26 P ROTEI N S C I ENC E and don’t forget ロボティクスとプロテオミクス：バイオマーカーを発見するための前途有望なパートナーシップ Robotics and フランスの研究者らは、ハイスループットのプロテオミクスを実現するため、Tecan のシステムを利用して患者サンプルからバイオマーカーを発見するためのサンプル調製プロトコルを自動化した。 Te-Stack を搭載した Freedom EVO 100 MultiChannel Arm によるピペッティング Tecan Journal 3/2008 新しい疾患バイオマーカーの探索が現在 Ducoroy 博士は品質管理の重要性を強く進められている。それにより最終的にはさま信じており、着実な再現性が得られるようなざまな癌、糖尿病、あらゆる代謝疾患を含む標準化された手順を達成するには、数多くの疾患に対して、これまでより個々の Freedom EVOプラットフォームが不可欠患者に応じた個人的な治療アプローチがであると考えている。Freedom EVO 200 可能になる。Patrick Ducoroy 博士はは試験管からサンプルを吸引する8チップ Clinical Innovation Proteomic Platのリキッドハンドリングアームを備えている。 form（CLIPP、フランスのディジョンとブザ臨床試験では、タイプの異なる様々な試験ンソンを本拠地とする）のマネージャーであ管が Freedom EVO 200に持ち込まれ、り、同社の保健部門はディジョンのこれをFreedom EVO 100 の MultiHospital and Cancer Centerを拠点とし Channel ArmTM96で処理できるように 96ウェルマイクロプレートに分注される。タている。Ducoroy 博士のような研究者にンパク質とペプチドの精製はTecanのとって、サンプル数の多さとスループットの Freedom EVO 100で行われ、さらに下高さは優れた結果を得るうえで不可欠な要素である。Ducoroy 博士はこう説明した。流の解析も可能となっている。Ducoroy 博士はこう付け加えた。「Freedom EVO 「有用で確かなバイオマーカーを見つける 200とFreedom EVO 100はどちらも為の研究には、こうしたことが極めて重要で 37℃のインキュベーターを備えていますのす。また、手順やサンプルの処理を標準化で、精製後すぐにタンパク質の分解が行わすることも非常に大切なことですし、このよれ、ペプチドが回収されます。」うな探索の初期段階においては厳密な品質管理を必ず行う必要があります。自動化は、まさにこれら全ての目的を達成するため「この Tecanシステムの主な利点は、患者 96 例分の処理を併行して1 時間で行うこの必須条件です。」とができる能力です。処理には、サンプルの試験管を1つ目のワークテーブルに置く最このため、Ducoroy 博士の研究室では用初のステップから、血漿の分離、ペプチドの途の広いFreedom EVO リキッドハンドリ精製、そしてペプチドを標的のマトリックスングプラットフォームを2 台使用して、患者上に置いて質量分析ができるようにするまの血液から精製したタンパク質サンプルをでのステップが含まれます。このように迅速展開し、長期間の保管や、質量分析によるに処理を行うことにより、優れた再現性を達さらに下流の解析に利用している。「われわ成することができます。この器械の再現性れの Tecanのロボットは2 台が一体化されについて時間をかけて分析した結果、とてており、両者は完全な互換性を持っていまも良好な結果が得られました。1 週間のうちす。オペレーションには同じソフトウェアが使に非常に多くの患者のサンプルの処理が用されていますので、サンプル調製時のピできることは極めて重要なことです。われわペッティングの手順が最大限に自動化およれは最終的には1,000 例を目指していまび標準化されています。」とDucoroy 博士すが、Tecanの技術はこの目標を達成するは述べた。うえで最も重要です。」 to receive future copies of the Tecan Journal you’ll need to re-register your details at: PROTEI N SC I E NC E www.tecan.com/get-journal proteomics もうひとつ重要なことは、患者サンプルの間で交差汚染が生じるのを最小限に抑えることである。Freedom EVOの場合、使い捨てのチップに切り替えることで、この懸念は解決される。サンプルごとにチップを取り替えることが、交差汚染を防止する鍵になる。また、T e c a n の P o s I DTM（ P o s i t i v e Identiﬁcation System）を使用することにより元の試験管と分注先のプレートが全てバーコードで特定される。同社のチームは、分離されたタンパク質の解析や同定を行う場合や、臨床試験でプロファイリングの比較により新たなバイオマーカーを探索する場合にMatrix Assisted Laser Desorption Ionization（MALDI）質量分析法を使用している。この方法では、イオン化されたタンパク質サンプルが解析チャンバー（真空または飛行管）を通して加速され、その質量電荷比に応じた分子に分離する。時間飛行（TOF）分析装置により飛行管内で検出器に到達するまでにかかる時間に基づいてペプチドの質量が決定される。その後、得られたデータを各種の統計ツールにより、処理および解析する。興味深いことに、同チームはインフォマティクス・ソフトウェア・ソリューションを得るために現在 Tecanと共同で開発を行っており、うまくいけば、これによりFreedom EVOのソフトウェアと質量分析計のソフトウェアとの間で優れた工程管理が可能になる。これは科学器械であり、ヒトの臨床診断または in vitro 診断にはご利用いただけません。 Clinical Innovation Proteomic Platform (CLIPP、フランス、ディジョン）の研究チームこのプロジェクトを成功させるにはTecanの技術者によるサポートが不可欠である。 Ducoroy 博士はこう付け加えた。「Tecan のサポートは非常に素晴らしく、特に自動化ワークステーションに関してさまざまなパラメーターを変更する場合にサポートしていただいています。われわれが必要とするスループットやこのような優れた結果の再現性が達成できたのはそのおかげだと私は確信しています。」 TecanのProtein Scienceソリューションの詳細については www.tecan.com/proteinscienceのサイトをご覧ください。 ■この記事は2008年9月発行　Tecan Journal 3/2008 に掲載されているユーザーストーリーを抜粋、翻訳したものです。ご質問、ご要望は下記までお願いします。「Tecan の技術はこの目標を達成するうえで最も重要です。」キャリアーやラボウェアを搭載ワークテーブル Te-VacS TM バキュームセパレーションモジュールの組み込み Tecan Journal 3/2008 27