マウスES細胞培養過程におけるメタボロミクス 1) 細胞培養では,細胞の成長を観察しながら,適切な頻度で培地を交換することを要求されるが,研究者の経験則や単に培地のpH変化を指標にすることも多い。そこで,ヒトの血液や 尿中の212成分の代謝物を一斉に測定できるガスクロマトグラフ質量分析計(GC-MS)によるメタボローム解析手法2) を応用し,培地中の成分を網羅的に測定し,変動を観察した。 培養 マウスES細胞(ST1株) 培養液 分取 培養後拍動確認(心筋に分化) パターン2 細胞分化付近まで増加し, その後濃度変化が認められなかった成分一例 パターン3 肝組織構築付近まで増加し、 その後減少した成分 パターン4 細胞分化付近まで減少し, その後濃度変化がなかった成分一例 パターン5 細胞分化付近で急激に増加した成分 パターン6 細胞培養中に濃度変化が認められなかった成分一例 50 μL 各n=3 ← IS 0.1mg/mL 2-イソプロピル リンゴ酸溶液 6 μL添加 肝組織構築 凍結乾燥 培地組成 Iscove s Modified Dulbecco s Medium(IMDM) +15% Fetal Bovine Serum +Non-Essential Amino Acids(終濃度:1 μM) +Sodium Pyruvate(終濃度:10 μM) +2-Mercaptoethanol(終濃度:7 nL/mL) 約16時間 ← 20mg/mL メトキシアミンの ピリジン溶液 40 μL添加 胚様体 PBS 細胞の成長と共に増加した成分一例 攪拌 Dishに播種し分化誘導 Mineral Oil パターン1 ← 水添加,10倍希釈 ハンギングドロップ法にて胚様体を形成 培地 解析結果 分析方法 各成分の特異的な定量イオンのピーク面積を,ISのピーク面積でノーマライズした。培地試料中から34成分 が検出された。濃度変化を6パターンに分類できた。なお,灰色のグラフは,再現性がなかった成分である。 メト オ キ シ ム 化 環鎖互変異性をもつグルコースなど糖類のアルデヒド基を メトオキシム化し,環状の糖類を鎖状にすることで感度向上 30℃ 90分間 振とう ← MSTFA 20 μL添加 TMS誘導体化 水酸基, カルボキシル基, アミノ基などプロトン性の反応基を トリメチルシリル化することで揮発性向上 マウスES細胞 培養5日目 (心筋に分化) 遠心分離 16,000rpm 10分間 上清採取 50 µL GC-MS分析 回収した胚様体 37℃ 30分間 振とう 1 µL注入 培養18日目 (肝組織構築) 新鮮培地,培養開始3∼19日目まで2日毎に交換 した培地を採取し,測定まで凍結保存した。 分 析結 果 GC-MS分析で,沸点及び極性の差により, アミノ酸,有機酸,糖,脂肪酸,糖アルコール,核酸, リン酸エステル 類などのメトオキシム化及びTMS誘導体化物が分離・検出された。 Pyruvic acidMO-TMS↓ Alanine-2 TMS ↑ Phosphoric acid-3TMS ↓ Glycerol-3 TMS ↑ IS Glutamine-3T MS ↓ Aspartic acid-3TMS ↓ Serine-3 TMS ↓ Citric acid-4TMS ↑ 新鮮培地 培養7日目 培養19日目 Fig. 培地試料のGC-MS分析結果 TIC パターン1∼5の成分については,細胞の成長過程と相関のある濃度変化が認められた。培養過程に伴う代謝産物, 培地成分及びそれら分解物の濃度変化を把握することは,最適な培地交換の定量的指標となり得ると考えられる。 1) 第13回日本再生医療学会総会 一般演題にて発表 発表者 ㈱島津テクノリサーチ 藤原 賢,松原 英理子,石部 恵子,辻野 一茂,南出 善幸,工藤 忍,東京工業大学 玉井 美保,田川 陽一 2)【引用文献】Nishiumi S, Shinohara M, Ikeda A, et al. Serum metabolomics as a novel diagnostic approach for pancreatic cancer. Metabolomics (2010) 6, 518-528
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