INTERPRETAZIONE DI UNA SEQUENZA GENOMICA UNA VOLTA OTTENUTA UNA SEQUENZA DI DNA, SIA DI UN SINGOLO FRAMMENTO CLONATO CHE DI UN INTERO CROMOSOMA, LA PRESENZA E LA LOCALIZZAZIONE DI GENI PUO’ ESSERE DEFINITA MEDIANTE UN ESAME ACCURATO DELLA SEQUENZA STESSA, ALLO SCOPO DI EVIDENZIARE SEQUENZE CODIFICANTI ED ELEMENTI DI CONTROLLO DELL’ESPRESSIONE GENICA. STRUTTURA TIPICA DI UN GENE PROCARIOTICO (IN REALTA’ UN OPERONE) ATG (83%), GTG (14%) O TTG (3%) TAA, TAG O TGA SEQUENZA DI SHINE-DALGARNO REGIONE –35 SEQUENZA CODIFICANTE REGIONE –10 TERMINATORE DELLA TRASCRIZIONE POSSIBILE STRUTTURA DI UN GENE EUCARIOTICO ATG TAA, TAG O TGA SEQUENZA INIZIATRICE (INR) SEQUENZA DI KOZAK SEQUENZA CODIFICANTE TATA BOX SEGNALE DI POLIADENILAZIONE VOLENDO INDIVIDUARE UN GENE, IL PRIMO ELEMENTO DA RICERCARE E’ LA SEQUENZA CODIFICANTE. QUESTA E’ FORMATA DA UN CODONE DI INIZIO (GENERALMENTE ATG) SEGUITO DA ALMENO 100 CODONI CHE SPECIFICANO AMMINOACIDI E QUINDI DA UN CODONE DI STOP (TAG, TAA O TGA). LA SEQUENZA CODIFICANTE VIENE ANCHE DEFINITA OPEN READING FRAME (ORF) O SCHEMA DI LETTURA APERTO, PER INDICARE CHE ESSA NON E’ CHIUSA PREMATURAMENTE DA UN CODONE DI STOP. FIGURA 7.2 GENOMI II ESERCITAZIONE “ORF”: LOCALIZZAZIONE DI UNO SCHEMA DI LETTURA APERTO (ORF) IN UNA SEQUENZA DI DNA GENOMICO. FIGURA 7.1 GENOMI II STRUTTURA TIPICA DI UN GENE EUCARIOTICO ATG TAA, TAG O TGA SEQUENZA INIZIATRICE (INR) SEQUENZA DI KOZAK ESONE TATA BOX SEGNALE DI POLIADENILAZIONE SITO DI SPLICING FIGURA 7.2 GENOMI II SITO DONATORE: AG/GTAAGT SITO ACCETTORE: YYYYYNCAG/ ESERCITAZIONE “GENE”: ANALISI DI UN GENE EUCARIOTICO.
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