次世代定序與生物資訊分析暨基礎臨床研究之應用
Next Generation Sequencing & Bioinformatics - From Basic Study to Clinic Research
威健公司 楊明哲博士
演講摘要
諾貝爾獎得主 Sanger 於 1975 年所發展出的 Dideoxy Termination Method (Sanger 定
序法) 在人類基因體解碼計畫中扮演著關鍵性的角色。傳統 Sanger 定序法須將分
析標的片段放大，針對較長的目標區域進行多次放大，定序後再進行比對
(Mapping)或組裝(Assembling)，實驗步驟繁瑣費時。有別於此，次世代定序 (Next
Generation Sequencing, NGS) 技術不需額外先行放大目標，直接將整個區域進行定
序後再進行分析，透過比對及組裝可建構出完整區域的序列資訊，顯著地提升定
序效率。NGS 實驗流程包含核酸片段化 (Fragmentation)、高通量定序
(High-throughput Sequencing)、分析 (Analysis) 、建庫 (Library Construction) 共四個
步驟。定序的方式又可分為單端定序(Single Read or Single End)與雙端定序
(Paired-End & Mate Pair)。此技術可應用於快速尋找已知或未知的序列資訊，並透
過比對與記數(Counting)分析可得知其與實驗樣品物種之已知參考序列(Reference
Sequence)間的相似度或定量。並可利用組裝方式預測與驗證無物種參考序列的序
列資訊。此 NGS 技術可預期對現代基礎及臨床生物醫學的發展產生加速性的鉅
大衝擊。