株式会社京都コンステラ・テクノロジーズ 2015年9月 化合物denovoデザインシステム『CzeekD』 新規化合物デザインや置換基構造の探索に使える! ●フラグメントベースのライブラリー設計 ●最適化アルゴリズムによる化合物空間の効率的探索 ●CGBVSスコアによる化合物評価 ●6つのタンパク質群に対する標準予測モデルを収載 ●ユーザーフレンドリーなGUI操作 ●ASPサービス(WebよりID、passwordでログイン)での提供 1 CzeekD(ASP) 価格(チケット制) ●利用基本契約の締結後にチケットを購入頂きます(価格表参照)。 ●初回チケット購入時にユーザーID、PW(1年間有効)を発行致します。 ●CzeekD計算機能は必要なタイミングで15日単位でご利用頂けます(チケット消費数は下表参照)。 ◆チケット購入価格表 チケット数 金額(税抜) 単価(税抜) 2 90万円 45.0万円 4 170万円 42.5万円 6 240万円 40.0万円 12 450万円 37.5万円 ※追加購入は1チケット・45万円(税抜) から可能です。 ※購入したチケットはユーザーID有効 期間内 (1年間)でご利用ください。 ◆チケット消費例 計算機能の利用期間 消費チケット数 同時実行ジョブ数 ×1 同時実行ジョブ数 ×2 1 15日 - 2 30日 15日 4 60日 30日 ※同時実行ジョブ数とは、 同一ユーザーの計算ジョブ について同時進行で処理 可能な数を表します。 2 CzeekD(ASP)のご利用手順 お客様 弊社 CzeekD利用基本契約の締結 弊社所定の契約書式による(サービス利用規約、秘密情報取扱い等) チケット購入(2チケット~) ID、PW発行(1年間有効) 計算利用申込(随時) 利用期間、同時実行ジョブ数を5営業日前までに連絡 計算機能有効化 確認通知 残チケット数、有効期限等を通知 1年間 計算利用期間 (15日×1 ⇒1チケット消費) 計算利用申込(随時) 利用期間、同時実行ジョブ数を5営業日前までに連絡 計算機能有効化 確認通知 残チケット数、有効期限等を通知 計算利用期間 (15日×1 ⇒1チケット消費) チケット追加購入可能(1チケット~) 利用期間の終了 3 ASPサービス提供に関する情報セキュリティー対策 データの安全性を担保するために多くの対策を実施しています。 ・SSLによるデータ暗号化 ・ファイアウォール設定 ・パスワードによるアクセス制限 ・情報セキュリティ担当者による定期的な監視 など コンステラ内ネットワーク ファイア ウォール SSL通信 ユーザー CzeekDサーバー 計算ノード 4 CzeekDご利用者の声 側鎖変換の指標として利用し、自分が想像で きなかった構造を示してくれるので、そこから の取捨選択ができる。 計算で得られた構造は実際に合成できそう なものが多く含まれており、化合物展開のヒ ント・参考になりそう。 膨大なフラグメントの組み合わせの中から、より 高スコアとなる組み合わせをアルゴリズムが効 率的に探索してくれます。 フラグメントどうしをRECAPの合成反応パターン に基づいて組み立てるので、より現実的なデザ インとして候補化合物が提示されます。 化合物のスコアリング機能を用いることで、 合成予定化合物の優先順位づけができるの が良い。 初期研究ではオフターゲットに関して構造活 性相関がとりにくいので、その場合にCzeekD の判断に従い化合物の合成方針を決めてい くのは効率的手法の一つになる。 CzeekD活用法の一つとして、指定した化合物構 造(最大100個まで)に対して直接CGBVSスコア を計算する機能が利用できます。 ほとんどマニュアルを見ずに直観的に操作で きた。 CzeekDの計算では最大10個までターゲットタン パク質を指定して総合スコアの算出が可能です。 ネガティブターゲットの設定も可能です。 シンプルなGUIで誰でも簡単に操作が可能です。 5
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