Espèces et …Taxinomie (Taxonomie)

Espèces et …Taxinomie (Taxonomie)
Regnum Animale (1735)
Espèces et Taxonomie (1)
Taxonomie, la science du classement
Espèces et Taxonomie (2)
1
Linné = 9000 espèces
Actuellement= 1.5-1.8 106
Estimation du Nb d’espèces
vivantes = 8.7 106 (1.3 106
d’Eucaryotes)
Donc 14% des espèces
terrestres et 9 % des espèces
marines ont été décrites en 250
ans de taxinomie
Mora et al. 2011, PlosBio
Espèces et Taxonomie (3)
20 532 espèces animales publiées en 10 ans (2001-2010,
source zootaxa)
Environ 19 000 espèces d’Arthropodes
650 espèces de Poissons
320 espèces d’Amphibiens
340 espèces de Reptiles
40 espèces de Mammifères
ZOOTAXA
Espèces et Taxonomie (4)
2
Bactérie à arsenic -Lac Mono en Californie (2011)
La « grande rouge » Tiburonia granrojo
(2006)- Hawai
« cafard sauteur » Saltoblattella montistabularis (2010)
Espèces et Taxonomie (5)
Varanus bitatawa (2010) Philippines
Laonastes aenignmamus (1996) - Laos
Décrit en 1996 (marché), observé en 2006
http://species.asu.edu/mission
1 cm
Hippocampe pygmé (Hippocampus satomiae) 2010 -Indonésie
Espèces et Taxonomie (6)
3
Philantomba walteri (2010) – Benin
« Pin de Wollemi » Wollemia nobilis (1995) -Australie
« Saola » Pseudoryx nghetinhensis (1993)
Vietnam-Laos
Palmier Tahina
spectabilis
(2008)Madagascar
Espèces et Taxonomie (7)
Classification Taxonomique = Taxon (Taxa)
Taxonomic hierarchy = Taxa
Règne (Kingdom)
Animalia/ Animaux
Phylum/Division (Phylum/ Division)
Chordata/ Chordés
Classe (Class)
Mammalia/mammifère
Ordre (Order)
Primates
Famille (Family)
Hominidae/Hominidés
Genre (Genus)
Homo
Espèce (Species)
sapiens
+ Nomenclature scientifique, système Linnéen
Linnean system (binomial)
Espèces et Taxonomie (8)
4
Règne (Kingdom)
Sous-règne (Subkingdom)
Infra-règne (Infrakingdom)
Superembranchement ou Superphylum (super Division,super Phylum)
Embranchement, Division ou Phylum (Division, Phylum)
Sous-embranchement, Sous-division ou Sous-phylum subDivision,subPhylum)
Superclasse (Superclass)
Classe (Class)
Sous-classe (Subclass)
Infraclasse (Infraclass)
Superordre (Superorder)
Ordre (Order)
Sous-ordre (Suborder)
Infraordre (Infraorder)
Superfamille (Superfamilly)
Épifamille (Epifamilly)
Famille (Familly)
Sous-famille (Subfamilly)
Tribu (Tribe)
Sous-tribu (Subtribe)
Genre (Genus)
Sous-genre (Subgenus)
Section (Section)
Sous-section (Subsection)
Série (Series)
Sous-série (Subseries)
espèce (species)
sous-espèce (subspecies)
variété (varietes)
sous-variété (subvarietes)
forme (form)
sous-forme (subform)
Espèces et Taxonomie (9)
Primates Reptiles Poissons
Primates
Amniotes
Osteichthyens
Chordés
Métazoaire
Invertébrés
espèce: sapiens
genre: Homo
Homininés
Famille: Hominidés
Hominoïdés
Hominoïdes
Catarrhiniens
Simiiformes
Haplorrhiniens
Ordre: Primates
Euarchontes
Euarchontoglires
Boréoeuthériens
Euthériens
Thériens
Classe: Mammifères
Amniotes
Tétrapodes
Sarcoptérygiens
Ostéichthyens
Gnathostomes
Vertébrés
Crâniates
Phylum : Chordés
Deutérostomiens
Bilatériens
Eumétazoaires
Métazoaires
Holozoaires
Opisthocontes :
Unicontes
Eucaryotes
Regne: Animalia
Espèces et Taxonomie (10)
5
Nomenclature biologique: système Linnéen (binomial)
Biological nomenclature: Linnean system (binomial)
Régit par
Ordonned by
ICTV « International Committee on Taxonomy of Viruses »
http://www.ictvonline.org
ICNB « International Code of Nomenclature of Bacteria »
1867: ICBN « International Code of Botanical Nomenclature »
http://ibot.sav.sk/icbn/main.htm
1889 : ICZN « International Commission on Zoological Nomenclature »
http://iczn.org/
NB: Douvillié 1882: Code pour la nomination des fossiles
Espèces et Taxonomie (11)
Les 2 codes (ICBN et ICZN) sont indépendants, quelques différences:
-même genre utilisable pour un animal et une plante
(the same genus name may be used for an animal and for a plant)
-diagnose en latin pour le ICBN / ICZN
(nessecity of a latin diagnosis in botany, not required in ICZN)
-Division sous-formes (ICBN) / Super Famille sous espèce (ICZN)
Division to subform (ICBN)/ SuperFamily to subspecies (ICZN)
-Tautonymie interdite (ICBN)/ autorisé (ICZN: ex. Meles meles)
Tautonymy not allowed (ICBN)/ allowed (ICZN)
-Date et auteurs d’une espèce modifiable avec les changement (ICBN)/ non modifiable (ICZN)
Date and authorship of species affected by change in rank (ICBN), unchanged (ICZN)
-differences orthographiques (ex. Famille en -aceae ICBN, en – idae (ICZN))
Difference in Ortography (e.g.. Family with -aceae ICBN, with – idae (ICZN))
-Type obligatoirement non vivant (ICBN)/ ICZN. type cannot be living organism (ICBN)/ICZN
Différences de terminologie. Differences in terminology:
last homonym (ICBN) / junior synonym (ICZN)
Correct name (ICBN) / (ICZN) valid name
Espèces et Taxonomie (12)
6
Class Mammalia
Clade Boreosphenida14
Infraclass Eutheria
Order and family incertae sedis
Juramaia sinensis gen. et sp. nov.
Etymology. Jura, Jurassic; maia, mother, in reference to placental affinities;
sinensis, of China. The binomial refers to ‘Jurassic mother from China’.
Holotype. Beijing Museum of Natural History (BMNH) PM1143 (Fig. 1) is
preserved with full dentition, incomplete skull, anterior part of postcranial
skeleton and residual soft tissues, such as hairs.
Locality and age. The Daxigou site of Jianchang County of Liaoning
Province in the Middle–Late Jurassic Tiaojishan formation. The formation was
dated by the SHRIMP U–Pb method on zircon at 164–165 Myr in the
neighbouring Ningcheng area15 and its stratigraphic equivalent dated by the
40Ar/39Ar method on sanidines at 160.7 ± 0.4 Myr in the Beipiao area.
Diagnosis. I5–C1–P5–M3/I4–C1–P5–M3 (Fig. 2), with identical formula as the
eutherian Eomaia3 and typical count of five premolars and three molars for Cretaceous
eutherians1. Molars tribosphenic, with derived eutherian features of distinctive paraconule,
incipient metaconule (M2 only), long preprotocrista past the paracone and long
postprotocrista past the metacone. The postmetacrista and the extended postprotocrista of
an upper molar form two separate ranks of shearing crests that pass the prevallid crest
(paracristid) of the succeeding lower molar (Fig. 3). The preparacrista and the preprotocrista
form two ranks of shearing crests that pass the postvallid crest (protocristid) of the
preceding lower molar. This kind of stepwise or en-echelon shearing is much better
developed in Juramaia than in most metatherians17. Distinct from metatherians in lacking
the vertical keel of the paraconid and the hypoconulid shelf18, 19 and in lacking the close
approximation of the hypoconulid and the entoconid as in Sinodelphys7 or the twinning of
these cusps in other metatherians6. Differs from metatherians (except Sinodelphys) in
lacking the inflected mandibular angle and flat ventral surface of the angle. Juramaia
sinensis is similar to many eutherians in having the posterior mental foramen of the
mandible below the p4–p5 junction, by contrast to metatherians that have the posterior
mental foramen below m1. Juramaia sinensis is similar to several Cretaceous eutherians in
retaining a deciduous dP3 in the middle of the right premolar series1 but differs from
metatherians wherein replacement only occurs at the ultimate premolar position6, 20.
Juramaia sinensis differs from all australosphenidans in lacking the continuous mesial
cingulid and the wrapping cingulid, and from most australosphenidan and
pseudotribosphenidan mammals in lacking the postdentary trough on the mandible14, 21,
22, 23, 24. Among the earliest-known eutherians, Juramaia sinensis differs from Eomaia in
having a two-rooted upper canine3, and from Acristatherium in having different numbers of
upper and lower incisors, a larger M3 and absence of diastemata between the anterior
upper premolars6. It differs from Prokennalestes, Murtoilestes and Acristatherium in having
a much lower protocone and longer postprotocrista1, 25, 26, from all known Early
Cretaceous eutherians in a deeper ectoflexus on P5–M2, and from Montanalestes in having
larger lower premolars 3 and 4. See Supplementary Information for full differential diagnosis
and summary of morphological distinction from other Mesozoic mammal groups.
Figure 1: Holotype specimen of Juramaia sinensis, Beijing Museum of Natural
History (BMNH) PM1343B.
Luo et al. 2011 Nature, 476: 442-445
Espèces et Taxonomie (13)
Order Carcharhiniformes Compagno, 1973
Family Triakidae Gray, 1851
Genus Galeorhinus Blainville, 1816
Type species: Squalus galeus Linnaeus, 1758, Recent. “European seas”.
Galeorhinus louisi sp. nov.
Synonymy: Galeorhinus articus Frabi, 1886: pl.2, non pl.6
Etymology: Species named in honour of Pierre Louis from the local“Société Laonnoise et Axonaise de
paléontologie” for his contribution to palaeontological research in the Reims region.
Holotype: UM−PRE 11, a lower antero−lateral tooth (Fig. 4A).
Type locality: Prémontré Abbey, Prémontré (Aisne, northern France).
Type horizon: “Sables de Glennes” (Laon Clays Fm.), Level 2, late Ypresian (NP12), Eocene.
Material.—Nine teeth.
Diagnosis.—Small species of Galeorhinus, teeth up to 2.2 mm in total width, with a reduced number of
denticles on the distal edge of crown (up to 4) and lacking denticles and serrations on the mesial cutting
edge, except sometimes a very small basal one. G. louisi differs from all other Galeorhinus species in
having the base of the labial face of the crown (overhanging the labial crown−root junction) with several
marked irregular folds and associated notches on the entire width, forming sometimes a horizontal,
straight transversal bulge in labial view. Root not very thick, with lobes always clearly separated, even in
the anterior files.
Espèces et Taxonomie (14)
7
Règles d’écriture pour une espèce nouvelle
Le nom d’espèce (italique) est suivi par « new species, species nova, sp. nov., ou n.
sp. » The species name is simply followed by a comma, and then new species, species nova, sp. nov., or n.
sp.
Class Hydrozoa Owen, 1843
Subclass Athecatae Hincks, 1868
Order Filifera Kuhn, 1913
Superfamily Hydractinioidea
Bouillion, 1978
Family Stylasteridae Gray, 1847
Conopora Moseley, 1879
Order Multituberculata Cope, 1884
Suborder Ptilodontoidea
(Gregory and Simpson, 1926)
Family Neoplagialacidae
Ameghino, 1890
Mesodma Jepsen, 1940
Conopora adeta, new species
Mesodma Mesodma nov. sp.
Espèces et Taxonomie (15)
Auteur(s) de l’espèce nouvelle
1er auteur + et al. selon l’ICBN
Nominatifs selon l’ICZN ( ex. Macrobiotus snaresensis Horning, Schuster
& Grigarick 1978)
(The ICBN recommends that the citation be restricted to the name of the first
author, followed by et al.)
Espèces et Taxonomie (16)
8
Quelques règles de création d’un nom d’espèce:
-obligatoirement en lettre latine
-pas de majuscule (ICZN, Art. 28)
-pas d’accent ni d’apostrophe (ICZN, Art. 27)
-au moins 2 lettres (ICZN, Art. 11)
-accordé avec le nom de genre (latin ou grec), selon qu’il est considéré comme:
1. une tautonomie (Mola mola)
2. un adjectif (simple: minutus ; ou composé: brevicauda pour « brevi
cauda »)
3. un lieu géographique (ex: Oromobula dakhlaensis, terminaison en –
ensis ou –iensis selon ICZN, –ensis -inus ou –icus selon ICBN)
4. commémoratif (ex: Galeorhinus louisi, si c’est un Nom (masculin), ajout
d’un « i », selon ICZN, dépend du sexe de la personne (i ou a) selon ICBN)
Espèces et Taxonomie (17)
Accord en Latin pour les noms d’espèce descriptifs (=adjectif)
L’accord est généralement:
(m) Squalus serriculus / Squalus brevirostris
(f) Deania eglantina
(n) Paleotherium siderolithicum
Mais vérifier le genre du nom latin du genre!
Par exemple, Felis (chat) est féminin en latin, l’accord du nom d’espèce (type
descriptif) doit donc être féminin soit Felis domestica (et non Felis domesticus si
genre masculin) pour le « Chat domestique ».
Inversement, Canis (chien), finissant aussi en –is est masculin en latin, on obtient
ainsi Canis familiaris (« Chien commun ») ou Canis lupus (« Chien loup ») et non
Canis familiare (si genre neutre) ou Canis lupa (si genre féminin).
You must check a Latin dictionary or sourcebook, which lists the gender of each noun.
For example, Felis (cat) is a feminine noun, so adjective species names for members of the cat genus must be feminine. The
house cat is Felis domestica, not Felis domesticus. But Canis (dog), which also ends in -is, is masculine in gender, so we have
Canis familiaris or Canis lupus, not Canis familiare (the neuter adjective ending) or Canis lupa (the feminine ending).
Espèces et Taxonomie (18)
9
Order Carcharhiniformes Compagno, 1973
Family Triakidae Gray, 1851
Genus Galeorhinus Blainville, 1816
Type species: Squalus galeus Linnaeus, 1758, Recent. “European seas”.
Galeorhinus louisi sp. nov.
Synonymy: Galeorhinus articus Frabi, 1886: pl.2, non pl.6
Etymology: Species named in honour of Pierre Louis from the local“Société Laonnoise et Axonaise de
paléontologie” for his contribution to palaeontological research in the Reims region.
Holotype: UM−PRE 11, a lower antero−lateral tooth (Fig. 4A).
Type locality: Prémontré Abbey, Prémontré (Aisne, northern France).
Type horizon: “Sables de Glennes” (Laon Clays Fm.), Level 2, late Ypresian (NP12), Eocene.
Material.—Nine teeth.
Diagnosis.—Small species of Galeorhinus, teeth up to 2.2 mm in total width, with a reduced number of
denticles on the distal edge of crown (up to 4) and lacking denticles and serrations on the mesial cutting
edge, except sometimes a very small basal one. G. louisi differs from all other Galeorhinus species in
having the base of the labial face of the crown (overhanging the labial crown−root junction) with several
marked irregular folds and associated notches on the entire width, forming sometimes a horizontal,
straight transversal bulge in labial view. Root not very thick, with lobes always clearly separated, even in
the anterior files.
Espèces et Taxonomie (19)
Synonymie (Synonymy)
Cheiriphotis williamsoni sp. nov.
Cheiripohotis megacheles, Walker, 1904: 284, pl. 6, figs. 42: Nayar, 1959:
33, pl. 11, figs. 23–25; 1966, pl. 159, fig. 17a. (Not Melita megacheles
Giles, 1885). (Salman and Jabbar 1990:215)
Cheiriphotis williamsoni sp. nov.
Cheiripohotis megacheles, Walker, 1904.
Cheiriphotis williamsoni sp. nov.
1904. Cheiripohotis megacheles, Walker
Espèces et Taxonomie (20)
10
Tylotropidius didymus (Thunberg 1815)
Gryllus didymus THUNBERG 1815: 241 (Rep. South Africa).
Heteracris speciosa WALKER 1870: 661 (Sierra Leon). Syn. by DIRSH
1966: 212.
Tylotropidius didymus var. voltaensis SJOSTED 1931: 34 (Burkina Faso).
Syn. by UVAROV 1953: 92.
Tylotropidius didymus var. citrea KARNY 1907: 352 (Sudan). Syn. by
DIRSH 1966: 212.
Tylotropidius didymus var. violacea I. BOLIVAR 1912: 99 (Zaire). N. syn.
Tylotropidius grandis SJO¨ STED 1931: 35 (Burkina Faso). Syn. by DIRSH
1966: 210.
Tylotropidius congoensis SJOSTED 1931: 35 (Congo) N. syn.
Espèces et Taxonomie (21)
Pachygaleus lefevrei (Daimeries, 1891)
Fig. 7A–C.
1891 Galaeus lefevrei sp. nov.; Daimeries 1891: 74 (no figure).
1905 Galeus lefevrei (Daimeries, 1891); Leriche 1905: pl. 11: 54–58.
1946 Eugaleus lefevrei (Daimeries, 1891); Casier 1946: pl. 1: 13.
1992 Pachygaleus lefevrei (Daimeries, 1891); Cappetta 1992: 644–645.
1994 Galeorhinus lefevrei (Daimeries, 1891); Kemp 1994: pl. 16: 7, 8.
1994 Galeorhinus lefevrei (Daimeries, 1891); Case 1994: pl. 8: 165,166.
1995 Pachygaleus lefevrei (Daimeries, 1891); Bault and Genault 1995:pl. 7: 5, 6,
pl. 8: 1, 2.
1999 Galeorhinus lefevrei (Daimeries, 1891); Müller 1999: pl. 5: 2.
1999 Pachygaleus lefevrei (Daimeries, 1891); Kent 1999a: pl. 2.2
Espèces et Taxonomie (22)
11
Order Carcharhiniformes Compagno, 1973
Family Triakidae Gray, 1851
Genus Galeorhinus Blainville, 1816
Type species: Squalus galeus Linnaeus, 1758, Recent. “European seas”.
Galeorhinus louisi sp. nov.
Synonymy: Galeorhinus articus Frabi, 1886: pl.2, non pl.6
Etymology: Species named in honour of Pierre Louis from the local“Société Laonnoise et Axonaise de
paléontologie” for his contribution to palaeontological research in the Reims region.
Holotype: UM−PRE 11, a lower antero−lateral tooth (Fig. 4A).
Type locality: Prémontré Abbey, Prémontré (Aisne, northern France).
Type horizon: “Sables de Glennes” (Laon Clays Fm.), Level 2, late Ypresian (NP12), Eocene.
Material.—Nine teeth.
Diagnosis.—Small species of Galeorhinus, teeth up to 2.2 mm in total width, with a reduced number of
denticles on the distal edge of crown (up to 4) and lacking denticles and serrations on the mesial cutting
edge, except sometimes a very small basal one. G. louisi differs from all other Galeorhinus species in
having the base of the labial face of the crown (overhanging the labial crown−root junction) with several
marked irregular folds and associated notches on the entire width, forming sometimes a horizontal,
straight transversal bulge in labial view. Root not very thick, with lobes always clearly separated, even in
the anterior files.
Espèces et Taxonomie (23)
Etymologie (Etymology, Derivation nominis)
Pas de règle ICZN, voir journaux (the ICZN makes no provisions about this, but many journals require it).
Etymology : The species name kahiko derives from the rich and poetic Hawaiian language. Primarily,
Kahiko means ancient, the remote past, or an ancient person. Kahiko was the name of the first native
Hawaiian man. When the initial syllable is stressed and long, kahiko means ornamented or dressed in
fine clothes (see Malo, 1951; Pukui and Elbert, 1971). The
word thus appropriately describes the only extinct, endemic Hawaiian species of Conus, a shell with a
richly ornamented color pattern.
Etymology: Named after the type locality, commonly referred to as the Charleston Lumps.
Etymology : The Latin verecundus (shy) refers to the males’ habit of calling softly from concealment.
Citations (references)
Vérifier les recommandations aux auteurs, certains journaux exigent
toutes les références citées y compris celles des différents niveaux
taxonomiques, d’autres les exclus
(Make sure to follow a specific journal’s format in this (and all other) sections.
Espèces et Taxonomie (24)
12
Order Carcharhiniformes Compagno, 1973
Family Triakidae Gray, 1851
Genus Galeorhinus Blainville, 1816
Type species: Squalus galeus Linnaeus, 1758, Recent. “European seas”.
Galeorhinus louisi sp. nov.
Synonymy: Galeorhinus articus Frabi, 1886: pl.2, non pl.6
Etymology: Species named in honour of Pierre Louis from the local“Société Laonnoise et Axonaise de
paléontologie” for his contribution to palaeontological research in the Reims region.
Holotype: UM−PRE 11, a lower antero−lateral tooth (Fig. 4A).
Type locality: Prémontré Abbey, Prémontré (Aisne, northern France).
Type horizon: “Sables de Glennes” (Laon Clays Fm.), Level 2, late Ypresian (NP12), Eocene.
Material.—Nine teeth.
Diagnosis.—Small species of Galeorhinus, teeth up to 2.2 mm in total width, with a reduced number of
denticles on the distal edge of crown (up to 4) and lacking denticles and serrations on the mesial cutting
edge, except sometimes a very small basal one. G. louisi differs from all other Galeorhinus species in
having the base of the labial face of the crown (overhanging the labial crown−root junction) with several
marked irregular folds and associated notches on the entire width, forming sometimes a horizontal,
straight transversal bulge in labial view. Root not very thick, with lobes always clearly separated, even in
the anterior files.
Espèces et Taxonomie (25)
Type(s)
-Holotype obligatoirement défini (après 1999) et servant à la description de
l’espèce
-Holotype (et série type) obligatoirement déposés dans une institution et
accessibles (ICZN, art. 72)
Holotype: spécimen (ou partie) unique et matérialisé* (illustration autorisé par
l’ICBN) + description sommaire de la pièce (par ex. os, sexe, taille)
Syntype(s): matériel supplémentaire de la série type (individu composite)
Lectotype: spécimen unique issu des Syntypes pour servir d’équivalent à l’holotype (cas des anciennes
descriptions). Les autres syntypes devenant des Paralectotypes ICZN Art. 73b
Paratype(s): matériel additionnel (différentes institutions possibles)
Neotype: en cas d’absence, de perte ou de destruction de la série type, a utiliser de façon exceptionnelle
(ICZN, Art. 75 et ICBN, art. 9.3-13)
- Indication précise du numéro d’inventaire et de la localisation de la série type
*Nb: moulage et scan numérique non autorisés, empreinte et trace fossile exclues (ICZN Art.72 C i, p.143)
Espèces et Taxonomie (26)
13
Type(s)
Localité type (type locality): lieu de vie ou de récolte du type, coordonnée,
GPS (de plus en plus demandé)
Horizon type (type horizon): formation, membre, série géologique ayant
livré l’holotype
Choix de l’Holotype:
-Si possible, spécimen ou partie de spécimen :
-la plus complète,
-la plus grande (limite l’effet ontogénétique),
-la plus diagnosique et
-montrant les caractères les plus « médians » (statistiquement)
Espèces et Taxonomie (27)
Order Carcharhiniformes Compagno, 1973
Family Triakidae Gray, 1851
Genus Galeorhinus Blainville, 1816
Type species: Squalus galeus Linnaeus, 1758, Recent. “European seas”.
Galeorhinus louisi sp. nov.
Synonymy: Galeorhinus articus Frabi, 1886: pl.2, non pl.6
Etymology: Species named in honour of Pierre Louis from the local“Société Laonnoise et Axonaise de
paléontologie” for his contribution to palaeontological research in the Reims region.
Holotype: UM−PRE 11, a lower antero−lateral tooth (Fig. 4A).
Type locality: Prémontré Abbey, Prémontré (Aisne, northern France).
Type horizon: “Sables de Glennes” (Laon Clays Fm.), Level 2, late Ypresian (NP12), Eocene.
Material.—Nine teeth.
Diagnosis.—Small species of Galeorhinus, teeth up to 2.2 mm in total width, with a reduced number of
denticles on the distal edge of crown (up to 4) and lacking denticles and serrations on the mesial cutting
edge, except sometimes a very small basal one. G. louisi differs from all other Galeorhinus species in
having the base of the labial face of the crown (overhanging the labial crown−root junction) with several
marked irregular folds and associated notches on the entire width, forming sometimes a horizontal,
straight transversal bulge in labial view. Root not very thick, with lobes always clearly separated, even in
the anterior files.
Espèces et Taxonomie (28)
14
Diagnose (Diagnosis)
- Obligatoire (ICZN, art. 12) et en Latin (ICBN art. 36.1 et 36.2)
- Différent de la description, la diagnose inclus uniquement les caractères
qui distinguent la nouvelle espèce des autres. Elle est courte, dans un
style épuré et sans référence à l’holotype
Cas de la Diagnose différentielle: Dans ce cas, il s’agit de lister les
différences avec chacune des espèces du genre
Certaines diagnoses peuvent être incluses dans une « clé de
détermination » (=diagnose différentielle)
Cas d’un nouveau genre: La diagnose de l’espèce (type) est celle du
genre:
« Diagnosis: same as for the genus »
Espèces et Taxonomie (29)
Cas de la diagnose émendée (Emended diagnosis):
Order CETACEA Brisson, 1762
Suborder ODONTOCETI Flower, 1864
Superfamily EURHINODELPHINOIDEA Muizon, 1988
Family EURHINODELPHINIDAE Abel, 1901
Genus Schizodelphis Gervais, 1861
Schizodelphis sulcatus (Gervais, 1861)
Holotype: MNHN RL12, a skull and a short part of the rostrum preserved without vertex or ear bones
(Gervais, 1861).
Type Locality: Near Cournonsec, Hérault, France (Gervais,1861). No GPS coordinate available.
Type horizon: Late Burdigalian ‘‘molasse coquillière’’(Gervais, 1861).
Paratype: PGN2, Skull remains and ear bones from Pignan, housed in the palaeontological collections of
Montpellier University, France
Emended diagnosis: S. sulcatus is distinguished by its dimensions, especially the length of the skull and
the low height at the base of the rostrum. Both skulls share a ventrally deflected postglenoid process,
however it is a less visible feature on MNHN RL12. S. sulcatus differs from S. barnesi by the more flattened
maxillar plate (not forming a longitudinal ridge) and the lower position of the paroccipital process compared
to the height of the postglenoid process in lateral view. On ear bones, edges of the fenestra rotunda of S.
barnesi are prominents, whereas they are flat on PGN2 and the periotic from Uzès. S. sulcatus differs from
S. morckhoviensis, by the ovoid shape of the nasals which are rectangular for S. morckhoviensis, the
maxilla less markedly telescoped over the supraoccipital (the posterior margin of the maxilla only slightly
passes the level of the nasal dorsally), the tympanic bulla which does not show an anterolateral concavity,
and the anterior angle of the periotic which does not exceed. Both S. barnesi and S. morckhoviensis share
a triangular projection of the anterior edges of nasals above the bony nares, a characteristic absent in S.
sulcatus.
Espèces et Taxonomie (30)
15
Abréviations autorisées et d’usage
aff. = affinis: Affinité avec mais non identique (having affinity with but not identical to)
cf. = confer : Confère (to be compared with, compare with)
comb. nov. = Combinatio nova: Nouvelle combinaison (new combination)
emend. = Emendatio: émendé (emended)
e.p. = ex parte: en partie (in part)
gen. et. sp. nov. = genus (novum) et species nova: Nouveau genre, nouvelle espèce
(new genus and new species)
gen. nov. =genus novum: Nouveau Genre (new genus)
ibid. = ibidem: meme référence (the same reference)
In: dans (in)
incertae sedis : position taxonomique incertaine ( of uncertain taxonomic position)
nomen nudum (pl. nomina nuda): Nom d’espèce sans désignation (invalide) (a name
without a designation (i.e.,its description is not acceptable nomenclaturally)
nov. = novum: Nouveau (new)
nov. sp. = nova species: Nouvelle espèce (new species)
s.l. = sensu lato : Au sens large (in the broad sense)
s.s., s. str. = sensu strictu : Au sens strict (in the strict sense)
sp. indet., sp. ind. = Species indeterminata: Espèce indéterminée (species indete)
spp. = species species (pluriel): en référence à plusieurs espèces du même genre ( used
in referring to
several species, usually in the same genus)
syn. = Synonymum: Synonyme (synonym)
tab. = tabula : Planche (plate, illustration)
Espèces et Taxonomie (31)
Description:
- L’ensemble des caractères visibles
(diagnosiques ou non) sur l’Holotype et des
Paratypes (variations) sont explicités dans
cette partie parfois longue.
- Le style peut être télégraphié ou non.
- La description peut être divisée en sous
parties (entités squelettique, anatomique voir
écologique, biologique etc…)
- Rappel possible aux figures ou aux tableaux
de données biométriques par exemple
Description.—The dignathic heterodonty is moderate and
concerns especially the shape and size of the cusp. The holo−
type (Fig. 2E) is an upper latero−anterior tooth, broader than
high. The enamel is mainly smooth. The cusp is high, well in−
dividualized, distally inclined with an angle close to 45; its
mesial cutting edge is rectilinear on the whole, slightly con−
cave and oblique. The distal cutting edge is straight, long and
oblique. The distal heel is well−developed, oblique and bears
five denticles with a size which decreases distally. The distal
angle (formed by the distal cutting edge of cusp and the mesial
edge of the first denticle of the heel) is acute. The lingual face
of the crown is rather convex transversely, especially on the
median part and it sometimes bears some parallel folds at the
base of the mesial extremity (Fig. 2E1). The labial face is
rather convex, especially at the level of the cusp. Its basal limit
is medially concave and clearly overhangs the root without
forming a true transversal bulge. The root is thick; the lobes
have very flat basal faces and are separated by a broad and
deep nutritive groove that reaches the crown−root boundary on
the lingual face (Fig. 2E1). A large foramen opens in the me−
dian part of the groove. The lingual protuberance of the root is
well−marked but not salient. The two margino−lingual faces of
the root show many and rather large foramina, especially to−
wards the ends of the lobes. In lingual view, the basal edge of
the root is medially concave and marginally raised. The labial
face of the root is low, with a slightly concave profile and
bears many foramina, irregularly spaced and aligned parallel
to the basal edge. Other antero−lateral teeth show a similar
morphology with moderate change in cusp shape (Fig. 2D)
and number of distal denticles.
In the anterior teeth, the mesial cutting edge of the cusp
bears few serrations on its basal and median part (Fig. 2B, C).
The distal heel is abrupt and cut out by five denticles. The nu−
tritive groove is narrower (Fig. 2C2) than on the holotype.
A lower symphyseal tooth is almost symmetrical (Fig.
2A). The tooth is rather narrow, with an almost vertical
erected cusp. The mesial edge is concave, with a blunt
denticle in its median half part. The distal edge is very abrupt
and bears three denticles; distal angle is close to 90. The
lower boundary of the enamel is medially concave.
The lower teeth (Fig. 2F–J) are relatively broader than the
upper ones, with a more erect cusp, leading to a more con−
cave mesial cutting edge. On an anterior tooth (Fig. 2G), the
mesial cutting edge is medially concave to slightly convex
near the apex of the cusp; the distal cutting edge is long and
oblique and the distal heel has three denticles. This tooth is
remarkable by the presence of a broad and probably abnor−
mal supplementary nutritive groove across the mesial lobe of
Espèces et Taxonomie (32)
16
Illustration(s)
-Photos (> 600dpi), tout types de
dessin = consignes du journal
-Illustration(s) de l’Holotype +
paratypes recommandées
-Légende en adéquation
Nb: Attention l’illustration ne se
substitue pas à la diagnose ou la
description qui restent les seules
normes de l’ICZN et ICBN
Fig. 2. Triakid shark Galeorhinus duchaussoisi sp. nov. Prémontré Abbey, late
Ypresian. A. UM−PRE 1, parasymphyseal tooth, labial (A1) and lingual (A2)
faces. B. UM−PRE 2, anterior tooth, lingual face. C. UM−PRE 3, anterior tooth, labial
(C1) and lingual (C2) faces. D. UM−PRE 4, anterior tooth, labial (D1)
and lingual (D2) faces. E. UM−PRE 5, holotype, antero−lateral tooth, lingual (E1)
and labial (E2) faces. F. UM−PRE 6, lower antero−lateral tooth, labial (F1)
and lingual (F2) faces.G. UM−PRE 7, lower antero−lateral tooth, labial (G1) and
lingual (G2) faces.H. UM−PRE 8, lower lateral tooth, labial (H1) and lingual
(H2) faces. I. UM−PRE 9, lower lateral tooth, labial (I1) and lingual (I2) faces. J.
UM−PRE 10, lower lateral tooth, lingual (J1) and labial (J2) faces.
Espèces et Taxonomie (33)
Dessin scientifique (estompe) publiable
Image non publiable
(dessin de Laurence Meslin-CNRS-ISEM)
Espèces et Taxonomie (34)
17
Dessin scientifique au trait (semi-interprétatif)
Image relief (3D) – Décalage 5°
(dessin de Laurence Meslin-CNRS-ISEM)
Espèces et Taxonomie (35)
Siamopithecus eocaenus (Thaïlande, Krabi, -34 millions d’années)
Spécimen fossile (brut)
(maxillaires + mandibule compressés)
Dessin scientifique (technique estompe)
des maxillaires en vue palatine
(dessin de Laurence Meslin-CNRS-ISEM)
Reconstitution 3D virtuelle
Espèces et Taxonomie (36)
18
Changement de nom
Aaroniella andrei nom. nov.
Replacement for Aaroniella badonelli Thornton, 1989, Bull. Mus.
Natl. Hist. Nat., Paris. 4e sér., 11, 1989, section A, no. 4: 810–812.
Preoccupied by Aaroniella badonelli (Danks): DANKS, L. (1950), State
Museum of Natural History, Riga, Latvian Soviet Republic, Information
Sheet No. 1, 2 pp. Transferred to Aaroniella by THORNTON, I. W. B.
(1981). Systematic Entomology, 6: 425, 432.
The newname retains the purpose of the preoccupied one: to acknowledge
the great debt that I, along with other students of the Psocoptera,
owe to the late André BADONNEL in the study of this order of insects.
(Thornton 1991:483)
Nouvelle combinaison
Namikawa, H., S. Kubota, and S. F. Mawatari. 1990. Redescription
of Stylactaria uchidai (YAMADA, 1947), comb. nov. (Hydrozoa:
Hydractiniidae) in Hokkaido, Japan. Proceedings of the Japanese
Society of Systematic Zoology 42: 2–9.
Espèces et Taxonomie (37)
Cas des sous espèces:
- seule catégorie infra spécifique autorisé par l’ICZN
-Trinomial (ex. Leiocephalus personatus elattoprosopon (Gali et al. 1988))
- une sous espèce nominotype + autres espèces (Leiocephalus
personatus personatus, Leiocephalus personatus elattoprosopon)
- l’ICBN autorise 5 autres catégories intraspécifiques dont sous espèce,
variété et forme (ex. Atriplex longipes subsp. praecox, Chrysothamus
viscidiflorus ssp. humilis, Ameria maritima var. sibirica, or Aloe
macrocarpa form. major.)
-Suit la même description que pour l’espèce (holotype, « diagnose »,
etymologie…)
Espèces et Taxonomie (38)
19
Description d’un genre
- nom unique parmi les genres du même règne
(the genus name must be unique within the kingdom).
- singulier et uninomial, 1ère lettre capitalisée , mot latinisé, pas d’accent et
en italique.
(it is singular,Uninomial, Latinized, spelled with an initial capital letter, no diacritical marks
and italicized).
-Dans le cas où le nom de genre n’est pas un mot grec ou latin, le nom de genre
est considéré comme masculin par défaut sauf décision de l’auteur (ICZN 1985,
art.30)
-Le nom peut etre moninal (Unio = perle), tiré d’un ou plusieurs adjectifs
(Chilehexops = « six yeux du chili », Saginospongia =« éponge en forme de
filet »…) ou commémoratif (on ajoute –ius, ia, ium après une consonne terminale
(Lamarckia,Cunninghamia) et –us, a, um après une voyelle terminale (Blainvillea))
Espèces et Taxonomie (39)
Description d’un genre
- Ajouté nov. gen, new genus, gen. nov…
- Donner l’étymologie
- Désigner une espèce type (ICZN 1985, art. 67-69)
Désignation original (création du genre et de l’espèce type)
Désignation secondaire (création du genre et désignation d’une
espèce déjà décrite comme type)
- Diagnose du genre (intégrant l’ensemble des espèces considérées)
- La description n’est pas d’usage pour un genre fossile mais elle peut etre
« refaite » pour l’espèce type.
Espèces et Taxonomie (40)
20
-Date et auteurs d’une espèce sont modifiables avec les changements
de genre pour les végétaux(ICBN)
Radphiodiocystis chrysocoma (Schumacher) C. Jeffrey (1962)
L’auteur originel de l’espèce chrysocoma est Shumacher, réattribuée au genre
Radpiodiocystis par Jeffrey en 1962
- Date et auteurs d’une espèce sont non modifiables pour les
animaux (ICZN) mais il est mis entre parenthèses si le genre a été
réattribué depuis.
Loxodonta africana (Blumenbach, 1797)
L’auteur original de « africana » est Blumenbach en 1797 mais sous le genre
Elephas
(Date and authorship of species affected by change in rank (ICBN), unchanged (ICZN)
Espèces et Taxonomie (41)
Genus Gomphogaleus nov.
Type species: Mustelus rodgersi Case, 1994, by monotypy; Meridian, Lauderdale County, Mississippi,
USA, Ypresian, lower Eocene.
Etymology: From Greek gomphos = “thick” referring to the great thickness of teeth.
Diagnosis.—Fossil genus differing from all other triakid genera in having small, thick teeth with short
distal cusplets and completely smooth enamel. Compared to all genera with cuspidate teeth (Galeorhinus,
Kouribgaleus, Pachygaleus, Triakis, among others), the cusp is shorter, rather erect, little
detached from the rest of the crown and its mesial cutting edge is clearly concave in labial view. The labial
face is convex in profile and strongly overhangs the root. Only one short denticle emerges from the distal
heel of the crown. The root is stocky and reduced in size; its lingual protuberance is well developed,
prominent, rounded and the two lobes are largely separated by a broad and deep nutritive groove.
Gomphogaleus rodgersi (Case, 1994)
Fig. 5A, B.
Synonymy: 1994 Mustelus rodgersi sp. nov.; Case 1994: 118, pl. 13: 276–281.
Description.—The best preserved specimen (Fig. 5B) is a latero−anterior tooth. The enamel is smooth
on both faces. The cusp is little detached from the rest of the crown, short and slightly erect. The crown is
broader than high. The mesial cutting edge is concave except in the mesial base where it is rather
strongly rounded. The distal heel is well developed, high and bears a strong, short denticle. The distal
cutting edge of the cusp is short, subvertical and slightly longer than the mesial edge of the distal denticle.
The distal angle is close to 90. The marginal part of the distal heel is rather long and slightly convex; its
lateral extremity is very rounded. The labial face of the crown is nearly flat. Its basal edge is marked by a
well individualized transverse bulge above the crown−root junction.
Espèces et Taxonomie (42)
21
Description d’un taxon supra générique:
-Nom (pas d’italique, avec terminaison adéquate) + new « taxon »
-Diagnose, genres inclus
CLASS MAMMALIA LINNAEUS, 1758
ORDER INSECTIVORA CUVIER, 1817
et discussion
SUBORDER ERINACEOMORPHA GREGORY, 1910
FAMILY DORMAALIDAE QUINET, 1964
Sespedectinae, New Subfamily
TYPE GENUS: Sespedectes Stock, 1935.
INCLUDED GENERA: Proterixoides Stock, 1935; Crypholestes Novacek,
1976.
DIAGNOSIS: Shares with the dormaaliids Scenopagus, Ankylodon,
Dormaalius, and Macrocranion the following …
DISTRIBUTION: Middle-later Eocene (Uintan), southern California.
DISCUSSION: The distinctive features shared by the southern California
Eocene dormaaliids warrant recognition of a separate subfamily
for these taxa. Sespedectes, by far the best represented form, is designated
the nominal genus for the group. Crypholestes is the most conservative
sespedectine; Proterixoides, in some aspects, the most derived.
The above diagnosis clarifies the inclusion of sespedectines within the
Dormaaliidae (see alsoNovacek, 1982) but distinguishes them from more
generalized dental taxa…
Espèces et Taxonomie (43)
Règne
Plante
Plantae
Algue
Protista
Embranchement, Division ou Phylum
-phyta
Sous-embranchement, Sous-division ou
Sous-phylum
-phytina
Classe
-opsida
Sous-classe
-idae
Superordre
Champignon
Fungi
-mycotina
-phyceae
-mycetes
-phycidae
-mycetidae
-anae
-ales
Sous-ordre
-ineae
Infra-ordre
-aria
Superfamille
-acea
Sous-famille
Tribu
Sous-tribu
Animal
Animalia
-mycota
Ordre
Famille
Bactérie
Bacteria
-oidea
-aceae
-idae
-oideae
-eae, ae
-inae
-eae
-ini
-inae
-ina
Espèces et Taxonomie (44)
22
La taxonomie numérique ( Sokal & Sneath, 1963)
= Taxonomie andansonnienne (Andanson, 1763)
I.
II.
III.
IV.
V.
VI.
Choix des caractères
Etablissement des unités a classifier (phénons)
Choix des règles de codification
Choix des algorithmes de classification (mesure de ressemblance)
Calcul du graphe arborescent (dendogramme)
Interprétation
Méthode
s’apparentant plus
à de l’écologie ou
de la génétique des
populations
(relations entre
populations ou
souches)
Espèces et Taxonomie (45)
New name needed for unwise Homo?
Homo sapiens was the name Carl Linnaeus assigned to our
species in 1758, when humanity may indeed have seemed ‘wise’
relative to others. Today, this name is up for debate, given our
questionable ability to control the potential disasters we have
unleashed.
An animal that imperils its own future and that of most other
life forms and ecosystems does not merit a single ‘sapiens’,
let alone the two we now bear.
We should be formally renamed to more accurately describe
a species that is: exterminating thousands of others;
releasing carbon, nitrogen and phosphorus in amounts
exceeding Earth’s natural cycles; devoting 50 times more
resources to making weapons than to sustaining the food
supply; destroying forests; degrading soil; polluting water;
pillaging the oceans; and damaging the atmosphere on a
planetary scale.
Changing our species’ name might risk infringing some of the
hallowed rules of nomenclature, but it would send an
important signal about our present collective behaviour. Our
present name Homo sapiens sapiens could then be reserved
for a future type of human that is able to meet defined criteria
such as, for example, living within the planet’s boundaries
(Nature 461, 472–475; 2009).
Julian Cribb Nature, aout 2011
Espèces et Taxonomie (46)
23
G.G. Simpson, 1961. Principles of animal taxonomy. New York, Columbia university press
241 p.
E. Mayrs, 1969. Principles of Systematic Zoology. 260 p.
E. Mayr & P.D. Aschlock, 1991. Principles of Systematic Zoology 2 edition.
J.E. Winston, 1999. Describing species. New York, Columbia university press. 487 p
http://www.mapress.com/zootaxa/
Espèces et Taxonomie (47)
24