目次 - Thomson Reuters Integrity

更新日:2012 年 11 月
2012 年 11 月に FAQ 内容が更新されました。
目次
※ご希望の項目に Ctrl キーを押しながらクリックして下さい。
コンテンツ ..................................................................................................................................................................................................................................... 4
Q. INTEGRITY では、どのような情報を検索できますか? ......................................................................................................................................... 4
Q. INTEGRITY の情報源は何ですか? ............................................................................................................................................................................. 4
Q. INTEGRITY では、どのくらい前の情報まで検索できますか? ............................................................................................................................ 4
Q. 特許情報が INTEGRITY に収載されるまでのタイムラグはどのくらいですか?........................................................................................... 5
Q. どのようなタイプの特許を解析するのでしょうか? ................................................................................................................................................. 5
Q. 特許の PDF ファイルにはどうすればリンクできますか?..................................................................................................................................... 5
登録とログイン ............................................................................................................................................................................................................................ 6
Q. どうすれば INTEGRITY にログオンできますか? .................................................................................................................................................... 5
Q. 個人でユーザ登録できますか? ................................................................................................................................................................................. 5
Q. 同僚とパスワードを共用できますか? ........................................................................................................................................................................ 5
定義と略号 ................................................................................................................................................................................................................................... 6
Q. Under Active Development(開発活動中)とはどういう意味ですか? ............................................................................................................ 6
Q. Lead Compound(リード化合物)とは? ........................................................................................................................................................................ 7
Q. Entry Number(EN:エントリー番号)とは? ............................................................................................................................................................... 7
Q. New Molecular Entity(NME:新規化合物)とは?..................................................................................................................................................... 7
Q. Targetscapes とは? ......................................................................................................................................................................................................... 7
Q. 標的物質レコードで、Condition(病態)に関連付けられている“Validated”、”Candidate“、”Exploratory“は何を意味しています
か? ................................................................................................................................................................................................................................................ 8
Q. <Disease Briefings>とは? ................................................................................................................................................................................................ 8
Q. <Experimental Models>の Knowledge Area は、どのような情報を主に収録していますか?.................................................................... 8
Q. 新規の Experimental Model のレコードは、どの様な場合に収録されますか? ........................................................................................... 8
Q. INTEGRITY における”Link to Potentially Related Patents”(関連があると思われる特許へのリンク)とは? ................................... 9
Q. Last Update(最新更新日)と Available Since(検索開始対象日または期間)の違いは何ですか? ..................................................... 9
Q. 更新とは? ............................................................................................................................................................................................................................ 9
Q. 薬物レコードの登録日はどうすれば分かりますか? ............................................................................................................................................. 9
Q. 薬物レコードの最終更新日はどうすれば分かりますか? ................................................................................................................................... 9
Q. 構造式が最初に表示された日付はどうすれば分かりますか? ........................................................................................................................ 9
Q. 「Highest Phase」と「Development Status サブメニューに含まれる”Phase”」と「Milestone サブメニューに含まれる”Phase”」の
違いは? ....................................................................................................................................................................................................................................... 9
Q. 医薬品が作用する仕組みや治療対象とする疾患に関する情報はどうすれば検索できますか? ..................................................... 11
Q. ”Mechanism of Action” (作用機序)検索フィールドは INTEGRITY でどのように機能するのでしょうか? ..................................... 11
Q. INTEGRITY では”Mechanism of Action”(作用機序)をどのように分類していますか?......................................................................... 12
Q. INTEGRITY において”Mechanism of Action”(作用機序)により、活性はどのように表示されますか? .......................................... 12
Q. INTEGRITY において”Therapeutic Group”(治療群)検索フィールドはどのように機能するのでしょうか? .................................... 12
Q. INTEGRITY において“Condition”(疾病)検索フィールドはどのように機能するのでしょうか? ........................................................... 13
Q. INTEGRITY において”Product Category”検索フィールドはどのように機能するのでしょうか? ......................................................... 13
Q. INTEGRITY における開発段階の専門用語は、どのように定義されていますか? ................................................................................ 13
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Q. Biological Testing とは?どうしてこの段階に多くの化合物が存在するのでしょうか? ......................................................................... 13
Q. INTEGRITY 中のマイルストーン専門用語の定義は何ですか? ................................................................................................................... 13
Q. Experimental Activity と Pharmacological Activity を検索する違いは何でしょうか? ............................................................................. 13
Q. <Experimental Pharmacology>におけるパラメータとしてどのような略号が用いられているのでしょうか? ................................... 14
Q. <Experimental Pharmacology>における投与経路の略号としてどのような略号が用いられているのでしょうか? ........................ 14
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>におけるパラメータとしてどのような略号が用いられているのでしょうか? .............................. 14
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>におけるパラメータとしてどのようなものが使用されていますか? ................................................ 14
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>における投与経路用としてどのような略号が使用されていますか?............................................ 14
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>における投与量(回数)としてどのような略語が使用されていますか? ....................................... 14
検索 ............................................................................................................................................................................................................................................. 23
Q. INTEGRITY からデータを検索する場合、どのような方法がありますか? ................................................................................................... 14
コンテンツ
Q. Search form はどこにあるのでしょうか?................................................................................................................................................................. 15
Q. どのように Knowledge Area を選択するのでしょうか?...................................................................................................................................... 15
Q. <Targets & Pathways>と<Genomics>の Knowledge Area はどのように使い分けたらよいですか? .................................................. 15
Q. どのような語句が利用できるのか、与えられた検索フィールドにどのように入力すればよいのかどうすればわかりますか?
....................................................................................................................................................................................................................................................... 15
Q. Browse Index とは何ですか? ................................................................................................................................................................................... 15
Q. なぜ Browse Index を使用するべきなのでしょう? .............................................................................................................................................. 15
Q. 検索フィールドのリスト中でどうして 2 回以上語句がみつかるのでしょうか? ........................................................................................ 16
Q. 一回の検索でいくつの検索フィールドが利用可能でしょうか? .................................................................................................................... 16
Q. 検索フィールドで何文字まで使用できますか? ................................................................................................................................................. 16
Q. NOT 演算子は使用できますか? ............................................................................................................................................................................. 16
Q. 利用可能以上の検索フィールドが必要な場合、どうすればよいのでしょうか? ....................................................................................... 16
Q. 化学構造式検索機能はどこにあるのでしょうか? .............................................................................................................................................. 17
Q. <Experimental Pharmacology> と<Pharmacokinetics & Metabolism>の Knowledge Area において特定の数値の範囲
検索は可能でしょうか? ............................................................................................................................................................................................... 17
Q. 数値検索にはどのような形式が利用できますか? ............................................................................................................................................ 17
Q. 検索後に<Experimental Pharmacology>と<Pharmacokinetics & Metabolism>での検索結果の集合を数値で選別できますか?
....................................................................................................................................................................................................................................................... 18
Q. 化学構造式検索にどのようなプログラムが使用されるのでしょうか? ........................................................................................................ 18
Q. 構造式エディターが違うと検索結果が異なることはありえますか?............................................................................................................. 19
Q. 構造式エディターはどの検索エンジンを使用していますか?......................................................................................................................... 19
Q. 化学構造式検索オプションを使う際に、どのようなタイプの検索を指定できるのでしょうか? ............................................................ 19
Q. 検索において正確な立体化学を特定できますか? ......................................................................................................................................... 19
Q. INTEGRITY における化学構造式検索についての情報をもっと知るためにはどうすれば良いのでしょうか?................................ 19
Q. ChemDraw ツールバーが見えなくなった場合、どうすればよいのでしょうか? .......................................................................................... 19
Q. 配列検索用フィールドに最少、最大の限界はあるのですか? ..................................................................................................................... 19
Q. Quick Search はどのように機能しますか? .......................................................................................................................................................... 19
Q. Quick Access Links は何でしょうか? ..................................................................................................................................................................... 20
データ管理 ................................................................................................................................................................................................................................ 20
Q. 検索結果用にどのような表示形式が利用できるのでしょうか? .................................................................................................................... 20
Q. 印刷に適した表示形式は何でしょうか? ................................................................................................................................................................ 21
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Q. 結果ページに関連している全ての”Knowledge Area”中に存在するレコードを全て見ることはできますか? ................................ 21
Q. 検索結果をエクスポートできますか? ...................................................................................................................................................................... 21
Q. 化学構造式はエクスポートすることはできますか? ......................................................................................................................................... 21
Q. SAR Tableを<Experimental Models>のKnowledge Areaからエクスポートできますか? .......................................................................... 22
Q. 複数の“Knowledge Area”から同時に情報をエクスポートできますか? ..................................................................................................... 22
アラート ....................................................................................................................................................................................................................................... 22
Q. INTEGRITY にはどのようなアラートがありますか? ............................................................................................................................................ 23
Q. どのような時に Save Query を使用したらよいですか? .................................................................................................................................... 23
Q. どのような時に Keep Me Posted を使用したらよいですか?........................................................................................................................... 23
Q. Controlled Vocabulary は何を追跡しますか? ....................................................................................................................................................... 23
Q. Session History はどのように使用しますか?........................................................................................................................................................ 23
Q. アラートはどうやって設定するのでしょうか? ........................................................................................................................................................ 23
Q. アラートを同僚も受信できるように E-Mail アドレスを追加できますか? .......................................................................................... 23
Q. いくつの検索式が保存でき、アラートを設定できるのでしょうか?................................................................................................................. 23
Q. Alert Center は新しい情報が INTEGRITY に収録されたことをどのようにして通知するのでしょうか? ......................................... 24
Q. どのくらいの頻度で Alert Center からメッセージが届きますか? ............................................................................................................... 24
カスタマーサポート ................................................................................................................................................................................................................. 24
Q. テクニカルサポートや内容に関する質問をしたい場合は、トムソン・ロイターにどのように連絡すればよいでしょうか? .......... 24
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コンテンツ
Q. INTEGRITY では、どのような情報を検索できますか?
医薬品の研究開発に従事する利用者に不可欠な以下の項目に関する情報が得られます。
・
生理活性化合物(医薬品):約 380,000 件(その内、約 34 万件には化学構造式が存在します)
・
標的タンパク/遺伝子:約 2,100 件(生理活性物質の標的となるタンパクや遺伝子に関する情報で
す)
・
ゲノム:約 20,0 00 件(遺伝子に関連した研究情報が豊富です)
・
合成スキーム:約 25, 000 件の生理活性物質の合成スキーム
・
研究機関:約 8,000 件(研究開発が行われている製薬企業や大学等に関する情報です)
・
薬理活性データ:約 1,200,000 件(医薬品/レセプター、酵素/標的細胞の相互作用を定量的に把
握できます)
・
薬物動態/代謝データ:約 510,000 件(被代謝物質に加えて活性代謝物に関する情報も得られま
す)
・
臨床試験:約 180,000 件(臨床試験中、或いは上市済み薬物の臨床試験レポートへの参照情報
が得られます)
・
疾病の解説:約 130 件(患者数、罹患要因、予防方法、診断方法、治療方法に関する情報が得ら
れます)
・
文献:約 1,500,000 件(上記の各情報の情報源である学術雑誌等の書誌事項とオリジナル文献
へのリンクです)
・
特許:約 210,000 件(上記の各情報の情報源である特許の書誌事項とオリジナル特許へのリンク
です)
・
動物モデル:約 5,700 件(モデルを使って評価を行った疾患や医薬品情報と共に動物モデルに関
する詳細情報が得られます。実験結果である薬理活性データへも直接リンクしています)
Q. INTEGRITY の情報源は何ですか?
主要な情報源として、特許・医薬関連学術雑誌・学会での講演内容、企業への聞き取り調査、インター
ネットが含まれます。INTEGRITY は、創薬化学・有機合成・実験薬理・臨床薬理・バイオマーカー・ゲノ
ミクス分野の 1,500 誌以上の学術雑誌と毎年 400 以上の学会をカバーしています。加えて、主な製薬、
及びバイオテクノロジー企業の研究開発状況を見守っています。
Q. INTEGRITY では、どのくらい前の情報まで検索できますか?
1988 年以降に発見された薬物、研究開発された薬物を収録しています。
図1に個々の Knowledge Area の継続的なカバー状況の詳細を示しています。
但し、関係する過去レコードも収録されています。例えば、<Drugs & Biologics>には 1,500 以上の選
ばれた過去の日付のレコードが存在します(例えば Aspirin)。
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図1
Knowledge Area
収録開始年
Drugs & Biologics
1988
Targets & Pathways
2004
Genomics
2001
Biomarkers
2007
Organic Synthesis
1970 年代
Experimental Pharmacology
1998
Experimental Models
2012
Pharmacokinetics/Metabolism
2000
Clinical Studies
2000
Disease Briefings
2000
Companies & Research Institutions
2000
Literature
1988
Patents
1988
Q. 特許情報が INTEGRITY に収載されるまでのタイムラグはどのくらいですか?
WO,EP と US 特許の索引は公開後 1-2 日でご利用できます。JP 特許の索引は公開後 5-7 日、CN、
KR と IN 特許は公開後 30 日以内でご利用できます。特許は我々のシステムに取り込まれて 1-2 週
間以内に化学や薬理と言った追加価値を含めて詳細に検討されます。文献や学会のレコードが収録さ
れるまでの期間は、通常 2 週間以内(その情報が最初に編集に利用された日から起算して)です。
2010 年 9 月から中国(CN)、韓国(KR)、インド(IN)の特許もカバーするようになりました。
Q. どのようなタイプの特許を解析するのでしょうか?
以下の特許機関からの特許をカバーしています;WO,EP,US,JP,CN,KR,IN。2005 年以降に公開され
た基本特許を持つ全ての特許に対して、人用の医薬物質、標的物質、バイオマーカー、遺伝子治療、
スクリーニング、ワクチン、及びそれ以外の少数のカテゴリーをカバーして完全な解析が機械的に行わ
れます。2005 年以前は、医薬用物質を中心に収録していました。
Q. 特許の PDF ファイルにはどうすればリンクできますか?
Integrity ユーザーは、弊社特許データベース Thomson Innovation を介し表示されたポップアップ画面
から特許明細書を PDF 表示/ダウンロードする事が出来ます。
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コンテンツ
登録とログイン
Q. どうすれば INTEGRITY にログオンできますか?
www.thomsonreutersintegrity.com のサイトよりログオンして下さい。トムソン・ロイターより既に「ユー
ザ名」と「パスワード」が発行されている、或いは初回の利用時に登録済みであれば、その「ユーザ名」
と「パスワード」を“Registered Users”の下のスペースに入力して“Login”ボタンをクリックして下さい。
Q. 個人でユーザ登録できますか?
あなたの所属企業がトムソン・ロイターとオプション契約を締結している場合は、INTEGRITY のログイ
ンページ(www.thomsonreutersintegrity.com)にて個人でユーザ登録できます。ログインページ中央の
“Self-Register” ボ タ ン を ク リッ ク し て 下 さ い 。 「 使 用 条項 」 を ご 一 読 頂 き 、 同 意 す る か ご 検 討 後 、
“Continue”ボタンをクリックして下さい。「登録フォーム」に必要事項を全て入力し、入力内容、特に
E-Mail アドレスをよくご確認頂き、“Send”ボタンをクリックして下さい。
「ユーザ名」と「パスワード」を記録しておいて下さい。登録は瞬時に行われます。新しい「ユーザ名」と
「パスワード」を入力し、“Login”ボタンをクリックすると INTEGRITY にアクセスができます。
Q. 同僚とパスワードを共用できますか?
INTEGRITY の「使用条項」の内容に基づき、INTEGRITY のユーザ名とパスワードは個人特有、移譲
不可なものです。INTEGRITY では、ユーザ名とパスワードの組み合わせにより個人のユーザアカウン
トを規定しています。各利用者は「アラート」を受け取るための一つの E-Mail アドレスを持っていること
になっています。ユーザ名とパスワードの組み合わせを共有することは本来の利用者の「保存検索式」
と「アラート」の機密性を損なうことになり、「アラート」機能を他の利用者が使用できなくしてしまいます。
二人の利用者が同一のユーザ名/パスワードを同時に使用した場合、システムがアクセスを拒絶しま
す。
定義と略号
Q. Under Active Development(開発活動中)とはどういう意味ですか?
“Under Active Development(UAD:開発活動中)”は、前臨床段階から登録(前臨床、IND 申請、
PhaseⅠ、PhaseⅠ/Ⅱ、PhaseⅡ、PhaseⅡ/Ⅲ、PhaseⅢ、pre-registered、recommended approval
そして registered)で活発に開発されている化合物のレコードに表示されます。
“Under Active Development”の表示が付与されている化合物には、以下 2 つの条件の一方、又は両
方の条件が過去 12-18 カ月の間に発生している必要があります。
a)プレスリリース、アニュアルレポートでの言及、企業のホームページ上での索引(特に、企業がその
薬物が開発品リストに公表している場合)を通じて企業が薬物の開発状況を活発に発表している。
b)化合物の進捗を示す言及がバイオ系文献(学術雑誌や講演)で発表されている。
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“Under Active Development”のチェックボックスは、活発に開発中である化合物のみを収得するよう
検索を制限して絞り込むのに用いられます。 “Under Active Development”検索項目 (プルダウンメニ
ュー中)は、この検索条件が他の検索条件と AND や OR ブーリアン演算子により結びつけられる場合
に用いられます。(例:Under Active Development=Y OR Highest Phase=Launched)。
“Under Active Development”は“Full Product Record”中に表示されます。“UAD”である薬物のエント
リー番号は、赤で表示されアスタリスクでマークされます。極めて開発の初期段階にある化合物は、
“Under Active Development”であるか否かは考慮されないので、“Under Active development”フィル
ターを用いた検索から除外されます。上市済みであり、新規の病態や新規の地域、あるいは新規の組
織では研究を行っていない化合物は、“Under Active Development”は考慮されないので、“Under
Active development”フィルターを用いた検索から除外されます。
Q. Lead Compound(リード化合物)とは?
一つの特許または学術雑誌から一群の「姉妹」化合物が得られる場合、その一群は“Lead compound
(リード化合物)”として指定された化合物を持ちます。仮に、特許中で特別にクレームされた一つだけ
の化合物が存在する場合には、それがリード化合物になるでしょう。または、薬理データ(例えば IC50
値)が存在するケースでは、もっとも活性な化合物が我々の一群(引用されている投与経路のような他
の事柄や全ての毒性が等価)におけるリード化合物として指定されたものとなります。トムソン・ロイタ
ーにおける“Lead compound”という用語の使用は、一群中のその化合物が前臨床や後期開発に進む
ことを予期するものではありません。これは大量のデータを検索している利用者が一群の中から一つ
の代表的な化合物を選択し、それにより”background noise”を軽減させるための道具とご理解下さい。
“Lead Compound”チェックボックスは、検索をリード化合物だけに制限するフィルターとして用いられま
す。開発のごく初期段階にある化合物に検索する場合に特に有用です(例えば、Biological testing)。
Q. Entry Number (EN:エントリー番号)とは?
“Entry Number”とは、Integrity データベース中に含まれる全ての生理活性化合物に割り当てられた
6 桁の化合物 ID 番号です。 これは、医薬品の一生を通じた化合物の識別子として用いられます。
この番号はデータベースに収録された順番に付与されています。
Q. New Molecular Entity (NME:新規化合物)とは?
INTEGRITY 中での“New Molecular Entity”は、開発コードあるいは化学名で特定される化合物であり、
生物医学文献、学術会議、会社情報に初めて掲載された化合物です。 “NME(New Molecular
Entity)”として表示される期間は 4 カ月間です。
Q.Targetscapes とは?
“Targetscape”は、標的物質へのリンクを含む疾病に関する分子景観図です。
仮に標的物質が予期されていない場合、“Targetscape”中にアクティブなリンクは無いと思われますが、
利用者は<Genomics>において関係する遺伝子関連研究と一緒に遺伝子やタンパクを参照するため
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に検索できます。“Targetscape”へは、<Targets & Pathways>内の画面左側のクイックアクセスリスト
を使用するか、或いは関連する標的物質のレコード内からリンクすることが出来ます。
Q. 標 的 物 質 レ コ ー ド で Condition ( 病 態 ) に 関 連 付 け ら れ て い る “ Validated” 、
“Candidate”、“Exploratory”は何を意味していますか?
ある病態の標的物質としてどの程度妥当であるかを示す為にアルゴリズムが使用されています。3 種
類のステータスが存在します。
Validated (V):注目している病態において、以下のいずれかに該当する。
① 特定の作用機序を有する薬物(群)の開発段階が[Launched]又は[Registered]である。
② 特定の作用機序を有する薬物(群)が[Preclinical]~ [Recommended Approval]の開発段
階において現在開発が進行中(Under Active Development)である。
Candidate (C) : 注 目 し て い る 病 態 に お い て 、 過 去 に 特 定 の 作 用 機 序 を 有 す る 薬 物 ( 群 ) が
[Preclinical]~ [Recommended Approval]の開発段階において開発が行われていた(Under Active
Development)。
E(Exploratory): 注目し ている 病態において、特定の作用機序を有する 薬物( 群)が Biological
Testing の開発段階において研究開発が進行中(Under Active Development)である。
Q. <Disease Briefings>とは?
“Disease Briefings”は、特定の疾患に対する薬物治療における現状と将来展望を大胆に捉えた上質
のサマリーのことです。
これらは疾病に関する背景情報や、その疾病治療に現在用いられている化合物やその病態を対象と
して研究中の化合物の情報を含んでいます。さらに関連する情報やサイトへもリンクしています。
Q. <Experimental Models>の Knowledge Area は、どのような情報を主に収録し
ていますか?
<Experimental Models>の“Knowledge Area”は、医薬品の薬理活性を試験する為に疾患の病態を
再現するのに用いられている in-vivo の実験モデルを詳細に記述します。個々のモデルで試験された
医薬品が詳述されており、これらは該当モデルを用いて生み出された複数の薬理実験結果にリンクし
ています。
Q. 新規の Experimental Model のレコードは、どの様な場合に収録されますか?
医薬品の薬理学的プロファイルを探求する際にモデルが医学研究に有用で、人の特定の疾患の病態
を再現すると明確になったならば、“Experimental Models”のレコードが作られます。
個々のレコードには、モデルを誘発し、医薬品の薬理学的プロファイルを探求するのに用いられる実験
の詳細や条件を記述する目的でモデルの“Description”(補足説明)と“Characteristics”(特徴)の項目
が存在します。
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モデルで試験された個々の医薬品や病態に対してレコード内の実験データや引用文献への直接のリ
ンクが設定されています。与えられたモデル内で使用されているバイオマーカーも同様です。
Q. INTEGRITY における Link to Potentially Related Patents(関連があると思わ
れる特許へのリンク)とは?
これは、化学構造式が未公開の化合物情報から同じ特許出願人(機関)によって出願された同じ作用
機序を有する化合物の特許へのリンクです。
Q. Last Update(最新更新日)と Available Since(検索開始対象日または期間)の
違いは何ですか?
“Available Since”検索フィールドは、そのレコードが最初に INTEGRITY に登場した日に基づいてレコ
ードを取得します。“Last Updated”検索フィールドは、何らかの情報が最後に更新された日付に基づい
てレコードを取得します。
Q. 更新とは?
2005 年後半以降に更新された薬物レコードは“Updates”ポップアップに示される更新履歴を持ってい
ます。全ての更新が逆時系列(最新が最初)で表示される更新履歴ポップアップを開くためには、
“Updates” ボタ ン ( 薬物のフルレ コード 表示の場合、エン トリー番号すぐ 右側) をクリックし ます。
“Updates”ボタンを持たないレコードは、2005 年後半、或いは INTEGRITY に含まれて以降に一度も
更新されていないレコードです。
Q. 薬物レコードの登録日はどうすれば分かりますか?
登録日(The Record Creation Data)フィールドによって、薬物レコードが最初に登録された時期を
特定できます。
Q. 薬物レコードの最終更新日はどうすれば分かりますか?
最終更新日(The Last Updated Data)フィールドによって、薬物レコードが最後に更新された時期を特
定できます。更新に関する詳細情報は、”Updates”ボタンをクリックすると表示されます。
Q. 構造式が最初に表示された日付はどうすれば分かりますか?
構造式登録日(The Structure Entry Data)フィードによって、構造式が追加された時期を特定できます。
この情報は、2012 年 8 月以降は充実しています。2012 年 10 月中旬以降に登録された構造式に対し
ては、その構造式が最初に判明した文献や特許への参照がリンクされます。
Q. 「Highest Phase」と「Development Status サブメニューに含まれる“Phase”」
と「Milestone サブメニューに含まれる“Phase”」の違いは?
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こ れ に 対 す る 説 明 は 以 下 の 通 り で す 。 同 様 の こ と が 、 “Condition” 、 “Organization” 、 “Brand
Name”、“Under Active Development”において繰り返し現れる他の類似フィールドにも適用されます。
個々の検索フィールドは極めて正確な検索を可能とします。可能であれば、“Knowledge Area”中に
「上位」と「下位」レベルの検索フィールドが特異性を高めて的をえた結果を可能とするために存在しま
す。上位レベルの検索フィールドとは、ドロップダウン方式の検索フィールド一覧表にすぐに表示されて
いる検索フィールドがその全てです。下位レベルのフィールドを持つ場合、検索フィールドカテゴリーの
名称がボールドで表示され、その隣にプラス印を持ちます。サイドメニューを開くためには、利用者はボ
ールドの用語をロールオーバー(マウスを用語の上に重ねる)するだけで良く、そして下位レベルの検索
フィールドを選択します。下位レベルの検索フィールドを組み合わせた検索は、関連付(Related
Criteria)検索として知られています。
“Higher Level – Highest Phase”は、上位レベルの検索フィールドの一例であり、“Lead Compound と
“Under Active Development”用のチェックボックスです。“Highest Phase”は、“Full Product Record”
中のページ上部左手近くにあります。各化合物は、たった一つだけ最高“Phase”を持ちます。これは特
定の“Phase”に達した全ての化合物を利用者が取得したいと思った場合に最適のフィールドです。
“Development Status Level – Development Status>Phase”は、下位レベル検索フィールドの一例で
す。“Development Status>Phase”は、“Development Status”一覧表中の“phase”の列にあります。
“Full Product Record”中の“Development Status Summary”は、各病態において達した最高“Phase”
を示し、一覧表のヘッダー中の“Details”ボタンで“Development Status”タブが開きます。
一覧表中の各行が開発プログラムに対応しているので、一覧表中に複数回繰り返される“Phase”がし
ばしば存在するでしょう。薬物は異なる機関により異なる病態で異なる地域で開発され得るので、これ
らのそれぞれは、おそらく異なる“Phase”にある独立した開発プログラムを持ちます。“Development
Status Phase”検索は、検索条件に合致する一覧表中の全ての行を抽出します。プログラムの行中に
見つかる検索条件に合致させたい場合に、これは最適のフィールドです。例えば、ガンで PhaseⅡの
開発段階で実際に開発中の化合物の検索ならば、“Development Status”フィールドを用いて実行でき
るでしょう。
“Milestone level - Milestone->Phase”は、別の下位レベル検索フィールドであり、“Development
Status summary”のヘッダー中に見つかる“Milestones”ボタンをクリックすることでポップアップとして
開く“Milestone”の一覧表の”Phase”列の中を検索します。通常複数の“Milestone Phase”が存在しま
す。“Milestone”は常に企業名、開発段階、病態に特異的であり、明確な“Milestone”日付を持ちます。
下位レベル検索フィールドを用いて検索する際に考慮すべきこと
初期の開発段階から一度も抜け出したことのない薬物は、開発履歴や“Milestone”を持たないと考えら
れているので、全ての薬物が開発段階の一覧表や「マイルストーン」の一覧表を持つわけではありませ
ん。それゆえに、極めて初期段階の化合物は、“Development Status”や“Milestone”検索フィールドで
検索しても結果が得られないでしょう。それは、検索を実行するための“Development Status”や
“Milestone”のデータを持たないからです。
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“Highest Phase”を用いた検索は、薬物のリストとして結果を返します。一方、“Development Status”
を 検 索 条 件 と し て 用 い た 検 索 で は 、 “Program List” と し て 結 果 を 返 し 、 “Milestone” で の 検 索 は
“Milestone List”を返します。その薬物がいかに多くの開発プログラムやマイルストーンを持っていても、
薬物リストは化合物あたり一つの結果を持ちます。一方、検索条件に合致する複数の開発プログラム
やマイルストーンが存在するならば、開発プログラムやマイルストーンのリストは、複数行の結果を持
つことになるでしょう。利用者は、“Options”メニューを使用することで表示を切り替えできます。
同一の下位階層の検索フィールドの集合から 2 つ以上のフィールドを用いると、検索条件を組み合わ
せて極めて的確な結果が得られます。例えば、“Development Status -> Phase = Phase I”、 且つ
“Development Status Condition = cancer”で検索した場合、「PhaseⅠ」の開発段階に無いガンの開
発プログラムがいくら多くあろうとも、或いはガンで無い「PhaseⅠ」の開発プログラムがいくら多くあろう
とも、ガンで「PhaseⅠ」の開発プログラムを持つ薬物の結果のみが検索されるでしょう。このことは、
“ガン”のように広範なトピックスについて検索する際に、利用者が閲覧したい結果に極めて明確に限定
し、あまりにも多くの不適切な結果を招いてしまう問題を回避可能とします。
異なったレベルの検索フィールドを用いた場合、フィールドがどこを検索するかというロジックと検索結
果の表示フォーマットが原因で、利用者に異なった件数の結果を得てしまうでしょう。
Q. 医薬品が作用する仕組みや治療対象とする疾患に関する情報はどうすれば検索
できますか?
医薬品や生物学的薬剤が作用する機序や、それらが標的とする疾患に関する色々なタイプの情報を
INTEGRITY は収録しています。これら情報を検索するには、以下の検索フィールドを使用します。
●Mechanism of Action
●Condition
●Therapeutic Group
●Product Category
Q. Mechanism of Action (作用機序)検索フィールドは INTEGRITY でどのように
機能するのでしょうか?
“Mechanism of Action”検索フィールドは、生物活性化合物用の種々のタイプの活性機序を記述した
統制語を用いています。例えば、“Angiotensin-1 Converting Enzyme(ACE) Inhibitor”、 “Calcium
Channel”、“Blockers, Angiotensin Receptor Antagonists”、“Dopamine D1 Agonists”等。
“Mechanism of Action”検索フィールドは同じ機序で働く極めて限定的な化合物群を検索する場合に
有用です。また、ブーリアン演算子“AND”と一緒に用いて二通りの活性機序を持つ化合物を探すことも
できます。 検索例は“Angiotensin-1 Converting Enzyme(ACE) Inhibitor” AND “Neprilysin
(Enkephalinase, Neutral Endpeptidase, NEP) Inhibitors”。 “Mechanism of Action”検索フィールド
用の“Browse Index”は、検索に用いる専門用語を階層構造に従って選択するための極めて目的を定
めた方法を提供します。この検索フィールドは、アルファベット順のリストから語句を選択するのにも使
用できます。また、利用者は検索用語の簡単な候補リストを作るために予備検索フィールド(Lookup ボ
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ックス)を利用できます。
Q. INTEGRITY では Mechanism of Action (作用機序)をどのように分類していま
すか?
INTEGRITY では、作用機序を次の 2 つに分けています。“Cellular Mechanisms(細胞内の作用機序)”
と“Molecular Mechanisms(分子生物学的な作用機序)”です。どのような化合物でもいずれか、また
は両方のタイプの複数の機序を持つことができます。<Drugs & Biologics>の“Filter by Statistics”を使
用し、“Mechanistic Scope (Compounds by Mechanism Type)” を選択することにより、下記の機序
タイプに応じて振り分けられた機序を表示した 2 種類のチャートが作成されます。
Molecular Mechanisms (分子作用機序によって分類)
Cellular Mechanisms(細胞作用機序によって分類)
Q. INTEGRITY において Mechanism of Action (作用機序)により、活性はどのよ
うに表示されますか?
リガンドとは、レセプターに結合しますが(それらは与えられたレセプターに対してある親和定数を持
つ)、それらがアゴニスト、アンタゴニストのいずれとして働くか知られていない薬物です。モジュレータ
とは、レセプターのオルソステリック部位よりもアロステリック部位に結合して、オルソステリックリガンド
の活性を調整する薬物です。モジュレータは、レセプターに対して作用しない作用機序を記述する際に
も用いられます。これは、真の作用機序が特定されることなく、エフェクター(例えば酵素やタンパク)の
活性を薬物が調整することを意図する広範な定義です。“drugs acting on X receptors”という語句は、
薬物がレセプター群(例えば、アセチルコリンレセプター群)に作用しても、どのレセプターに結合する
かに関する情報が特定されていない際に用いられます。
Q.INTEGRITY において Therapeutic Group(治療群)検索フィールドはどのように
機能するのでしょうか?
“Therapeutic Group” フィールドは、生物活性化合物を分類できる種々のタイプの薬理学的/治療学的
グル― プを 記述し た 統 制 語を用 いて いま す。こ れら は、広 範なグ ルー プ( 例え ば、循 環器系 薬
[Cardiovascular Drugs]、神経系薬[Neurologic Drugs])であり得ますし、より限定的なグループ(例え
ば、降圧薬[Antihypertensive Drugs]、 抗不整脈薬[Antiarrhythmic Drugs])でもあり得ます。このフィ
ールドは、作用機序(阻害剤、アゴニスト、アンタゴニスト、増強剤、増感剤等)用の専門用語は含みま
せん。特定(広意または狭意)の病態に関係する化合物を検索する際に全てのタイプの作用機序に興
味がある場合に、“Therapeutic Group”検索フィールドは有用です。例えば、“Therapeutic Group =
Antihypertensive Drugs”という検索は、ACE 阻害剤、カルシウム拮抗剤、エンドセリン ETB 拮抗剤、
アンジオテンシン AT1 阻害剤等の化合物を見つけることができます。“Therapeutic Group”検索フィー
ルド用の“Browse Index” は、検索に用いる専門用語を階層構造に従って選択するための極めて目的
を定めた方法を提供します。この検索フィールドは、アルファベット順のリストから語句を選択するのに
も使用できます。
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Q. INTEGRITY において Condition(病態)検索フィールドはどのように機能するの
でしょうか?
“Condition”検索フィールドは、問題に対して医学的なアプローチをとり、生物活性化合物が治療する
病態のタイプを記述した統制語を用いています-例えば、“Condition = Hypertension”で検索すると高
血圧治療に用いられる利尿薬が抽出されます。“Condition”検索フィールド用の“Browse Index”は、検
索に用いる専門用語を階層構造に従って選択するための極めて目的を定めた方法を提供します。こ
の検索フィールドは、アルファベット順のリストから語句を選択するのにも使用できます。また、利用者
は検索用語の簡単な候補リストを作るために予備検索フィールド(Lookup ボックス)を利用できます。
Q. INTEGRITY において Product Category 検索フィールドはどのように機能する
のでしょうか?
“Product Category”フィールドは、「どのように作用するのか」、あるいは「何のために使用するのか」
ではなく、「何であるか」という基準で生理活性物質をクラス分けできる種々の分類を記述した統制語を
用いています。これらの集合は、「化学的範疇」、「生物学的要因」、「バイオテクノロジー医薬品(抗体、
ワクチン等)」、「送達システム」、「ホルモン」等を含みます。“Product Category” 検索フィールド用
の”Browse Index”は、検索に用いる専門用語を階層構造に従って選択するための極めて目的を定め
た方法を提供します。この検索フィールドは、アルファベット順のリストから語句を選択するのにも使用
できます。また、利用者は検索用語の簡単な候補リストを作るために予備検索フィールド(Lookup ボッ
クス)を利用できます。
Q. INTEGRITY における開発段階の専門用語は、どのように定義されていますか?
開発段階の用語の定義は付録の表1にあります。
Q. Biological Testing とは? どうしてこの段階に多くの化合物が存在するのでしょ
うか?
特許からの薬物はこの段階にまず入力されます。これは、ほとんど全ての薬物レコードが「生物学的試
験(Biological Testing)」から出発することを意味します。さらに先に進行したことを示す情報が公表され
た場合のみ、より進んだ Phase に移行します。INTEGRITY 中の全化合物の 80%以上が「生物学的試
験(Biological Testing)」です。
Q. INTEGRITY 中のマイルストーン専門用語の定義は何ですか?
マイルストーンの用語の定義は付録の表 2 にあります。
Q. Experimental Activity と Pharmacological Activity を検索する違いは何でし
ょうか?
“Pharmacological Activity”フィールドは、薬物と標的であるレセプターや酵素との相互作用に関する
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情報を収録しています。“Experimental Activity”は、より広範で包括的な情報を説明しており、以下の
サブカテゴリーの組み合わせで構成されています。
System:“in vivo”, “in vitro”, “ex vivo”等の実験方法
Activity/Effect:“activation ”, “affinity”, “agonism”, “antagonism”, “blockade”, “induction”,
“inhibition” 等の薬理作用の形態
Target/Condition/Toxicity:標的物質名、疾患名、毒性・副作用名
Q. <Experimental Pharmacology>においてどのような略号が用いられているので
しょうか?
<Experimental Pharmacology>中のパラメータの略号は付録の表 3 にあります。
<Experimental Pharmacology>中の投与経路の略号は付録の表 4 にあります。
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>においてどのような略号が用いられている
のでしょうか?
<Pharmacokinetics/Metabolism>中のパラメータの略号は付録の表 5 にあります。
<Pharmacokinetics/Metabolism>中の投与経路の略号は付録の表 7 にあります。
<Pharmacokinetics/Metabolism>中の投与量(回数)の略号は付録の表 8 にあります。
Q. <Pharmacokinetics/Metabolism>におけるパラメータの修飾語句としてどのよ
うなものが使用されていますか?
<Pharmacokinetics/Metabolism>中のパラメータの修飾語句は付録の表 6 にあります。
Q. <Experimental Models>においてどのような略号が用いられているのでしょう
か?
<Experimental Models>中の投与経路の略号は付録の表 9 にあります。
検索
Q. INTEGRITY からデータを検索する場合、どのような方法がありますか?
INTEGRITY では下記の通り 4 種類の検索方法があります。
・Search forms(各“Knowledge Area”に存在します)
・Quick Search(INTEGRITY の各ページに存在します)
・Quick access links(例:“Pipeline on the Move”, “Today’s Patents”等)
・Disease Briefings(病態や疾病にから検索する)
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コンテンツ
Q. Search form はどこにあるのでしょうか?
INTEGRITY の各“Knowledge Areas”に対応した Advanced Search 検索画面があります。
この検索画面には INTEGRITY のホームページ上の関連する“Knowledge Area”をクリックしてアクセ
スできます。
Q. どのように Knowledge Area を選択するのでしょうか?
最初に見たい検索結果の種類が、どの“Knowledge Area”を選択すべきかを決定します。
INTEGRITY では全てのデータが統合されているので、全てのデータにアクセスすることができます。
Q. <Targets & Pathways>と<Genomics>の Knowledge Area はどのように使い
分けたらよいですか?
<Targets & Pathways>の “Knowledge Area”は実績のある標的情報を含んでおり、遺伝子と蛋白は
別々に掲載されています。また、この “Knowledge Area”には、関連する化合物へのリンクと情報が
あります。<Targets & Pathways>の “Knowledge Area”にある遺伝子のレコードには、常に関連する
<Genomics>の ”Knowledge Area”のレコードが存在します。<Genomics>の ”Knowledge Area”に
は遺伝子と蛋白が組み合わされて掲載されており、遺伝子関連研究の情報が含まれます。
Q. どのような語句が利用できるのか、与えられた検索フィールドにどのように入力す
ればよいのかどうすればわかりますか?
検索フィールドを選択し、“Browse index”を開くためにフィールドの右側にある“Index”をクリックして下
さい。
Q. Browse Index とは何ですか?
語句をどの様に入力するかを示す下記 4 種の索引が INTEGRITY に存在します。それらが“Browse
Index”です。
・
Tip – 検索条件を入力する形式に関するヒントを提供(例えば Available Since)
・
Masterlist – 完全なデータベース内容を収録(例えば Drug Name)
・
Controlled Vocabulary – 与えられた検索条件に対する独自の語句(例えば Phase)
・
Controlled Vocabulary:hierarchical – 与えられた検索条件に対する階層で検索可能な独自の
語句(例えば Mechanism of Action)
Q. なぜ Browse Index を使用するべきなのでしょう?
INTEGRITY で用いられる特定の語句を選択することは、検索しているものが INTEGRITY 中に存在
することを保証し、結果を得ることができます。例えば、INTEGRITY は全てのマスターリストと統制語
索引を一つの語句に標準化しています。従って、与えられた語句の略語、他の語句、他の綴りを用い
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ると間違った結果となってしまうのに対して、索引から選択すればそれら全てを検索できるでしょう。
Q. 検索フィールドのリスト中でどうして 2 回以上同じ語句がみつかるのでしょうか?
INTEGRITY 中で関連付けられた検索条件フィールドは、利用者がある特定の語句を何と関連付けた
いかを正確に特定することを可能とします。例えば、“Condition”は薬物の検索フィールドとして 3 回登
場します。1 回はメインリスト中(一般的な観念として病態は化合物に結びついています)、1 回は
“Development Status”の中(その病態での Phase 情報を検索するため)、そして 1 回は“Milestones”
の中(その病態に関連するマイルストーンを検索するため)の 3 回登場します。
Q. 一回の検索でいくつの検索フィールドが利用可能でしょうか?
各検索フィールドのセッションは、ドロップダウンメニュー中で利用可能ないずれの検索フィールドでも
設定可能な 3 つのフィールドを持っています。複数のフィールドは、自動的にブーリアン演算子 AND で
結ばれますが、右横側、”Index”ボタンのちょうど右側にあるブーリアン演算子のドロップダウンメニュー
を調整することで、利用者はこのブーリアン演算子を OR に変更できます。さらに薬物の検索セクション
には、“Lead Compound”と“Under Active Development”(これらの語句の定義に関しては、この FAQ
中の他の箇所をご参照下さい)のいずれか一方、あるいは両方でフィルターするオプションを追加する
ための 2 つのチェックボックスがあります。検索条件に構造式を追加するために、利用者は“Structure
Search(構造式検索) ”ツール(ほとんどの“Knowledge Area”で利用可能、さらなる構造式検索に関し
ては、このガイドの他の箇所をご参照下さい)を開くことができます。全ての“Knowledge Area”は、少な
くとも 2 つの検索フィールドのセクションを持ち、その内の一つはその“Knowledge Area”固有の一組の
検索フィールド(例えば、特許の出願人や文献の著者のようなフィールド)であり、多くの場合に一つは
“Product”検索フィールドのセクションです。
その“Knowledge Area”の内容に関係するならば、いくつかの“Knowledge Area”では同様に追加の検
索フィールドのセクションを持ちます。
Q. 検索フィールドは何文字まで使用できますか?
検索フィールドは、フィールド間と同様にフィールド内の AND や OR ブーリアン演算子を使いつつ 300
文字まで格納できます。例えば、Phase = "Phase Ⅲ" or "Pre-Registered" or "Recommended
Approval" or "Registered"。
Q. NOT 演算子は使用できますか?
INTEGRITY において“NOT”は正しい演算子ではありません。検索の精度を高めるためには、“Filter
by Statistics”チャートを使用し、除去の条件として部分集合を選択することを推奨しています。
Q. 利用可能以上の検索フィールドが必要な場合、どうすればよいのでしょうか?
利用者がもっと検索フィールドが必要、或いは利用者が必要とする“Knowledge Area”固有の検索フィ
ールドに十分なフィールドが存在しない場合は、結果表示ページの右手側にある“Filter by Statistics”
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チャートを使用して検索の精度を高められます。利用できるチャートは、“Knowledge Area”固有であり、
元々の検索フィールドで選択できるのとほぼ同数の条件を用いて検索や結果参照の精度を高めるた
めのオプションを提供します。これらのチャートは、棒グラフ(利用者は、“Filter by Statistics”チャートの
ページで他の表示形式に変更可能)として検索結果を視覚的な表現として表示します。この棒グラフを
使って利用者は、選択された条件での内訳を見たり、データの部分集合を選択したり、チャートの結果
をエクスポートしたり、チャートのスクリーンキャプチャーを取るなどできます。棒グラフの棒で表現され
ている検索結果の正確な件数を示す「ロールオーバー表示」を見るためには、棒部分をロールオーバ
ーして下さい。検索結果の部分集合へ移動して精度を高めるためには、個々の棒の左にあるチェック
ボックスをチェックして”View Subset(s)”ボタンをクリックして下さい。
Q.化学構造式検索機能はどこにあるのでしょうか?
化 学 構 造 式 検 索 は 、 全 て の “Knowledge Areas” ( <Targets & Pathways> 、 <Genomics> 、
<Biomarkers>以外)中で利用でき、“Structure Search”と記されたボタンの下にあります。このボタン
は上級検索ページの右手の方にあり、構造式は薬物レコードに直接関連付けられるので、検索フィー
ルドの“Product”セクションのヘッダーと同じ行に通常存在します。例外は<Organic Synthesis>であり、
そこでは構造式は有機合成レコードに結び付けられており、最終生成物か中間体のいずれかに合致
する構造式が見つかるでしょう。
Q. <Experimental Pharmacology>、<Experimental Models>及び
<Pharmacokinetics & Metabolism>の Knowledge Area において特定の数値の
範囲検索は可能でしょうか?
<Experimental Pharmacology>、<Experimental Models>及び<Pharmacokinetics/
Metabolism>の“Knowledge Area”において、数値の範囲を用いてデータ検索が可能です。
この機能によって、パラメータと単位を選択後、含まれるべき数値を特定して検索を限定できます。ドロ
ップダウンメニューから値が選択されると、利用者をガイドするように検索フォームは修正されます。
<Experimental Pharmacology>では、この検索フィールドは“Measured Product”サブメニューの中か
ら利用できます。
Q. 数値検索にはどのような形式が利用できますか?
Integrity におけるデータポイントの表示は、元の公表文献で数値がどのように表現されているか、つま
り単一の数値、以上、以下、範囲、標準偏差のいずれを含むかに依存します。数値の範囲検索を利用
すれば特定のレコードを含めたり、除外したりできます。検索用の数値は、指数形式でも通常の形式で
も指定できます。 例えば、1nM は以下の 2 通りで指定できます。
・ 1e-9M(下付きの e を使用)
・ 0.000000001M
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Q. 検索後に<Experimental Pharmacology>と<Pharmacokinetics &
Metabolism>での検索結果の集合を数値で選別できますか?
<Experimental Pharmacology>と<Pharmacokinetics/Metabolism>の“Knowledge Area”において、
“Filter by Value Range”ボタン(ページ右側の“Filter by Statistics”タブの中にあります)を使って検索
結果を数値で選別できます。“Value range charts”は、他の“Filter by Statistics”チャートに類似してい
ます。しかし、デフォルトの表示形式は、対数尺度です。チャートの右側にある”Standard Scale”ボタン
をクリックするとこの表示形式に変更できます。チャートは、検索結果のリスト中の数値の分布を表示し
ています。数値範囲は Y 軸方向に 20 個の区分に分割されており、特定の数値や数値範囲への絞り込
に利用できます。数値は、数値が合致する各区分に割り当てられます。例えば、20.0x10e-9 -
20.9x10e-9、21.0x10e-9-21.9x10e-9、22.0x10e-9-22.9x10e-9 の区分を含む標準尺度のチャー
トならば、20-26nM の範囲の数値は、これら全ての区分に表示されます。
Q. 化学構造式検索にどのようなプログラムが使用されるのでしょうか?
INTEGRITY は、ポータルにおいて化学構造式検索に用いる構造式を作画するための 4 つの異なるプ
ログラムと互換性を現在持っています。利用者は常に任意のオプションを選択可能であり、最後に選
択したオプションが各利用者の新しいデフォルトとなります。このオプションは、構造式検索できる全て
の“Knowledge Areas”で利用可能です。
これらは下記の通りです。
Accelrys Draw (以前の Symyx® Draw, MDL® Draw)
このオプションを利用するためには、利用者は“Accelrys Draw”ソフトウェアーの現行ライセンスの所有
とインストールが必要です。
ISIS/Draw™ + Chime
化学構造式作画ツールとして ISIS/Draw を使用するためには、利用者は Accelrys ISIS/Draw のライ
センスの所有が必要です(さらに情報が必要な場合は http://accelrys.com/をご覧ください)。
さらに利用者は“Accelrys Chime plugin”を無償でのダウンロードとインストールする(ここをクリック)か、
Integrity 内のリンクを辿ることが必要です。
ChemAxon Marvin Applet
“ChemAxon Marvin Applet”は、利用者が INTEGRITY 内部でこの構造式作画オプションを選択した
際に自動的にインストールされます。
CambridgeSoft CS ChemDraw™ Plugin
このオプションを利用するためには、利用者は“CambridgeSoft CS ChemDraw™ Pro”プラグイン、又
は“CS ChemDraw™ Net”プラグインをインストールしておく必要があります。
“CS ChemDraw™ Net”プラグインは、無償で“CambridgeSof”t ウェブサイト
(http://www.cambridgesoft.com/software/ChemDraw/)から、若しくは INTEGRITY 内のリンクをたど
ることでダウンロード可能です。
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Q. 構造式エディターが違うと検索結果が異なることはありえますか?
CambridgeSoft(ChemDraw)と Accelrys(ISIS/Draw)は検索時に適応される判断基準の方針に歴史
的に相違があり、異なる結果となる場合があります。その例は、互変異性(tautomers)の扱いです。
Q. 構造式エディターはどの検索エンジンを使用していますか?
3 種類の構造式エディター(Accelrys Draw, ISIS Draw, Marvin Applet)が ChemAxon 社の検索エン
ジン JCHEM JAR 5.0.2.1 を使用しており、これは JAVA の API です。ChemDraw は、ORACLE
Cartridge インターフェースを通じて CsCartridge 12.0.1.71 を検索に使用しています。
Q. 化学構造式検索オプションを使う際に、どのようなタイプの検索を指定できるので
しょうか?
利用者は、部分構造、完全一致、類似検索の中から選択できます。
Q. 検索において正確な立体化学を特定できますか?
“Exact”または“Substructure”検索を実行する場合に、“Match Stereochemistry”オプションは、利用者
が立体化学を考慮する(Match Stereochemistry enabled)か、無視するかの選択を可能とします。
Q. INTEGRITY における化学構造式検索について、もっと知るにはどうすれば良い
のですか?
構造式検索についてより詳細な情報が必要な場合は、“Guide to Structure Search Options”、もしくは
“Learning Center”内の“Recorded Training”をご利用ください。
Q. ChemDraw ツールバーが見えなくなった場合、どうすればよいのでしょうか?
ツールバーが見えなくなった場合、描画画面上で右クリックして“View”、次に“Show Main Tools”を選
択して下さい。
Q. <Genomics>の Knowledge Area での配列検索に用いる文字数に最小、最大
の制限はあるのですか?
<Genomics> “Knowledge Area”で配列検索が可能です。配列検索において定義する為に 18 塩基が
想定されています。しかし、検索フィールドには 300 塩基まで入力できます。検索フィールド内では配列
の左右で自動的にトランケーションされます。
Q. Quick Search はどのように機能しますか?
これは、INTEGRITY の全ての“Knowledge Areas”中で得られる情報をひと目で参照するための機能
です。“Quick Search”機能は、個々の“Knowledge Area”中のテキストが基本となっている最も適切な
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フィールドを横断的に検索します。日付のフィールドや Y/N(Yes/No)のフィールドは横断検索しません。
また、“Knowledge Area”に直接当てはまらないフィールドも検索しません(例えば、<Companies &
Research Institutions>のフルレコード中には病態フィールドは存在しないので、<Companies &
Research Institutions>中において病態は検索しません)。検索語句として、ハイフンやアポストロフィ
は使用しないで下さい。その代わりに一つ、または複数の文字の代用としてアスタリスクを用いて下さ
い。アスタリスクは、左又は右でのトランケーションの指定として同様に用いられます。社内コードを入
力する際には、ハイフンは削除して下さい。例えば FK506。
Q. Quick Access Links とは何でしょうか?
これらは、INTEGRITY ホームページ上、或いは“Knowledge Area”にあるリンクであり、データベース
中の特定の情報に直接アクセスします。以下の情報を含んでいます。
・
Today’s news:過去 24 時間以内に登録された 5-10 個の最も重量なニュース記事へリンク
・
Today’s Featured Patents:過去 24 時間以内に登録され入念に分析された特許項目へリンク
・
Conferences:最近の学会から選択された索引情報へのリンク
・
The Starting Line:前臨床か臨床のいずれかの開発段階に進んだ最も有望な化合物の一覧表
(週次で更新)へリンク。これらの化合物は、通常リード化合物であるか、或いは<Literature>の文
献中において初めて索引された新規の活性機序を持つものです。
・
Pipeline on the Move:現在開発中の医薬品の開発段階において見つかった変化の一覧表(週
次で更新)へリンク。前週のデータへのアクセスし、情報をソートやエクスポートできるデータベー
ス形式として提供されます。
・
Gateways to Gene-related Studies:前業務週の間に INTEGRITY に登録された標的物質に関
する新しい研究のリストへリンク
・
Gateways to Patents:前業務週の中で特色のある特許のリストへリンク
・
Gateways to Clinical Trials:前業務週の間に INTEGRITY に登録された新規“Clinical Studies”
の参照文献の一覧表へリンク
・
Gateways to Development Status:特定の病態(広範な集合、あるいは一つ又は複数の”部分集
合”を選択可能)において上市済み、或いは開発中である全ての化合物へリンク
データ管理
Q. 検索結果用にどのような表示形式が利用できるのでしょうか?
選択できる表示形式は、結果が存在する“Knowledge Area”により異なります。例えば、“Drugs &
Biologics” に は “Product List”, “Product List with structure”, “Full Records”, “Gateways to
Development Status List”, そして“Milestones List”があります。一方、<Literature> “Knowledge
Area”には“References List”と“References with Associated Text List”があります。どの“Knowledge
Area”からでも、希望の表示形式を選択するためには、“Options”メニューを開いて、表示形式の全て
の種類をご覧下さい。
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Q. 印刷に適した表示形式は何でしょうか?
“Knowledge Areas”の全ての表示形式は、“Printer Friendly Format”で結果を表示する選択肢があり
ます。“Knowledge Areas”で、“Options”メニューを開き、“Printer Friendly Format”を選択して下さい。
<Disease Briefings>では、各ページ上の小さなプリンターアイコンか、画面の左手側の“Disease
Briefings Chapters”メニューの一番下の“Print Full Documents”ボタンをクリックすると印刷されます。
Q. 結果ページに関連している全ての Knowledge Areas 中に存在するレコードを全
て見ることはできますか?
INTEGRITY 中のほとんど全てのレコードは、他の“Knowledge Areas”の中に関連レコードを持ってい
るでしょう。これらの関連レコードへのリンクは、フルレコード表示画面の一番下に存在し、これらのリン
クをたどることで利用者を他の“Knowledge Area”中の関係レコードに導くことになるでしょう。“Options”
メニューの中にある“All Related Information via Quick Search”は、表示されている全ての結果に関
する「関連情報リンク」の要約を利用者に提供します。利用者は、元々の結果に個々の“Knowledge
Area”の何件のレコードが関連しているのかを見ることができ、選択した“Knowledge Area”の名称を記
載した横棒部分を単にクリックすることでそれらのレコードに移動できます。
Q. 検索結果をエクスポートできますか?
“Knowledge Area”に依存して、Export Center 経由で Excel、MS Word、Bizlnt、SDFile、RDFile、
EndNote、Reference Manager、Refworks、ISIS for Excel フォーマットでエクスポートできます。個々
のエクスポート操作で一回あたり標準的には最大 1000 レコードまでエクスポートできます。エクスポー
トするレコード件数を Export Center 中のテキストボックスで指定することができます。関心のあるレコ
ードを指定する為にレコード件数を入力するフォーマットには、範囲やカンマ区切りのリストを含めるこ
とができます。例えば、”1-5, 14, 21-24”の場合、1,2,3,4,5,14,21,22,23,24 のレコードがエクスポートに
含まれます。
Q. 化学構造式はエクスポートすることはできますか?
化学構造式は“CS ChemFinder”や“Accelrys MDL ISIS Base”といった化学構造式データベース管理
プログラムで使用できるようにSDfile(<Drugs & Biologics>と<Experimental Pharmacology>
Knowledge Areaから)、及びRDFile(<Patents>と<Experimental Pharmacology> Knowledge Area
から)のそれぞれのフォーマットでエクスポートできます。
同様にインストール済みのISIS for Excelでの使用目的でISIS for Excelフォーマットでもエクスポート
できます(<Drugs & Biologics >と<Experimental Pharmacology SAR Table view>から)。
構造式は、<Drugs & Biologics >、<Patents>、<Experimental Pharmacology>(SAR Table viewを
含む)Knowledge AreaからSMILES形式をバッチでエクスポートできます。
構造式は、<Drugs & Biologics >にある“Structure Futures”から個々のSMILESかMolfileとしてエクス
ポートできます。同様に構造式はイメージとしてExcel やWord形式でエクスポートできます。
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Knowledge Area <Drugs & Biologics>からSDFile形式でエクスポート可能です。同様にDrugレコー
ド中の“Structure Features”ボタンからSmilesやMolfile形式でエクスポートできます。Knowledge
Areas <Patents>や<Experimental Pharmacology>からはRDFile形式でエクスポート可能です。ま
た、MS WordやExcelに画像形式でエクスポート可能です。
Q. SAR Tableを<Experimental Models>のKnowledge Areaからエクスポートで
きますか?
Structure-activity relationship(SAR) tableは、<Experimental Models>からMS Excel、ISIS for
Excel、MS Wordのいずれかの形式でエクスポート可能です。
Q. 複数の Knowledge Area から同時に情報をエクスポートできますか?
異なった“Knowledge Areas”からの情報を組み合わせた選りすぐりのレポートが Word フォーマットで
“INTEGRITY Reports”経由で利用可能です。INTEGRITY において現在 11 種の異なったレポートが
利用可能です。
・
Product Report – 最近の更新、開発段階、マイルストーン、更に選択された化合物に関する他
の Knowledge Areas 中の関連レコード数の一覧表を含めた薬物情報。
・
Sales & Intellectual Property Report –選択された化合物に関する薬物、売上、特許の組み
合わせ情報
・
Chemistry Report – 選択された化合物に関する薬物情報と合成スキーム
・
Target Pipeline Report – 関連薬物の一覧表付きの基本的な標的物質の情報
・
Organic Synthesis Report – 最終生成物、反応中間体、試薬の情報付きの合成スキーム
・
Experimental Pharmacology Report – 関連する化合物の薬物情報を組み合わせた実験薬
理データの一覧表
・
Pharmacokinetics Report –関連する化合物の薬物情報を組み合わせた薬物動態データの一
覧表
・
Clinical Studies Report –関連する化合物の薬物情報を組み合わせた臨床試験データ
・
Company Report – 選択した団体に関する他の“knowledge Areas”中の関連レコード数の一覧
表を含めた企業情報
・
Literature Report – 選択した参照文献に関する他の“knowledge Areas”(例えば、薬物動態デ
ータや合成スキーム)からの関連情報付きの全索引情報
・
Patent Report with related information – 選択した特許に関連した薬物、実験薬理、有機合
成、標的物質、及び遺伝子とバイオマーカーのいずれか一方、あるいは両方からの情報を組み
合わせた特許情報
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アラート
Q. INTEGRITY にはどのようなアラートがありますか?
“Saved Query”、“Keep Me Posted”、“Controlled Vocabulary”の 3 種類のアラートがあります。
これらのアラートは“Query Manager/Alert Center”を使って管理できます。
Q. どのような場合に Save Query を使用したらよいですか?
“Save Query”は、同じ条件で検索を再実行した場合に、ヒットして来る新規の検索結果を追跡する目
的で使用できます。
Q. どのような場合に Keep Me Posted を使用したらよいですか?
“Keep Query”は、既存レコードに対する更新の通知を受け取りたい場合に使用できます。
Q. Controlled Vocabulary は何を追跡しますか?
“Controlled Vocabulary”は、“Browse Index”中に新たに登場した作用機序、治療領域グループ、病態
や機関名を表す統制語の通知を受け取るために使用できます。
Q. Session History はどのように使用しますか?
“Search History”は、過去 24 時間以内に実行した検索式と、得られた結果を再確認するために使用で
きます。最初の時に検索式を保存しなかった場合にとても便利であり、“Session History”から保存でき
ます。同様に編集ボタンを使って検索式に対して変更も行えます。
Q. アラートはどうやって設定するのでしょうか?
“Save Query”アラートは、検索実行後に“Options”メニューから設定できます。元の検索式で検索結果
を与えなかったとしてもアラートの設定は可能です。“Keep Me Posted”アラートは検索結果画面でレコ
ードを選択し、“Options”のプルダウンメニューから設定できます。“Controlled Vocabulary”アラートは
“Query Manager/Alert Center”内で設定できます。
Q. アラートを同僚も受信できるように E-Mail アドレスを追加できますか?
Saved Query アラートには、そのアラートを受け取りたい方々の E-Mail アドレスを含めることができま
す。アラートを設定する際に、テキストボックスが表示されます。E-Mail アドレスはここに入力できます。
アラートの修正は Query Manager/Alert Center で行ってください。
Q. いくつの検索式を保存し、アラートを設定できるのでしょうか?
“Query Manager”は、構造式検索に用いた検索式を含めて無制限の数の検索式の保存を行えます。
“Saved Query”は同様にアラートとしても設定でき、その場合には検索式は自動的に実行され、新規
の検索結果が得られた場合には利用者は通知を受け取ります。
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Q. Alert Center は新しい情報が INTEGRITY に収録されたことをどの様にして通知
するのですか?
新規の検索結果が得られた場合、E-Mail にて利用者にお知らせします。“Save Query”と“Keep Me
Posted”の場合、検索式と共に 2 つの“Follow This Link”を含むメッセージを利用者は受信します。この
ハイパーリンクをたどると、利用者は検索結果が表示された INTEGRITY のページに行くことができま
す。この一番目のリンクは利用者を新規レコードのみに導き、二番目のリンクは検索式を再実行して得
られた全ての検索結果を与えます。“Controlled Vocabulary”アラートの場合は、変化のタイプ(例えば、
Mechanism of Action:作用機序)を特定し、どのような統制語が追加されたかを記載した E-Mail が届
きます。
Q. どのくらいの頻度で Alert Center からメッセージが届きますか?
利用者はアラートを毎日、毎週、または毎月の頻度でアラートを設定することができます。アラートに関
係する新規の情報が INTEGRITY に追加された場合のみ利用者に通知が届きます。
カスタマーサポート
Q. テクニカルサポートや内容に関する質問をしたい場合は、トムソン・ロイターにど
のように連絡すればよいでしょうか?
使い方に関するご質問、製品についてのご意見などは、下記までご連絡ください。
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