ゲノム編集技術・CRISPR/Casシステム用カスタムDNA/遺伝子合成

ゲノム編集技術・CRISPR/Casシステム用
カスタムDNA/遺伝子合成サービス
ゲノム内の特定の標的領域を改変する技術、すなわちゲノム編集技術として、昨今、ZFNやTALENTM、特にCRISPR/Casシ
ステムが非常に大きな注目を集めております。これらは配列特異的に細胞内で2本鎖DNAを切断するヌクレアーゼを利用する
技術で、ゲノム内へのエピトープタグ配列やloxP 配列の挿入、ランダムな挿入欠失変異による遺伝子ノックアウト、1 塩基あ
るいは複数塩基置換の遺伝子変異導入などに広く使われています。
特にCRISPR/Casシステムは、共通に利用できるヌクレアーゼCas9と、標的領域に対する核酸合成品とを用意するのみで実
験が行えます。そのため、一旦このシステムを導入すれば、核酸合成品を新たに用意するのみで別の標的領域の編集が可能に
なります。このように簡易に設計及び材料を用意できる事が、このCRISPR/Casシステムが特に注目を集めている要因です。
弊社では、IDT社のUltramer®（45∼200 basesの1本鎖DNA）やgBlocks® （125∼1,000 bpの2本鎖DNA）を、このシス
テム用の核酸合成品として利用することで、より安価に、効率的に、且つ応用範囲を広げてCRISPR/Casシステムによるゲノ
ム編集を行っていただけるのではないか、と考えております。
Ultramer®
45 ∼ 200 basesまで合成可能な、1 本鎖 DNA 合成サービスです。
精製
合成可能塩基数
納品量
価格（税抜）
納期
PAGE
60 ∼ 200
お問合せ
¥240/base
約 10 営業日
脱塩
45 ∼ 200
4 nmole
¥120/base
5 ∼ 10 営業日
20 nmole
¥240/base
5 ∼ 10 営業日
CPISPR/Casシステム用では、脱塩でのご注文が多いですが、より純度が高い1本鎖DNAが必要なプロトコールでご使用の場合は、
PAGE精製がオススメです。
例) 160 bases のオリゴを注文した場合
脱塩・4 nmole
160 bases × ¥120/base = ¥19,200
PAGE精製・0.5 nmole(※)
Ultramer®使用論文 (変異導入用1本鎖オリゴとして)
160 bases × ¥240/base = ¥38,400
※160 bases でPAGE精製を行なった際の納品量です。
長さ・配列次第で納品量は変わります。
gBlocks®
配列長 (bp)
Nature Protocol
2013 Nov; 8(11):2281-308
Ran FA, et al.
Cell
2013 Sep 12; 154(6):1370-9
Yang H, et al.
in-fusion®法やgibson assembly®法と非常に相性の良い直鎖状2本鎖DNAです。
合成後にクローニングを行わないため、異なる配列の断片が10∼30％程度含まれます。
価格（税抜）
納期
125 ∼ 500
￥14,000
1 ∼ 2 週間
501 ∼ 750
￥20,000
1 ∼ 2 週間
751 ∼ 1,000
￥24,000
2 ∼ 3 週間
納品量
5' 末端のリン酸化
バイオハザードフォーム※
約 200 ng
可（無償 )
要提出
※ 毒素やウイルス断片など、危険性等がないことのご署名をお願いしております。
クローン化し、プラスミドに正しい配列を挿入する人工遺伝子合成サービスも
ございます。
http://ruo.mbl.co.jp/
gBlocks®使用論文 (Cas9,gRNA発現系構築に)
Science
2013 Feb 15; 339(6121):823-6
Mali P, et al.
世界最高品質を目指して Integrated DNA Technologies
Integrated DNA Technologies 社（以下IDT）は、1987年に米国Iowa大学の研究者Joseph Walder博士によって設立され、現在では
世界のオリゴヌクレオチド合成サービス分野におけるリーディングカンパニーの1つです。
世界4ヶ所に、同一の機器と品質基準で合成を行う製造工場を構え、世界最大級の供給量を誇ります。
IDTがこの分野でリーディングカンパニーとなった理由は、その「品質」
と「価格」です。
IDTは、業界最高水準のカップリング効率を誇っています。カップリン
グ効率とは、ヌクレオチドを1つ伸長する時の効率で、業界標準では約
98.5%です。
しかしながらI DT では、自社製の機器を用いて合成法の改善を続け、
通常のオリゴヌクレオチド合成サービスでも99.25%を達成していま
す。CRISPR/Casシステム等で活用が期待される長鎖1本鎖DNAを提供
アイオワ州コーラルビルの合成工場
するUltramer ® 合成サービスでは、さらなる工夫を加えて99.5%を達
成しています。（IDT調べ）
一見すると小さな差ではありますが、長いオリゴ合成の場合
はこの効率がオリゴヌクレオチドの品質に大きな差となって
カップリング効率と正確に合成されるオリゴとの関係
現れます。右図をご覧ください。
Ultramer®合成サービスでは、120 basesを合成しても、納
品物に完全長DNAが55%以上含まれています。たった1%の
効率の違いが120 bases合成完了段階で、3倍の収量を生み
出します。また、この効率の高さは価格を抑える事にもつな
がります。製造に投入する原料と比較して、得られる完全長
DNAの収量を多くすることができるからです。
正確に合成されるオリゴの割合
100%
Ultramer®合成サービスは200 basesまでが標準サービスと
して設定されており、特別価格の必要が無いリーズナブルな
90%
80%
70%
60%
50%
99.5%
（IDT Ultramer®オリゴ）
40%
30%
99.25%（IDT オリゴ）
20%
10%
0%
98.5%（業界標準）
0
20
40
60
80
100 120 140 160 180 200
合成オリゴの長さ（bases）
価格です（¥120/base）。詳しくは表面をご覧ください。
なお通常のDNA合成サービスの価格も下記で記載しておりま
す。ぜひご覧ください。
もちろん「品質」と「価格」はIDTの特徴の一部に過ぎません。豊富な修飾オプション、精製オプション、各種の用途の合成サービスも
取り揃えております。ぜひ一度、弊社のWebページもご覧ください。
世界最高品質を目指して改善を進め、より多くのお客様へ多種多様な製品供給で成長を続けるIDTに、これからもご期待下さい。
DNA合成脱塩グレード
合成スケール
合成可能塩基数
保証収量
価格（税抜）
チューブ
プレート
25 nmole
15 ∼ 60
∼ 3 ODs
¥ 27/base
¥ 18/base
100 nmole
10 ∼ 90
∼ 6 ODs
¥ 54/base
¥ 40/base
250 nmole
5 ∼ 100
∼ 15 ODs
¥100/base
¥ 80/base
1 μmole
5 ∼ 100
∼ 45 ODs
¥180/base
¥160/base
※ プレート納品は、24本以上の発注から承ります。
※ TALENTM はCellectis biosearch社の商標登録です。
Copyright
2014.02
2014 MEDICAL & BIOLOGICAL LABORATORIES CO., LTD. All Rights Reserved.
http://ruo.mbl.co.jp/
◎基礎試薬グループ
〒460-0008 名古屋市中区栄四丁目5番3号 KDX名古屋栄ビル10階
TEL :（052）238-1904 FAX :（052）238-1441
E-mail : [email protected]
145289-14021100N
詳細、注文方法はwebページをご覧下さい。
http://ruo.mbl.co.jp/custom/oligo.html
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