2011年10月7日 - biocomputing.cc

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2011年10月7日
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生命科学分野の基本となる知識の習得
o 進化・生物多様性・遺伝子
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生命科学分野への情報通信技術の応用について知る
o 分子生物学・遺伝学へどのようにコンピュータが応用されてい
るかを知る
o 分子動力学法やモンテカルロ法など、計算化学のさまざまな方
法について理解する
o ゲノム情報など膨大な情報を検索・管理するデータベースシス
テムについて知る
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毎回レポート必須
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Today s Topic
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30億年前に発生
動物が120万種、植物が30万種
動物のうち80万種が昆虫・残りは40万種
o 地球上の生物種の半分以上が昆虫
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推定1億5000万種(現在の100倍)が絶滅
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生物の起源は?
「かたち」が違う…なぜ?
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o これらを考えるのが進化論
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生物は進化に対して能動的か受動的か?
o 高いところの葉っぱを食べようと努力した結果キリンの首が長
くなった?
o 獲得形質は遺伝する?
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遺伝子はどのように変化するのか?
o 「進化=遺伝子の変異」は異論なし
o 安定しているはずの遺伝子が変わる?
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進化に方向性はあるか?
o 必然 or 偶然?
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創造説
o すべての生物を創造したのは神
o その時刻は紀元前4004年10月23日午前9時
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19世紀になると
o 現在生息していない生き物の化石が見つかる
o 天変地異による「絶滅」であると説明 by キュヴィエ@パリ自然
史博物館
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「しんか」
o レベルアップ(ポッチャマ→ポッタイシ→エンペルト)
o しんかのいし(ピカチュウ→ライチュウ)
o 通信進化
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「進化」ではない
o 現実世界の「変態」に近い概念
• 昆虫の幼虫→さなぎ→成虫やオタマジャクシ→カエル
o 「ヘンタイ(abnormal)」はまた別の概念
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しかし、進化に対する一般的な認識はこれ(かも?)
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進化=より優れた何かに変わること
o それは「進歩」や「進展」では?
o 生物学的進化には「退化」が含まれる
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「進化」はさまざまな意味で使われるので注意
o 「進化する鹿児島大学の教育」!?
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この授業では 「進化= biological evolution 」
o 進化生物学(evolutionary biology)の分野
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By ラマルク@パリ自然史博物館
o 「動物哲学」
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生物が持つ向上性と環境からの影響
o 向上性による変化が環境により方向付け
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用不用説
o 使えば発達・使わなければ退化
o キリンの首・モグラの目
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用不用は子どもに伝わる
o =獲得形質は遺伝する
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「獲得形質は遺伝する」に批判が集中
o 同僚(?)キュヴィエも批判
o ネズミの尾を何世代にもわたり切断して尾の短いネズミが生まれてこ
ないことを持って否定するケースも
• →「獲得」形質でなく、実験自体が無意味
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「獲得形質は遺伝しない」ことは現在まで証明されていない
o でも、これは言葉の問題
o 「遺伝子の変異による表現型の変化」であるなら当然遺伝する
o 「遺伝子の変異によらないかたちの変化」であれば遺伝しない
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「変異」が起き、「自然淘汰」&「性淘汰」により「適者生
存」し個体が進化
パンゲネシス説
o 細胞に含まれ、子に伝えられる「ゲンミュール」が変化することに
より「変異」が起こる
o 「獲得形質は遺伝する」
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生存に有利な「変異」が遺伝することで進化する
ラマルクとの違いは変異の方向性の有無
o 高いところの草を食べようとして首が長くなった(ラマルク)
o 首の長いキリンが適者生存して今に至る(ダーウィン)
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ダーウィンの進化論は当時の最新学説
日本に伝わったのは明治初期
o 欧米の知識を貪欲に導入
o モースの講義@東京大学
• ところが最近では「∼が進化」などと…
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欧米では今でも進化論に否定的
o 学校での教育に異論
o 生物学者はうまく折り合いをつけている
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メンデルの法則=遺伝因子は変化しない
o ゲンミュールの変異によって進化が起こるダーウィン進化論は否定
される
o メンデルの法則は1900年に再発見
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「突然変異」の発見 by ド・フリース
o 遺伝因子が変化する
o 「獲得形質は遺伝しない」
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「突然変異のみで進化する by ベントソン」は否定される
o 大した突然変異は起きない&生存に有利でも不利でもない
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「突然変異」と「自然淘汰」によって進化
o 種分化→系統進化→大進化
o ダーウィン進化論の拡張「ネオ・ダーウィニズム」
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いつまでたっても「論」か「説」
o 「進化」は証明が不可能
• 霊長類の登場は1億年前(333万世代以上)
• ヒトの登場は500万年前(16.6万世代以上)
• ミトコンドリア・イブは20万年前
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人類の唯一の母系共通祖先…ではないので注意
o 「種」の始まりをどう考えるか
o 身近すぎて「用語」の明確な定義が困難
o 非科学的な話に惑わされないのが肝要
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人類の祖先は猿である→進化論否定の論拠の一つ
ヒトはサルから進化した
○人類と猿の祖先は同じ
o 共通の祖先を何と呼ぶかによる
o 猿に言わせれば「猿の祖先は人である」では?
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人が進化の最先端であるという傲慢な誤解に基づく思想
o 地球の生態系を破壊する害悪が最先端?
o 他の生物との共存共栄を図らない限りいずれは皆絶滅
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NHKスペシャル ホットスポット 最後の楽園
o 第6回 日本 ∼私たちの奇跡の島∼
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レポート課題『生物多様性について』
o 生物多様性が失われつつある。①その原因、②失われてはなら
ない理由、③どのようにすれば回避できるか、についてA4用紙
1枚(1,500字程度)に記述
o PDF形式(ファイル名:学籍番号.pdf)にして以下のアドレス
に送信(10/13正午まで)
• [email protected]