好熱菌の全ゲノム配列 決定とその意義 増井良治 ・倉光成紀 Database Center for Life Science Online Service は じめ に 1997年 か ら1998年 にか けて,す さ ま じい 勢 好 熱 菌(thermophile)と は55℃ 以上 で 生育 で きる菌 を い で ゲ ノ ム 全 配 列 決 定 の 報 告 が 相 次 い で い る。 イ ン フ 指 し,生 育 で き る温 度 に よ っ て,中 等 度 好 熱 菌(75℃ ル エ ン ザ 菌 の 全 ゲ ノ ム 配 列 が 決 定 さ れ た の は わ ず か4 以 下),高 好 熱 菌(90℃ 以 上) 年 前(1995年)だ が,1998年8月 現在 で全塩 基配 列 が 度 好 熱 菌(75℃ 以 上),超 と よ び 分 け て い る*2。 こ の うち,超 好 熱 菌(hyperther- デ ー タ ベ ー ス と し て 公 開 さ れ て い る も の は17種(表 mophile)の 1)1∼18),現 在 進 行 中 の も の は微 生 物 だ けで も30種 細 菌 で あ る 。 逆 に古 細 菌 で あ っ て も,耐 熱 性 が そ れ ほ をこ え る19)。ゲ ノム 配 列 決 定 の対 象 となって い る生 物 種 は 多 岐 に わ た る が,そ の 目 的 に基 づ い て大 き く3つ の グ ル ー プ に分 け る こ とが で き る。 第1は,出 ほ とん ど は 古 細 菌 に属 す るが,一 ど高 くな い 好 熱 菌 もい る(表2)。 で は,な ぜ これ ら好 熱 菌 が ゲ ノ ム 解 析 の 対 象 と し て 選 ば れ た の だ ろ うか?い 芽 酵 母20)や 大 腸 菌,枯 草 菌 な ど生 物 研 究 部 は真正 ま ず,地 くつ か の理 由が 考 え られ る 。 球 環 境 を見 つ め直 そ う と す る社 会 的 な 動 き の のモ デ ル 生 物 と して 長 い 歴 史 を もつ グル ー プで あ る。 唯 な か で,極 一 の光 合 成 生 物Synechocystisも こ こに含 まれ る21) 。第 う背 景 が あ る。 高 温 と い う特 殊 な環 境 に 生 き る生 物 の ン フル エ ンザ 菌22)や ピ ロ リ菌23),結 核 菌 な どの さ ま ざ ま な適 応 力 を知 る う え で は,超 好 熱 菌 は 興 味 深 2は,イ 病 原 性 微 生 物 で,社 会 的 に大 き な問 題 に な っ て い る感 染 症 の 病 原 性 解 明 を 目的 と して い る。 第3は,メ タン 限 環 境 で 生 き る 微 生 物 に も注 目 し よ う と い い。 ま た,極 限 環 境 で 生 育 す る生 物 か ら工 業 的 に有 用 な遺 伝 子 が 見 つ か る ので は,と い う期 待 も大 きい 。PCR 生 産 菌 や 超 好 熱 菌 な ど極 限 環 境 に棲 息 す る微 生 物 で あ 法 に 用 い る 耐 熱 性DNAポ る24)。これ まで に配 列 が 決 定 され た この グル ー プ に属 す 安 定 な 酵 素 の 利 用 価 値 は高 い 。 る生 物 は す べ て(超)好 熱 菌 で あ る。 さ ら に,好 これ らの 解 析 に よ っ て得 られ た 情 報 は 多 くの 分 野 に 波 及 効 果 を もた ら し て い るが,学 問 の流 れ そ の もの に 熱 菌,と リ メ ラー ゼ を は じめ と し て, くに 古 細 菌 に対 して は,進 化 系 統 学 的 な 興 味 が あ げ られ る 。 進 化 系 統 分 類 学 に お け る 古 細 菌 ゲ ノ ム 決 定 の意 義 は,メ タ ン菌 のゲ ノム解析 に は,期 待 され た ほ どの 大 き な変 革 は(と くに 日本 で は) つ い て の 山岸 らの 解 説24)に 詳 し い の で,こ ま だ 見 られ て い な い。 本 稿 で は,ゲ 菌 とい う面 か ら述 べ る こ とに す る。 ノム配列 決定後 を 含 め た 最 近 の ゲ ノ ム プ ロ ジ ェ ク トの流 れ をふ ま えつ つ, Woeseら が提 唱 した 古 細 菌 とい う概 念 は 現 在 で は広 く認 め られ,リ 好熱 菌ゲ ノ ム決定 の意 義 につ いて考 えてみ たい。 こで は好 熱 ボ ソー ムRNAの 塩 基 配 列 に基 づ く分 子 系 統 樹 で は,真 核 生 物 は古 細 菌 に近 縁 で あ る(図1)。 か し,異 Ⅰ .な ぜ好熱菌か? な る分 子 の 系 統 樹 で は異 な る結 果 が 得 ら れ る こ と も 多 く,さ 一 口 に好 熱 菌 と い っ て も多 種 多 様 で ,す べ て が 古 細 菌*1で は な い 。 常 温 菌(mesophile)に Ryoji Masui,Seiki of Biology,Graduate What Kuramitsu,大 School We Can Learn from 対 し て,一 般 に the Whole Genome ら に,分 子 に よ っ て は 真 正 細 菌 の ほ う に近 い と い う反 対 の 結 果 が 得 られ る こ とが あ る 。 この 矛 盾 は,原 始 生 命 か ら分 か れ た真 正 細 菌 へ の 道 と古 細 阪 大 学 大 学 院 理 学 研 究 科 生 物 科 学 専 攻(〒560-0043 of Science,Osaka し 大 阪 府 豊 中 市 待 兼 山 町1-1)[Department University,Machikaneyama-cho,Toyonaka,Osaka560-0043,Japan Sequences of Thermophiles 165 66 蛋 白質 核 酸 酵 素 Vol.44 No.2(1999) 菌 への道 が再 び合流 して真核 生物 が生 まれた と考 えれ す る こ とが 期 待 さ れ る。 さ て,真 ば説 明 で き る。 いわ ゆ る共生 説で あ る。今 後,ゲ ノム 正 細 菌 と古 細 菌 ・真 核 生 物 の どち らの 枝 に お い て も,系 統 樹 の根 元 に近 い 菌 は超 好 熱 菌 で あ る(図 全体 で の比較 に よって,生 物 進化 の研 究 は大 き く進 展 Database Center for Life Science Online Service 表1 全 ゲ ノム 配列 が 公 開 され てい る生 物 ● は 好 熱 菌 を 示 す 。a)Pyrococcu 表2 a)数 5種 shorikoshiiは,Pyrococcus 値 は そ れ ぞ れ の 文 献 あ る い は ホ ー ム ペ ー ジ に よ っ た 。b)機 Institute of Technology も よ ば れ る。 能 既 知 の 遺 伝 子 と マ ッ チ し た こ と を 意 味 す る 。c)特 Institute for Genomic 稿 で は,生 物 界 を 真 正 細 菌(Eubacteria),古 い る。 古 細 菌 に つ い て は,成 Research,GTC:Genome 細 菌(Archaebacteria),真 が 提 唱 したArchaea(ア Therapeutics 徴 的 な モチ ー フを Corporation,NITE:National 核 生 物(Eukaryotes)の3つ に分 け るWoeseら の分 ー キ ア)と い う名 称 に対 して も “古 細 菌 ” の訳 語 が慣 用 的 に使 用 され て 書40)に よ られ た い 。 適 生 育 温 度 に よ る分 類 はあ く まで 人 為 的 な もの で あ り,と を45℃,好 166 sp.OT-3と and Evaluation。 類 法 に従 った 。 の ち にWoeseら *2至 .Pyrococcus の 好 熱 菌 と そ の ゲ ノ ム の 比 較a) も つ だ け の も の も 含 め た 。d)TIGR:The *1本 shinkaj, 熱 菌 と超 好 熱 菌 の境 界 を80℃ くに 定 義 は され て い な い。 常 温菌(中 温 菌 と もよ ぶ)と 好 熱 菌 の 境 界 とす る分 け 方 もあ る。 好熱菌の全ゲ ノム配列決定 とその意義 Database Center for Life Science Online Service 67 図1 生物 界 の 分 子 系統 樹 全 ゲ ノ ム配 列 デ ー タが 公 開 さ れ て い る もの(太 字),お 内 に は 生物 の 慣 用 名 あ る い は性 質(病 よ び ゲ ノ ム配 列 決 定 が 進 行 中 の もの の 一 部 を あ げ た 。下 線 は好 熱 菌 を表 わす 。() 原 と な る 病 名 な ど,好 熱 菌 で は至 適 生 育 温 度),[]内 古 細 菌 と真 正 細 菌 の 系 統 樹 に つ い て は文 献42よ り,真 核 生 物 につ い て 文 献43よ 縁 種 を あ て は め た 。2つ の 系 統樹 を結 び つ け た た め,系 単 位 も,真 核 生 物 と他 の2つ に は配 列 決 定 が 完 了 す る 予 定 年 を示 した 。 り改 変 した 。 対 応 す る 生 物 が 文 献 に な い場 合 に は,近 統 樹 の根 に対 す る古 細 菌 と真 正 細 菌 の分 岐 点 は 正 確 で は な い。 また,枝 の 長 さの で は 同 じで は な い 。 1)。 そ れ らの 生 化 学 的 な性 質 や 惑 星 科 学 な どの 知 見 か 1に 示 し た 原 核 生 物 の ゲ ノ ム サ イ ズ と遺 伝 子 数 を比 較 ら,全 生 物 の 共 通 の 祖 先 は 好 熱 菌 で あ る と す る仮 説 が す る と,1遺 提 唱 さ れ て い る25)。そ の 説 に 従 え ば,好 熱 菌 の研 究 は, 塩 基 配 列 が 決 定 され た好 熱 菌 のゲ ノム サ イ ズは約2Mb, 原 始 生 命 の 基 本 的 な性 格 の 解 明,す 遺 伝 子 数 に し て 約2,000個 な わ ち 「生 命 とは 何 か 」 とい う根 本 的 な 問 い に直 結 す る もの と な る。 伝 子 あ た り約1kbに な る。 これ まで に全 で あ る 。 し た が っ て,こ れ ら好 熱 菌 に は,生 命 活 動 に 最 小 限 必 要 な 基 本 的 生 命 現 基 本 的 生 命 現 象 の 解 析 に好 熱 菌 が 適 し て い る こ とは, 象 が “濃 縮 ” さ れ て い る と い え る。 こ の よ う な 好 熱 菌 ゲ ノ ム に コ ー ドされ る遺 伝 子 の 数 か ら も支 持 され る。 最 の 特 徴 を生 か した 最 近 の ゲ ノ ム プ ロ ジ ェ ク トに つ い て 少 培 地 で 独 立 に棲 息 で き る生 物 が 最 小 限 必 要 と す る基 は の ち ほ ど述 べ る。 本 的 遺 伝 子 数 は 約1,000個 と見 積 も られ てい る20,25)。 表 167 68 蛋 白質 核 酸 酵 素 Vol.44 No.2(1999) 正 細 菌 で あ りな が ら古 細 菌 と 同 じ くエ ー テ ル 型 脂 質 を Ⅱ .決 定された好熱菌ゲノムの特徴 も つAquifex aeolicusで は,エ ー テル型 脂質 の合成 に 働 く遺 伝 子 は 同 定 され て い な い 。 これ らの こ と は新 し 1.ゲ ノムの 全体 像 い 経 路 ・酵 素 の 存 在 を 示 唆 し て い る 。 真 核 生 物 ゲ ノ ム の 特 徴 の ひ とつ で あ るイ ン トロ ン は, 古 細 菌Methanobacterium thermoautotrophicumと chaeoglobus fulgidusのtRNAにAr そ れ ぞ れ4個 個 ず つ 見 つ か っ た 。Methanococcus ム に18個 jannaschiiの 写 ・翻 訳 ・複 製 な ど 古 細 菌 の エ ネ ル ギ ー ・物 質 代 謝 や細 胞 分 裂 に 関 連 し と5 ゲノ も 見 つ か っ て 注 目 さ れ た イ ン テ イ ン は, た 遺 伝 子 は真 正 細 菌 の もの に よ り似 て い るが,DNA代 謝 関 連 の もの は基 本 的 に真 核 生 物 型 で あ る。 ただ し,真 核 生 物 の シ ス テ ム に 含 まれ る 因 子 の い くつ か は見 つ か Pyrococcus horikoshii(11個)以 外 には見 つか って い っ て い な い。 また すべ ての 好 熱 菌 ゲ ノ ム は,Gln-tRNA な い 。 また 近 縁 な種 間 で さ え,ゲ ノム上 の遺伝 子 の並 シ ン テ タ ー ゼ を 欠 い て い るが,Glu-tRNAを び 方 に は ほ とん ど保 存 性 は見 られ な か っ た 。 ア ミ ド化 す る酵 素 遺 伝 子 は 同 定 され てい る。P.horikoshiiを ゲ ノ ム サ イ ズ に 関 し て は,細 胞 生 命 の 生 存 に 必 要 な Database Center for Life Science Online Service B.転 ば,Asnに 対 す る酵 素 も見 あ た ら な い。 こ れ らは 耐 熱 遺 伝 子 の 数 は どれ く ら い か とい う問 い が よ くな され る。 化 機 構 に 関 連 す る もの と考 え ら れ る(後 述)。 い ま の と こ ろ,寄 生 性 の マ イ コ プ ラ ズ マ の遺 伝 子 数 が C。 最 小(470個)だ が,イ 小 必 要 数 を256個 ン フル エ ン ザ 菌 と の比 較 か ら最 とした 報 告 もある26)。好 熱 菌 を含 む9 シ グ ナ ル 伝 達 系 ・シ ャ ペ ロ ン な ど M.thermoautotrophicumは,い を構 成 す る2つ 正 細 菌 のdnaK,dnaJ,grpEホ の 数 は34個 の 菌 とA.fulgidusは,真 で あ っ た27)。 しか し,こ れ らの 数 値 は配 列 子 の2成 わ ゆ るthermosome の 古 細 菌 型 シ ャペ ロニ ン に加 えて,真 種 の 細 菌 ゲ ノム す べ て に お い て 保 存 さ れ て い た 遺 伝 子 の相 同 性 に基 づ いた 共 通 遺 伝 子 の数 に しかす ぎな い。 た 除け モ ログ も もって い る。 こ 正 細 菌 に広 く見 られ る制 御 因 分 系(two-component system)の 遺 伝子群 とえ ば,同 一 の 活 性 を もつ 異 な る生 物 種 由 来 の 酵 素 が, も多 数 もっ て い る 。 こ れ は,こ ア ミノ 酸 配 列 の相 同 性 が わ ず か10%程 ル ギ ー 代 謝 系 を もつ こ と に 関 係 す る と思 わ れ る。 全 体 ず,X線 度 に もか か わ ら 結 晶 解 析 で 立 体 構 造 を 決 定 し て み て,初 めて 的 に みて好 熱 菌 で は,炭 れ らの 菌 が 複 雑 な エ ネ 素 ・窒 素 の 欠 乏 やDNA傷 害な 相 同 蛋 白 質 で あ る こ とが わ か っ た例 が あ る28，29)。 この よ ど に反 応 し て遺 伝 子 の 発 現 を 制 御 す る た め の シス テ ム う に,配 が 欠 け て い る か,少 列 の類 似 性 か ら だ け で は,相 少 な く見 積 も る こ と に な る の で,よ る た め に は,蛋 同遺 伝 子 の 数 を り正 確 な 数 を 求 め 白 質 の ア ミノ 酸 配 列 だ け で な く,そ れ D.膜 な い よ うで あ る 。 輸 送 ・そ の 他 ア ミ ノ酸 配 列 の 解 析 か ら,ゲ ノム に コ ー ドさ れ て い ら の 立 体 構 造 や 機 能 も考 慮 に 入 れ る 必 要 が あ る。 現 段 る 蛋 白 質 の2割 階 で は,基 本 的 生 命 現 象 に必 要 不 可 欠 な遺 伝 子 の数 を か に は膜 輸 送 に 関 与 す る トラ ン ス ポ ー タ ー も多 数 含 ま 約1,000個 とす る前 述 の 見 積 も り は,妥 れ る が,何 当 な も の と考 近 く は膜 蛋 白 質 と推 定 さ れ る。 そ の な を輸 送 す るの か わ か っ て い な い もの も多 い。 え られ る。 3.耐 2.機 能別 にみ た各 ゲ ノムの 特徴 A.エ ネ ル ギ ー 代 謝 系 ・生 合 成 系 な ど .fulgidusとM.thermoautotrophicumは A ー 代 謝 系 の遺 伝 子(機 熱 化機 構 100℃ で 生 育 す る 超 好 熱 菌 か らゲ ノ ム の2本 を単 離 し,100℃ エ ネル ギ 能 未 知 の もの も含 む)の 数が 多 染 色 体 結 合 蛋 白質 と は 相 同性 の な いDNA結 (Sso7d30)な 後 者 が 電 子 供 与 体 と し て 水 素 を利 用 す る無 機 栄 養 細 菌 に は,ピ で あ る こ とに 起 因 し て い る。 た が,Sso7dの 複 雑 な 電 子 伝 達 系 の た め に 多 くの 補 酵 素 を も っ て い れ らの 合 成 に 必 要 な遺 伝 子 が 見 つ か っ て い な い場 合 も多 い。 他 の生 合 成 系 につ い て も,た とえ ば,真 *3真 正 細 菌 のDNAジ ャイ レ ー ス とは逆 に,正 か に は,Sulfolobus acidocaldayiusの 168 鎖 に な って しま う。 そ れ を 防 ぐた め に,Sulfolobus(図1)は,既 い 。 これ は前 者 が 硫 酸 還 元 を行 な う任 意 独 立 栄 養 細 菌, る が,そ に す る とDNAは1本 鎖DNA 知の 合 蛋 白質 ど)を も っ て い る。 ゲ ノ ム 解 析 され た もの ス トン様 蛋 白 質 あ るい はHU蛋 白質 は存 在 し ホ モ ロ グ は見 つ か っ て い な い 。 しか し, 高 温 下 で のDNAの 構 造 維 持 に 必 須 と考 え られ て い る リ バ ー ス ジ ャ イ レー ス*3は,至 moautotyophicumを 適 生 育 温 度 の低 いM .ther- 除 くすべ て の好 熱 菌 で見 つかった。 の 超 らせ ん を 導入 す るⅠ 型 トポ イ ソメ ラ ーゼ の一 種 。 な お,好 熱 性 古 細 菌 の酵 素 のな リバ ー ス ジ ャ イ レー ス の よ う に,室 温 で は活 性 を示 さ な い もの が あ る41)。 好熱菌の全ゲ ノム配列決定 とその意義 好 熱 菌 の 蛋 白質 で は,ア ミノ 酸 残 基 の う ち,高 温で 化 学 的 に不 安 定 なCys,Asn,Gln,Metな どの 含 量 が 少 な い とい わ れ て い る。 実 際 に,好 熱菌 の全 遺伝 子産 て,基 本 的 生 命 現 象 を原 子 レベ ル で 解 明 す るた め に は, “蛋 白質 が 安 定 で あ る こ と” と “遺 伝 子 操 作 系 が 確 立 し て い る こ と” と の2つ の 条 件 を 満 た す こ とが 不 可 欠 で 物 の 平 均 ア ミ ノ酸 組 成 を常 温 菌 の も の と比 較 す る と, あ る 。 遺 伝 子 操 作 系 が 確 立 した 超 好 熱 菌 は 存 在 し な い Glnが 大 き く減 少 してお り,Asnも た め,上 逆 に,GluとAspの 同 様 の傾 向 を示 した 。 割 合 は増 加 して い た が,こ れ は蛋 白 質 の 表 面 に イ オ ン対 や 水 素 結 合 が 多 い と い う好 熱 菌 記 の条 件 を 満 た す 生 物 と し て は,現 時 点 で は 高 度 好 熱 菌Thermus る。 そ こで,こ thermophilus HB8が のT.thermophilus HB8を 最適 で あ モデル生物 の 立 体 構 造 の 特 徴 を 反 映 した もの か も し れ な い 。 蛋 白 と し,可 能 な 限 り多 くの生 体 分 子 の 立 体 構 造 を決 定 し, 質 の 熱 安 定 性 に寄 与 してい る因 子 を調 べ るた め に は,好 そ の 立 体 構 造 を 基 に し て,原 熱 菌 ・常 温 菌(さ 命 現 象 を 解 析 し よ う と い う壮 大 な “高 度 好 熱 菌 丸 ご と らに は低 温 菌)の 可 逆 な 熱 変 性 実 験 の ほ か,水 蛋 白質 に つ い て の 和 水 を含 め た 詳 細 な立 体 子 レベ ル で 細 胞 全 体 の 生 1匹 プ ロ ジ ェ ク ト” が 日本 で 始 ま りつ つ あ る33，34)。 国 外 で は,と 構 造 の情 報 が 不 可 欠 で あ ろ う。 くに生 物 種 を 特 定 せ ず に,蛋 2次 構 造 に 出 現 す る約1,000∼8,000個 4.機 能未 知の 遺伝子 白質 の 超 の パ ター ン35，36) を 網 羅 し よ う とす る構 造 生 物 学 的 プ ロ ジ ェ ク トが 計 画 どの 好 熱 菌 に お い て も,全 遺 伝 子 の1/3∼1/2が Database Center for Life Science Online Service 69 未 知 な もの に分 類 され てい る(表2)。 機能 好 熱 菌 の場 合,こ され て い る37，38)。 しか し,日 本 の 1匹 プ ロ ジ ェ ク ト” の 目的 は,そ “高 度 好 熱 菌 丸 ご と の よ う な分 子 の 立 体 れ まで よ く研 究 され て きた 真 正 細 菌 や 真 核 生 物 と は 進 構 造 解 析 だ け に と ど ま ら な い 。 多 くの 研 究 者 が ボ ラ ン 化 的 に遠 縁 で あ るた め に 類 似 性 を見 つ け ら れ な くな っ テ ィ ア 的 に 協 力 しつ つ,決 て い る可 能 性 も あ る ほ か,異 能 解 析 を行 な い,最 な る経 路 や 機 構 を も っ て い る 可 能 性 も考 慮 す る必 要 が あ る。 し か し,以 上 の 議 論 は あ く まで 配 列 の 類 似 性 だ け に基 づ い て お り,個 々 定 され た 構 造 に 基 づ い て 機 終 的 に は1つ の細 胞 全体 の生命 現 象 を 原 子 レベ ル で理 解 しよ う とい う壮 大 な計 画 であ る39)。 本 稿 の 冒頭 で は,好 熱 菌 を極 限 環 境 に棲 息 す る グ ル の 遺 伝 子 の 同 定 に つ い て は,前 述 の よ う に,立 体 構 造 ー プ と し て位 置 づ けた が や 機 能 を含 め た 検 討 が 必 要 で あ る。 有 利 さ をふ ま え て 考 え れ ば,好 ,プ ロ テオ ーム解 析 にお け る 熱 菌 は こ れ か らの “ポ ス トゲ ノ ム 時 代 ” を拓 く新 た な モ デ ル 生 物 と して 最 も Ⅲ .ゲ ノムか らプ ロテオームへ 適 し て い る。 こ の よ う な 新 た な 展 開 を 可 能 に した こ と こ そ が,好 ゲ ノム配 列決 定 は生物全体 を理解 す るた めの ス ター トラ イ ン に す ぎず,各 熱 菌 ゲ ノ ム 決 定 の 最 も大 き な 意 義 とい え る の で はない だ ろうか。 遺 伝 子 に よ っ て コ ー ド さ れ る蛋 白質 の全体像 の解明 す なわち プロ テオー ム解 析 が次 の 課 題 とな る 。 機 能 未 知 な もの を含 め た 蛋 白 質 の 細 胞 機 能 を解 明 す る た め に は,こ れ まで の 生 化 学 的 ・分 子 生 物 学 的 な 手 法 は も と よ り,新 しい 方 面 か らの 取 り組 み も必 要 とな っ て くる。 そ こで,蛋 白質 の 安 定 性 が 高 い31) とい う好 熱 菌 の 特 色 が 注 目 され る よ うに な って きた 。 た と え ば,酵 素 蛋 白 質 の 機 能 を原 子 レベ ル で 理 解 す る際 に は,ま ず で きるだ け広 い 範 囲 のpHや 論 的 測 定 を行 な い,反 析 し て お く。 次 に,そ 種 に つ い て は,X線 温 度 で反 応 速 度 応 過 程 の 分 子 種 を速 度 論 的 に 解 の 反 応 過 程 に お け る 安 定 な分 子 結 晶 解 析 やNMRを 利 用 し て立 体 構 造 を決 定 す る。 こ れ ら の結 果 を総 合 し,酵 素 反 応 機 構 を推 定 す る 。 さらに,分 子 生 物 学 的 手 法 を用 い て,部 文 献 1)Fleischmann,R.D.,Smith,H.O.,Venter,J.C.et al.:Science,269,496-512(1995) 2)Fraser,C.M.,Smith,H.O.,Hutchinson,C.A., Venter,J.C.etal.:Science,270,397-403(1995) 3)Kaneko,T.,Tabata,S.etal.:DNARes.,3,109136(1996) 4)Kaneko,T.,Tabata,S.etal.:DNARes.,3,185209(1996) 5)Himmelreich,R.,Hilbert,H.,Plagens,H.,Pirkl, E.,Li,B.C.,Herrmann,R.:Nucl.AcidsRes.,24, 4420-4449(1996) 6)Blattner,F.R.,Plunkett,G.Ⅲ,Shao,Y.etal.: Science,277,1453-1474(1997) 7)Tomb,J.-F.,Berg,D.E.,Smith,H.O.,Venter,J. 位 特 異 的 変 異 導 入 に よ る 反 応 モ デ ル の 検 証32)や,欠 失 変 異 体 に よ る細 胞 内 で の 機 能 解 析 を 行 な う 。 この よ う に,構 造 生 物 学 と分 子 生 物 学 と を融 合 させ C.etal.:Nature,388,539-547(1997) 8)Fraser,C.M.,Casjens,S.,Venter,J.C.etal.: Nature,390,580-586(1997) 169 70 蛋 白 質 核 酸 酵素 Vol.44 No.2(1999) 9)Fraser,C.M.,Smith,H.O.,Venter,J.C.etal.: Kuramitsu,S.:ActaCryst.Sec.D,54,1032-1034 Science,281,375-388(1998) (1998) 10)Kunst,F.,Ogasawara,N.,Danchin,A.etal.: 29)Nobe,Y.,Kawaguchi,S.,Ura,H.,Nakai,T., Nature,390,249-256(1997) Hirotsu,K.,Kato,R.,Kuramitsu,S.:J.Biol. 11)Deckert,G.,Swanson,R.V.etal.:Nature,392, Chem.,273,29554-29564(1998) 353-358(1998) 30)Gao,Y.-G.,Su,S.-Y.,Robinson,H.,Padmanab- 12)Cole,S.T.,Barrell,B.G.etal.:Nature,393,537- han,S.,Lim,L.,McCrary,B.S.,Edmondson,S.P., 544(1998) Shriver,J.W.,Wang,A.H.-J.:NatureStruct. 13)Butl,C.J.,Woese,C.R.,Venter,J.C.etal.: Biol.,5,782-786(1998) Science,273,1058-1073(1996) 31)Jaenicke,R.,Schurig,H.,Beaucamp,N.,Osten- 14)Smith,D.R.,Noling,J.,Reeve,J.N.etal.:J. dorp,R.:in Bacteriol.,179,7135-7155(1997) 15)Klenk,H.P.,Woese,C.R.,Venter,J.C.etal.: mic Press,San Nature,390,364-370(1997) 32)倉 16)Karabayashi,Y.et al.:DNA 17)Karabayashi,Y.et Res.,5,55-76(1998) al.:DNA 33)倉 Res.,5,147-155 (1998) Database Center for Life Science Online Service Chemistry(ed. 光 成 紀:蛋 光 成 紀 Diego(1996) 白 質 核 酸 酵 素,37,2243-2256(1992) ・河 口 真 一:バ イ オ サ イ エ ンス とイ ン ダ ス ト 34)http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/∼kuramitsu/ 35)Chothia,C.:Nature,357,543-544(1992) 19)http://www.tigr.org/tdb/tdb.html 笠 原 直 毅 36)Orengo,C.A.,Jones,D.T.,Thornton,J.M.: ・ 村 上 康 文:蛋 白 質 核 酸 酵 素,42,673- 678(1996) Nature,372,631-634(1994) 37)Gurkhard,R.:Structure,6,259-263(1998) 21)池 内 昌 彦:蛋 22)小 笠 原 直 毅:蛋 23)中 澤 晶 子:蛋 24)山 岸 明 彦 白 質 核 酸 酵 素,41,2579-2583(1996) 38)Gaasterland,T.:NatureBiotech.,16,625-627 白 質 核 酸 酵 素,41,366-370(1996) (1998) 白 質 核 酸 酵 素,43,81-85(1998) ・ 大 島 泰 郎:蛋 39)倉 白 質 核 酸 酵 素,42,174- 島 泰 郎:生 40)山 命 は 熱 水 か ら 始 ま っ た,東 光 成 紀 ・柴 田 武 彦 同 年 会(長 177(1997) 25)大 in Protein リ ー,54,34-36(1996) 18)Nature,387(Suppl.),5-105(1997) 20)小 Advances Adams,M.W.W.),Vol.48,pp.181-269,Acade- 京 化 学 同 人 岸 明 彦:古 39,東 岡98)要 ・井 上 頼 直 ・横 山 茂 之:蛋 白 合 旨 集,30-33(1998) 細 菌 の 生 物 学(古 賀 ・ 亀 倉 編),pp.16- 京 大 学 出 版 会(1998) 41)Kikuchi,A.,Asai,K.:Nature,309,677-681(1984) (1995) 26)Mushegian,R.,Koonin,E.V.:Proc.Natl.Acad. 42)Olsen,G.J.,Woese,C.R.,Overbeek,R.:J.Bacte- Sci.USA,93,10268-10273(1996) riol.,176,1-6(1994) 27)Huynen,M.A.,Bork,P.:Proc.Natl.Acad.Sci. 43)Douglas,S.E.,Murphy,C.A.,Spencer,D.F., USA,95,5849-5856(1998) Gray,M.W.:Nature,350,148-151(1991) 28)Nakai,T.,Okada,K.,Kawaguchi,S.,Kato,R., 第1回 開放的融合研究公開シンポジウム 個 体 発 生 の ゲ ノム 機 能 と分 子 機 構 の 解 明 期 日:平 成11年3月18日(木)・19日(金) 会 場:駒 場 エ ミ ナ ー ス(東 京 都 目黒 区 大 橋2-19-5/Te1.03-3458-1411) GTP結 合 蛋 白質 の 介在 す る新 規 シ グナ ル伝 達 経 路 堅 田利 明(東 大) 一 條秀 憲(東 医 歯 大) 細胞 死 シ グナ ル の制御 機 構 動物 の初 期発 生 にお け る臓器 形 成 と遺 伝子 発 現 浅 島 誠(東 大) 血液 と血 管 の発 生 西 川 伸 一(京 大) ゲ ノ ム イ ンプ リンテ ィング の機 構 と個 体 発 生 佐 々木 裕 之(遺 伝研) 細 胞 を操 作 して個 体 を作 る 角 田幸 雄(近 畿 大) ゲ ノ ム機 構 の解 析 系 として の突 然 変 異 マ ウ ス 170 山 村研 一(熊 本 大) 妊 娠 の認識 と成 立 の メカ ニ ズム:着 床 にお け るサ イ トカ イ ン遺 伝子 の 発現 制 御 今 川 和彦(東 大) 連絡 先:〒154-8509 東 京都 世 田 谷 区 太 子 堂3-35-31 国立 小 児病 院 小児 医 療研 究 セ ンタ ー 実験 外 科生 体工 学 部 鈴 木 盛 一 Tel.03-3414-8121 ext.2773 〒305-0901 茨城 県稲 敷 郡 茎 崎 町 池 の台2 農林 水産 省 畜産 試 験 場 Tel.0298-38-8617 企 画 調整 部 松 本 光人
© Copyright 2024 Paperzz
