Figure S2: Caveolin-1 CpG sites sequence localization, methylation changes during adipogenesis and possible
regulatory transcription factors associated to these sequences *.p≤0,05, **p≤0,01.
CpG 1
CpG 2
CpG 3
CpG 4-5
CpG 6
CpG 7-8
CpG 9-10
CpG 11-12
CpG 13
CpG 14-15
CpG 16
CpG 17
CpG 18-19
CpG 20
CpG 21-22
CpG 23
CpG 24
CpG 25
CpG 26
CpG 27
CpG 28-29
CpG 30
CpG 31
CpG 32-34
CpG 35
CpG 36
CpG 37
CpG 38
CpG 39
CpG 40
CpG 41
CpG 42-43
CpG 44
CpG 45
CpG 46
CpG 47
Seq.
Location
Day
0(%Me
Day
21(%Me
t)
t)
-618
-601
-546
-500, -494
-442
-366, -364
-320, -312
-245, -242
-232
-193, -190
-181
-146
-116, -108
-103
-8, -6
+18
+27
+89
+103
+113
+126,
+128
+135
+248
+284,
+288,
+291
+303
+313
+407
+483
72,58
47,92
27,92
29,25
17,33
6,50
6,08
21,83
2,83
0,60
5,13
0,33
1,67
5,50
2,87
70,93
42,20
25,53
26,53
13,13
7,73
7,37
10,53
5,20
0,93
4,70
1,40
2,92
6,33
4,20
1,65
5,72
2,38
2,72
4,20
-1,23
-1,28
11,30
-2,37
-0,33
0,43
-1,07
-1,25
-0,83
-1,33
27,25
11,53
20,47
23,46
16,13
8,42
18,60
25,07
11,13
3,12
1,87
-1,61
8,53
10,67
6,08
10,73
15,25
5,40
-2,20
-4,58
0,68
18,50
21,08
15,17
8,50
11,12
6,78
10,00
9,97
8,38
4,83
1,67
3,17
+490
+506
+515
+552, -556
+568
9,33
2,33
7,00
11,92
12,42
2,88
6,67
13,80
1,80
5,25
-1,38
1,08
+608
29,33
21,47
7,87
+648
+659
4,83
3,42
1,67
4,47
3,17
-1,05
Change(
% Met)
p
Trascription
factors
0,73
0,19
0,19
0,11
0,19
0,56
0,19
*0,016 CBF, AP-2, WT1
0,19
0,42
0,69
0,31
0,34
0,69
0,15
*0,029 TFII-I, SREBP
*0,016 p300
0,15
0,29
WT1, CBF,
**0,008 HES1,deltaEF1
0,20
0,19
TGIF, AhR, Arnt,
*0,016 HIF-1, AP1, CBF
*0,016 CBF
*0,016
*0,016
AhR, Arnt, CBF.
AhR, Arnt, HIF-1,
*0,016 USF2
*0,016 p300
0,91
*0,016 CBF, YY1, WT1
CBF, HIF-1, AhR,
*0,032 Arnt
C/EBP beta, c-ETS*0,016 1
0,73
CpG 48
CpG 49
CpG 50
CpG 51
CpG 52
CpG 53
CpG 54
CpG 55
CpG 56
CpG 57
CpG 58
CpG 59-62
CpG 63
CpG 64
CpG 65
CpG 66
CpG 67
CpG 68
CpG 69
CpG 70
+678
+843
+919
+947
+1028
+1062
+1091
+1126
+1133
+1150
+1162
+1177,
+1180,
+1184,
+1186
+1197
+1214
+1233
+1238
+1260
+1292
+1319
+1333
CBF, AhR, Arnt,
*0,016 HIF-1, AP-2
2,88
1,80
1,08
71,71
70,70
1,01
0,41
1,42
75,88
1,33
1,63
1,33
1,20
75,67
1,43
2,03
1,43
0,22
0,21
-0,10
-0,41
-0,10
0,41
1,00
0,73
0,56
0,73
ER, LXR alpha,
*0,016 RXR alpha
24,42
19,03
5,38
64,42
3,25
42,30
2,10
22,12
1,15
*0,016 AP-2, AP-1, CBF
0,29
8,79
4,75
93,79
0,92
4,87
3,07
92,57
1,93
3,93
1,68
1,22
-1,02
*0,032 p300
0,06
0,73
0,41