SPICE 5.0: An Analysis and Discovery Software for Complex Flow

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Finding Correlates of Vaccine-Mediated Protection
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Vaccine-Elicited Protection
$QWLJHQVSHFLÀF
CD4 T cells
Abstract
1.50
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1.00
0.50
1e10 IM
1e7 IM
1e7 SQ
MML/CpG
MML/CpG IM
Vaccine Group
&ŝŐƵƌĞϭ͗dŚĞƋƵĂůŝƚLJŽĨƚŚĞϰdĐĞůůƌĞƐƉŽŶƐĞŵĂLJďĞŝŵƉŽƌƚĂŶƚƚŽƉƌŽƚĞĐƟŽŶĂŐĂŝŶƐƚLeishmania
major
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B S I P
ď
Group: 1e7 IM
Group: 1e7 SQ
Group: MML/CpG
50
Bar Chart Legend
40
Group: 1e10 IM
30
Group: 1e10 IM
Group: 1e7 IM
Group: 1e7 SQ
Group: MML/CpG
50
Group: MML/CpG IM
Bar Chart Legend
40
Group: 1e10 IM
30
Group: 1e7 IM
20
Group: 1e7 SQ
10
Group: MML/CpG
Group: MML/CpG IM
IFNg
IL2
TNF
Pie Slice
+
-
+
-
+
+
+
-
+
+
+
+
+
+
+
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;Ğ͘Ő͕͘dE&ŽŶůLJͿĂƌĞƌĞƉƌĞƐĞŶƚĞĚďLJƚŚĞΗƌĞĚΗƉŝĞƐĞŐŵĞŶƚƐ͖ƚŚŽƐĞƚŚĂƚŵĂŬĞƚǁŽĂƌĞƌĞƉƌĞƐĞŶƚĞĚďLJƚŚĞ
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ΗďůƵĞΗ͘
E//KĸĐĞŽĨdĞĐŚŶŽůŽŐLJ/ŶĨŽƌŵĂƟŽŶ^LJƐƚĞŵƐ
Group: MML/CpG IM
Group: 1e7 IM
20
Group: 1e7 SQ
10
Group: MML/CpG
Group: MML/CpG IM
IFNg
-
IL2
TNF
Pie Slice
+
-
+
+
+
+
+
+
+
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+
-
+
-
&ŝŐƵƌĞϰ͗&ůŽǁĐLJƚŽŵĞƚƌLJĚĂƚĂĨŽƌϰdĐĞůůĨƵŶĐƟŽŶƐ͕ƐŽƌƚĞĚďLJƚŚĞŵŽĚĞůĨŽƌϰdĐĞůůĚŝīĞƌĞŶƟĂƟŽŶ͘dŚĞ
ŇŽǁĐLJƚŽŵĞƚƌLJĚĂƚĂƐŚŽǁŶŝŶ&ŝŐƵƌĞϮǁĂƐĂƐƐŽƌƚĞĚďLJƚŚĞĐĂƚĞŐŽƌŝĞƐĨŽƌϰdĐĞůůĚŝīĞƌĞŶƟĂƟŽŶĚĞƐĐƌŝďĞĚŝŶ
&ŝŐƵƌĞϯƵƐŝŶŐ^W/͘,ĞƌĞƚŚĞŐƌĞĞŶƉŝĞĐŚĂƌƚƐĞŐŵĞŶƚƐĂƌĞƚŚĞĞĂƌůLJͲĚŝīĞƌĞŶƟĂƟŽŶĐĞůůƐ͕ďůƵĞĂƌĞƚŚĞ
ƉŽůLJĨƵŶĐƟŽŶĂůĐĞůůƐ͕ĂŶĚƌĞĚĂƌĞƚŚĞůĂƚĞͲƐƚĂŐĞĐĞůůƐ͘
džĂŵŝŶĂƟŽŶŽĨƚŚĞƌĞͲƐŽƌƚĞĚŇŽǁĐLJƚŽŵĞƚƌLJĚĂƚĂƉƌŽǀŝĚĞƐĂďĞƩĞƌ
ƵŶĚĞƌƐƚĂŶĚŝŶŐŽĨƚŚĞƌĞůĂƟŽŶƐŚŝƉďĞƚǁĞĞŶdĐĞůůĨƵŶĐƟŽŶƐĂŶĚ
ǀĂĐĐŝŶĞƉƌŽƚĞĐƟŽŶ͘dŚŝƐƐƵŐŐĞƐƚƐƚŚĂƚŽƉƟŵĂůǀĂĐĐŝŶĞƉƌŽƚĞĐƟŽŶŝƐ
ŽďƚĂŝŶĞĚďLJŐĞŶĞƌĂƟŶŐĞĂƌůLJƐƚĂŐĞĐĞůůƐĂŶĚƉŽůLJĨƵŶĐƟŽŶĂůĐĞůůƐ͕ĂŶĚ
ĂǀŽŝĚŝŶŐƚŚĞŐĞŶĞƌĂƟŽŶŽĨůĂƚĞͲƐƚĂŐĞĞīĞĐƚŽƌĐĞůůƐ͘
&ŝŶĚWĂƩĞƌŶƐŝŶzŽƵƌĂƚĂ
^W/ĐĂŶďĞƵƐĞĚƚŽĂŶĂůLJnjĞĂŶLJ
ŵƵůƟǀĂƌŝĂƚĞĚĂƚĂƐĞƚĨŽƌǁŚŝĐŚĂ
ƐŝŶŐůĞĐŽŶƟŶƵŽƵƐŵĞĂƐƵƌĞŵĞŶƚŝƐ
ĂǀĂŝůĂďůĞ͘
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ͻ^ƵƉƉŽƌƚĨŽƌĂĚĚŝƟŽŶĂůĚĂƚĂƐŽƵƌĐĞƐΘĚŝƌĞĐƚŝŵƉŽƌƚĨƌŽŵ&>Kt:K
ͻ&ƵůůŵƵůƟƚŚƌĞĂĚŝŶŐƚŽƚĂŬĞĨƵůůĂĚǀĂŶƚĂŐĞŽĨŵƵůƟƉůĞͲĐŽƌĞDĂĐƐ
ͻWŽƚĞŶƟĂůĨŽƌyŐƌŝĚƐƵƉƉŽƌƚĨŽƌƉĂƌĂůůĞůƉƌŽĐĞƐƐŝŶŐ
ͻdĂďďĞĚŝŶƚĞƌĨĂĐĞĨŽƌĐŽŵƉĂƌŝƐŽŶŽĨŵƵůƟƉůĞǀŝĞǁƐĨŽƌĂĚĂƚĂƐĞƚ
ͻĚĚŝƟŽŶĂůĨŽƌŵĂƫŶŐŽƉƟŽŶƐĂŶĚŐƌĂƉŚƚLJƉĞƐ
ͻ^ƵŐŐĞƐƟŽŶƐ͍ŽŶƚĂĐƚ^ƉŝĐĞ^ƵƉƉŽƌƚΛŶŝĂŝĚ͘ŶŝŚ͘ŐŽǀ
ĐŬŶŽǁůĞĚŐĞŵĞŶƚƐ
^W/ǁĂƐǁƌŝƩĞŶŝŶĐŽůůĂďŽƌĂƟŽŶǁŝƚŚƌ͘DĂƌŝŽZŽĞĚĞƌĞƌ͕^ĞŶŝŽƌ
/ŶǀĞƐƟŐĂƚŽƌŽĨƚŚĞ/ŵŵƵŶŽdĞĐŚŶŽůŽŐLJƐĞĐƟŽŶŽĨƚŚĞsĂĐĐŝŶĞ
ZĞƐĞĂƌĐŚĞŶƚĞƌĂƚƚŚĞEĂƟŽŶĂů/ŶƐƟƚƵƚĞŽĨůůĞƌŐLJĂŶĚ/ŶĨĞĐƟŽƵƐ
ŝƐĞĂƐĞ͘