2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 検索実習 問題&解説 本日の講習内容 ■ 講習会の進め方(60 分) ① 欲しい雑誌論文を入手する – 電子ジャーナル: E-JOURNAL PORTAL 【例題1】、 東京大学で利用できる電子ジャーナル検索 – 紙の雑誌 : 東京大学 OPAC (e-DDS)、 Webcat ② あるテーマに関する雑誌論文を探す – 日本語論文を探す:医中誌 Web 【例題2】 – 英語論文を探す: PubMed 【例題3】、Ovid MEDLINE ③ 学外からデータベースや電子ジャーナルを利用する ■ 配布資料 ・ 検索実習 問題&解説 ・ 補足資料 ― 医中誌 Web をもっと知る ・ 医中誌 Web(Ver.4)検索ガイド(第 3 版) ・ OvidSP Quick Reference Guide ・ OvidSP – Quick Reference Card ・ ECCS アカウントのチラシ ・ アンケート用紙 ■ 講習会で使用するデータベース、各種サービスへの入り口 ⇒ 東京大学医学図書館 http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/index.html ⇒ GACoS http://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/gacos/index.html GACoS(ガコス) 東大全体で利用できる データベースへの入口 この資料に関するお問合せ:東京大学情報基盤センター学術情報リテラシー係 TEL: 03-5841-2649(内線:22649) E-mail: [email protected] 1 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【欲しい雑誌論文を入手する】 例題1 参考文献リストに載っていた、以下の論文を探す。 Jeff H. Tsai and William M.F. Lee, Tie2 in Tumor Endothelial Signaling Survival: (著者名) (論文名) Implications for Antiangiogenic Therapy, Mol Cancer Res, 7(3), 2009, p.300-310 (雑誌名) (巻号) (年) ■Step 1:まず、E-JOURNAL PORTAL で電子ジャーナルを探す E-JOURNAL PORTAL ① ② ③ ④ ⑤ http://www.lib.u-tokyo.ac.jp/ext/ejportal/ (Free マークのものは学外からも OK) 雑誌名を入力して、Search ボタンをクリック。 検索結果一覧で、利用可能範囲に注意して、データベース名をクリック。 データベースのサイトが開く。 読みたい論文を、巻号一覧から探すか、検索して探す。 PDF をクリックすると、論文の全文を読める。 (ページ) 「ネットでアカデミック」 p.26、27 【参考】 リ ー フ レ ッ ト「 文 献 探 し の ヒ ン ト ⑤ 雑誌論文を入手するには?」 省略形の場合は、*をつけて検索 単語と単語の間に半角スペースを入れる ① 【注意!】 論文名ではなく、 雑誌名で検索。 ② 利用可能範囲をチェック! ③ ④ 2 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【補 足】 ■Step 2:E-JOURNAL PORTAL で見つからない場合 ⇒東京大学で利用できる電子ジャーナル検索で探す 東京大学で利用できる電子ジャーナル検索 http://ejournal.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/ 【注意!】 論文名ではなく、 雑誌名で検索。 省略形の場合は、そのままで検索可能 単語と単語の間に半角スペースを入れる ■Step 3:電子ジャーナルが無い場合⇒東京大学 OPAC で紙の雑誌を探す 東京大学 OPAC 「ネットでアカデミック」 p.26、27 「ネットでアカデミック」 p.18 https://opac.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/ 雑誌にチェック *資料によっては 要注意 【注意!】 論文名ではなく、 雑誌名で検索。 省略形の場合は、*をつけて検索 単語と単語の間に半角スペースを入れる *の前には、2 文字以上必要 (例) J. ⇒ jo* (journal の略称と推測) Web リクエストサービスへ ASK サ ー ビ ス (質問)の画面へ 誌名変更した場合は、変更前後の タイトルへのリンクあり ★所蔵巻号、配架場所を必ず確認 ■ e-DDS ボタンが表示された場合 e-DDS 利用申請をしておけば、Web 上ですぐに文献(電子コピー)の申込・閲覧が可能。 (申込みは学外からも可。閲覧は学内のみ。) ⇒ 医学図書館ホームページ「e-DDS サービス」参照 http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/medicine/edds.html ■Step 4:東大に無かった場合⇒Webcat にチェックを付け、全国の大学図書館の蔵書を検索。 ⇒ 医学図書館ホームページ「文献・図書を取り寄せる」参照 http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/medicine/ill.html 3 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【あるテーマに関する雑誌論文を探す】 日本語論文 例題2 アルコール性肝炎 に関する論文を探す。 医中誌 Web http://login.jamas.or.jp/enter.html 「ネットでアカデミック」 p.22 【同時アクセス 12 まで】 ① 医中誌 Web (Ver.4)ログイン画面で、ログインボタンをクリック。 ② アドバンスドモードを選択。*検索対象年変更可 ③ 「新規検索」の検索語入力欄に アルコール性肝炎 と入力し、検索ボタンをクリック。 (「検索対象の限定」で条件の設定可能。) ④ 検索結果一覧から文献番号をクリックすると、詳細画面が開き、抄録等を確認できる。 ⑤ 本文を探すには「UT Article Link」(電子ジャーナル)、「所蔵確認」(紙の雑誌)のリンクボタンをクリック。 または「メディカルオンライン PDF」、「CiNii 本文あり」等のボタンがあれば、クリックすると全文が読める。 ⑥ 画面右上の終了ボタンをクリックし、ログアウトボタンをクリックして終了。 検索履歴の再利用 (例: #2 AND #3) 「アルコール性肝炎」で検索すると 検索式が自動的に以下のようになる。 肝炎‐アルコール性/TH or アルコール性肝炎/AL /TH⇒シソーラス用語(Thesaurus)を検索。 /AL⇒全項目(タイトル・抄録等)を検索。 条件を追加して絞込み (例: 総説に限定) ③ 入力した言葉だけでなく、自動的に シソーラス用語(統制語)とその下位語からも 検索してくれる。(シソーラスについて⇒p.6) p.6 検索対象を限定できる。 (今回はなし) ④ 4 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 文献管理ツールへ保存 (RefWorks、EndNote、EndNote Web) ④ 印刷、ダウンロード、メール送信、 クリップボード(一時保存&まとめ印刷) 入力した「アルコール性肝炎」は タイトル中に無いが、シソーラス 用語に「肝炎-アルコール性」が あるため探せた。 ⑤ 【シソーラス用語】 論文の内容を表すキーワード。 人手によって、論文内容を把握し、 シソーラス(上位語・下位語を整理 した用語集)に基づき統一された キーワードを各論文に付与している。 これによって検索漏れを防ぐことや、 探したい主題の論文に絞り込む ことができる。(p.6 参照) 【補足】 ボタンをクリックした後の手順(下記①~④の順) ① Article のリンクをクリックして目的の 論文を電子ジャーナルで入手する。 ※Article が表示されない場合でも、 Journal、Resource のリンクから目的の論文を探すことが できます。 同じ論文が複数のデータベースに収録されている場合も あります。 ④(③で見つからなければ) 「冊子の所蔵を調べる」のリンクで OPAC を検索し、図書館で入手。 ②(①のリンクがいずれも表示されなければ) 「東京大学で利用できる電子ジャーナル検索」 をクリックして雑誌名か ISSN を入力して検索。 ③(②で見つからなければ) OAIster や Google Scholar 経由で 本文が入手できる可能性もある。 ※「論文情報」にある ISSN の数字をコピーして検索すると効率的。 5 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【チョッと上級編】 ■自動的にではなく、自分でシソーラスを参照して検索に使う場合 ① ② ③ ④ ⑤ 「▼候補語辞書の参照」でメニューから「シソーラス」を選択。キーワードを入力し参照ボタンをクリック。 入力したことばから導き出された同義語と「見出し語」(=統制語。シソーラス用語)が表示される。 「シソーラス」ボタンをクリックすると、シソーラス用語の階層関係を確認できる。 適当なものを選んでチェックし、採用ボタンをクリックする。 「新規検索」の検索語入力欄にシソーラス用語が入る。検索ボタンをクリック。(以降は p.4 参照) 思いつく言葉を入力 「リラックス」ではなく、 「リラクゼーション」が シソーラス用語になっていること が分かる。 ① ② 対応するシソー ラス用語へ誘導 ③ ④ 階層(ツリー構造) の表示 ⑤ シソーラス用語が検索式に入る ので、検索ボタンをクリック。 【検索のヒント】シソーラス用語(論文の内容を表すキーワード)を究める! 例えば、ガンに関する論文を探したい。 シソーラス用語(統制語) 思いついたことばで検索すると・・・ 悪性腫瘍? 肉腫? 癌腫? 癌? 精度の高い検索が 可能に! ◆上位語:腫瘍 悪性腫瘍 肉腫 ◆ 癌 癌腫 シソーラス用語である「癌」へ誘導 著者がどのことばを使っているか わからない・・・ ツリー構造 上・下位語、副標目 との組合せで 多様な検索が 可能に! ◆下位語:乳癌 :子宮癌 :肺癌 :皮膚癌 モレやノイズが生じる・・ データベース提供側で各論文の データにシソーラス用語を付与 6 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【あるテーマに関する雑誌論文を探す】 英語論文 例題3 CABG(Coronary Artery Bypass Graft 動脈バイパス移植術)についての英語論文を探す。 PubMed ① ② ③ ④ ⑤ ⑥ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib【東大専用入口】 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez 「ネットでアカデミック」 p.22 検索語入力欄に、 cabg と入力。 Limits をクリックすると、絞込み条件を設定可能。(今回は Languages の English にチェック。) Search ボタンをクリック。 検索結果一覧が表示される。(必要に応じて Display Settings で表示形式を変更可能。) 論文名をクリックすると詳細画面が開く。 本文を見るには、Full Text ボタンまたは「UT Article Link」ボタンをクリック。 ① ② ③ まとめて印刷するには、クリップボード に一時保存⇒ブラウザの機能で印刷。 検索した後で Limits を解除するには 検索結果画面左上の Remove をクリック 文献管理ツールに保存するに は「File」と「MEDLINE」を選択 ⇒「Create File」を押して保存 ⇒文献管理ツールでフィルター を 「 PubMed (NLM) 」 ま た は 「NLM PubMed」でインポート。 表示形式の選択が可能。 ④ レビュー論文(総説) だけを表示するには ここをクリック。 ⑤ 7 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 ⑤ ⑥ 【ポイント】 ■検索式の確認をしよう 「Search details」の欄で、どのような検索式が実行されたかを確認できる。 必要なら修正して再検索。 略語の CABG のまま、それだけで 検索されていることに注意。 (AIDS で検索した場合との違い) 検索式確認の 詳細画面へ 【参考: AIDS と入力して検索した場合】 MeSH=Medical Subject Headings 米国国立医学図書館作成のシソーラス。 入力した言葉に対応する適切な MeSH 用語があれば、 自動的に検索。 8 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 【チョッと上級編】 ■MeSH 検索(シソーラスを利用した検索)をする場合 ① トップ画面で、「Search」のプルダウンメニューで検索対象を「MeSH」に選択。 (または More Resources で MeSH Database をクリック。) ② 検索語入力欄に aids と入力し、Search ボタンをクリック。 ③ 検索結果の MeSH 用語一覧に適当なものがあれば、対応する Link から PubMed を選択して検索。 (*MeSH 用語をクリックすると、上・下位語、関連語や Subheading(副標目)等が表示されるので、 適宜組み合わせをして検索することも可能。) ② ① ③ 対応するシソーラス用語 へ誘導 選択した MeSH 用語の Subheadings (副標目)や階層構造を表示。 組合せれば、多様な検索が可能。 Subheadings(副標目)を複数選択した場合の検索 ①Subheadings を複数選択。 ②画面右上の Sendto から、 「Search box with AND…」等、論理演算を選択。 ③検索式が表示される。 ④Search PubMed ボタンをクリック。 MeSH 用語の上位語・下位語表示 (この例は下位語無し) 関連性のある MeSH 用語へ 9 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 例題4 (例題3と同じ) CABG(Coronary Artery Bypass Graft 動脈バイパス移植術)についての 英語論文を探す。 http://gateway.ovid.com/autologin.html Ovid MEDLINE 「ネットでアカデミック」 p.22 【同時アクセス 20 まで】 ① □ Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations □ Ovid MEDLINE(R) and Ovid OLDMEDLINE(R) 1947 to Present with Daily Update の両方にチェックを付けて、Select Resource をクリック。 ……【Advanced Search(シソーラスを利用した検索)の場合】……………………………………………………. ② Advanced Search で、検索語入力欄に cabg と入力。 ③ 条件設定する場合は、Limits をクリックして、English Language、Review Articles 等をチェック。 ④ Search ボタンをクリック。 ⑤ Mapping 機能により、Subject Heading(件名標目)候補が表示されるので選択し、Continue ボタンを クリック。(複数選択した場合は、適宜論理演算子(AND/OR/NOT)を設定。) ⑥ ⑤で選択した Subject Heading に組み合わせ可能な Subheading(副標目)が表示されるので選択し、 論理演算子(AND/OR/NOT)も適宜設定して、Continue ボタンをクリック。 ⑦ 検索結果一覧が表示される。 適宜 Filter By で絞り込みや、Sort By で並び替えが可能。 ⑧ Complete Reference をクリックすると詳細画面が開く。 ⑨ 本文を見るには、「PDF」、「Ovid Full Text」 または「UT Article Link」ボタンをクリック。 ② ④ 対応するシソーラス 用語へ誘導 ③ ⑤ 下位一致検索 ⑥ 組合せ可能な Subheading (副標目)の表示 10 論文主論点に絞り込み 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 You searched に、実際に使用された 検索語が表示される。 Subject Heading の coronary artery bypass で検索されたことが分かる。 印刷、メール、文献管理 ツールへ保存 ⑧ ⑨ ⑦ 【学外からデータベースや電子ジャーナルを利用する】 SSL-VPN Gateway サービスの利用 ⇒ECCS アカウントが必要 https://gateway.itc.u-tokyo.ac.jp/ 【参考】 リーフレット「文献探しのヒント④」 参照 11 2010.10.29 医学系文献検索講習会 2010 “医者なら誰でも知っている!? --医学系文献検索入門--” 医学図書館情報サービス係 & 情報基盤センター学術情報リテラシー係 参 考 【PubMed 参考文献】 文献管理 PC ソリューション : PubMed/医中誌検索から論文執筆まで / 讃岐美智義著 2007 ISBN 9784879623546 医図 請求記号 W:26.5:BU 登録番号 4311075008 図解 PubMed の使い方 : インターネットで医学文献を探す / 阿部信一, 奥出麻里共著 第 3 版 2006 ISBN 4931222129 医図 請求記号 W:26.5:ZU 登録番号 4311002606 上手な情報検索のための PubMed 活用マニュアル / 縣俊彦編著 改訂第 2 版 2005 ISBN 4524240470 医図 請求記号 W:26.5:JO 登録番号 4310985280 東京大学医学図書館 PubMed の使い方 (2010.4) http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdf 慶応義塾大学信濃町メディアセンター PubMed@KEIO 検索からフルテキストを入手しよう!(2010.10.12) http://www.med.lib.keio.ac.jp/pdf/ug/ug_pubmed.pdf 東邦大学医学メディアセンター PubMed の使い方 http://www.mnc.toho-u.ac.jp/mmc/pubmed/index.htm 【Ovid SP マニュアル】 http://www.ovid.jp/site/j_0ss.htm (日本語クイックレファレンスガイド、ユーザーガイドあり) 12
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