MODELADO OSTEOMUSCULAR 1- Identificación Estudios: Grado de Ingeniería Biomédica Curso: Tercer curso Trimestre: Tercer trimestre Número de créditos ECTS (European Credit Transfer System): En total, el curso consistirá de 1.44 créditos ECTS (36 horas). La asistencia a las clases es obligatoria. El curso se divide en los siguientes tipos de clases: i) 18 horas de clases teóricas, ii) 8 horas de seminarios y iii) 10 horas de prácticas. Profesorado: Jérôme Noailly (DTIC, Universitat Pompeu Fabra) 2- Objetivos generales El sistema osteomuscular (o musculoesquelético) comprende varios tejidos, típicamente huesos, ligamentos, cartílagos, tendones y músculos, los cuales interactúan entre ellos para proveer al cuerpo flexibilidad, resistencia, y estabilidad mecánica, mientras se asegura motricidad. Cuando uno o varios tejidos de este sistema dejan de asumir plenamente su función, todo el equilibrio funcional de sistema se ve alterado, traduciéndose esta alteración en cambios de distribuciones de cargas mecánica entre los diferentes tejidos. Debido a la mecano-sensitividad de las células que aseguran el buen mantenimiento de los tejidos, describir estas distribuciones de carga es clave tanto para el entendimiento como para el tratamiento de las patologías. El modelado teórico del sistema musculoesquelético representa una herramienta única para anticipar el equilibrio mecánico y por lo tanto biológico de los tejidos, el cual difícilmente puede ser medido in situ. La asignatura pretende dar una visión de conjunto de las necesidades tecnológicas que intervienen en el uso de modelos musculoesqueléticos para el análisis y el tratamiento de pacientes con enfermedades osteomusculares. La estructura sigue dicho proceso en su orden lógico: desde el conocimiento de las características mecánicas y funcionales de los tejidos del sistema musculoesquelético, a la modelización de dichas características para integrarlas en modelos que representen un paciente, una enfermedad, o un tratamiento. La integración de datos clínicos, el problema de calibración y de validación de los modelos serán abordados, así como el uso practico de los modelos para el diseño de implantes ortopédicos, y para la evaluación de resultados clínicos. 1 / 6 1. Estructura del curso Clases teóricas 1- Introducción: sistema musculoesquelético y mecanobiologia (3h) 2- Aproximaciones de modelización (3h) (Complemento información sobre herramientas de modelización: Seminario 1) • • Modelos de agentes Modelos de cuerpos rígidos y cuerpos deformables (Complemento de información sobre modelos de cuerpo rígido: Seminario 2) • Concepto de modelización por elementos finitos del solido deformable en biomecánica 3- Modelización de los tejidos de sistema musculoesquelético (4h) • Hueso: elasticidad linear, poroelasticidad • Ligamentos: grandes deformaciones, elasticidad no lineal, viscoelasticidad • Tejidos cartilaginosos: hyperelasticidad, poro-hyperelasticidad, osmo-porohyperelasticidad • Músculos: Modelo de Hill, y alternativas (Complemento de información en modelización de la función muscular: Seminario 2) • Modelos avanzados con parámetros que dependen de la composición 4- Calibración y validación (3h) • Concepto de validación de modelos de materiales vivos • Ensayos para caracterización de tejidos: identificación de parámetros, variabilidad, y optimizaciones numéricas • Estudios de sensibilidad • Interpretaciones: análisis comparativas e identificación de mecanismos (diseño de estudios), márgenes de seguridad, regulación (FDA) 5- Integración de datos clínicos y protocolos (2h) (Complemento de información sobre hueso y cartílago: Seminario 3) • • • CT y huesos MRI y cartílago EMG, motion capture, placa de fuerza y músculos (Complemento de información sobre sinergia entre músculos: Seminario 2) 6- Casos prácticos en ortopedia (3h) (Complemento de información sobre casos clínicos de interés: Seminario 4) • Ensayo virtual de implantes • • Diseño de implantes Plataformas de modelización para prognosis y predicción de fracturas (Complemento de información meseta tibial: Seminario 1) (Complemento de información sobre riego de fractura: Seminario 3) 2 / 6 Seminarios Los seminarios consisten en ponencias invitadas de especialistas que tienen como objetivo dar complementos de información e ilustrar de manera práctica las clases teóricas. También pretenden servir de fuente de inspiración para los proyectos de practica. • Seminario 1 – 30/04/2015, 10:30-12:30 – Gaëtan Chary, Ingeniero, Consultor independiente y colaborador del grupo SIMBioSys – Especialista en biomecánica computacional con programas de código abierto (1.5h + 0.5h de discusión) • Seminario 2 – 05/05/2015, 15:30-17:30 – Josep Maria Font, Profesor agregado, director del grupo de investigación BIOMEC en la Universitat Politècnica de Catalunya – Especialista en análisis del movimiento humano y simulación de la función muscular (1.5h + 0.5h de discusión) • Seminario 3 – 19/05/2015, 16:00-18:00 – Ludovic Humbert, Cofundador y director de la Musculoskeletal Unit, a Galgo Medical S.L. - Especialista en modelización personalizada de órganos de pacientes (1.5h + 0.5h de discusión) • Seminario 4 – 22/05/2015, 15:30-17:30 – Antoni Molina, Cirujano a l’Hospital del Mar – Especialista en Cirugía Ortopédica y Traumatología (1.5h + 0.5h de discusión) Cada estudiante deberá entregar al profesor un resumen de cada seminario, con una extensión de 200-250 palabras por resumen. Trabajo de practicas La asignatura incluye la realización de un trabajo grupal de 10 horas, durante las horas en el aulario. Se tratará de: 1) Escoger una región específica (tejido o órgano) del sistema musculoesquelético del cuerpo humano 2) Resaltar el interés del estudio computacional de esta región en relación a un problema de salud específico (degeneración, trauma, malformación, …) 3) Diseñar del análisis numérico en términos de cálculo de interés, condiciones de contorno, parámetros de modelos (asignación e identificación/calibración), y otras aproximaciones relevantes 4) Proponer vías de implementación 5) Discutir la validez de la información potencialmente calculada con el modelo Toda la información aportada deberá ser respaldada por datos de la literatura científica, debidamente citados. El trabajo será validado por la redacción de un informe que se entregará al profesor el día del examen escrito, para su posterior evaluación. 3 / 6 3. Evaluación La evaluación se hará en base a los contenidos impartidos en las clases y al trabajo de practicas. En particular: - Examen escrito (no-recuperable): 50% - Trabajo de prácticas (no-recuperable): 40% - Resúmenes de seminario: 10% 4. Requisitos La asistencia a las clases es obligatoria. En caso de no poder atender a alguna clase, se deberá entregar un justificante de la razón de dicha ausencia. 5. Literatura recomendada Cowin, S.C. (2001). Bone Mechanics Handbook, Second Edition. CRC Press. ISBN-13: 978-0849391170. ISBN-10: 0849391172 CRISFIELD, M.A. (2000). NON-LINEAR FINITE ELEMENT ANALYSIS OF SOLIDS AND STRUCTURES VOLUME 1: ESSENTIALS. WILEY, 2000, ISBN: 9780470860205 Gasser, T. C., Ogden, R. W., & Holzapfel, G. a. (2006). Hyperelastic modelling of arterial layers with distributed collagen fibre orientations. Journal of the Royal Society, Interface / the Royal Society, 3(6), 15–35. doi:10.1098/rsif.2005.0073 Henak, C. R., Anderson, A. E., & Weiss, J. a. (2013). Subject-Specific Analysis of Joint Contact Mechanics: Application to the Study of Osteoarthritis and Surgical Planning. Journal of Biomechanical Engineering, 135(2), 021002. doi:10.1115/1.4023386 Henninger, H. B., Reese, S. P., Anderson, A. E., & Weiss, J. A. (2010). Validation of computational models in biomechanics. Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers Part H Journal of Engineering in Medicine, 224(7), 801–812. doi:10.1243/09544119JEIM649 Holcombe, M., Adra, S., Bicak, M., Chin, S., Coakley, S., Graham, A. I., … Worth, D. (2012). Modelling complex biological systems using an agent-based approach. Integrative Biology, 4(1), 53–64. doi:10.1039/c1ib00042j Holzapfel, G.A. (2000). Nonlinear Solid Mechanics: A Continuum Approach for Engineering. Wiley, 2000, ISBN-10: 0471823198, ISBN-13: 9780471823193 Holzapfel, G.A. (2001). Biomechanics of Soft Tissue. In: Handbook of Material Behavior 1, Academic Press 4 / 6 Jones, A. C., & Wilcox, R. K. (2008). Finite element analysis of the spine: towards a framework of verification, validation and sensitivity analysis. Medical Engineering & Physics, 30(10), 1287–304. doi:10.1016/j.medengphy.2008.09.006 Julkunen, P., Wilson, W., Isaksson, H., Jurvelin, J. S., Herzog, W., & Korhonen, R. K. (2013). A review of the combination of experimental measurements and fibrilreinforced modeling for investigation of articular cartilage and chondrocyte response to loading. Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2013, 326150. doi:10.1155/2013/326150 Machado, D., Costa, R. S., Rocha, M., Ferreira, E. C., Tidor, B., & Rocha, I. (2011). Modeling formalisms in Systems Biology. AMB Express, 1(1), 45. doi:10.1186/21910855-1-45 Malandrino, A., Jackson, A. R., Huyghe, J. M., & Noailly, J. (2015). Poroelastic modeling of the intervertebral disc: A path toward integrated studies of tissue biophysics and organ degeneration. MRS Bulletin, 40(04), 324–332. doi:10.1557/mrs.2015.68 Marckmann, G., & Verron, E. (2006). Comparison of hyperelastic models for rubberlike materials. Rubber Chemistry and Technology, 79(5), 835–858. Noailly, J., & Lacroix, D. (2012). Finite element modelling of the spine. In L. Ambrosio & K. E. Tanner (Eds.), Biomaterials for Spinal Surgery - Part I: Fundamentals of Biomaterials for Spinal Surgery (pp. 144–232). Cambridge: Woodhead Publishing Ltd. doi:10.1533/9780857096197.1.144 Noailly, J., Malandrino, A., & Galbusera, F. (2014). Computational modelling of spinal implants. In J. Zhongmin (Ed.), Computational Modelling of Biomechanics and Biotribology in the Musculoskeletal System (pp. 447–484). Cambridge: Woodhead Publishing Ltd. doi:10.1533/9780857096739.4.447 Potier, E., Noailly, J., & Ito, K. (2010). Directing bone marrow-derived stromal cell function with mechanics. Journal of Biomechanics, 43(5), 807–17. doi:10.1016/j.jbiomech.2009.11.019 http://www.fda.gov/MedicalDevices/DeviceRegulationandGuidance/GuidanceDocumen ts/ucm371016.htm http://biomedicalcomputationreview.org/content/biology-interacting-things-intuitivepower-agent-based-models http://biomedicalcomputationreview.org/content/identifying-and-overcomingskepticism-about-biomedical-computing 5 / 6 6. Repositorios de modelos http://www.ulb.ac.be/project/vakhum/ http://lifesciencedb.jp/bp3d/ 6 / 6
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