Amminoacidi (1) a-amminoacidi Gruppo carbossilico Gruppo amminico a Gruppo laterale (R) 1 Amminoacidi (2) COOH g-amminoacido a H C H b g H C H acido 4-ammino butanoico (g-ammino butanoico,GABA) H C H NH2 2 Amminoacidi (3) Gli amminoacidi che si ottengono dall'idrolisi delle proteine sono 20 e tutti a-amminoacidi COOH a H2N C H R 3 Amminoacidi (4) Gli a-amminoacidi naturali appartengono tutti alla serie sterica L (ad eccezione della glicina, che non ha atomi di carbonio asimmetrici) COOH H2N C H R 4 Amminoacidi (5) COOH H2N C H R Gli a-amminoacidi naturali differiscono per la struttura della catena laterale 5 COO+ H3N- C-H Amminoacidi apolari Glicina Alanina Gly Ala G A -H -CH3 Essenziale Valina Leucina Val Leu V L -CH(CH3)2 -CH2-CH(CH3)2 Essenziale Isoleucina Ile I -CH(CH3)-CH2-CH3 R Essenziale H Prolina* *imminoacido Pro P H2C H2C H + N H CH CH2 + N COO- OH CH COOIdrossiprolina (Hyp) H2C H2C CH2 Forma idrossilata presente nel collagene in seguito a modificazione postraduzionale 6 Amminoacidi polari non carichi COO- + H3N- C-H R Serina Treonina Ser Thr S T -CH2-OH -CHOH-CH3 Cisteina* Essenziale Metionina Asparagina Cys Met Asn C M N -CH2-SH -(CH2)2-S-CH3 -CH2-CONH2 Glutammina Gln Q -CH2-CH2-CONH2 Essenziale + H3 N COOC H + H3 N COOC CH2 CH2 SH SH Cisteina H *ossidazione (-2H) riduzione (+2H) + H3 N COOC H H2 C S + H3 N Cistina S COOC H CH2 7 COO- Amminoacidi aromatici + H3N- C- H CH2 R Essenziale Fenilalanina Phe F CH2 NON essenziale se nella dieta è presente fenilalanina Tirosina* Tyr Y OH CH2 Essenziale Triptofano Trp W N indolo H 8 Amminoacidi con carica negativa COO + Amminoacidi acidi H3N- C-H R Aspartato Asp D -CH2-COOH Glutammato Glu E -(CH2)2-COOH 9 Amminoacidi con carica positiva COO+ Amminoacidi basici H3N- C- H R Essenziale H Istidina His CH2 + N H N anello imidazolico H Essenziale Lisina* Lys K -(CH2)4-NH3+ Essenziale Arginina Arg R -(CH2)3-NH-C=NH2+ NH2 Gruppo guanidinico *Idrossilisina (Hyl) -(CH2)3-CH-NH3+ Forma idrossilata presente nel OH collagene in seguito a modificazione postraduzionale 10 Amminoacidi non standard a) Amminoacidi presenti nelle proteine ottenuti dalle modificazioni post-traduzionali b) Amminoacidi non presenti nelle proteine 11 Proprietà degli amminoacidi in soluzione (1) Allo stato cristallino gli amminoacidi sono nella forma zwitterionica (anfoinica) La loro natura dipolare è dimostrata dai punti di fusione molto più alti rispetto a molecole organiche di pari massa (valori simili ai sali ionici) 12 Proprietà degli amminoacidi in soluzione (2) Gli amminoacidi sono anfoliti forma cationica forma anfoionica forma anionica 13 Proprietà degli amminoacidi in soluzione (3) Gli amminoacidi sono acidi deboli poliprotici 14 Proprietà degli amminoacidi in soluzione (4) Il pKa1 degli amminoacidi è influenzato dal gruppo amminico glicina (ac. amminoacetico) acido acetico pKa1 = 2.34 pKa = 4.75 15 Legame peptidico (1) Dalla condensazione di due amminoacidi si forma un “legame peptidico” (legame carbammidico) 16 Legame peptidico (2) R H N H C O C N H H R C O C H OH R O Mesomeria del gruppo funzionale peptidico R H Sei atomi coplanari N H C H a O C N H C H a C OH 17 Legame peptidico (3) Planarità e isomeria cis/trans Angoli diedri di torsione intorno ai legami e 18 Catena polipeptidica Dalla condensazione di più amminoacidi si forma una “catena polipeptidica” Es: seril-glicil-aspartil-alanil-leucina H3C CH3 COOH CH2OH H H H CH2 H CH3 CH H CH2 H3N C C N C C N C C N C C N C COOH O amminoacido N-terminale H O H O H O Per convenzione l’inizio della catena è il gruppo amminico terminale H amminoacido C-terminale 19
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