S1 Table - PLoS ONE

resting CD4+ T cells
CD8+-depleted PBMCs
Cell types
Patients
Year of birth
Year of HIV
diognostics
HIV
subtype
CD4+ nadir
(cells/mm3)
Year of 1st
treatment
Year of
undetectable status
Year of blood
sampling
CD4+ T cell count
(cells/mm3)
Last treatment
Ongoing treatment since
(year)
P1
1966
1994
X
384
1997
1998
2013
905
ABC/3TC/ZDV
2004
P2
1957
2004
X
45
2004
2005
2013
351
EFV/TDF/FTC
2010
P3
1972
1994
X
138
1994
2002
2013
747
TDF/FTC/FPV/r
2010
P4
1961
2007
X
364
2011
2011
2013
659
ABC/3TC/ATV/r
2013
P5
1971
2008
X
603
2008
2011
2013
758
EFV/TDF/FTC
2008
P6
1971
2012
X
477
2012
2012
2013
607
TDF/FTC/ATV/r
2012
P7
1982
2008
X
620
2009
2009
2013
889
TDF/FTC/ RPV
2009
P8
1965
1995
05 DF
11
1995
2006
2013
990
DRV/r/RAL
2011
P9
1939
2001
X
267
2001
2006
2013
1198
EFV/ABC/3TC
2006
P10
1964
1998
X
1
2005
2006
2013
506
TDF/FTC/FPV/r
2009
P11
1977
2008
02 AG
143
2009
2009
2013
494
EFV/TDF/FTC
2010
P12
1965
1996
X
11
1996
2010
2013
657
TDF/FTC/NVP
2012
P13
1953
1995
X
199
1995
2004
2013
847
ABC/3TC/SQV/r
2007
P14
1961
1996
X
92
1996
2005
2013
770
EFV/TDF/FTC
2010
P15
1960
1995
X
314
1997
2003
2013
633
ABC/3TC/ FPV/r
2012
P16
1953
2006
X
340
2006
2007
2013
641
ABC/3TC/NVP
2008
P17
1973
1997
X
395
1997
2010
2013
585
EFV/TDF/FTC
2010
P18
1955
2003
X
77
2012
2012
2013
313
TDF/FTC/ATV/r
2012
P19
1959
2009
X
331
2009
2010
2013
815
EFV/TDF/FTC
2010
P20
1965
2009
X
316
2010
2010
2013
895
TDF/FTC/ATV/r
2011
P21
1968
1995
X
185
1995
2000
2013
890
TDF/FTC/NVP
2009
P22
1952
2005
X
133
2005
2005
2013
319
EFV/TDF/FTC
2011
P23
1964
1996
X
435
1996
2001
2013
531
ABC/3TC/ZDV
2002
P24
1963
1990
X
140
1990
2003
2014
752
TDF/FTC/ATV/r
2010
P25
1967
2002
X
482
2002
2009
2015
534
FTC/TDF/NVP
2009
P26
1952
1998
X
316
1998
1999
2015
832
FTC/TDF/NVP
2009
P27
1944
1991
X
15
1991
2002
2015
859
ATV/r/ABC/3TC
2008
P28
1969
1996
X
200
1996
1997
2015
554
ABC/3TC/EFV
2006
P29
1966
1994
X
384
1997
2011
2015
778
EFV/ATV/r
2011
P30
1960
1993
B
187
1996
2011
2015
830
LPV/r/NVP
2010
P31
1939
1994
X
272
1994
2002
2015
880
3TC/ZDV/EFV
2002
P32
1975
2011
X
10
2011
2012
2015
453
DRV/3TC/ZDV
2012
P33
1967
1990
B
587
1990
2001
2015
2112
ABC/3TC/ZDV
2002
P34
1990
2013
X
515
2013
2014
2015
1400
DTG/ABC/3TC
2013
P35
1979
2008
B
135
2009
2009
2015
463
EFV/c/TDF/FTC
2014
P36
1949
1995
X
399
1997
2007
2014
869
EFV/TDF/FTC
2011
P37
1966
1998
X
558
1998
1999
2014
670
3TC/ZDV/NVP
1999
P38
1973
2004
X
746
2004
2010
2014
848
TDF/FTC/LPV/r
2008
P39
1966
2006
X
215
2006
2007
2014
418
EFV/TDF/FTC
2009
P40
1960
1989
C
53
1999
1999
2014
401
TDF/FTC/NVP
2009
P41
1954
1984
X
61
1996
2011
2014
856
3TC/ZDV/NVP
2002
P42
1973
2004
X
294
2004
2004
2014
736
ABC/3TC/NVP
2007
P43
1956
1985
B
92
1991
2005
2014
818
DRV/r/FTC/MVC
2010
P44
1995
1998
X
251
1998
2006
2014
663
EFV/TDF/FTC
2010
P45
1969
2001
X
192
2001
2004
2014
928
ABC/3TC/ZDV
2002
P46
1948
2009
X
354
2009
2009
2014
817
ABC/3TC/NVP
2013
P47
1952
2000
01 AE
424
2002
2007
2014
1091
EFV/TDF/FTC
2010
P48
1969
2011
F2
364
2012
2013
2013
723
ABC/3TC/ATV/r
2012
P49
1967
1992
X
362
1994
2000
2014
845
TDF/FTC/NVP
2009
P50
1975
2004
B
292
2006
2006
2014
561
EFV/TDF/FTC
2006
“X” means not reported
S1 Table