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水稻基因组中的 $%&’ 和 +%&’ 基因
王希胤 -，)，, ，史晓黎 -，) ，郝柏林 )，+，T，!
（-\ 北京大学生物信息中心，北京! -**/0-；
)\ 中国科学院北京基因组研究所，北京! -*-,**；
,\ 河北理工大学理学院，唐山! *5,**.；
+\ 复旦大学理论生命科学研究中心，上海! )**+,,；
T\ 中国科学院理论物理研究所，北京! -***/*）
摘! 要：在最近完成测序的水稻籼稻和粳稻 两 个 亚 种 基 因 组 中，各 找 到 T5+ 和 T-. 个 较 为 可 靠 的 %]3K 基 因，进
一步证实了于 )**) 年发表的基于基因组序列草图的分析结果。修正的摆动假 设，即 至 少 需 要 +5 种 %]3K 基 因 才
能译出 5- 种可能的反密码子，在这两个亚种 中 均 准 确 成 立。 在 这 +5 种 %]3K 中，有 些 在 籼 稻 和 粳 稻 中 的 序 列 均
全同。有 -/ 种水稻 %]3K 与拟南芥中的相应序列全同。在籼稻基因 组 序 列 中 还 发 现 了 ,/+ 个 T " (]3K 基 因，一
批 -0 " 和 T F / " (]3K 基因以及一个 )T " (]3K 基因。这些 (]3K 基因的不完备是由于它们通常以串接 阵 列 形 式
存在于异染色质区域，而后者在全基因组霰弹法测 序 中 不 易 完 整 测 出。在 %]3K 和 (]3K 基 因 序 列 之 间 发 现 了 多
收稿日期：
)**+ 4 *0 4 )5；修回日期：
)**+ 4 */ 4 -*
基金项目：国家自然科学基金项目（ 编号：
,*-0*),)）和中 国 科 学 院 创 新 工 程 项 目（ 编 号：6789- 4 */ ）资 助［ ":$$;(%#< ’= 8>?@#A# 3B%?;@BC
3B%:(BC "D?#@D# E;:@<B%?;@（ 3;F ,*-0*),)）B@< %># 2@@;GB%?;@ H(;I#D% ;J 8K"（ 3;F 6789- 4 */）］
作者简介：王希胤（-.0) 4 ），男，河 北 滦 县 人，博 士 研 究 生，研 究 方 向：生 物 信 息 学。 LM&B?C：NB@OP= Q &B?CF D’?F $R:F #<:F D@；S#C：*-*M
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!! 通讯作者。郝柏林（-.,+ 4 ），北京人，教授，中国科学院院士，研究方向：生物信息学。LM&B?C：>B;Q?%$F BDF D@
遗传学报+ $5!< O949!75< )7475<+ Y3?@ -* + #3@ . + 1,,0
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处互补片段，这将有助于研究它们的进化和相互作用。
关键词：!"#$；%"#$；水稻基因组；修正的摆动假设；籼稻；粳稻
中图分类号：&’( ；)(** + + + 文献标识码：$+ + + 文章编号：,-’. /0*’1（1,,0 ）,. /,2’* /,’
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（ 责任编辑：李绍武）