アノテーション情報の利用マニュアル

アノテーション情報の
利用マニュアル
110730
1
マススペクトルの質などを確認したいが・・・
114.0560
132.0666
(Precursor)
72.0454
90.0560
55.0189
単にマススペクトルのm/z の値だけ並べられても・・・
114.0560
C5H8NO2
C3H6NO
C3H3O
C3H8NO2
72.0454
55.0189
90.0560
アノテーション情報が
知りたい！
132.0666
(Precursor)
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使用可能なアノテーション情報
Precursor-Product テーブル
（PPテーブル）
開裂スキーム
標品の一次プロダクトイオンスペクトル（約1600のマススペクトル、約600種の化合物）に
対するアノテーション情報を開裂スキームとPPテーブルに集約
１スペクトルごとに１つの開裂スキーム＆PPテーブルが作成されており、
これらを利用することでアノテーション情報を得ることが可能
3
開裂スキーム
化合物名
化学構造式
ピークm/z ：結合の開裂位置（生成イオンの分子式）
＊m/z部分が色づけされていることがあるが、作業上の
マーカーのため無視すること
プロトン付加(脱離)体の分子量
相対強度が強いピークのm/z をメモ
m/z = 90のピークは、
・矢印 a と交わる化学結合が開裂
・開裂位置よりも下側（矢印の向きによる）がイオンとして生成
・生成したイオンの分子式がC3H8NO2
結合の開裂位置のアノテーション情報を確認したい場合におススメ！
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開裂スキーム（特殊表記）
①
②
①：どの置換基が脱離するか不明の場合
（OH基,NH2基など）
③
④
②予想される開裂位置が2通り考えられる場合
（3通り以上の場合、 “M3”or “M4” と省略）
③：結合の開裂位置まではアノテートできていない場合
④：複数ヶ所で結合が開裂する場合
⑤：MSnを測定した場合
⑤
＊その他の特殊表記
⑥ “rad.”：アノテートした分子式がラジカルの場合
⑦ “T” ：転移を伴う場合
⑧ “分子式A or 分子式B” ：分子式の候補を１つに絞り込めなかった場合
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開裂スキーム（備考）
・アノテート支援ソフト（MassFrontier, MSmanager) の結果を参考
→２つのソフト間で異なった予測を示す、複数の予測を示す、複雑な転移反応を介した
予測を示す、などの問題あり
→あくまで参考レベル、目視で確認して除外・絞り込み
・m/z の値からの分子式候補の絞り込み
→相対質量確度：50ppm ＊（測定精密質量と計算精密質量との差） / 測定対象質量）
→やや幅をもたせ、結合の開裂のしやすさなどを考慮してさらに絞り込み
・アノテート対象としたピーク
→強度の上位10ピーク程度（スペクトルによって多少違いあり）
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PPテーブル
アノテートしたピークのm/z＆分子式
（行と列に同一のものが並ぶ）
Precursor 側
側
Product
中性脱離分子の分子式
（Precursor → Product生成時）
＊交点元の２つのイオンがprecursor-productの関係
にあるものと仮定
m/z = 86をPrecursor、m/z = 60をProductと仮定した時
の中性脱離分子の分子式がC２H２
２つのイオン間の中性脱離分子を確認したい場合におススメ！
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PPテーブル（セルの色）
Precursor 側
側
Product
Pre.-Pro.関係にある
→計算値どおりの中性脱離分子を
生成している可能性大
Pre.-Pro.関係にない
→あたかも中性脱離分子が生成しているように見えるが、
実際には生成し得ない可能性大
＊オレンジ色か水色か判断できていない場合にはクリーム色で表示されている
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閲覧方法
Metabolomics.JP (http://www.metabolomics.jp/wiki/Main_Page) のサイト内に
各化合物の開裂スキーム＆PPテーブルが格納されている
化合物リスト
今回は化合物リスト（Excelファイル）に貼られている
ハイパーリンクをクリック
→ 直接アノテーションページへ飛ぶことができる
PR100262のアノテーションページ
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アノテーションページから他のアノテーションページへ
PR100262のアノテーションページ
①閲覧したい機関をクリック
分子リスト
②閲覧したい化合物の化合物名を探し、
同一行のMassBank IDをクリック
KOX00083のアノテーションページ
他の化合物のアノテーションページへ
移動することができる
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