項目
説明
1
現在のタグを表示しているレポートテンプレートです。
2
アイコン
• 新しいタグを追加します。
• 画像タグを追加します。
• 内容エリアを表示します。
• 文書変更ログを表示します。
3
タグ提供ソフトウェア タグ情報を提供するソフトウェア名が表示されます。
4
フィールドの種類 ソフトウェアに適切なフィールドの種類が表示されます。
5
選択されたフィールドの種類に基づく利用可能な属性リストが表示されます。
たとえば、タグ名や数値のフォーマットです。
6
「Save Tag Parameters タグパラメータの保存 」 変更を保存します。変更が保存
されていない場合、変更の保存を促すメッセージが表示されます。
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203 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
2. 表 7-21の手順を使用します。
3. 変更した後は、タグパラメータの保存をクリックしてください。
ヒント 必須情報は、フィールド左側の点滅している赤いエクスクラメーションマークで
示されます。
表 7-21 Reporter機能
この作業を行うに ..この作業を行う
は...
フィールドタイプ タグ内部をクリックして、新しいフィールドタイプを選択してから、
を変更します。 属性を選択します。
フィールドタイプ タブの内側をクリックして、必要に応じて属性を変更します。
の属性を変更しま
す。
タグを追加しま
す。
新しいタグの追加アイコンをクリックし、フィールドタイプを選択し
て、属性を選択します。
画像タグを追加し 画像タグの追加アイコンをクリックし、属性を選択します。
ます。
タグの開始・終了 内容エリアの表示アイコンをクリックします。
を表示します。
文書監査ログを表 文書変更ログの表示アイコンをクリックします。
示します。
タグをコピーしま 新しい場所に選択したタグを貼り付け、フィールドタイプの属性を更
す。
新します。
属性はコピーされないため、選択しなければなりません。
タグ間で移動しま 左右の矢印キーを使って、タグ間を移動します。
す。
タグを消去しま
す。
次のいずれかを実行します。
• カーソルがタグの左側にある場合は、Deleteを押します。
• カーソルがタグの右側にある場合は、Backspaceを押します。
Reporterテンプレート
カスタムのレポートテンプレートは、ユーザーの責任において検証してください。
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204 の 240
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取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-22 Reporterテンプレートの説明
テンプレート
説明
All Peaks Qual
各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情報、分析
物結果表、および全分析物と内部標準が重なったクロマト
ログラムで構成されたセクションが表示されます。分析物
結果表は、結果表で表示されているように印刷されます。
定性分析の信頼信号灯は、すべて表の先頭に示されます。
Analyte Summary
各分析物について、サンプル要約表のセクションが表示さ
れるレポートです。
Calibration Curves
ファイル情報、統計表 標準 、分析物のキャリブレーション
カーブが表示されるレポートで、分析物ごとに1ページで構
成されています。
Metric Plot
各分析物について、ファイル情報と分析物のピーク面積の
メトリックプロットで構成されたセクションが表示される
安定したレポートです。
Per Sample Quant-Qual
選択した各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情
報、および選択した分析物の分析物結果表で構成されたセ
クションが表示されます。分析物結果表は、結果表で表示
されているように印刷されます。定性分析の信頼信号灯は、
すべて表の先頭に示されます。
Per Sample Quant-Qual Visible Rows 選択した各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情
Using Visible Analyte
報、および選択した分析物の分析物結果表で構成されたセ
クションが表示されます。分析物結果表は、結果表で表示
されているように印刷されます。定性分析の信頼信号灯は、
すべて表の先頭に示されます。
Per Analyte Quant-Qual
各分析物について、ファイル情報、結果表、キャリブレー
ションカーブ、および内部標準と各分析物のクロマトグラ
ムで構成されたセクションが表示されます。このテンプレー
トは、グループが定義された結果表に適しています。
Per Sample Report
各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情報、分析
物結果表、各分析物のキャリブレーションカーブ、および
内部標準と各分析物のクロマトグラムで構成されたセクショ
ンが表示されます。このテンプレートは、グループが定義
された結果表に適しています。
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205 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
表 7-22 Reporterテンプレートの説明 (続き)
テンプレート
説明
Positive Hits Qual
選択した各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情
報、選択した分析物の分析物結果表、すべての分析物、内
部標準、XICが重なったクロマトログラム、取得/理論的MSス
ペクトル、選択した各分析物の取得/ライブラリMS/MSスペ
クトルで構成されたセクションが表示されます。分析物結
果表は、結果表で表示されているように印刷されます。定
性分析の信頼信号灯は、すべて表の先頭に示されます。
Qual CSV Report
各サンプルについて、ファイル情報、サンプル情報、およ
び分析物結果表で構成されたセクションが表示される.csv
フォーマットのレポートです。
Sample Summary
各サンプルについて、分析物要約表のセクションが表示さ
れるレポートです。このレポートテンプレートは、グルー
プを持つ結果表に適しています。
MS Tune (MSチューン)
.datファイルは、機器データが保存される際にソフトウェアによって作成されます。 このファ
イルを使用して、以前のパラメータ状態を復元します。 .datバックアップファイルは、ファ
イルがバックアップされた時刻ではなく、ファイルが作成された時刻を使用して名前が付け
られます。
注 機器の最適化は、ESIプローブのみ。
MSチューン手順をロードするたびに、質量分析装置のパラメータがバックアップされます。
クイック状態チェックの実行
TOF MSモードおよびMS/MSモードで質量の精度と解像度を迅速に確認する場合は、ここで説
明する手順に従います。質量精度が仕様を満たしていない場合は、各ステップを繰り返して
システムをキャリブレーションできます。解像度が仕様を満たしていない場合は、TOFチュー
ニング手順を実行してシステムを最適化できます。
ヒント この手順は、状態パネルで「MS Check MSチェック 」をクリックして評価できま
す。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
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206 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Positive Quick Status Check ポ
ジティブクイック状態チェック 」または「Negative Quick Status Check ネガティブク
イック状態チェック 」を選択します。
3. 状態パネルのCDS電源アイコン
をダブルクリックして、CDSの動作をオンにします。
4. 適切なチャネル 1または2 を選択して「Start 開始 」をクリックし、ウィンドウを閉じま
す。
5. CDSが平衡化するように、少なくとも1分間待機します。
6. 「Automatic 自動 」または「Manual 手動 」を選択します。
デフォルトは「Automatic 自動 」です。キャリブレーションが必要な場合は「Manual 手動 」
を選択します。
7. 「Next 次へ 」をクリックします。
8. 噴射が安定していることを確認します。
9. 各ステップについて、画面に表示される指示に従います。
10. キャリブレーションを実行した場合は、「Confirm 確認 」をクリックして確認目的の測
定を実行します。
11. オプション レポートを保存します。
12. 結果に問題がなければ、「Save Tuning Settings チューニング設定の保存 」をクリック
します。結果に問題がある場合は、以下のいずれかの操作を行います。
• 各ステップを繰り返します。
• TOF MSのチューニング手順を実行します。TOF MSのチューニング 該当ページ 209を参照
してください。
• 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを閉じて結果を破棄します。
• 「Restore Instrument Data 装置データの復元 」メニューから該当するバックアップ
ファイルを選択して、以前の設定を復元します。
検出器の最適化
システム感度が低い場合は、この手順に従って検出器の電圧が最適化されていることを確認
します。手順の実行中はソフトウェアが検出器の電圧を調整し、最適な感度を提供します。
最適化が完了したら、最適化された値を保存したり変更を破棄したりできます。
検出器は6ヶ月ごと、または清掃後に信号が弱くなる、あるいは失われる場合に最適化するこ
とをお勧めします。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Detector Optimization 検出器の
最適化 」を選択します。
3. 噴射が安定していることを確認します。
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207 の 240
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4. 「Next 次へ 」をクリックします。
5. 画面に表示される指示に従います。
6. 「Next 次へ 」をクリックします。
最適化レポートが表示されます。
7. オプション レポートを保存します。
8. 「Next 次へ 」をクリックします。
9. 「Save Settings 設定の保存 」をクリックします。
注 検出器が2650 V以上で最適化される場合は、sciex.com/request-supportでサポートに問い
合わせて検出器を交換してください。
Q1のチューニング
MS/MS実験では、フラグメンテーション用の前駆体イオンを選択する目的でQ1領域が使用さ
れます。Q1 Unitのチューニングによりピーク幅が最適化され、Q1質量がキャリブレーション
されます。Q1 Unitは、ユニット分解能での前駆体イオン選択ウィンドウの幅を表します。Q1
LowまたはOpenは、低分解能 広いウィンドウ またはオープン分解能 オープンウィンドウ で
の前駆体イオン選択ウィンドウの幅を表します。Q1 Unitをチューニングすると、Q1 Unitの値
に基づいてQ1 LowおよびOpenの設定が計算されます。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Positive Q1 Tuning ポジティブ
Q1チューニング 」または「Negative Q1 Tuning ネガティブQ1チューニング 」を選択し
ます。
3. 状態パネルのCDS電源アイコン
をダブルクリックして、CDSの動作をオンにします。
4. 適切なチャネル 1または2 を選択して「Start 開始 」をクリックし、ウィンドウを閉じま
す。
5. CDSが平衡化するように、少なくとも1分間待機します。
6. 噴射が安定していることを確認します。
7. 「Next 次へ 」をクリックします。
8. 各ステップについて、画面に表示される指示に従います。
9. オプション 「Edit Method メソッドの編集 」をクリックして、パラメータを調整しま
す。
10. キャリブレーションを実行した場合は、「Confirm 確認 」をクリックして確認目的の測
定を実行します。
11. 「Next 次へ 」をクリックします。
12. オプション レポートを保存します。
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208 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
13. 「Next 次へ 」をクリックします。
14. 「Save Settings 設定の保存 」をクリックします。
TOF MSのチューニング
TOF MSチューニング手順では、TOF MSおよびMS/MSモードでの分解能と感度に対応するパラ
メータを最適化します。最適化はチューニング前のシステム性能の確認から始まり、強度と
分解能を最大限に高めるための各種パラメータのランピングへと続きます。チャネルのアラ
イメントが完了するとシステムがキャリブレーションされ、システムの性能が特定されます。
性能が十分な場合は、システムにチューニング設定を保存することができます。また、設定
を破棄することもできます。
TOF MSのチューニングは、自動または手動モードで実行できます。手動モードでは、最適化
されたパラメータ値を選択したり、チューニングステップの最後で一時停止したりできます。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Positive TOF MS Tuning ポジティ
ブTOF MSチューニング 」または「Negative TOF MS Tuning ネガティブTOF MSチュー
ニング 」を選択します。
3. 状態パネルのCDS電源アイコン
をダブルクリックして、CDSの動作をオンにします。
4. 適切なチャネル 1または2 を選択して「Start 開始 」をクリックし、ウィンドウを閉じま
す。
5. CDSが平衡化するように、少なくとも1分間待機します。
6. 噴射が安定していることを確認します。
7. 「Next 次へ 」をクリックします。
8. 各ステップについて、画面に表示される指示に従います。
9. 「Next 次へ 」をクリックします。
10. オプション レポートを保存します。
11. 結果に問題がなければ、「Save Settings 設定の保存 」をクリックします。結果に問題が
ある場合は、以下のいずれかの操作を行います。
• 各ステップを繰り返します。
• 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを閉じて結果を破棄します。
• 「Restore Instrument Data 装置データの復元 」メニューから該当するバックアップ
ファイルを選択して、以前の設定を復元します。
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209 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
• sciex.com/request-supportに問い合わせます。
Q1 Highのチューニング
MS/MS実験では、フラグメンテーション用の前駆体イオンを選択する目的でQ1領域が使用さ
れます。Q1 Highのチューニングによりピーク幅が最適化され、Q1質量がキャリブレーション
されます。Q1 Highは、高分解能での前駆体イオン選択ウィンドウの幅を表します。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Positive Q1 High Tuning ポジ
ティブQ1 Highチューニング 」または「Negative Q1 High Tuning ネガティブQ1 High
チューニング 」を選択します。
注 ポジティブQ1 Highの手順が一定時間実行されていない場合は「Copy コピー 」をク
リックし、ポジティブQ1 Unitの設定を出発点として使用します。
3. 状態パネルのCDS電源アイコン
をダブルクリックして、CDSの動作をオンにします。
4. 適切なチャネル 1または2 を選択して「Start 開始 」をクリックし、ウィンドウを閉じま
す。
5. CDSが平衡化するように、少なくとも1分間待機します。
6. 噴射が安定していることを確認します。
7. 「Next 次へ 」をクリックします。
8. 各ステップについて、画面に表示される指示に従います。
9. オプション 「Edit Method メソッドの編集 」をクリックして、パラメータを調整しま
す。
10. キャリブレーションを実行した場合は、「Confirm 確認 」をクリックして確認目的の測
定を実行します。
11. 「Next 次へ 」をクリックします。
12. オプション レポートを保存します。
13. 「Next 次へ 」をクリックします。
14. 「Save Settings 設定の保存 」をクリックします。
高度なトラブルシューティングの実行
チューニング手順の結果に問題がある場合は、ここで説明する高度なトラブルシューティン
グ手順を使用して、質量分析装置に関連するパラメータを最適化します。また、測定中にTDC
チャネルの統計情報とスペクトルを表示することもできます。
SCIEX X500 QTOFシステム
210 の 240
システムユーザーガイド
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取扱説明書 – ソフトウェア
ヒント 「Live Method ライブメソッド 」ウィンドウを使用して、チューニング実行後の最適
化されたパラメータを表示することもできます。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Tuning Procedures チューニング手順 」リストから「Advanced Troubleshooting 高
度なトラブルシューティング 」を選択します。
3. スキャンの種類を選択します。
4. 必要に応じて「Edit Method メソッドの編集 」をクリックし、「Live Method ライブメソッ
ド 」ウィンドウでパラメータを編集します。
5. 「Start/Restart Method メソッドの開始/再開 」をクリックします。
6. データを確認し、必要に応じてパラメータを調整します。
7. 「Stop 停止 」をクリックし、必要に応じて検出器のパラメータまたはTOF MSのパラメー
タを保存します。
装置データの復元
各チューニング手順の最後にユーザーがチューニング設定を保存すると、ソフトウェアによ
り装置データファイル .dat のコピーが生成され、現在の.datファイルが更新されます。以前に
保存した設定は、「Restore Instrument Data 装置データの復元 」機能を使用して復元でき
ます。
各チューニング手順を実行すると、最適化された結果を追跡するためにレポートとデータファ
イルが生成されます。.wiff2データファイルおよびレポートは、D:\SCIEX OS Data\Optimizationに
あります。
1. 「MS Tune MSチューン 」ワークスペースを開きます。
2. 「Restore Instrument Data 装置データの復元 」リストから、データファイルを選択しま
す。
図 7-63 「Instrument Tuning and Optimization 装置チューニングおよび最適化 」ダイ
アログ
3. オプション 「View Report レポートの表示 」をクリックします。
4. 「Yes はい 」をクリックします。
システムユーザーガイド
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211 の 240
取扱説明書 – ソフトウェア
Event Log (イベントログ) ワークスペース
ログを表示
1. イベントログワークスペースを開きます。
2. 左側にパネルから項目をクリックして、ログを表示します。
ログの印刷
1. Event Log (イベントログ) ワークスペースを開きます。
2. (オプション) アーカイブされたログを開きます。
3. Print (印刷) をクリックします。
ログをアーカイブ
1. Event Log (イベントログ) ワークスペースを開きます。
2. Archive (アーカイブ) > Archive Log (ログをアーカイブ) をクリックします。
図 7-64 Archive (アーカイブ) > Archive Log (ログをアーカイブ)
アーカイブログダイアログが開きます。
図 7-65 「ログをアーカイブ」ダイアログ
3. 以下以前のイベントログ項目をアーカイブフィールドで、日付アイコンをクリックして日
付を選択します。
4. アーカイブをクリックします。
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212 の 240
システムユーザーガイド
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サービスおよびメンテナンス情報
8
を参照してください。
トラブルシューティング情報をサポートに送信することができます。サポートパッケージの
生成 該当ページ 229を参照してください。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 クリーニングやメンテナン
ス前に、汚染除去が必要かどうかを判断します。 放射性物質、生物学的病原
体、または有害化学物質が質量分析装置に使用された場合、お客様はクリー
ニングまたはメンテナンス前にシステムに対して汚染除去を行う必要があり
ます。
推奨されるメンテナンススケジュール
パフォーマンスを最適化するために、システムの定期クリーニングおよびメンテナンスを行っ
てください。
表 8-1は、システムのクリーニングとメンテナンスの推奨されるスケジュールを示したもので
す。
ヒント 定期的にメンテナンス作業を実行し、質量分析装置が最適に機能していることを確
認してください。
イオンソースの維持に関する情報については、イオンソース オペレータガイドを参照してく
ださい。
消耗部品を注文するには、資格のあるメンテナンス技術者 QMP にお問い合わせください。
メンテナンスサービスおよびサポートに関しては、SCIEXフィールドサービス担当者 FSE にお
問い合わせください。
表 8-1 メンテナンスタスク
部品
周波数
タスク
詳細な情報については…
毎日
漏れがないかど 化学的注意事項 該当ページ 11
うかを点検しま を参照してください。
す。
質量分析装置
システム
システムユーザーガイド
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213 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
表 8-1 メンテナンスタスク (続き)
部品
タスク
詳細な情報については…
カーテンプレー 毎日
ト
クリーニング
カーテンプレートのクリーニン
グ 該当ページ 219を参照してく
ださい。
オリフィスプ 毎日
レート フロン
ト
クリーニング
オリフィスプレートの前面を洗
浄 該当ページ 220を参照してく
ださい。
粗引きポンプオ 3年ごと
イル
交換
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
オリフィスプ
レート 前面お
よび背面
必要に応じて
クリーニング
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
必要に応じて
クリーニング
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
Q0ロッドセッ 必要に応じて
トおよびIQ1レ
ンズ
クリーニング
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
機器の表面
必要に応じて
クリーニング
表面のクリーニング 該当ページ
215を参照してください。
CDSボトル
必要に応じて
交換または再充 CDSボトルの交換 該当ページ 45
填
を参照してください。
CDS流量モ
ジュール
必要に応じて
交換
チェックバルブおよび流量モ
ジュールの交換 該当ページ 223
を参照してください。
ドレインボトル 必要に応じて
空
イオン源排気ドレインボトルを
空にする 該当ページ 221を参照
してください。
粗引きポンプオ 必要に応じて
イル
チェック
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
検査と交換
イオン源オペレータガイドを参
照してください。
®
QJet イオンガ
イド
周波数
イオン源
ESIおよびAPCI電 必要に応じて
極
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システムユーザーガイド
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サービスおよびメンテナンス情報
表 8-1 メンテナンスタスク (続き)
部品
周波数
タスク
詳細な情報については…
コロナ放電針
必要に応じて
交換
イオン源オペレータガイドを参
照してください。
ターボヒーター 必要に応じて
交換
お近くのメンテナンス技術者ま
たはFSEにお問い合わせくださ
い。
サンプルチュー 必要に応じて
ブ
交換
イオン源オペレータガイドを参
照してください。
「適宜」作業については、次のガイドラインに従ってください。
®
• QJet イオンガイドとQ0領域をクリーニングしてください。
ヒント 四重極とレンズへの充電の影響 短時間で対象イオン感度が大幅に損失 を最小限
に抑えるために、定期的にQ0領域のクリーニングを行ってください。 メンテナンス技術
者またはFSEにお問い合わせください。
• こぼれた後、または汚れた際に、質量分析装置の表面を清掃してください。
• 一杯になる前にドレインボトルを空にします。
表面のクリーニング
溶液がこぼれたり、または汚れた場合には、質量分析装置の外面をクリーニングします。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 推奨されているクリーニング方法および
材料のみを使用して、装置を損傷から守ります。
1. 温かい石鹸水で湿らせた柔らかい布で外面を拭きます。
2. 石鹸の残留物を除去するため、水で湿らせた柔らかい布で外面を拭きます。
フロントエンドのクリーニング
以下の警告は、本セクションの手順すべてに適用されます。
警告 熱くなった表面の危険性。 メンテナンス手順を開始する前に、イオン源を少
TM
なくとも90分そのままにして熱を下げるか IonDrive Turbo Vイオン源の場合 、あ
るいは30分そのままにして熱を下げます。 他のイオン源の場合 。 操作中、イオン
源の表面と真空インターフェースコンポーネントが熱くなります。
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215 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
定期のクリーニングメソッドを使用し、質量分析装置のフロントエンドをクリーニングしま
す。
• システムの予期せぬ故障を軽減します。
• 最適感度を維持するようにしてください。
• サービス人員の訪問が必要となるような大規模クリーニングはできるだけ避けてくださ
い。
汚染が発生した場合は、初期の定期クリーニングを行ってください。 オリフィスプレートの
前面も忘れずにクリーニングしてください。 定期クリーニングを行っても感度の問題が解決
しない場合は、フルクリーニングが必要です。 お近くのメンテナンス技術者またはFSEにお
問い合わせください。
このセクションでは、真空部を傷つけない定期クリーニング、。
注 お住まいの地域で適用される条例に従ってください。健康および安全のガイドライン
は、化学的注意事項 該当ページ 11を参照してください。
汚染の兆候
以下のいずれかが観察された場合、システムは汚染されているおそれがあります。
• 感度の著しい低下
• バックグラウンドノイズの増加
• サンプルの一部ではない別のピークは、フルスキャンまたは調査スキャンメソッドに表示
されます。
こうした問題が観察された場合、質量分析装置のフロントエンド部を洗浄してください。
必要な材料
注 米国のお客様は、877-740-2129までお電話での資料請求およびお問い合わせが可能です。
米国以外のお客様はsciex.com/contact-usをご覧ください。
• パウダーフリーグローブ ニトリル、あるいはネオプレンが推奨されます
• 保護メガネ
• 実験用白衣
• 高品質の純水 最低18 MΩの脱イオン水、または超高純度のHPLC用水 古い水には不純物が
含まれており、質量分析装置の汚染を進行させる可能性があります。
• MS用メタノール、イソプロパノール 2-プロパノール 、アセトニトリル
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216 の 240
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サービスおよびメンテナンス情報
• 洗浄液 以下のうちひとつを使用してください。
• 100%メタノール
• 100%イソプロパノール
• 1:1比のアセトニトリル 水の溶液 新規調整すること
• 1:1比のアセトニトリル 水に0.1%酢酸を加えた溶液 新規調整すること
• 洗浄液を準備するために、1Lまたは500mLのグラスビーカーを洗浄します。
• 使用済の溶媒を入れるための1Lビーカー
• 有機廃棄物コンテナ
• 汚れのないふき取り布製造業者から入手可能なツールとサプライ該当ページ217を参照し
てください。
•
オプション ポリエステル製綿棒
製造業者から入手可能なツールとサプライ
説明
部品番号
小型ポリスワブ 熱接着 クリーニングキットに同封
1017396
糸くずの出ない拭き取り布 11 cm x 21 cm、4.3 インチx 8.3 インチ クリー
ニングキットに同封
018027
最良の慣行
警告 有害化学物質の危険性。 化学製品の安全データシートを参照し、化学物質の
取り扱い、保管、処理についての全ての安全ガイドラインに従ってください。 安全
衛生対策は、化学的注意事項 該当ページ 11を参照してください。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 クリーニングやメンテナン
ス前に、汚染除去が必要かどうかを判断します。 放射性物質、生物学的病原
体、または有害化学物質が質量分析装置に使用された場合、お客様はクリー
ニングまたはメンテナンス前にシステムに対して汚染除去を行う必要があり
ます。
警告 環境の危険性。 システムコンポーネントを一般廃棄物として処分しないでく
ださい。 コンポーネントを処分する際は、地域の規制に従います。
• クリーニングを行う際は、常に清潔なパウダーフリーグローブ ニトリル、あるいはネオ
プレンが推奨されます を着用してください。
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サービスおよびメンテナンス情報
• 質量分析装置部品のクリーニング後、再組立前に新しいグローブを着用してください。
• 本手順書で指定されるもの以外のクリーニング用品を使用しないでください。
• 可能な場合は、クリーニングの直前に洗浄液を準備してください。
• 全ての有機溶剤および有機含有溶剤は、非常に清潔なガラス製品にのみ、準備保管してく
ださい。 プラスチックボトルは決して使用しないでください。 汚染物質はこれらのボト
ルから浸出し、質量分析装置を汚染します。
• 洗浄液の汚染を避けるため、液は布またはモップに浸して使用してください。
• 布の中心部分のみが質量分析装置の表面に触れるようにしてください。 切れ端は、繊維
を残留させる可能性があります。
ヒント 熱結合されたポリモップの周りに布を巻きつけてください。
図 8-1 例 布の折り方
• 相互汚染を避けるために、布やモップは表面に一度でも触れたものは、廃棄してくださ
い。
• カーテンプレートなどの真空インタフェースのより大きい部分は、複数の布を使用して数
回のクリーニングが必要なことがあります。
• 水または洗浄液を塗布する場合は、布またはモップをわずかに湿らせる程度にしてくださ
い。 有機溶剤より頻繁に使用される水は、質量分析装置の残留物が残り、布を劣化させ
る可能性があります。
• 経口部を布でこすらないでください。 経口部から拭き取り布が質量分析装置に入らない
ように傾向部の周辺を拭いてください。
• カーテンプレートまたはオリフィスプレートの経口部にブラシを挿入しないでください。
質量分析装置の準備
1. デバイスを無効化します。 デバイスを無効にする 該当ページ 50を参照してください。
2. イオンソースを除去します。 イオンソースオペレータガイドを参照してください。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 イオン源を取り外す際、イオン源排
出管に何も落とさないでください。
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218 の 240
システムユーザーガイド
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サービスおよびメンテナンス情報
イオンソースを使用しない場合には、保管して破損から保護し、操作の完全性を維持して
ください。
図 8-2 真空インタフェースのソースドレイン
カーテンプレートのクリーニング
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 カーテンプレートやオリフィスプレート
をアパチャチップに載せないでください。 カーテンプレートの円錐側が上になっているか
を確認します。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 ワイヤやメタルブラシをカーテンプレー
ト、オリフィスプレート、またはインターフェースヒーター のアパチャに挿入して、アパ
チャに損傷を与えないでください。
1. 真空インタフェースからカーテンプレートを取り外し、円錐形の方を清潔で安定した面に
置いてください。
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219 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
図 8-3 カーテンプレートの取り外し
カーテンプレートはオリフィスプレートに設置された3つの留めボールキャッチに固定さ
れています。
2. 糸くずのない布を純水に浸し、カーテンプレートの両側を拭いてください。
注 必要であれば、複数の布を使用してください。
3. 洗浄液を使用して、手順 2を繰り返してください。
4. 水に浸した布と小型の綿棒を使用して、隙間を洗浄してください。
5. カーテンプレートが乾燥するまでお待ちください。
6. カーテンプレートに溶剤や糸くずの付着がないかを確認し、残留物がある場合、清潔で軽
く濡らした糸くずのない布で拭いてください。
注 しつこい染みやほこりや水などの薄い膜が、溶媒が汚染されているサインとなりま
す。
オリフィスプレートの前面を洗浄
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの オリフィスプレートの表面をクリーニン
グするときに、インターフェースヒーターを取り外さないでください。 インターフェース
ヒーターを頻繁に取り外すと、損傷の原因となる可能性があります。 定期クリーニングの
際に、インタフェースヒーター表面の清掃を行ってください。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 ワイヤやメタルブラシをカーテンプレー
ト、オリフィスプレート、またはインターフェースヒーター のアパチャに挿入して、アパ
チャに損傷を与えないでください。
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220 の 240
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1. 糸くずのない布を水に浸し、インタフェースヒーターを含むオリフィスプレートの前面を
拭いてください。
2. 洗浄液を使用して、前の手順を繰り返してください。
3. オリフィスプレートが乾燥するまでお待ちください。
4. オリフィスプレートに溶剤や糸くずの付着がないかを確認し、残留物がある場合、清潔で
軽く濡らした糸くずのない布で拭いてください。
注 しつこい染みやほこりや水などの薄い膜が、溶媒が汚染されているサインとなりま
す。
質量分析装置の運転を再開
1. 質量分析装置にカーテンプレートを設置してください。
2. イオン源を質量分析装置にインストールします。
ソースラッチをロッキングポジションまでねじこみ、イオンソースをしっかり閉めるよう
心がけてください。イオンソースオペレータガイドを参照してください。
3. ClearCoreMDソフトウェアのステータスパネルでSCIEX OSソフトウェアを使用します。
イオン源排気ドレインボトルを空にする
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 有害物質は、適切にラベル
を貼った廃棄物容器に入れて処分し、その際は現地規制に従い処分してくだ
さい。
警告 放射線障害、生物学的危害、化学的危害。 排気ガスを専用の実験室用
ドラフトチャンバーまたは排気システムで通気するよう注意して、換気チュー
ブがクランプで固定されていることを確認します。
イオン源排気ドレインボトルは定期的に確認し、満杯になる前に空にします。また、ボトル
とその継手に漏れがないか点検し、必要に応じて接続部を締め付けるかコンポーネントを交
換します。ボトルを空にするには、この手順のステップに従います。
1. イオンソースを除去します。 イオン源オペレータガイドを参照してください。
2. ホースをイオン源排気ドレインボトルのキャップに取り付けているクランプをゆるめま
す。
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221 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
3. キャップからホースを外します。
4. 必要に応じてドレインボトルをホルダーから取り出します。
5. ドレインボトルからキャップを取り外します。
6. ドレインボトルを空にし、実験室の手順と現地の廃棄規制に従って不用品を廃棄します。
7. ボトルにキャップを取り付け、ホルダーにボトルを取り付けます。
8. ホースをキャップにクランプでしっかりと取り付けます。
図 8-4 イオン源排気ドレインボトル
項目
説明
1
換気口への接続
2
イオン源排気ドレインチューブ 内径 i.d. 2.5 cm 1.インチ
3
粗引きポンプ排出ホース i.d 3.2 cm 1.25インチ
4
イオン源排気ドレインボトル
5
質量分析装置への接続 内径 i.d. 1.6 cm 0.625インチ
6
粗引きポンプ真空インレットホース
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222 の 240
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サービスおよびメンテナンス情報
注 排気ボトル、質量分析装置、検査室通気口の箇所のイオン源排気ホースの接続部は、
ホースクランプで固定されています。
チェックバルブおよび流量モジュールの交換
警告 有害化学物質の危険性。 化学製品の安全データシートを参照し、化学物質の
取り扱い、保管、処理についての全ての安全ガイドラインに従ってください。 安全
衛生対策は、化学的注意事項 該当ページ 11を参照してください。
チェックバルブは、CDSがオフのときに、キャリブラントがイオン源に流れないようにする
役割を持ちます。流量モジュールは長さ10 cmの黒いチューブで、寸法が重要な意味を持ちま
す。これにより、イオン源へのキャリブラントの流量を制御します。
図 8-5 チェックバルブおよび流量モジュール
項目
説明
1
CDSへ
2
チェックバルブ
3
流量モジュール
4
イオン源へ
必要な材料
• 1/4インチのレンチ
1. チェックバルブを取り外すには、チェックバルブの両側にある指で締め付けたPEEK接続器
をゆるめます。
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223 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
注 チェックバルブを取り付ける際は、チェックバルブの矢印がイオン源を向いているこ
とを確認してください。
2. 流量モジュールを取り外すには、以下のステップを実行します。
a. イオン源プローブからサンプル通路を取り外します。
b. 流量モジュールをチェックバルブに接続している指で締め付けたPEEK接続器をゆるめ
ます。
c. 1/4インチのレンチを使用して、流量バルブをプローブに接続している接続器を取り外
します。
の保管および取扱
警告 環境の危険性。 システムコンポーネントを一般廃棄物として処分しないでく
ださい。 コンポーネントを処分する際は、地域の規制に従います。
質量分析装置の長期保管および出荷準備が必要な場合は、SCIEX FSEに停止 保管情報をお問い
合わせください。 質量分析装置から電源を外す際は、AC主電源から主電源コネクタを取り外
してください。
注 システムは、-30 °C +60 °C -22 °F 140 °F で搬送および保管されなければなりません。シス
テムは、海抜1828 m 6000フィート 以下の高度で保管してください。
質量分析装置の移動
警告 吊り上げ時の危険性。質量分析装置を吊り上げるためには、少なくとも9人で
作業するようにします。 認定を受けた安全吊り上げ手順に従います。 システムコン
ポーネントの重量については、『設置計画概要書』を参照してください。
警告 吊り上げ時の危険性。 粗引きポンプを吊り上げるためには、少なくとも2人で
作業するようにします。 認定を受けた安全吊り上げ手順に従います。
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224 の 240
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サービスおよびメンテナンス情報
警告 熱くなった表面の危険性。 やけどに注意してください。 操作中、質量分析装
置の表面が熱くなります。
必要条件
• すべてのガスの流れを止め、ガス通路の圧力を下げます。
必要な材料
• リフティングキット
1. 質量分析装置から、真空ホース、ガスチューブ、イオン源排気チューブ、電源ケーブル、
イーサネットケーブル、TDCケーブルの接続を外します。
2. 左右のスカートを取り外します。
3. 質量分析装置の右前面で、リフティングバーを固定しているロックピンを引き抜きます。
次にバーの穴がチューブの穴と揃うようにバーを引き出し、ロックピンを使ってバーを固
定します。
図 8-6 リフティングバーを縮めた状態
図 8-7 リフティングバーを伸ばした状態
4. 質量分析装置の右背面、左前面、左背面についてもステップ 3の作業を行います。
5. 各リフティングバーにショートブロックを取り付け、ロックピンで固定します。
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225 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
図 8-8 ショートブロックの取り付け
6. 質量分析装置の右側で、各ブロックにロングロッドを通します。
注 ブロックから突き出しているバーの長さが長いほうの端部が、質量分析装置の前面に
来るようにしなければなりません。
7. 質量分析装置の左側についてもステップ 6の作業を行います。
8. ロングロッドにロックピンを取り付けます。
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226 の 240
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サービスおよびメンテナンス情報
図 8-9 ロングロッドへのロックピンの取り付け
9. ロングロッドの端部にトールブロックを取り付け、2本のロックピンで固定します。
図 8-10 トールブロックの取り付け
10. 質量分析装置の前面で、各トールブロックにショートロッドを通します。
11. ショートロッドを2本のロックピンで固定します。
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227 の 240
サービスおよびメンテナンス情報
図 8-11 ショートロッドへのロックピンの取り付け
図 8-12 リフティングキットを取り付けた状態
12. 自分以外の8名に協力してもらい、質量分析装置を別の場所に移動します。
13. 自分以外の1名に協力してもらい、粗引きポンプを別の場所に移動します。
14. 左右のスカートを取り付けます。
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228 の 240
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サービスおよびメンテナンス情報
15. 真空ホース、ガスチューブ、イオン源排気チューブ、電源ケーブル、イーサネットケーブ
ル、TDCケーブルを質量分析装置に接続します。
注意 システムに障害を与える可能性のあるもの。 真空ホースのクランプが、質量分析
装置の側面を超えて突き出さない向きになっていることを確認します。向きが正しくな
い場合、質量分析装置の保守のためにドレスパネルを開けたときに、ドレスパネルが破
損するおそれがあります。
図 8-13 誤った取り付け方のクランプ
サポートパッケージの生成
1. 「Configuration 構成 」ワークスペースを開きます。
2. 左側のパネルの「About バージョン情報 」をクリックします。
3. 「Service and Support サービスとサポート 」で、「Generate a Support Package サポー
トパッケージの生成 」をクリックします。
圧縮されたレポートがD:\ServicePackagesフォルダに保存されます。
4. 圧縮ファイルをサポートに送信してください。
システムユーザーガイド
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229 の 240
質量分析装置のトラブルシュー
ティング
9
この章には、システム問題のトラブルシューティングのための情報が含まれています。特定
の作業は、研究所のSCIEXの訓練を受けた資格のあるメンテナンス技術者 QMP のみが行うこ
とができます。トラブルシューティングの詳細については、フィールドサービスエンジニア
FSE にお問い合わせください。
表 9-1 システム問題
兆候
原因
是正措置
感度が減少しています。
質量分析装置またはイオン源 質量分析装置を最適化しま
は、チューニングまたは最適 す。
化が必要です。
カーテンプレートが汚れてい カーテンプレートのクリーニ
ます。
ング 該当ページ 219を参照し
てください。
オリフィスプレートが汚れて オリフィスプレートの前面を
います。
洗浄 該当ページ 220を参照し
てください。
®
QJet イオンガイド、Q0四重 お近くのメンテナンス技術者
極、またはIQ0レンズが汚れて またはFSEにお問い合わせくだ
います。
さい。
®
TM
QJet イオンガイドが極度に汚 Curtain Gas 流量が低すぎま
れているか、頻繁に汚れま
す。
す。
カーテンガスパラメータの設
定を確認し、適用可能な場
合、増加させます。
真空圧力が高すぎるために、 粗引きポンプのオイルレベル 粗引きポンプのオイルレベル
システムエラーが発生しまし が低すぎます。
を確認し、オイルを追加する
た。
にはお近くのメンテナンス技
術者またはFSEにお問い合わせ
ください。
液漏れがあります。
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230 の 240
点検して液漏れを直してくだ
さい。
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質量分析装置のトラブルシューティング
表 9-1 システム問題 (続き)
兆候
原因
是正措置
誤ったオリフィスプレートが 正しいオリフィスプレートを
設置されています。
設置してください。
キャリブラント信号が低く
なっています。
• CDSが接続されていませ
ん。
• CDSのチューブが詰まって
います。
• CDSの接続を確認します。
• キャリブラントチューブの
詰まりを点検します。
販売、技術サポートまたはサービスについては、FSEにお問い合わせいただくか、SCIEXのホー
ムページ sciex.com のお問合せ情報を参照してください。
システムユーザーガイド
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SCIEX X500 QTOFシステム
231 の 240
A
推奨キャリブレーションイオン
以下の表は、SCIEX X500 QTOFシステムのキャリブレーション用にSCIEXが推奨している標準を
示しています。
表 A-1 キャリブレーション溶媒
部番
説明
数量
5042914
SCIEX X500システムのAPCIポジティブキャリブレーショ
ン溶媒
100 mL
5042918
SCIEX X500システムのAPCIポジティブキャリブレーショ
ン溶媒 5パック
5 × 100 mL
5042915
SCIEX X500システムのAPCIネガティブキャリブレーショ
ン溶媒
100 mL
5042919
SCIEX X500システムのAPCIネガティブキャリブレーショ
ン溶媒 5パック
5 × 100 mL
5042912
SCIEX X500システムのESIポジティブキャリブレーショ
ン溶媒
100 mL
5042916
SCIEX X500システムのESIポジティブキャリブレーショ
ン溶媒 5パック
5 × 100 mL
5042913
SCIEX X500システムのESIネガティブキャリブレーショ
ン溶媒
100 mL
5042917
SCIEX X500システムのESIネガティブキャリブレーショ
ン溶媒 5パック
5 × 100 mL
APCIキャリブレーションイオン
表 A-2 TOF MSポジティブキャリブレーションイオン
質量
146.1176
266.1598
315.1623
609.2807
618.3695
922.0098
SCIEX X500 QTOFシステム
232 の 240
354.2122
442.2647
1521.9715
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
推奨キャリブレーションイオン
表 A-3 TOF MSネガティブキャリブレーションイオン
質量
144.1030
264.1453
277.0983
352.1977
403.1122
440.2501
616.3550
792.4598
表 A-4 TOF MS/MSポジティブプロダクトイオン
プレカーサーイオン m/z
315.1623
609.2807
デクラスタリングポテンショ
ナル V
80
80
衝突エネルギー V
27
45
フラグメントイオン1
315.1623
609.2807
フラグメントイオン2
270.1044
577.2544
フラグメントイオン3
242.0731
448.1966
フラグメントイオン4
235.1356
397.2122
フラグメントイオン5
227.0496
365.1860
フラグメントイオン6
220.1121
236.1281
フラグメントイオン7
86.0964
195.0652
フラグメントイオン8
58.0651
174.0913
表 A-5 TOF MS/MSネガティブプロダクトイオン
プレカーサーイオン m/z
277.0983
403.1122
デクラスタリングポテンショ
ナル V
–80
–80
衝突エネルギー V
–30
–30
フラグメントイオン1
277.0983
403.1122
フラグメントイオン2
249.1033
277.0983
フラグメントイオン3
217.0771
158.0611
フラグメントイオン4
200.0591
125.0067
フラグメントイオン5
158.0611
93.0344
フラグメントイオン6
130.0662
該当なし
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
SCIEX X500 QTOFシステム
233 の 240
推奨キャリブレーションイオン
表 A-5 TOF MS/MSネガティブプロダクトイオン (続き)
プレカーサーイオン m/z
277.0983
403.1122
フラグメントイオン7
116.0506
該当なし
フラグメントイオン8
77.0397
該当なし
ESIキャリブレーションイオン
表 A-6 TOF MSポジティブキャリブレーションイオン
質量
132.9049
266.1598
315.1623
354.2122
442.2647
609.2807
829.5393
922.0098
1053.9074
1521.9715
1643.8691
2121.9332
2130.2449
2253.8308
表 A-7 TOF MSネガティブキャリブレーションイオン
質量
68.9958
112.9856
154.9738
204.9706
248.9604
384.9352
520.9100
656.8848
792.8596
928.8344
1064.8092
1200.7841
1336.7589
1472.7337
1608.7085
1744.6833
1565.9624
1633.9498
1880.6581
2165.9241
2233.9115
表 A-8 TOF MS/MSポジティブプロダクトイオン
プレカーサーイオン
m/z
315.1623
609.2807
829.5393
デクラスタリングポテ
ンショナル V
80
80
80
衝突エネルギー V
25
45
45
フラグメントイオン1
315.162
609.281
829.539
フラグメントイオン2
270.104
577.254
811.529
フラグメントイオン3
242.073
448.197
724.497
フラグメントイオン4
235.136
397.212
706.486
フラグメントイオン5
227.05
365.186
607.418
フラグメントイオン6
220.112
236.128
532.334
SCIEX X500 QTOFシステム
234 の 240
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
推奨キャリブレーションイオン
表 A-8 TOF MS/MSポジティブプロダクトイオン (続き)
プレカーサーイオン
m/z
315.1623
609.2807
829.5393
フラグメントイオン7
86.0964
195.065
512.344
フラグメントイオン8
58.0651
174.091
494.334
411.297
399.26
381.25
298.213
268.166
227.175
215.139
185.129
157.134
表 A-9 TOF MS/MSネガティブプロダクトイオン
プレカーサー
イオン m/z
248.9
384.9
520.9
792.8
1200.784
デクラスタリ
ングポテン
ショナル V
80
80
80
80
80
衝突エネル
ギー V
15
16
20
22
30
フラグメント
イオン1
248.9604
384.9352
520.91
792.8596
1200.784
フラグメント
イオン2
204.9706
248.9604
384.9352
656.8848
1064.809
フラグメント
イオン3
154.9738
204.9706
248.9604
520.91
928.8344
フラグメント
イオン4
112.9856
154.9738
204.9706
384.9352
792.8596
フラグメント
イオン5
68.99576
112.9856
154.9738
248.9604
656.8848
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
SCIEX X500 QTOFシステム
235 の 240
推奨キャリブレーションイオン
表 A-9 TOF MS/MSネガティブプロダクトイオン (続き)
プレカーサー
イオン m/z
248.9
384.9
520.9
792.8
1200.784
フラグメント
イオン6
該当なし
該当なし
112.9856
204.9706
520.9100
フラグメント
イオン7
該当なし
該当なし
該当なし
154.9738
384.9352
フラグメント
イオン8
該当なし
該当なし
該当なし
112.9856
248.9604
該当なし
該当なし
該当なし
204.9706
該当なし
該当なし
該当なし
154.9738
SCIEX X500 QTOFシステム
236 の 240
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
B
正確な質量および化学式
レセルピン
レセルピン(C33H40N2O9)
表 B-1 レセルピンの正確な質量
説明
質量
分子イオン C33H41N2O9
609.28066
フラグメント C23H30NO8
448.19659
フラグメント C23H29N2O4
397.21218
フラグメント C22H25N2O3
365.18597
フラグメント C13H18NO3
236.12812
フラグメント C10H11O4
195.06519
フラグメント C11H12NO
174.09134
システムユーザーガイド
RUO-IDV-05-2334-JA-A
SCIEX X500 QTOFシステム
237 の 240
改訂履歴
改訂
変更の理由
日付
A
文書の初版
2016年2月
SCIEX X500 QTOFシステム
238 の 240
システムユーザーガイド
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インデックス
Invert Second Overlay 2番目のオーバーレイを反
転 136
クリーニング 最善の方法 217
クリーニング 必要物 216
クリーニング 表面 215
クリーニング 理由 216
L
し
LCメソッド
作成 112
LED、説明 27
システム 質量分析装置
システム サービスを再開 221
システム メンテナンス要員要件 16
システム 使用と変更 16
システム 製造業者に返却 15
システム 表面のクリーニング 215
システムの変更 16
I
Q
Q0およびIQ1レンズ
メンテナンスの頻度 214
Q0領域 クリーニング 215
QJetイオンガイドおよびIQ0レンズ
メンテナンスの頻度 214
あ
アイコン 状態パネル 74
す
スイッチ、粗引きポンプ、位置 40
た
い
ダイバーターバルブ
位置 25
ダイバーターバルブ 配列 42
イオン源排気 ドレインボトル、排出 221
イオン源排気ドレイン メンテナンスの頻度
214
て
お
オリフィスプレート クリーニング 221
き
キャリブラントボトル
位置 25
く
クリーニング オリフィスプレート前面 221
クリーニング カーテンプレート 219
クリーニング フロントエンド 216
システムユーザーガイド
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テクニカルサポート 要件
デバイス
無効化 50
と
ドレインボトル 排出 221
は
バッファ、リスト 12
パネルシンボル、説明 27
パラメータ
復元 211
SCIEX X500 QTOFシステム
239 の 240
インデックス
ふ
プレカーサーイオン質量分析 29
プロダクトイオン質量分析 29
め
メンテナンス およびパフォーマンス 213
メンテナンス クリーニングのスケジュール
213
メンテナンス 説明されているタスク 213
メンテナンス 要員要件 16
SCIEX X500 QTOFシステム
240 の 240
システムユーザーガイド
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Office365 ProPlusを利用する

写真の必要な部分だけを切り抜くマル秘テク 文書に写真を挿入する際

パワーポイントコンバータの操作方法

インターネットでのお買い物方法 (2010/07/07 改)

録音レベルの調整方法（WindowsXPをお使いの方）

SSID ステルス設定が有効な場合の接続方法（Mac OS 10.7/10.8 の場合）

傾いた写真の修正

画面が正しく表示されない場合

設定マニュアル〜セキュリティサービス編