生化学Ⅲ 第11回 生化学ⅢSBO-16 転写と翻訳のメカニズム-5 リボソームの構造と機能について説明できる RibosomeStructureandFunction 今回のSBOs リボソームの構造と機能について説明で きる SBO-16課題(予習&復習) リボソームの構造と機能に関連する基本的な用語の意 味について確認し、ノートにまとめること。 SBO-16小テスト-1 リボソームはRNAとタンパク質から構成された粒子で、 mRNAの情報をもとにタンパク質を合成する機能をもつ。 開始因子、伸長因子、ペプチジルトランスフェ ラーゼ、転移、遊離因子、リボソーム再生因子、 Yes ポリリボソーム 復習 リボソームの働き リボソームはmRNAの塩基配列をもとにタンパク 質(ポリペプチド)を合成する装置で、全ての生 物に存在する。 復習 No タンパク質の合成 リボソームはmRNAのコドンを5 読みとる。 →3 方向に ポリペプチド鎖はN末端側からC末端側に向けて 合成される(翻訳)。 翻訳開始コドンのAUGはメチオニン(Met)をコー ドする(開始コドン以外のAUGもMetをコードす る)。 翻訳終止コドンはUAA、UAG、UGAの3種類。 リボソームの働き リボソームはmRNAの塩基配列を5 末端から 3 末端方向に読み取りながら、ペプチド鎖をア ミノ末端側からカルボキシ末端側へ伸長する。 翻訳 (translation) 真正細菌の翻訳に必要な因子 1,mRNA 2,リボソーム 3,アミノアシルtRNA 4,開始因子(IF-1,IF-2,IF-3) 5,伸長因子(EF-Tu,EF-G) 6,遊離因子(RF-1,RF-3,RRF) 7,その他 原核生物の翻訳開始コドンとアミノアシルtRNA 開始コドンにはホルミルメチオニン-tRNAが結合する。 SD 配列 翻訳開始 コドン mRNA 5' 翻訳終止 コドン AUG AUG UAA UAG UGA リボソームの構造 リボソームに存在するtRNA結合部位は、Eサイト、Pサ イト(ペプチジルサイト)、Aサイト(アミノアシルサイ ト)である。 3' fMet Met UAC UAC fMet-tRNAfMet͒ (ホルミルメチオニン-tRNA) メチオニン-tRNA 開始コドン以外のAUG にはMet-tRNAが結合 5 50S サブユニット 3 mRNA A:aminoacyl-tRNA P:peptidyl-tRNA E:exit 原核生物の翻訳開始機構-前段階 IF-3が70Sリボソームを50Sと30Sサブユニットに解離さ せる。 E P A 原核生物の翻訳開始機構-1 30SサブユニットのEサイトにIF-3が、AサイトにIF-1が 結合する。 開始因子 initiationfactor(IF) IF-3 30S サブユニット IF-3 50S サブユニット IF-1 解離 E 30S サブユニット 原核生物の翻訳開始機構-2 GTP結合型IF-2がfMet-tRNAfMetを30SサブユニットのPサ イトに運ぶ。 fMet IF-3 E UAC P 原核生物の翻訳開始機構-3 GTP fMet 16SrRNAの 3 末端 IF-3 mRNA 5' A 30Sサブユニット A mRNAのSD配列(シャイン・ダルガノ配列)と30Sサブユ ニット中のrRNA(16SrRNA)を介して、mRNAとリボソー ムが結合する(30S開始複合体)。 IF-2 IF-1 P 30Sサブユニット SD配列と16SrRNAの結合 IF-1 UAC AUG lll lll lll UAA 3' E SD 配列 GTP IF-2 P A 30S開始複合体 原核生物の翻訳開始機構-4 IF-3が解離し、50Sサブユニットが結合する。 IF-3 50Sサブユニット fMet GTP IF-2 IF-1 UAC AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' E P A 30Sサブユニット 原核生物の翻訳開始機構-5 原核生物の翻訳伸長機構-1 IF-2によるGTPの分解に伴い、IF-2・GDPとIF-1がリボ ソームから遊離し、70S開始複合体が完成する。 EF-Tu2・GTP複合体がアミノアシルtRNAをAサイトに運 ぶ。 GDP 2 IF-2 fMet fMet IF-1 lll UAC AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' E P 3' E 70S開始複合体 原核生物の翻訳伸長機構-2 原核生物の翻訳伸長機構-3 ペプチジルトランスフェラーゼ活性によりペプチド結 合が形成され、ペプチドがPサイトからAサイトに転移 する。 EF-Tu2 UAC lll AUG lll lll lll UAA 3' P A GDP fMet 2 E P 70S複合体 EF-Tu2がGTPを分解してGDP結合型になり、リボソーム から遊離する。 mRNA 5' 伸長因子 (elongationfactor) UAC AUG lll lll lll UAA mRNA 5' A GTP EF-Tu2 UAC lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' A 3' E 70S複合体 P A 70S複合体 原核生物の翻訳伸長機構-4 原核生物の翻訳伸長機構-5 EF-G・GTPが結合する。 EF-GによるGTPのGDPへの分解に伴い、ペプチジルtRNA がAサイトからPサイトに転移する。 GTP EF-G GDP EF-G UAC lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' E P mRNA 5' A UAC lll AUG lll lll lll UAA 3' E 70S複合体 P A 70S複合体 原核生物の翻訳伸長機構-6 原核生物の翻訳終結機構-1 EF-G・GDPがリボソームから遊離し、tRNAがEサイトか ら出ていく。 リボソームがストップコドンに到達する。 fMet -2-3 GDP -4 EF-G mRNA 5' lll AUG lll lll lll UAA 3' E P 70S複合体 A mRNA 5' lll lll AUG lll lll lll UAA 3' E P 70S複合体 A 原核生物の翻訳終結機構-2 原核生物の翻訳終結機構-2 RF-1とGTP結合型RF-3がAサイトに結合する。 ペプチジルトランスフェラーゼ活性(加水分解)により ペプチドが解離する。 遊離因子 (releasefactor) fMet -2-3 - 4 fMet-2-3-4 GTP 加水分解 RF-3 RF-1 RF-1 lll lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' E P GTP RF-3 lll lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' A E 70S複合体 P A 70S複合体 原核生物の翻訳終結機構-3 原核生物の翻訳終結機構-4 RF-3によるGTPの分解に伴って、RF-1とRF-3・GDPがリ ボソームから解離する。 RRFとGTP結合型EF-GがAサイトに結合する。 リボソーム再生因子 (ribosomerecyclingfactor) GDP RF-3 GTP EF-G RF-1 RRF lll lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' E P lll lll AUG lll lll lll UAA mRNA 5' 3' A E 70S複合体 P A 70S複合体 原核生物の翻訳終結機構-5 原核生物の翻訳終結機構-6 EF-GによるGTPの分解に伴いRRFがPサイトに転移し、 tRNAがリボソームから遊離する。 EF-G・GDPがリボソームから遊離し、IF-3がEサイトに 結合する。 GDP EF-G lll lll GDP RRF mRNA 5' EF-G AUG lll lll lll UAA 3' E P A 原核生物の翻訳終結機構-7 50Sサブユニット RRF AUG lll lll lll UAA 3' IF-3 E P 3' P 70S複合体 70Sリボソームが解離し、RRFとmRNAもリボソームから 遊離する。 30Sサブユニット AUG lll lll lll UAA E 70S複合体 mRNA 5' RRF IF-3 mRNA 5' A A
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