分類学上は，（※動物で用いられる主なもの）界動物界門脊索動物門（脊椎動物亜門）綱硬骨魚綱目ダツ目科メダカ科属種メダカ属生物を扱う際のメダカ ※分類は生物学事典による以上に加え，亜-，上- などをつけて細分することがある．「品種」は分類学上の単位ではない（注：植物では採用する場合もある）基本単位主な種の定義（種の概念）類型学的種概念：同一の特徴を持つ個体の集まり (Typological species concept) 形態学的種概念：形態的特徴を共有する個体の集まり (Morphological species concept: ) 生物学的種概念：生殖可能で，他から隔離される個体の集まり (Biological species concept: Dobzhansky 1935, Mayr 1942) 進化学的概念：進化の歴史を共有する個体の集まり (Evolutionary species concept: Wiley 1978) 系統学的種概念：系統を共有する個体の集まり (Phylogenetic species concept:Cracraft 1989) 生態学的種概念：生態的特徴を共有する個体の集まり (Ecological species concept: Van Valen 1976) 種の認知概念：互いに認知可能な個体の集まり (Recognition species concept: Paterson 1985) 種の結合概念：上記複数の基準を包括する個体の集まり (Cohesion species concept: Templeton 1989) ※詳細は原著等を参照のこと『類型学的種概念』とは？異型変わった特徴違う特徴種A 同じ特徴種B 同じ特徴同じ特徴＝一つの種（変わった特徴は異型）違う特徴＝別々の種『形態学的種概念』とは？種A 違う形態似た形態種B 似た形態変異を含む似た形態を共有＝一つの種違う形態＝別々の種『生物学的種概念』とは？生殖を妨げる障壁種A 繁殖可能生殖的隔離繁殖不可能種B 繁殖可能親子繁殖可能＝一つの種＝生殖的隔離なし繁殖不可能＝別々の種＝生殖的隔離あり系統学的種概念に基づいた種の評価 ≒単系統性を示すグループが1つの種集団１集団２ここ？集団３集団４どこまでを単系統とする？集団５集団６ここ？集団７集団８集団９集団１０集団１１集団１２集団１３集団１４集団１５集団１６集団１７集団１８ 1.2 0.9 0.6 0.3 0.0 遺伝的距離（※遺伝的に似たものほど値が小さい）基準は必ずしも存在しない例えば，種の基準は？生殖的隔離の存否（生物学的種概念）猿払川（北海道） ●集団１これは，ヤツメウナギの系統樹でした！最上川（山形） ●集団２ナルバ川（沿海州） ●集団３カワヤツメキヤ川（アムール） ●集団４猿払川（北海道） ▲集団５ビエラヤ川（沿海州） ▲集団６茶志骨川（北海道） ▲集団７アリチー川（アムール） ▲集団８シベリアヤツメオノン川（アムール） ▲集団９インゴダ川（アムール） ▲集団１０石狩川（北海道） ■集団１１信濃川（新潟） ■集団１２庄川（富山） ■集団１３茶路川（北海道） ■集団１４雄物川（秋田） ■集団１５最上川（山形） ■集団１６庄川（富山） ■集団１７洛東江（韓国） ■集団１８ 1.2 0.9 0.6 0.3 0.0 遺伝的距離（※遺伝的に似たものほど値が小さい）スナヤツメ北方種スナヤツメ南方種それぞれの種間の同所的な生息地で生殖的隔離が存在生殖的隔離機構【Futuyma(1998)を改変】交配前（配偶子接合前）隔離機構《雑種は生まれない》・時間（季節）的隔離：産卵時期の違い・空間的隔離：産卵場所の違い・行動学的隔離：行動や認知機構の違い（鳴き声，フェロモン，視覚など）・機械的隔離：交尾器の構造の違い・配偶子隔離：メス体内と精子の不適合交配後（配偶子接合後）隔離機構《雑種は生まれる》・雑種の死亡：受精後すぐに死亡・雑種の生存性の低下：受精後しばらくして死亡・雑種の妊性の低下：不妊・雑種崩壊：雑種第二代以降における妊性や生存性の低下生物学的種概念に基づいた種の評価生殖的隔離種A 繁殖可能繁殖不可能種B 繁殖可能親子種を特徴づけるアリル生殖的隔離なし＝一つの種＝同じ遺伝的特徴を持つ生殖的隔離あり＝別々の種＝異なる遺伝的特徴を持つカワヤツメとシベリアヤツメの例（北海道猿払川から採集） ※カワヤツメとシベリアヤツメは予め形態的特徴で区別遺伝子座カワヤツメ（68個体） MDH-3* AA 68 MEP-2* Yamazaki & Goto (1998)を改変シベリアヤツメ（47個体） BB 47 CC : CD : DD 3 : 10 : 55 EE : EF : FF 1 : 11 : 35 アリルを共有しない生殖的隔離の存在別々の種スナヤツメに存在した遺伝的に異なる２グループ（３河川における遺伝子型頻度の比較） Yamazaki & Goto (1996)を改変 ※形態的特徴から全個体がスナヤツメと識別された遺伝子座大野川（北海道）（41個体）庄川（富山）（86個体）角川（富山）（39個体） MDH-3* AA 41 AA : BB 52 : 34 BB 39 PGM-2* CC : CD : DD 21 : 16 : 4 CC : CD : DD : EE : EF 14 : 26 : 11 : 33 : 1 スナヤツメA 《北方種》 EE : EF : FF 31 : 7 : 1 スナヤツメB 《南方種》同所的な生息地においても両者間には遺伝的交流がない → 生殖的隔離の存在 → それぞれが独立した種に相当空中移動が可能な動物の場合島島交流○ 全体で１つの集団を形成島海陸上生活する動物の場合島島交流× それぞれの島の個体が１つの集団を形成島海地点間で希な移動をする動物の場合局所集団島島希な移動・繁殖全体で１つのメタ集団を形成海島温暖な時代寒冷な時代 1本の連結した川海岸線 2本の独立した川平面図海岸線断面図海水面海水面の低下海水面海水面の上昇集団の二次的接触過去 1つの集団障壁 2つの集団それぞれ遺伝的分化現在 2つの集団の二次的接触