Quantum Prep Plasmid Prep Kit - Bio-Rad

クイックガイド
Quick Guide
Quantum Prep Plasmid
所要
時間
約
Maxi
Prep Kit
あらかじめWash Buffer には95−100%EtOHを
1:1になるように(270ml)加えておきます。
90 分
■キット構成内容:
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Maxiprep Resuspension Solution ……………………………………………………165ml
Cell Lysis Solution …………………………………………………………………………250ml
Neutralization Solution……………………………………………………………………165ml
Quantum Prep Matrix ……………………………………………………………………110ml
Maxiprep Wash Buffer ……………………………………………………………………270ml
Maxiprep Spin Baskets ……………………………………………………………………10 本
5M NaCl …………………………………………………………………………………………5ml
■キット以外に必要な試薬: 95−100%エタノール/TE もしくは滅菌済超純水
操
集 菌
上清廃棄
作
手
順
100∼500mlを5000×gで5min遠心 TBや2×YT 8OD/ml→ 250ml
LB
4OD/ml→ 500ml
細胞ペレット
再懸濁
Cell Resuspension Solution 15ml 完全に再懸濁する。
アルカリ溶菌
Cell Lysis Solution 23ml
穏やかにチューブを転倒懸濁。
中 和
Neutralization Solution 15ml
穏やかに振り混ぜて懸濁。
5min以上放置せず次のステップへ。
遠心 8∼10000×g 20min
10分以上放置せず次のステップへ。
沈殿廃棄
吸 着
上清廃棄
洗 浄
上清廃棄
上清を回収
Quanturm Matrix 10ml
15-30sec穏やかに懸濁
遠心 3000×g 5min
Wash Buffer 25ml を加え懸濁
遠心 3000×g 3∼5min
沈殿物を取らないように十分気をつける。
マトリクスを完全に懸濁する。
懸濁は穏やかに行う。
スイングロータを使用してください。
50ml遠沈管に25mlスピンバスケット
を収める。必要であればアダプターリ
ングを使用する。
Wash Buffer 15ml を加え懸濁
スピンバスケット/遠沈管
へ懸濁液を入れる
スピンバスケットのフィルターを
傷つけないないように注意。
ふたはしない。
遠心 3000×g 5min
流出液廃棄
洗 浄
流出液廃棄
Wash Buffer 10ml
遠心 3000×g 5min
スピンバスケットを新しい遠沈管
へ移す
溶 出
滅菌水またはTE 5ml
70℃に温めて溶出することにより
遠心 3000×g 5min
よい収率が得られる。
必要であればEtOH沈殿を行う。
精製プラスミドDNA
※詳細は英文取扱説明書を参照してください。
Quantum Prep
プラスミドプレップキット
トラブルシューティング
問 題
考えられる原因 確認してください
Trouble Shooting
解決方法
ローコピー
プラスミド
ローコピープラス
ミドを使用していま
せんか?
濃厚培地を使用し、細胞量を増やしてくださ
い。もしくはハイコピープラスミドを使用
してみてください。
細胞数が
不十分
大腸菌のオーバー
ナイト培養していま
すか?
濃厚な培地を使用してください;培養時間、
容量を調節してください。OD 600 を測定し
OD /ml を確認してください。
培養液が
古い
大腸菌はどのようなも
のを使用していますか?
単離した大腸菌を 37 ℃でオーバーナイト培
養し、培養後すぐに使用してください。
回収されて
いない
マトリクスに吸着さ
れているか確認する
溶出バッファー(dw か TE)を 70 ℃に温めて
溶出してください。溶出バッファー量を増や
す、あるいは 2回にして溶出してください。
ゲノムの
コンタミネーション
低から高分子量のス
メアがありますか?
溶菌後なるべく穏やかに懸濁してください。
培養液を減らしてください。
Endonuclease A
のコンタミネーション
低分子量のスメアが
ありますか?
洗浄ステップの回数を増やしてください。
ホスト株を変えてみてください。
細胞のオーバー
ロード;Cell
Resuspension
Solution の劣化
260/280>2.0で
すか? 泳動した際、ゲ
ルに低分子量のバン
ドが見られますか?
オーバーロードを避けてください;新しい
CellResuspensionSolution を用いてくだ
さい。
(CellResuspensionSolution には
RNaseが含まれています)
タンパク質のコン 細胞構成タンパク
タミネーション
が混入している
260 /280 <1.5
ですか?
クリアライセートを回収する際、白色の沈殿
が混入しないように気をつけてください。
スピンカラム
からマトリク
スが漏れる
キット指定の速度で遠心してください。rpm
遠 心 機 の 回 転 速 度 (revolutions per minute)への変換方法
(rpm)2 r
は速すぎませんか? RCF(g)=(1.12×10-5 )
r:ローターの中央からチューブの中央までの半径(cm)
回収率が
低い
スメアリング
RNA コンタ
ミネーション
スピンバスケット
の破損
遠心をした際マ
スピンバスケットへ
トリクスが遠心
のオーバーロード
機内に飛び散る
マトリクス+クリア
ライセートの量が
多すぎませんか?
マトリクス+クリアライセート懸濁液がスピ
ンカラムに入りきらない場合は遠心を 2 回に
分けて行なってください。
塩基配列が
決定出来ない
泳動によるバンドの
確認をしていますか?
260 /280 比率測
定していますか?
培養のOD600 を確認してください。細胞の
オーバーロードを避けてください。
260/280比率を測定し、
260/280<1.5 の場合はタンパク質、
260/280>2.0 の場合はRNAが混入し
ている可能性があります。
精製度が不十分
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