q-gram Based Database Searching Using a Suffix Array (QUASAR

!#"%$'&(*)+$,&(*-/.103254+6879):4;/4<:=
>?A@BDCEGF(HJILK#MNCOIQPN?%R
c CENVAdeY@?A@Igfh@UEiMJZB R
STENPJIQ@UCVXW1IQCHNVL@IR
j IQ`\kgl`nmOC[\Vpo
v wxzy'{a|}Ay
h
~zz/,zAQ%Q
U,1zpQz
¡z ¢£¤ QeQ£O,¥ALz'T¦%¤§Lz¡©¨zX
,¨AOQT£, %¢ª£«,eQzuG% ¤¬
¤LT£¤ ¨®r¯X,°±²z ¨!³ pnQDgQ¤z¡z%pzAQ'´z¡
¤%¡zXµh¤ z^Q¤¤¡¬a°±,zD¬¶¤¤· %Qz TQ1¤Qz
QeQ£O,®¸
'zXµTzp,µ QeQ£OQgAQze¹¤¡¬
z¡zºA¤¤ X»
¼ ½¾u¿ » ¬¶Qeº¤ %,U£OQ X½¬
ÀÁ ¾he¨eÂNµheµ z/'ÃU¤¡¨ ,z,U,
µh¡zpDz ¦%¤Qz¡¶¨(z·z,¨/X·z Á iµh,zp¨
QzehLz ,z Le£ ®Ä
¤ Qz¡z;Q¬
¤,1% À AQzNÅL¬az¤ À ¤¡z,z%%¤%z gz
Q·ÆÇ Á Qe¨®ªÈµ¢°±,z 1µ'z ,°±¤ ¥É%
¾Êz NÇ Á Qe¨ i,JzzÇ Á Q¬
e¨/ Ã®#~Ë, %OLz i%¤%eLzµh¡z%¯Ì½È
Q É zOLJ Nz e/N ,JQOp¡z iÉDz,A®
Ía¥#Aµ° ,A¥#zDz,z zXz%ALz'Ë/Dz ¤¡¨«%¤Q

uU,
Qhh©¨¤¤¡¨XzAz ¥O® ®¥Ogz, z Á
QN¤Dz,z( Á z A
eQ ¿\Î½ÈeÂ'®
Ï ÐÒ y'{\ÓOÔÕ}AyeÖ Ó Ò
Ñ
%,z ¤Qz Qe£X¤ ª× zz,
U,ªQztLµØz ¤¡¨:A° Q¤Q£¤tL°±,¹z²~GÎ¯*
LzgeÃU¤¨Ë£ %Æz²Ù¶¤£¤ Q
%¤¤L%£ ¤¨Ú
Û ~Ë¤Ü±ÝÞ\®Èp Xz«zg, 1£OQz´·zgAµ,Q
£ % ¤,¤QËß,àá,âà'ãäeà¹äzåæ
çèéeêÉß'åã²µhztz¢AQ,¬a§¬¶«Q
z¤¦ALz'ge QeQ£OQ·É¦U,· Á £¡z
ßzêÉæ/ênëèéeêÉìníTzËË °±t,¨^A ®rÈÆALz'TLz
Aµ ¨(zzg °U¡e¤ÉQX%¤¤Lp£ ¤ Q¨^£A
z,¨/,z°±zgÙ¶ ,eQz,µ^ÃUAµh¤ Ú Û ±ÜîÞ\®J~t,°±'
,µ^ ,N¤ A, ¥±°U¡z
zz z§Lz
QeQ£O,J!zi Á Dz®¡ï,zA¥L£#AOQ¤¤¨z,z,Dz¥
Q¤ALz Jz QeQ£OQ
Lz·z·¤Dz'z%N%¤Q
U,zTA,¦nQ%¤ Û ð·ñ ÜòQÞ\¥#Q z//£¤¡¨
QNA
§e %,UzhT%·A Û ñ ½óJÜòÞ\®
ôeõö÷ø©úù û ÷ÉüLøý û\þÿ ÷ þ aÿ
ÿ ü Qÿ'ö ÿ,û û ú ù ý ü ýh÷ û\þÿ ü ! "ÿ'#û $ %
þ
ü ý ÷ÉüLøý û\þ
ÿ &ÿ ' (û ) *+ÿ )a&ÿ , û ) aÿ %
ÿ -.&
/ &0 / ö )\
ÿ ÷ aÿ 1!

ø
ý
ü
6
ü
ý
ý
ú )23)54Nû 3) û )2Aú )73 ¶û\úQ8
þ 95;:=<>2 û ;$ )$2@?A üQøý #û B
þÿ C ÷ DFE G.& ! BHI.KJF3 3 û 6 =û\þÿ ü Y
COZ[\Z^]J@ILIQCO_àENC^b
qrCOIL?L`\Etsg`\EJ_ILZEuo
LOD:ze%¤Ã±;z ¯Ì½È
Q LU½È# eÃ¬
Û Ê½ ó ÜM¥ONÌò ò ÞJQ¡z,eQz ½U%¡z¬\~¹Lz,zp Û ½~GòQP'Þ
A,¤ %z1LzX ÉQ1z/z ®ÎN¤¤¡¨
¯Ì½È¹N%z°±¤¡¨nQDA®NÈiz Qe,z%i
¤AL
AQQUzJµh¤i¤¤'z/QA!AQzeN,
µQ £¤ %z(z· U£z Qi %·£Dz
z,¨1Dz®Èz¤¡·¤DQ#AQ Qz¡z%z
Le£ ®i¤z /zQ¤ z¡z+'Éz%N¤ QeQ£O
ALz'·Q·p Rp ¥!z ¨!³
¤Qz z z
z ,T%zXDz ,U(,ÉQzp,XzA¡z%,Uzµh,z
z,·¤ Qz¡z%zAQ'z¡h¤%z®i¯¡hz %Qz
XÎ½È Qe£z/¡z¤¡zz ¤Dz,z/Q
/zUz Á #z 1A¥ ¤¤¡¬©Q±QD¬¶¤¤%OL¬
/Qh¤§Lz %z· QeX zg£% %z ®pÈ
z£¤ z,X%z £¨^zzp Á z§Q¤
zAµz%zpQ¨1A QeU®NÈU¥ Le£
Qze
z ¤zQz zz %zz¡z QeQ£Op¨(%zAL
Ézz£%¦z¤Aµ zp µhzz1A°¤'/Q Qe
¿n¦Q¤ Û ÊX¨ÜSQÞÂ'®
Í©z À ,¤ Q3à T±è ä,ì·Dz^pQze¥z,'OA°±
£ ° ¤ zOQ¦zz,z Á ¦«'«µ¨zOLA¥
ÆAQzeX%OLz,z¥¤¡¨p¤¤JQz
QzQz Á ·'¬
zOQ¤¤¨ zX£( Á ¤,z¤¡¨Q ®p½U(Æz(Q¤AL¬
z ,z£ £L°± ¥ (% ¦°±,¨ÆDz¦pQze
,z¡z,z !¥
z ÆTz eµ tzzeUGQ¬
'gz²z'Æ%zL°±z«,Ç(,¨Q Le£ËALz'¬
pQ¤z¡z%+® U LzQz¦ DzAQz Á Qe
Dz'zz(¤Ã±gÇ Á z Û ÊT&U%MV Þ\¥Ç Á Qe¨ Û ÊÊgÜXW Þ\¥
Y
NJLz,§Tz, Û ð UO MWQÞ\¥zOQQ¤¤Aµ+zg,z ,z¦
z%gzz ¤z¢zT¤,z´z,¨^Dz«µh¤
£( , ,UQh £¤¦Jz·Z R,QJzQze
z Á Û ÊTU%MV Þ\®
Ä
¤¡¨%É,µuLz%zA°±
£,Xp z1 zz,'¬
,zXz/%¤Lz¶ÄQze¦ £ ¤ A¤¬
,®:ÊgQzR Û ÊgQeòW Þa¥hg Á Q%¤ ¥h L° Æz À zDT¬
¤ALz;Æu ¡z z%¤¤L²£ ¤ Q¨® È
Le^Dz,zzÆzA¡zg£ [
P&V¹z%Tz¢¢
z´DzQz«z«z OQ¤ Qeªµh'u¤AQz¤¡¨p¨G,zALzË,z¡¬
gz£¤%pµhQ¤ zª¤§Lz Qe¹¤¤'z¹¿n
¤ Û ¸
ÜM¥!ÊT¸
Ü±ÝQÞÂ'®
È À zD
£¤Q Á ,,z z%¤¡¬
Qz¡z%·µ,zpz £U\
¨ UÆQ Ìµh¤' Û UÌÜ ] ÞQ
¼ ÃUÃ± Û ¼ ÃUÃXÜ SLÞ\®«È,¨«XÆÇ Á z,QzU,¨Ë'¬
£hDz¤¤AQTz QeQ£O®
ÊX¨,z Û ÊX¨±AÜ] Þ
Dz Ë£¤AL«¿n´z QeQ£O
^ RLÂ#ALz'%Q¤ z¡zzQNNz,z Qz 1 Á £¤
pz Le£OQA,®iÈ'¨%A¤hz
p¤¤h£Dz pQ µQ %zØ¢ U£z z
Qz·¤ALz Tz· Á ®iÈ·Í©¯Ê z ,KLJÌ½¸ Û U¾
ÜWÞ
eÃ ¦ ° QUeQ %QhX¤QzªÙ©z£OQ£¤DzÚ Á µh'z%
Q¤¤JÅQ¬\z¤
Lz/, ,z ¥£ ¤¨g %¦iz LzeQ¬
%¤¡¨pe ,®iÈ'¨%z PAò ¯´ Á É PAîî/%¤¤
z, Le£OQµh'%pQÃ±ie%pQz±e%%eQ,zA¤
¤Qz Qe£®
Í©z¦OQ,·µ(zDz,z¤°±¦zXz(ALz'«/,¬
,zOLLz
Dz ¤¡¨p%¤§Lz/°±,¨1A ®
3©ÄQ¤/,OQzGÆAQzeGQ Î½È QeQ£OQª¢,¬
,zOQ/Lz ,z°± z z(zQ%% p·z%,¨
U, ® È z,Q¦%¤Lz¶¨ Á 'z 'z
£,A1Æ, ¥ /¤¡¨, z A¤#µh¡zÆA,
'zz® Lz,z%z ¥Uµ·OA°±g% T¤Qz gµh,z
pQ¨1ALz'Lzz(z 'z,¤Ã±¥U ® ®¥pQ¤¤¡¬¶° ,zD¬¶¤¤
, %OLz i/,NA,®ÈU¥µ Q1Qze
Q¤ z¡zzOL·
à'é'
í èßzìN ÆAQ'¤1AQze«Lz/ Á ¬
,p¿n£¤¡¨Â % ¡z°U¶¨® ° ´z¤Aµ
'ÉzpQ¦Q,z ÃU, %OLz z%z,zOQ¤%%Q¨
¿Éz,±Q ·QJz%Q eD,NeQzLÂ'¥ »
¼
½¾Ëi£
¹¹ Á LeTDz'zz(zÆA°± z%¤AQ/AQËz
,Uz¡z Qe£ ®
L¤¤Aµh«gDe Q z et¿nX® ® Û ¼ Ü P±¥ ¼ ÃÃÜXSU¥
¸
¯·Ü ]¥ NJ~GXÜ W¥ NiÌò òQÞÉÂ'¥Xµtz,z1¤Qztztz £¤ Q
Qze·ÉQ Le£ANµh'pLz° ,¨1,¤zz
,¨«U,pzgz%z£¤ ,z%Æ«ãâ
æ eà'éTå 3à T±è ä,ìNAQze··£A,
¤Qz¢Å¿n¤¤ ÅL¬
Qe%eÂ'®iÄ
Nz e(J£O z ¤¤Aµh¦ £'z° Lz
ê ì å¦ßàá,âà'ãäeà'
ß è à
èQãà êÉì êÉßzìaèãOä'
à eà,ëå ¹è1äeà'é'ìaèQêÉ
ã zåâUã åQãàÆäeèQ
ã âèQéèãì¶àeàì èì/ì à'íËß èéàè¹äeà'éeìaèêÉãGãâU
æ eà'éÆå 1Å éDèæ1ß Û ¼ ÜQP ¥ ¼ ÃUÃÜXSLÞ\®iÈh £,z°Qz T¤¤Lµhz
À ¤z'1zOL(¤'z(A LzX¡z1§z 3z Le£OQ
µh,z¦z,¨XA¦ £¤¡¨,zµhz(¤°±¤
Q%¤Qz¡©¨®JÈ ¡z Ap¤Qz'£h,z %%Qz
zµh¡z1De L ¤ %¤ Qzzg®
È/,z,§Q¤N z1Qz±eÆµ1/ »
¼ ½¾
µ·z'z,ÉQz1z ¢z À ¤¡z,·µhe¢1£%
Q¤¡zA ¨ªÃAµh¹ A/²,µºµA¨®~ËÆëå ê\äzè ëë í%OLzz
z Qe£¹z²U¤¦¤Qzu£¤'ÃU1^ R ¥¦z¨
¥ ^¿n,©®
Û ~ÊgÜXSÞÂ'®gÈ%AQzeËzp,Ä,!G¦z ,¬
, % z(¦,eQXU1£'QÙ©%¤Qz¡©¨Ú(Qze
£A,Q"
Q$ #5Tà %¤,z!®Æ½UeËgALz'¹%¤,¬
%,Uz £¨/Qze·ÉQQ¤¤zz,Q¡ziÅQ¬aQe%i
z QeQ£OQ ¥ , zAe¦£¤'ÃzNU1£'AQze
ÅL¬aeQ%X,z¹t¡A® pz A¥Ëz 'z¤¨´'
£ ²zT1£,1·Qz ÅQ¬aQe%%Q¤¤Aµh(z ,¬
z,,
£¤'ÃUµh'£¤¡¨gQz z QeQ£Oz
¤¡¨%%¤Qz¦zU,¨/A
ª¿nn® ®¥AQ Qzh¡zeÂ'®
¹Qe¨¢hz,z %´ %,£¤'&Ã %´ zg,
zp Uzz/ gÇ Á Qe¨ Û ÊÊgÜW Þ(Q¤
Q
('¬¶'Ç% Qe(Dz,zzÉ
eÃ¤¡¨z,z°U1z
¡zµh,zzhALz' ÅQ¬aQe%i(z Le£ ®
~«·%¤%z ©µ1°±,z QN Le1Dz'zz¦ ¤¡¬
z¡z
^¢%ªzQgzµh ¤ Qe¹¤¤'zr
z, (Ëzpz,zOQ¤%%Q¨¢Qzp %z,A¥NQ z
Qz,(%gzOL/z Á LeÆDz,zzp1¤Lz X
zUOz1z, · Ã®
Èz¤¡ziµe°±hµh¡zzz±Q'pLµ²zOL
pLz''zz'zËQ À ¤¡z,zTQz eQz1D¤n¥,¬
,§Q¤¤¨¦£,A!ÉAQ¬a,,pQzep¨
,z®Ä
° Q¤OQzµh¤¤É pepzQz Aµ¬
^zQX T,µ ¤ Qz¡z g%QzzOGp ¡z
ÉDz,
zOÆ¯Ì½Èµh¤peXQ£ z/zQ%,¬
¡z°U¡©¨®Í©z¦AQ1Q¤¤¡¬¶ D¬¶Q¤¤N%OLz¥µh,z
zzz% U eQzA¤¤¡¨ ¦z1£,,¬
,i, %OLz ¥e%Q(%zL°±%¤ Nz·
£DeQ¬
zQ¤i,zA1L°±,eQ¤¤N,zpQ ®1½U%¤Qz¤¡¨¥! 1AQ¢,¬
°UzzQAA°U¤¡¨( µ£%,z°Uh% NeÃ± °e
QOz ï,z £¨· iz±Q'/£¨· ¤¤,z·,z#
/,µr, z,TALz'(ÉQz;Xz Le£OQ ®
È(,·z ^R ·É¤¤Aµh®XÈ(¤ Qzz3½'¬
z ËDeLz/£¨¢Uz Tz%pLz'¢,z¡z,z Ëµ(µ1¤¤
#AQ QzN¡z!zh¤ À ¤¤Q Á ¤§QAµË¡¤ Q#
À ¤¡z,z/,¤,,£¤eÃUÉQ,z®NÍ¶Uz ,zDz'¬
zz »
¼
½¾¦¥AµhAµzÇ Á Qe¨%µ1£
µh¡z²ÅL¬aeQ*pQze¥ ^ ,z£1zT%¤%,UeLz ®
È¾¤¡zp½U,z ªUeQ/zX Á 'z%,UeQ¤QO¤¡¨%
zz,zOQ¤J%%¨T z/, Q¨Æ%,%¨X°±,z
¤ Qzzg®NÍ¶Nµh¤¤¤£QeQz 1z
z% ¥±,¡z°¡¶¨¥
Q¤1 °± ,eQ¤Xz,Ç(,¨pQz
pQzep,z¡z,z
µ·¦ À ¤z'A®
')(+*-, v+. /UÓU{¶Ö y *0
~Ë OA°± ,°±¤ %¤%z Qz Á pQz
pQze;¤ Qz¡z ÉQ 'z,z%º¤¤ËA,G
Le£
1ºzQL° ¦¤¤!%¤Qz¡¶¨z/1,¨%A,
®~«/z¨XzOQ%A3
25461 ¤A¤¤¡¨%¤Qz5
¥¡
z'z Á DzNQi¤ADi OQ¡h¿7 Û 8 8:9;=< P,Þ?>2-@Â£Dz
µh¡zTzÉ ¤¤Aµhz 'z,A B Û 8 8C9D;E< P,ÞN%£Dz%F ²Q¤z ; Q 2 @
1£Dz1G 2O®
B È£Dz H 2 @ Û 8 8A9!;5< P'ÞL° Û 8 ¡ 89D;eQ<
Q#%DG I¥Q\® ®J¥ 2 @ A¦£eQDz% zK

P,Þ
£U¨XLh% D"
I,A¥ ¤,z¦ z¤§Q· 'eQz ®
~ËA¤¤zzè'ç çOé&å Têæ%èì¶àæ%èìaLä UêMã çOé&å ëà'N
æ NêÉì KIQê O
à'Pé à'ãäeà'ßèã =NêÉã ±å tëà'-ã ì ; ® L%¤,¶¨¥Uµ%zOQ
1*( ¤TDz¢Q
¤zR
Q 1SQ¡®^¡%Q
£Dz
µh¡zËzpQ£Q° z ,z/¤¤ Gè'ç±çé&å TêÉæ(èì¶àæ(èìaLä U®
½UeLzhµhz Û P ; Þµ'Ézzz Á pLzpLz'
AQ¤,¤Qz ¤¤£¤¦£Dz h$ ¹#¤,z ; ®
LJ%¤¡¶¨µAµË '#z À zD#£Dz"
Û PT ; Þ
N¤z ; g 'z£·Aµuz ,z,z%¤¤#Qz Á pQz
pQze,QF Û P ; Þµh¡zÆ£Dz U1T®Ä
,,eQ¤# A

z¦É¤¤AµhV ~Ë/% ¡¨Æ ApUz £¨ Û Ä·ÊgòòÞ
Û ¼ QÜ PÞhz¢ ¤°±Qz Á pQzXpQzeÆ£¨¹z ¡
zp Á ,pQze%iQ£Dz i¤QzÅ¿nA¤¤ Aá éèQæ1ßÂ'®Íaz¤,Xz ¤¤Aµhp¤,%pV WYXZ6Z\[D] Û ¼ Ü PÞ¦Ì!,gQtz
Û PE ; Þµh¡zGL
% D
I ¡ï,z,% Lp ¡z _
^«
1T®²È²Qp¤AQD
;R9 P < ¿?I 9 PAÂ©ÅQ
zTÅL¬¶Qe%(` Û P_ ; Þhpªz
£Dz
1 Û ^ <a;b9 Pc^Þ\®
È#¤%p °±,#,zQ¨¦ z¦N£A,
d 1:z¦£AQ QzhÉQhz Á pQzpQze(µhz5
Û P
; 7Þ J¤ADY eYf ;9 P < ?¿ I 9 PAÂ©ÅzÅL¬aeQ%e
Û P ; Þp·£Dz·
1+µh¡z%¤z ; ®½£Dz
Y 1;µh¡zTzz '©¨TQz¦zz¤z Á pLz·pQze
µh¤¤¤Qz'
£e,'Ã± µh¡zg¤ %,UQ¤ z¡zg®
'gÏih Õ&j5k%vh{©{\|l(| x ÐÒ Ô , km| yz| h y'{¶Õ}Ay'Õ{ ,
Í©T 'z À z·zz¤z Á pLz·pQzehQF Û PT
; Þ5
1T¥UÉQhAeXÅL¬aeQonrp Û P ; Þµ
OA°±z/'Ç%z¤¡¨
z,z°±%¡z¦¤D/Qhz,_1Ø¿Éµ%A¤¤NzqUêÉì\ë êÉßzìDÂ'®
¯¨«¹ Á LeÆDz,zz((¤¤ÅQ¬aQe%¦
1 µ
z ¡z,z
ALz'ÉQr
nrzLµQ p¤¤z 1
zU
zgA°± AQXz/µh ¤ QeQ£O®p½(Åp
pOQeQ%,z,· ¦z±Q'!¥µ z1p¤¤¡¬az Á
Á LeDz,zzzOL¡iQi,zQ¨1zz,£¤
z Á ¡µ1eO /Å®~«1z1Ç Á Qe¨
zQ¬
£¨ËÊgU£,1 ÊX¨,z Û ÊÊgÜXW Þ\®ÆÈpÇ Á Le¨_s
1
b
B1
B3
(i-1)b/2 + 1
...
...
B2
b/2
B i-2
(i+1)b/2
Bi
B i-1
B i+2
B i+1
...
B c-3
...
B c-1
B c-2
# z JP JN Qz¡z Q#z QeQ£OT1;z(L°±,z¤1£¤'ÃUh#ZR, Q®
L
£¤¡i QeQ£Or1 i%LeA¨/O¤,zQ 1SQLDzzz¤ Á ¬
eQAQ¤¤¨« ,z A/hQ¤¤Ç Á ·+1T®ÎN¨
s Û ^ÞOUeQNzz Á i ¡z (µh,zz$^¬\z(pQ¤¤,DÇ Á
Q 1 DeQz®JÈ,z,z+s¹zA¡z#DzQz Á Q,z¤¡¨¦ z,
'·z Á ¡z ²¿n¤¤¡¨ ]£¨UzeÂ'®/È1Ç Á Qe¨ 1
Dz,z ¹Tz,zDz,®X·µLz% ¤¡¨¢¬
z'zDz pzhz,ÅQ¬aQe%¥¡,zQ¨%z

zAQzez zz £¨XÊgU£,hQ ÊX¨,z®
Í¶DzA ¥µ%z, %z/z( ¡z /Qz1¡z¤Dz¢z
Ç Á Qep
¨ sÉQ¤¤£¤ÅL¬aeQ%h Dzzz
Q Á ¤§L¨TQzeÆQe¨N^ R!
Q Q U¥µh'z
tz¤£,A®
L%Æ °±,ªU,¨ËÅL¬aeQg¥Jz(Q¤¤Aµh%z À zpDeQ
¡zTQ¡zz¤Dhp Dez% ®JÍaµµQz/eOQ
ÅU¥µ¤¡¨OA°±z1z%zzDeQhz °U§
/Az¤!ATi®
'g '
. ÓO}(vÔÔ{ , x'x'Ö Ò /
Í¶«Q ,·z À ¤¤z Á pLz1pQze,·£,©µ_ Û P= ; Þ
Q 1T¥µL° z z¡¨1¤¤z£Dzi1 zQNOLz
L·¤AD
eÅL¬ae%µh¡z6 Û P ; Þ\® %¤1Qz eµ ¤
£(zÆQ ^Tz,¦zAeË£DzQh¤,z ; _
1
¿ Q 1SQ <a;b9 P· z,zeÂ z(,z%,UQ¤¤z·, z,zhQ
£¤'ÃU egÅL¬¶Qe%·z Û P ; Þa®T§z,z,
z
z¤Dzhz,¨pÅQ¬aQe%Q¤¤£DzµhzX z,
°¤QzAQz'
zOQgAOQ¤z
ehLz¦zz¤JQz Á pQz
pLz'®: p eAµh£eÃ¦zX ¤zzÆOQ
zU¡z zgDzQz(z(, z,z®XÈ,z,ÉQz%µ%1£1°¬
'e¤!£Dz #¤,z ; z(£¤eÃXQ g¤¡¨
, z,z/z£¤eÃ Û ¼ ÜQP±¥U~ÊgÜXSQÞ\®ÈDeLz¨XOQ©µ
'ï,zA (¡¦z ¦zpQ% U¦Q Uz'z¦zU¡z ¥J£¡
X¤/¤A z%zÉ¤ ¡z°±®iÍaz,z,ÉQzz ,
e ï£,©µªOQXzAz,%z1Q zX1£,Q
É¤¤¡¨g z À Qz,®
Í© ,eQ¤i
ëåAä Æ&è &éà'ßzßeêMã ß'Lä à'æ%àpµQzÃU/Q ¤¤AµhA È Le£T
1h z¤¤¡¨ °U z/£¤'ÃUQ ÀÁ
^ R!
g¿ S ; Â'®X~«p ªgz,·zAQ'«£¤'Ã®TÈ
, z,µh¤¤£
,z%z µh,°±'hQze¦ÅQ¬aeQ
n+zz·QÆz,/ /z/£¤'Ã®·hz,
z,
Q¤¤iÅL¬aeQ% Û P ; Þa¥z/z,
p,,e£¤'ÃT ¡¬
QzhAµGpQU¨(ÅQ¬aeQ%z Û P ; ÞLz eQ z
, %!z Le£OQ ®Èz,°¤Lz
DzQz
QpQe¨(Q^ R
Q 1SQ Q® ¼
zLeA¨/µhAQ À ¤¤z,¬
,Dz·z Qz Qe£ ¥±\® ®¥Q¤¤£¤eÃNzOLi e
e
QN%ziz,JÅQ¬aeQ%zN Û P ; Þ!¿nÌ!%p PLÂ'®
È£¤'ÃU¦OA°±(z£peeÃ± ÉQ%z Á pQz(pLz'
%Q¤ %¤ Qzzg®
Í¶Jµ¦¤Ãgg%z ,e¤JLz·%¤·£¤eÃg z
e,% ¥ µzOQNµµh¤¤%NAQ QzNÉQQz Á pQz
pLz'·zOL/'z 1£¤'Ã£ Lz®gÍ¶ËTµQzD1,¬
Qz¥z/z,¦QÅL¬¶Qe%§z Û P5 ; ÞQz%zA
Q% g©µÆ 1£¤'ÃU/ pz,£¤'Ã¢ ¬
z,zzezzz, ¤ e,®JÍ¶XQ ,z1A°± zz £¤,g¥
µ%pT £¤'Ã , %zËz Le£ ¥Jn® ®¥
¢, £¤eÃªQe¨®´ÈT, £¤eÃ , % ¡z ²
¡§z £¨%¤¡z
¤zJ¦£¤eÃ¿n£ S Â¿n L# zY
PLÂ'®NÍ¶

£°U zQA¥(¡zOLz ,z£ Q£L°±¦zÉQ
£¤eÃU
(\
L#z P¥z,«£¤e
Ã 1UeQ·z
z,UzQ¤AQ Qz ®
/zX zAQze^z zÉ%zXÅL¬aeQ%(
Û P ; Þz£¤'ÃUe/z Á pQzpQzeiz Û P
; ÞL° ·1z,° Q¤QNQ¤ADr e,®
'g Ö Ò ÔÓ h * Ö nyeÖ Ò /X| Ò Ôv+. Ö / Ò0,±Ò y
½nLµ%OA°± z±Q'«z À Q¤¤z Á ¡¬
QzipQze,ÉQJzNµh AµD Û PT ; Þ\®JÍ©¦Q ,#z 'z,z%
p
z¦Qz Á pQz·pLz'ÉQz Á µh Aµ Û S ;D9 P,Þ\¥
µ ¤¡ÖA°±·z ,
z¢Ù¶ ¤ ÚÅL¬¶Qe Û PÅLÞNQ z
Ù©,µhÚÅQ¬aeQ Û ; < Å 9 S ;D9 P'Þ\®
~Ë¦L° z%z '
z¡z¤Dh!z
ÅL¬aeQ Û PÅLÞa®N~« ,z%z
, z,
°¤¦Q¤¤£¤eÃU·zOQeËz¦ÅL¬¶Qe Q
zOL%OA°±Q(zAQ' zzz¤ e'®ªÍ¶·Æz,1
£¤eÃXhQ¤z ¨zAQ' e,¥Uµ·¤L° ·% À ®JÍ¶z
µ¨µ1pQzÃT¤¤JAQ Qz1£¤'ÃU·Q¤z ¨ ®·Èµ
zÇ Á LeA¨¦zAQze¤¤Uz,JOz1Ù¶,µhÚ
ÅL¬¶Qe Û ;q< Å 9 S ;59 P,ÞQ 'z%JzhQz
£¤eÃ¢, z,z®p~«(¡¦z(µh Aµ+h¤z ; L°±,¦z
Dz!
¹z¤µzAQ'Tzh ®
z'(%zTzp¤D(£¤eÃU1eÆQzz§Q¤
¡z¥
¯Ì
½È Û Ê ó ÜîÞT z¹AQuQ¤¤
zÆ£¤eÃU®
È°±,z pµUz,eQz z, ¦% À Qz
U¯Íh¯Ì
½È SU® î® W® QeQ£OÆ¯Ì
½ÈÉQzpQ
£¤
C
XpQ%,%¨1µh'pzp zz
¯Ì½ÈÁLz'
®È Dz,zTz Le£
zAz,h/ À ¬
AQUQ% QJz% z ,hzL¨Q° ,zA ®
'g h , }QÓ Ò Ô| {7l ,-0 Ó{7l"! , {ax'Ö Ó Ò
È¦^R¦N¤Lz , Le£OQ
p¨z£¡Dzz(z·Ç Á
Qe¨««z,z¤%%¨®XÈ'z,ÉQzµ °±,¤ ßàäA
åã ±èéeí%æpà'æ%åQé'í%° ,z gQ »
¼
½¾µh,z
zÇ Á Qe¨
DzQz ¦, Q¨·%,%¨/¿nOQ · ÃÂ'®OL · ÃU#Qz
%eOQA¤ °U¥±zz%z, Qe· %OQz £U¨
%L°Uz Ã/A zz¤AQz(µh,zz Qez, ®
ÈÃ/z%h·¤AQÉ,z %Q De, ¥Un® ®¥U,ÃU
L°±,% DeQ,pQzT/e¹nDz'%zO^ÃU%L°±,(¤
DeQ Û ¾~GÜ] Þ\® ¡z ¤¤¡¨¥% ,z Ã z° Qz¦ ¬
z%^ R z·£nQD%Az¤ ,eLz®iÈQ',°±
£¨²z ¬¶QA DeQz,g %p ¬a£ï'z®rÈ,z'¬
ÉQz¦h,zQ¨TzpA°± e ÃTQµh°±,
£¤®+Èz±Q' ,z£ Q£L°±µ ¤ z
e Ãp,hzz z
z¤Dzhz
ÅL¬aeQ%
z1Ç Á Qe¨®pÄ
·%¤(¤z ¢zT¡z/°±z
z £¤,·É ¤¤Aµh®/~«/Qz Æz ,z,·° ,e¤N'¨,¬
,®gÈ«µ%'eQzT¤D1Q¤¤ÅL¬ae%¦e
Æz1A·Q z×µh¡z¢z,,zzDeQ
¡zQNz¡¡z¤Dz
gz¦Ç Á Qe¨®ÈQ¤¤Aµh
z(,z
Ç Á Qe¨XAz¤¤¡¨¥z 1z·1£,
Qe Ã/,Q eQÃ¦ °eQ zA ¬¶A
DeLz ®
'g
NÓ 0 . , kÖ yl
Èz,z¬aDzË¿Éz Dz,zTz
Ç Á Qe¨
Q zz, %eQz^QzXQze´LeA¨Â¦A^£
(¿Q 1SQD¤ Q 1SQ Â·z% Û ÊÊgÜXW Þ\®¢½QzeÉQ% À ÅL¬
Qe zA¡zT, DeQTz%Æ£zU/£,zz
,zAt£¤QX Q 1SQ ®%z,zÆLz
(¿ Q Q ÂpÅL¬
Qe%¥ z±Q'eÃ±
(¿ Q QQ 1SQ Â
z% ®/Í¶Q·z/
£¤eÃzAez/zz¤ e,¥z(¤ %
µh¡zË¯Á Ì½È
eQÃ±·Éz,
(¿ JQ Q Â
z% ® È(%%¤ ¡©¨ÆQ
¤z¡z %OLz £¨pz
O, zÇ Á
Le¨®t(Dz,z ²z%µg Ü Q 1SQi ®1z
z%z,zOQ¤Q¤z¡z ¤¡¨ %Ý Q 1SQO, ®
d, x,ÕV. yzx
~«¦° Q¤OQz z¦,ÉQzp ,¡z°¡¶¨g »
¼ ½¾
Q , %OLz ¡¦zg U¯Í·¯Ì½È S® îU® W®XÍ©¢z(É¤¤Aµh¥
µ 'z£z,zT# h Á 'z%,Uz¥%OLz
z¤Dz
Q%¤Q/A,· £¨«¯Ì½È:Q ¹»
¼ ½¾¦¥!
QOQ¤Q¨ RXzXzz%( zX,Ç%,¨ª
À ¤¡z,A®
»
¼
½¾uµQ , ÉQ·z,T/¤¡z¤,z¥
µ¦ z,D'zQ%
PAîî îp,z¦¿\Î½Èz z Le£OQ
z%¤°±eÂ'®¹~ª°¤OLzË¯Ì½È:µT¤Ë PAî îî
,zhQh¦z% ®NÈhQ¤¤Aµh¯Ì
½È²zÃ±pz Le£OQ
Æp%%Q¨¥p¡¤¡¨gz¤ /Q
z¦DeQ
Qhz(zDz!®gÈpz%((¤ gµ/¤ ¹
¤¤Lz%ÉizhA°±'e z%,ALz'(£,Ahµh ¤
%Az¡QeLz¤¡¨¥£iµhDzpQzh¡z%OQ,i (z
%z,%
zT£nL¦£¤Lµ P/,zA® L »
¼ ½¾rµ
¤ z¦¤± z%¦µh'gµ8
W î% hÉQ
z
%Î½È Qe(£/ PXP], z·UpQgÎ½È
Qe1£ ®
g§Ï k , {aÖ 0,Ò yzx
Èz LeX,zµ,z( ¦zzDz® L#¡zDz¤¡¨¥z1,¦Q
%Î½ÈAOA°U/¦ %¤ ¨%zÃUAµhp%
%¾µQ ;¿ PÜ Xò WXSW·A,¥ M Ý® S¦ÊT¤¤p£O¡z
¿aÊT£eÂÂ'®½,µ«Lz«Q¤^± G¤Dz,zª%
Î½È¥µÆz «°±,z ²·z Qe£gµhe´µ
% À ¢¤Dz,zz²;¿ PÜ±Ý VM PÂ,¥ MW® Ý
ÊT£eÂ'®rÍ©´z,pµz%L°± zÆA,, e
¶Ä¤i% (zAL/U, zz z Qe
z¤%z%QÙ¶ z Á z¤Úz,AQz®#~«iz,%Q° ,¬
¦e¤·UeQ ¤¡Ü¬ ¿ f sT>K>3>+>Âhµh'
Lz¢§zAz¤¡¨z £Äêg
LzÆOQ¤¤¨+Ù¶¤ Ú¹£¨ªzTAË,Uz'z®uÍ¶²É,A¥
%
A, eQ ¤§Lz ¤¡¨¬ GDe Qpz W îî
£®p~Ë(¤Æ¤ z% ¤¡Ü¬¶º ¤¡Ü¬¶È OQ¤/Q¦z
£, ªg, QzÆA®:ÈÆ¤QzD Le¹,
µ( ·zDzXz1'¦UpÎ½È¦·e
z( U¯Í¸
p ¼ Le£OQ¿ MXSWXVMÝTA¥
SMÜU® Ý¦ÊT£eÂ'®NÈ Le
,iµQzz, ¤ ¤¡¨(z
z1%(Î½È QeU¥Qz1µh¡z ·z,%Q°Up%%
%
z,AQA,®
¯Ì½Èµ
Á z µh¡zz1ÎN¬a°¤¦zz, ¤ ,z
f Pî ! ¥¤¤hz,%OLe%,z'z1µ,zX¤,L(z¡ ,nQ¤¡
°¤®~Ë¦e »
¼ ½¾uµh¡z(µh Aµ ¤zÆ ; f Ýî
£¥QÅQ¬aeQ%#¤Qz PP zz, ¤ eµh' Qez,
z À µh Aµhpµh¡zQp%D V#" ï'z«¿n\® ®¥hQ
DeQ8
W±Â'®¢¤¤zDzµ,z 'z ª pzQ
¿a½ ¼ ¼ ¤¡e½UOQz,ÍÍ'¥ WXWW·ÊT RAÂ AQz ½Îiz,zz
PAîî îî%µh¡z ]
¯JpQX%%¨Q 1¤A¤ ÃXLe¨®
g ')h ,±Ò x'Ö yeÖ $Ö yl
LQJz, %OLz 1£'©µ,(¯Ì½ÈË 1»
¼ ½¾¹z,z%
¦,¡z°¡¶¨¥ Æµ ¤ A¤¤¡¨, %OLzÎJ¬¶°¤®r¸Aµ¬
°±'A¥Qh z hXz·¤ Qz¡z%½,,z ¥µ·DzzQ¬
z·pQze£,¶µ,XzU,¨X ¤,z £¤eÃhD¬
1¯Ì
½È
®U~ËA¤¤z°±,z »
¼
½¾h¬¶¯Ì
½ÈËz1Ã
z QOLA® »
¼ ½¾h¬¶¯Ì
½ÈËAQ¤¡¨p À ¤¡z,z £,
zz¡z Le£OQ ® U Az¤¡¨¦ÉQ¡iU,¥
»
¼
½¾¬¶¯Ì½È ¯Ì½È¹ÎN¬a°¤,JQzJ, %OLe£¤
£AQz,¨pz,É,z QeQ£O,Q ¡ï,zh^ R®

°±'z¤¥¡OhAz, QJh¡J£¨¦¯Ì½È
T»
¼ ½¾h¬©¯Ì½È^¡µh¤¤¨¤ z
zQ%Q¤%hQ
zXz%Xzg^£z^A,®tÈpQ¤¤Aµhp1z¢ %Qz
z¹¤Dz«QppQzeÆz , £¨ »
¼ ½¾h¬¶¯Ì
½È Q
¯Ì½È
®JÈµ z, %/Qz £¤ ®¢Í¶£Qz¹¤Dz/ e
z
z%
¡¬¶U,¥Uz,¨%µh¤¤£
pz
z%
Q ,µh¡z
z Á z ÆA
µh¡zÆAOQ¤NÎN¬a°¤,®
~Ë¦zQ
zhQ?ê à'ãìnênäeèëéà'ßzâë ìnßz®Í¶!z©µ/¤Dz ï'A¥µzQz
¯Ì½ÈGÎJ¬a° Q¤Jz£DpQzepzOQ »
¼ ½¾G% ®
Í©«z% ¤%&
%:à'ãìnê\äzè ëiézà'ßzâë ìnßp¹È#£¤ P¥N %A¹
zOL·¢%DAQp¿\QÜ P(' ]#" XÜ M)'^P*"1Â'¥ »
¼ ½¾ À Á ¬
'z¤¨z·zQ%·¡z¯Ì
½È ¿Éµh¡z
f PAî ! Â'®N~t,Tz
z¤z ¡ï,1¿n ¤%,
+è ë ß,àã?à ±èìnê àLÂ'¥zA°±,- eQ 1ÎN¬a°¤
Nz À zD
% pLz'ÆLz Pî PAî z'z° ¤¡¨®

Qz1zOLµpA°±'e z/¤ ±Lz¡z%¦z%ÎJ¬a° Q¤¥
z
ÎN¬a°¤,z%¤°±,.- ®NÈL°±' e ¤¤%/+ÎJ¬¶°¤ÉQ
nQ¤ Qz°±NLz PAî Pî ® ° zQJµQzOL¬
z zÆL° ° ,¨Ë£¤eÃËe¢Q1¤AD1
µh Lµ Q(%Qz¢zOQrÜ ]" z¶¨z »
¼ ½¾h¬¶¯Ì
½È
zOQ(gzA¤hpQze¹
Î½È/¶Ä¤¤¡¨ªOQ1AQ¬ R,z¢ÎJ¬
°¤ ¥Nz1z(zOL1µ Q1%1¨¹A,
µÆz z À ® ÈÆzQï PAî ! ÉXz¯Ì½È
ÎJ¬¶°¤
h/°¤
µ ¤ z1ALz'Th°±'¨p ¬
,z°Qz°±pQze®ËÈU/zX¤Lz TU1£,/A,1µh,z
»
¼
½¾×Q'°±pzzQ%¡z°U¶¨QT¯Ì½È Aµh
zOL »
¼
½¾;¤¹Q£¤gz À °± ¤zOL¨ °±,z ,U
% ¤ hQi1 °±T,¨®
È¦¤°±¤NA,¦ z¡©¨ %µh Aµrz(µhe
»
¼
½¾^N QeQUz, z À pQze/µQN,z V#"®NÈ
¤°±¤
zÙ¶µzDÚ¥n® ®¥!(pLz'µh,z ï'z,
Qz·z¤Qz¤¡¨TO, ¤ (z·pLz'(A, ®Í©Te'¬
zTµge° T£,z,1z¤¡zA Tp%XÎ½È(zTp Á ¬
1;,zeQ 1Q ¡ï,zz,z £¨ »
¼ ½¾rA°±'¬
L°±'p¤C
¤ PAîî îË'z,( PS/"p®ÈgL°±,e¤¤hp Á 1
8
S P*"p¥µh¡zTz,·1£,z£(%z ¤¤!pQze
OA°U%%Qz¦z V/" ¡ï,z,®~ËQz/µLz/Qiz·n'
zOLzQz,zA¤ %zAQ¤!OQ¤¡¨,
Lz·,zQ¨z(
zT,p,z¢zTOQeQ%,z,z(z¹Q'°±Tzg¤°±¤
z°U¡©¨^µQUz® LQp% TÎ½È¥µg¤Ë°¤OLz
zp¡z°U¡©¨¢ÉQ(£¤eÃ«^ R/£,©µ^Ý PS ]±î Ü V®¢È
%OQz(µhz¯Ì½È²Q ,,z£ £L°±¨¤ Á Q,z¤¡¨
z
z%z¤z®
g
0C, { \ÓU{ 0 | Ò } ,
È^¤D¢zzª¤%XÈ#Q£¤ P²%pQz^RËz²A°±'¬
·z/z%hg, É »
¼
½¾¥ »
¼ ½¾tz¬
Tµh¡z« Á z,z¤i%%¨ª¿ »
¼ ½¾¬¶ÎÂQ ¯Ì
½È
®Í©
zp%p UpQËÎ½È QeQ£OQ¥ »
¼ ½¾+AQze,
0.9
Filtration Ratio
Total time
Alignment Time
Filter Time
0.8
Time in sec, Filtration ratio in %
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
512
1024
2048
Block size (bp)
4096
8192
# z MS i¾z%Q À ¤¡eQz TeLz(É°Qz h£¤'Ã^R®
L
·¯
Ê
T
¸
pQ
½^ R
ÊT£
MWU® Ý
SMÜU® Ý
» ,z
½^R±¿n£eÂ
WXVò
W ÜW
Í zA¤
¾¤¡z
Ü P ® ] "
Ü MU^® P "
X
OQ¤
ÎN¬a°¤
Pî P
î L
#¤¡eQz
¾
Lz
î® S]#"
î®^PM("
L
U+N
¼ z%g,
î®^PSW
î® W ò
î®^P&Sò
îU® W Ü
U®
®
W WM
PW X
S M
È£¤ PJ/½U¡z°U¡©¨¢ zz%,·ALz'¢% p Up¢Î½È Le£OQ·µh¡zË£¤eÃ¢^R%QCPAîS] £® Lz
¤,§¦zTz Le£OQp ¡z·^R ¥NA°±,eQ p'¨ÆZR, ¥J,z,UeQ %QAQze,°g zA¤Nz¤z¥ÉQ/Qze·¨¤
¡ï,z·z¤¡z·z1%1× A°±,eQ pÎJ¬a° Q¤·z À zD¦% A, ¥!z À ¤¡eQz ¢eQz z U+N ¼ z%·
»
¼ ½¾¦¥ »
¼ ½¾h¬¶Î¹ ¯Ì
½È
®
zz MW' ÝtÊT£¢Q SMÜ)' ÝGÊT£ î'^P&Sz,,z°±¤¡¨
)î ' W ò% ® »
¼ ½¾¬¶ÎËµh¡zTz
Ç Á Qe¨X Tz Ã
Q'°±ALz¤¨ziz%N,zpJµh¡z/î)'^P&W î)' W Üh,¬
®g¯Qz »
¼
½¾ Ë»
¼ ½¾h¬¶ÎtQzz Á pLz¤¡¨
Wîz%#nQDz,NzOQ1¯Ì½È
®±ÈJ%zQ° %#J,§Q¤¤¨
À AQ£AQ
z,zQ¤¡zA ¨p£¤Q!µQzÃp
À ,¬\z/ g¯Ì½È
®
Èp,zpQ%Q
XÅQ¬aeQ £O z±Q'¹¤Ã±%z
%U/£ £¨¢zAQz/%¤Aµ¬a %¤ Á ¶¨«z ®
Èzz%,J 1zz ¤O%Î½È Le£zOL
Dz¤¤e¦zALz¥J ¤¡Ü¬¶¥,z ®gAµ+zQ¦z,ï,
% ,eQz®Ë;ALz'ª ¹z Le£OQXzAz Â°±,e
)î ' S Ý1 µh'XDz¤¤! ,eQ£¤¡¨pnDz'zX¯Ì
½È
®
Lz'z%z ¥NzX Á z,zOQ¤%%¨«°±,z »
¼
½¾h¬¶Îu
AQz¤¡¨QnQD »
¼ ½¾¦®È z·zz/Qz
±¬aeQ%%£,ÉQzÆ,Ëz,p¡z¤Dzp ²z Ã^Q z
/ep¤¤, QepDz,zz
ÆpÆ%%Q¨®Í¶eQ,z
zz¤¡z¦ËX£DeQUzQ¤'zA%«, L°±,¯Ì½È
Q Q¤¤Aµhz1µQzÃTg¤Qz '
z £¤%® LQDe ¥µ
µ,zh£¤z
z1(Q¤¤¬a°±'zD¬¶¤¤, %OLz 1Qz% À
%Î½È;¿ PAÜ±Ý VM Ph,zeÂ1Q ¼ ¤e½Qz Sµh¡z P ¯
QpË%%Q¨¢¹¤zO PXPz®g~«,DzpLz z
z%zAz z% ,z¦ALz'hµhzÆ¯Ì½Èz%£
¤Lz ,zOQ PAî ¨Tz
z%·pe ®
g m ,V,Ò Ô ,±Ò }cl%Ó y *-, . y'{a|yeÖ Ó Ò {a| yeÖ ÓTÓ Ò y *M, wV. ÓO}%x'Ö ,
Èg°¤OLz(z%OQ¤¶¨ À ¤¡eLz¥#µ(%AQz1µhQ
µAQ¤¤V#ië ìnéèìnê\åQãéèìnê\åQ®Ía À Qz,zeQ
Qz
QeQ£Oµh'/#¤,z £¨·z À ¤¡eQz 1 zz
Q¤%Dz!®J~Ë%z
z À ¤¡eQz TeLzpÉ¤¤AµhA
À ¤¡z,z U,
U, Le£OQ
½Uz¤Qz(Î½È NQN° L¨1e¥LzJiz Á ¬
pLz¤¡¨%z
zQ%Q Uz1U/£,zQJ£OQ
¡zDzA
QU/£,zA® LQ¦£¤'Ã^ R¦£,¶µ¹Ý PSX
ò PAXÜ SU@¥ L# z SAµhz1zeQ¤zXz%( »
¼ ½¾¦¥
z(z%%/«z À ¤¡eQz ªQ z(z%%,U«z
Q¤% ®iÍ¶Xz·zQ%·eQ¥µ·Aµuz À ¤¡eQz
eLz%T,zA®
È À ¤¡eQz GeQz²,zAQµhzGz¢£¤eÃtZ R,J ´
¤Lz ,
£¤'ÃX^ Rhz·zJz QeQ£OOQ z1z
Q¤%1DzªzAµh®²½,%AQ'ªz,zDz£¤eÃ¹¤¤
U,L°±,zzQ£¤'ÃpLz
ALz' %z¤ %
OQ ¥ zzeQ¤O%JQAJz /ziOQ
QzAµh1z ¤¡¨¹¤Qz¤¡¨Ëµh¡z¹zp£¤eÃ«^ R ®¢Í©¹eD1z
z¥zz%zA¡z z À ¤¡z,z QeQ£O·z X
z¢zgpQ¤¤,U/£,%Q· z,z%zOQpA°±TzË£g,z,¬
%,Uz Ëz¦ zgz(z ^ Rphz%£¤eÃ
, z,%Qe¨®´Ía%%1zzzOL(zz%pzA¡z
z¤ %,U QzAµtz QzOQ¤¤¡¨(z·z
À ¤¡eQz (eLz®iÈiiAQ £¨¦zL°±,zA AQ¤¤·z
Q¤%
¤ Qz¡z Q z ÀÁ U1£'hipQzehzOL
Lz gz¦Q¤%OQ·µh'ÆLz¦ , ,UQ
z·' X£¤eÃX^ R ®
Í¶1¤ £T z 1zQ1z À ¤¡eQz ªDz^( Á ¬
z,%¤¡¨/ÉD zNÉ¤NzO1 z zzQe¤
z/z%1¿É1£¤eÃp^ R·@ SQî ] ò£eÂ'®È¥z
Q »
¼ ½¾Gµ¤ £ À % Dz %zL°±%,Uzgz
Q¤%/ ®Æ~Ë%z,z,ÉQzX¤¹z%zL°±(zpz,¬
Ép£,¶µ,«z À ¤eLz ¹Q Q¤%¦Dz!®TÈ%z°
Q¤AµhizQNzzp¤£¤'Ã^ Rh¤,£,¶µ PAî S]
] î Ü Vp£®
mÖ x,}Õx'x'Ö Ó Ò
ÈµzÃ·zz ,zQzz¤¤§Q£eLz% ,z¬
·zh¤Dz,z¥Q1£¤¡¨¥ ¤¡¨Î½ÈÛ,®
Ä
É· AL¬a,É'·pQzepQp¨gU,zDz%
z:zz,zD%zz£¤g® UQz ¤¡¨¥¡
1zz «zTz pg£Dz¡zz(ÉQ(¯Ì½È+Q1Qz,
z Le£gALz'«%'z ®ªÄ
%Qz±e´(¬
z Nh%¤%!z
Á Dz%,z ÉQi¤AQz
µh'z %¤§Lz¡©¨g Á ,z µh,zpÄQze,
Qz·'Éz% z ,z,A®
Ä
hz¤¡zAµzOQ ,µrz±Q'%zz
p¡z nQDz,
z¯Ì½Èg ,Uz¡§¨%Dz ¤¡¨g%¡¬
¤Q¦A,®¦Í©Æz11QQ«Q¤¤¡¬¶ D¬¶Q¤¤ %Qz !¥
µh'zzzz%hz zO¤Oz·zzQz U(¬
£,NQAJ/z Le£ ¥ e1Q1%zL°±%,U¤A
zgp£Dez¤N,z(Q° ,e¤¤N,ÉQzp ®(½%¤§Lz¤¡¨¥
A1U°zQ zOLAA°U¤¨/ ~Ë£/,z°Uh%JeÃ±
° Qe /z ï,z £¨ ¦z e¢£¨¤¤,,¬
1U,z,µG h zXz/z:h
z!®
ÈË z¹z% »
¼
½¾ Qz ¢z^z
zz, %z Ç Á Le¨®¸
Aµ°±,A¥z¢¤ Q¬
z¡z z%z/zpÇ Á Qe¨¥NQ¤¡z ¹Q, %¤ Á ¡©¨
(¿ ·¤ ¿ ÂÂ'¥zA¡z¤Qz
%zQz,z¤%%Q¨(Q
eÃ ·eQz'/¤¹£ ¤z(z% ® Lz,z%Qz ¥!É/¤Qz
Le1,zhz,zOQ¤!%,%¨ph¤Ã±,¤¨pz(£
Ç%,,Uhhz
Dz'z% , Q¨/%%Q¨·°±,z NQzzAz z
Ã±,«¡zzXz%1µh¡z«z £¤p¤%¡z®gÈ¦/
Qz(#zzz,AQze®
Í©Éz,
pµQzÃgµ/Qz/Dz ¨pÆ%z z
z , ,izNzhz%,# »
¼
½¾« ¦z^ R
z/¡·¤Dz¦ z/^ R(z Le£OQ ®~Ë(Lz1µQzÃ¬
¦ %zQe¤¤¤^ RAQzT Q¤z¡zº U°±Dz Qz
£¤¡zgzª%zL°±gzz°U¡©¨®~ËLz¢zz¤¡¨
¤¡¨ »
¼
½¾^z·z(¤¤¡¬©Q±QD¬¶¤¤ %Qz !U¬
pgÎ½È¥% Î½È¥!Q eQ£ Î½È®¯Q
z/ zA¥J%Î½È1A°±¤¡zA ¨¹£ª¤Dz,z ¥iQD¬
/£¤ ¥ zz,eQz°±¤ pOA°±g£,´¤'z ÉQ
,gN Á z Le¨®
v } Ò Ó ". , ÔM/ ,-0,Ò yzx

ÈËµzÃ µQ¹OQzQ¤¤¡¨+z £¨ z´Î ¼ Î½QNi¾ÍDÈ
ÌÈ¾ NJz ,t® SîXS]] ¿\Ì5UÄ·ÊX¬aÍDÈhÂ'¥/~ N WU® S® ½Uz,É
¯zÃQ eLz,É¤¤¨Q'ÃULµh¤ À OQ¤Qz
e ,zÃ± ¤¤pe Qz·É¤¤AµhJz¦,ze LQ¬
e %'QX¿nCL Â'®JÊgLz ñ z¹ ÎJzp¾¡¬
°¤(eLz,É¤¤¨éÃUAµh¤ À ¤h1§z Ø¯Êg+¯ L
µh¡zTz ,zpX¸
p % NNz 'A®
JÓ Ò yz|}AyeÖ Ò /Ty *-, vhÕy * ÓU{ax
È*zzA £*e,z £¨ p¤ z
!" ®
d, , { ,Ò } , x
Û
Ê ó ÜîQÞ/½® L®¤zeU¤n¥~ ® ¥U~ ®ÊT¤¤'A¥Î® ~r®OÊX¨±,z¥
Q 1® ®!Ìp®
¯Q1¤¤i¤ %ALz'
z¤\$® #UåâUéeãè ëå &%¢å ëàä,âëè(é 'hê\åëå í¥ S PAMÝ ]±î W) ]QPAîU¥
PÜ Ü îU®
Û Ê½óNXÜ MLÞ²½® L®¤¡zeU¤n¥È
® Ìi®hÊg ¥h¦® ®½eOQï'A¥ ®
*OQ+¥ *#+® *¥~ ®ÊT¤¤,A¥# 1® ®Ì!p!®
Q ¯¤D/ NN¡¬©¯¤§QD /X'µ:'eQz
Û UÌÜ]Þ
Û U¾ÜXWLÞ
zQz QeQ£OQQzez Qe%® âäëà'ê\ä
ä,?ê ß à'ß ¥OS Ý- WW òÜ) W]±îXSU¥@PAÜ ÜXMU®
~ ®NÍ'® U« Î®Ìi®iÌAµh¤,A®´½U£¤QpQ¬
z Á pLzDz(pLz'(Q £ ¤ A¤NQ¤¡¬
AQz ® ë ±åé'êì Uæ1ê\äzè¥ PSU#¿ ] ÝPÂ WSXM ) W]X]@¥ PAÜÜ ]®
® U¤¡nQ¹Q Í'®N¾ z ® LJÌ
½3
¸ J ÉD
¤Ã¬¶¤ Qzz Dz^% ¤ Q¨®ºÍ¶Ìi®
¸
z,A¥U/®½ALz¤¥ ®O½UOA°U¤Ã¥U ¡zz¥ éDåAä
å ì à Qßzì %eãì¶à'é'ãOèìnê\åãOè ë iåAã Oåã %eãì¶à,ëë ê à'ãì íQPß ì¶à'æ1Hß åQé %¢å ëàä,âëèé 'hê\å ëå íQ¥OÝ V) V]5¥ PAÜXÜ WU®
¾® L®¤¡z¤ ® èS
ì b
à è àtëàèéeãà èã iêÉëÉëOëàèéeTã 'éåQæºß,àá,âOà'ãOäeà ±èQìa&è zèß,à'ße¥OQ S P ) WQP ®
¬\~«¤,Ä¥ PAÜ Üî®
~ ®¸ ¥ ®¯zÃ± ¥Q 1®¯®·A°U !®¯¬
¤ AQ¤°¤OLz «Q S¥#QËQ¤z¡z ¬
,ÉQzp,Û,¹ %Qz !® # iåæ
ç
'hê\å ë A¥ PZPÜ Ü )QS PAÝU=¥ PÜ Ü ]®
NJ® ÃUQ Î® ¼ ÃUÃ± ®Èµ/¤ Qzz%
z Á pLz·DzppQze%DeQz¦z Á z®Í©
éDåAä å ì à Qì íæçåßzêÉâUæØåã %¢èì à'æ(èìnê\äzè ë
+åâUã ±èQìnê\åãßå iåQæ
çOâUì¶à'é Oä,êaà'ãäeà'¥Q°±¤%XÝ SîQ
#àä,ìnâéà ¦åQì¶à'ßêã iåQæ
çOâUì¶à'é ä,êaà'ãOä'à'¥OO S]±î )
S]±òUF
¥ PÜ QÜ P®
1®Î® ð Uz!® à é'ìå iåæ
çâì¶à'é éJå éèæ/æ1êÉ-ã å ë âUæpà %.%.% åéeìnêÉ-ã Tèã àèéDLä UêÉMã ®
¬\~«¤,¨¥¾A ¥Êg¦¥ PÜ MW®
® ð eQQ Ê¢® ñ Qz !®Ø,¬\zQz,z
z±Q'z Le£OQ%AQze ¤Dz'z®
'hê\åêÉAã åéeæ%èìnênä,ße>¥ P]V ]W î ) ]XW ò¥ PÜ Ü òU®
¸/®Ê¢®ÊgQz R ®p,Ç%%'z ÉQ À
zAQz1^% ¤,¤Q%U,® âäëà'ê\ä ä,?ê ß
à'ß,àèéLä 5¥ PXP ;¿ P&W±PÂ ]XVSÜ ) ]XVXW]¥ PÜ ò W®
Îh®ÊT Uz A®+,¬a, %A¤Ç Á z,
Dz,z Q¤z¡zg® #UåâUéeãè ëå Æì à +%Æ¥
SW¿ SP
Â SVS )QSMXSU¥ PÜ MVU®
ð ®¸pQ® 'hênå ëå êÉß'Lä à àá,âOà'ã ±èì¶à'ãèQãè ë íQß,à
éå ià'é ¦èì¶à'ãß èì L3à zèßzêaà'éà'ã èPâ håßzêÉìnê\åã:ß zèâU
æ Qèé'ênèãì¶à'ã+® NNrzF¥ PÜ Ü M®
¸/®±~ ®UÊT,µhQ ð ®¸pQ® %
QO¤¡Ü¬
A 5NJQz,zALz'/¦£¤ AQ¤pQ,z %¤,¤®
Í© iå
æ ,êÉãèQìaåé'ênè ë hèìnì¶à'éeã %èìaLä UêÉ-ã ¥´Ì!,zz

z,·\
U %z,¦½ ¥°± ¤n®XÜ WXMU¥N½Uz,¬
ñ ,z¤Q¥O SVQP )QSQò±ÝU¥=PÜ Ü ÝU®
¼ ®!ÊgQ£'· Îh®~r®!ÊX¨,z®½Ç Á heA¨A h
,µ:%,z ÉQ( ¬a¤DzAQze® % %
#UåâUé'ãOè ë#åã iåæçOâUìnêÉMã ¥ SXSU¿aÝ PÂ XÜ W Ý )UÜ ]±òU=¥ PAÜ Ü W®
Îh®O~r®!ÊX¨,z®
¤ Qz¡z%1 °·Qze¬
£A Le£OQ®3Í©r½ Q Q«½n¥
¡zA¥ iåæ
çâìaèQìnê\åãèë %«à'ì å Qß(êÉã à'ãOåæpà :à ßàèéDLä U¥±+ PS P )OPW±Ý® Ni¤U NJz¥±,µ zÃ¥
PAÜ X
Ü SU®
Îh®h~ ®ÊX¨,z® £¤AQQ¤ z¡z5É¢Q¬
z Á pLzrÃ±'¨µ AQze®
ë ±åQé'êÉì æ1ê\äzè¥
PS#¿ ] ÝPÂ W]Ý ) WM]@
¥ PAÜÜ ]®
Ä/®!Äµ¤§Q£JQ 1®¾®!ÊT z QAC
® LOQD·z Á ¬
pLzDzËpLz'® å 'ì èézà éDè±ä,ìnê\äeà¢èã T'çà'éeêaà'ãäeà'5
¥ Pò#¿ ]±PÂ Wò M ) W Ü W¥ PAÜò òU®
Û Ü îLÞ
Û ¸
¯·Ü]QÞ
Û ¼ ÜQP'Þ
Û ð·ñ Ü òQÞ
Û ÊgLeòXWQÞ
Û ÊTU%MVQÞ
Û ¸OÜXMLÞ
Û ÊT¸
Ü±ÝLÞ
Û ÊÊgÜWQÞ
Û ÊX¨ÜSLÞ
Û ÊX¨Ü]Þ
Û Ä·ÊgòòQÞ
Û ð U MWQÞ
#"$ &%(' ) !
*
.- 0/
) 4 ,+
21 3+
5
6
7 8
<:9 ; ?> =
0
B
@
A
~ ® ¾® N#Qz u 1® ®Ì!p!®+Í©%zL°±
z¤Ji£ ¤ A¤A%OQz®
¥
ò MÝ S]]X]
) S]]±ò¥ PÜ ò òU®
Û NN~tÜXWQÞ
N#®
® N#° R,i Ê¢®±½®L~ËQz,zpQ®ÊT¤¡z¤ À ¤¡¬
eLzÆ z Á pLz·OQz'zpQze® ë ±åéeêÉì Uæ/ê\äzèF¥ PWV^P&W Ý ) PLÝ ]=¥ PAÜÜ±ÝU®
Û ¾~GÜ]Þ
U®i¾%%¤,1 ®N~t¤Ã±®²²z ,z
z Ã z°±% ¤® %
iåæçOâUì¶à'é'¥! ,
P&M)QSQò5
¥ PÜ Ü ]®
Û ½U~Gò P,Þ
È
® L®U½%¡z1 Ê¢®U½®Q~¹Lz,zp!®OÍ z À ALz
Q, %% %¤¤L£A® #UåâUé'ãOè ëNå %¢åëàzä,âëèé 'ê\å ëå íQ¥ P] MM^PÜ±Ý ) PAXÜ MU¥ PAÜQò P ®
Û ¼ ÃUÃÜSAÞ Î® ¼ ÃUÃ±!®z Á pQzDzQ¬apQze
µh¡z
ÅL¬ae%Q p Á pQ¤ÆpQze® àåéà'ìnê\äzè ë
iåæçOâUì¶à'é ä,êaà'ãOäeà'¥Ü SU;¿ PLPÂ ^PAÜ P ) S PXP¥ PAÜ XÜ SU®
Û ñ ½ó#Ü òLÞ ® U® ñ ,Uz'A¥Ê¢®1®± Q%¥ ® ®½Uz¥¦®¾¦®
ð ,z¤A° ¥·¸/®Ä/®½U%¡z¥ Ê¢®¸Ã¤¤LA®
½UzXA1Q#z·Upp % ® Oä,ê
à'ãOä'à'¥ SòVî ^PLÝ ]±î ) PLÝ ] SU@¥ PAÜÜ òU®
Û ~¹Q¤§Ü ÝLÞ
Ê¢®Ê¢®!~¹¤ z ®%Ä
¬a¤(Lz'°±·¤,¦£¤ Dz
z,z Qzz% ® ä,ê\à'ãäeà'¥ SV VÜ ^PW±Ý V)OPW±ÝòU¥
PÜ Ü±Ý®
Û ~ÊgÜSAÞ ½®~«Ë ¢¼ ®JÊgQ£'A® LD¦z Á AQzeg¤¡¬
¤Aµht,zQz® iåæ/æ1âUãênäeèQìnê\åãß¹å «ì à +%¥
W Ý;¿ PAî PÂ X
ò W)QÜ P=¥ PAÜ XÜ SU®
Û NÌò òLÞ
2 .BCBDB E
4
2
F

Download Report

q-gram Based Database Searching Using a Suffix Array (QUASAR

Paperzz.com

Your Paperzz