イルミナ次世代テクノロジーセミナー5 都市で開催！ ■ お知らせ 「さらに進化する次世代シーケンサー：高性能化と汎用化の時代へ」 次回配信予定： 2010.06.30 急速にテクノロジーが進歩する次世代シーケンサー。スループットの向上だけではなく、使 GA関連論文 いやすさも自動化がさらに進み、高性能化と汎用化の時代へと突入いたしました。本セミ 検索しやすくなった英語版をお試 ナーでは、こうした次世代シーケンサーの最新情報と、実際にお使いの先生の招待講演を し下さい 交えた内容となっています。 バックナンバー まず前半は、どういった研究にどの機種が適しているのか、そしてサンプル調製から実際 のアプリケーション応用例をご説明しながら、現在のマイクロアレイ手法とあわせて次世代 お問い合わせフォーム シーケンサーをどう使いこなすのかをご紹介いたします。mRNAだけでなく非コードRNAも 同時にシーケンスする新プロトコールも併せてご紹介。 後半はゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームを代表する先生方に東京、京都、大阪会 場にてご発表いただきます。つくば、札幌会場ではデータ解析とアグリバイオ分野への応 用も含めてイルミナからご案内いたします。ぜひお聞き逃しなく！ ■ 開催日程 つくば（7/6)、京都（7/8）、大阪（7/9）、東京（7/14）、札幌（7/16） ■ プログラム 13:30-14:00 すべての研究にシーケンサーのパワーを：イルミナ次世代シーケンサー機種のご紹介 14:00-15:00 次世代シーケンサーを使いこなすポイント サンプル調製からゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム解析まで 15:20-16:10 招待講演 【東京会場】 「パーソナルゲノム時代の疾患研究」 東京大学医学部神経内科 辻省次先生 【京都会場】 「次世代エピゲノムツールで広がる発生分化および疾患のDNAメチル 化解析」 東京大学先端科学技術研究センター 永江玄太先生 【大阪会場】 「デジタルトランスクリプトーム解析による多面的な癌の標的探索」 東京大学先端科学技術研究センター 石川俊平先生 【つくば、札幌会場】 「次世代シーケンサーデータ解析とアグリバイオ分野への応用」 配信停止フォーム イルミナ株式会社 ■ プログラム詳細および登録はこちらから 事前登録制、参加費無料 今月の論文ピックアップ： 一卵性双子ゲノム、自発性高血圧症ラット、RNA-Seqアセンブルツール 多発性硬化症の一卵性双子ゲノム解析 多発性硬化症の発症が不一致である一卵性双子のゲノム、エピゲノム、トランスクリプトー ムをGenome Analzyerで解析。360 万SNP、あるいは 20 万indelではその差を見つけ ることができず、またエピゲノム、トランスクリプトームでも発症の差を見つけることはできま せんでしたが、一卵性双子の遺伝的背景をシーケンサーで解析した最初の論文です。 Genome, epigenome and RNA sequences of monozygotic twins disconcordant for multiple sclerosis 自発性高血圧症ラットをシーケンス SHR（自発性高血圧症ラット）を 10.7xでシーケンス。Brown Norwayと比べて 360 万 SNP、343Kのindelを発見。またcisのeQTLにマップされた遺伝子領域には非常にたくさ んのSNP, indel, 欠失などがあることがわかりました。 The genome sequence of the spontaneously hypertensive rat: Analysis and functional significance Cufflinks: RNA-Seqによるトランスクリプトームアセンブルツール オープンソースソフトウェアのCufflinksは既知の遺伝子アノテーション情報を必要としな く、選択的転写やスプライスを説明するアルゴリズムです。マウス由来サンプルから 75bp ペアエンドをシーケンスし、約 14000 の既知遺伝子と 3,724 の新たにアノテーションされ た転写産物を検出。タイムコーススタディではTSSやスプライスアイソフォームで変化をみ せた遺伝子も約 300 ありました。 Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation このニュースはイルミナ株式会社が毎月１回、月末に発行しています。 Copyright(C) 2010 イルミナ株式会社 記載記事の無断転記を禁じます。 イルミナ株式会社 マーケティング部 東京都中央区日本橋茅場町 2-13-13 共同ビル 5F Tel: 03-4578-2800 Fax: 03-4578-2810
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