特集学生の研究活動報告−国内学会大会・国際会議参加記 19 “第 6 回広島−明治−龍谷合同合宿 ∼ウサギと過ごす 1 泊 2 日∼” 及び，広島明治単位互換プログラム “プロテオミクス実験法，演習” に参加して中出賀乃われた．そこで私は自分の専門とは異なる研究分野の方々と様々な意見を交換・議論をした．この合宿を通じて自身の研究を新たな目線から考えることができた．大変有意義な時間を過ごせたと感じている． 3．講義“プロテオミクス実験法，演習” Kano NAKADE 数理情報学専攻修士過程 8 日から 30 日は広島大学で行われた広島大学明 1年治大学単位互換プログラム“プロテオミクス実験 1．はじめに法，同演習”を受講した．単位互換プログラムは．私は，2013 年 8 月 26 日から 27 日まで広島大学龍谷大学が広島大学，明治大学と大学間交流に関すと明治大学と合同で行われた“第 6 回広島−明治− る包括的協定を結んでいるため，理工学研究科の学龍谷合同合宿∼ウサギと過ごす 1 泊 2 日∼” 及び，28 生は他大学院の科目を受講することができるという日から 30 日にかけて広島大学明治大学単位互換プものである．この制度により講義を受講することがログラム“プロテオミクス実験法，同演習”に参加できた．今回の講義を担当してくださった泉俊輔先生にした．は，合宿から帰ってきた 27 日にお会いし，翌日か 2．研究合宿ら共に講義を受ける 3 大学のメンバーと交流を兼ね 8 月 26 日から 27 日は広島県大久野島で研究合宿た講義の打ち合わせに参加した．実験は少人数の班に参加した．この合宿の目的は，数理分子生命理学で行われた．生物・化学の分野にほぼ無知な我々のの交流であり，数学・生物・化学という縦割りに分ために，班員構成に専攻の偏りがないように配慮さ割された専門の枠を超えて交流することにある．昨れていた．今，生命現象を数理モデルで再現することが多く行 3. 1 3 分時計の作成われているが，実際のところ学生個人が専門の枠を初日はうがい薬・ビタミン C 入り清涼飲料・オ超えて考えるということは難しい現状がある．そこキシドール・デンプンのりを使って 3 分時計を作成で普段のセミナーとはまた違ったこの合宿でともにした．手順としてはじめにうがい薬のヨウ素・デン衣食住を共有することで異分野の学生同士が意見交プン・水を適量入れ，ヨウ素でんぷん反応で青紫色換できるように交流することが目的である．に変色することを確認した．次にビタミン C を入合宿先の大久野島はたくさんの野ウサギがいるこれる．そこで還元により溶液の色が消えた．最後にとで知られている．一歩，宿泊施設から足を出すだオキシドールを加えて時間を計った．少し時間が経けで多くの野ウサギがえさを求めてよってきて，合過すると，再び酸化されることにより青紫色に変化宿のつかの間の癒しとなった．また，第二次世界大した．この時間を先生に設定された 3 分にする為に戦時には日本軍の毒ガス工場があった場所で，建物溶液の量を何度も調整した．私の班は練習で与えらの一部が保存されていたり資料館があり当時の様子れた時間，ほぼ 3 分まで調整することができた．しをうかがうことができる．そこで化学兵器の恐ろしかし，本番では 30 秒程度で反応してしまい，残念さを実感した．な結果となった．練習と本番では各溶液の量は同じ合宿は 3 大学の先生方・院生による研究発表やポであったのに失敗してしまったことから，数学と比スター発表など分野・年齢の枠を超えた交流会が行べて同じ数値でも異なった結果が出ることに化学実 ― ５１ ― した．験の難しさを痛感した．この実験の目的はピペットマンなど，使用したこ（5）消化とのない実験器具を使うことに慣れ，翌日の実験にマイクロチューブを氷と共に放置してゲルを冷却支障が出ないようにするためであった．広島大学のさせた．25 mM の NH4HCO3 12.5 ng/ μ L のトリプシ院生の方や先生に一から教えていただいたおかげでン（酵素溶液）をゲルが膨張する 5∼10 μ L 加え翌日からスムーズに器具を扱うことができた．た．10 分間氷上で放置し，ゲルが初期の状態まで 3. 2 タンパク質の質量分析 3. 2. 1 膨張したか確認した．膨張が不十分な場合には蒸留実験手順水を加えた．最後にインキュベートを行い，2 日目（1）ゲルの洗浄の作業は終了した．マイクロチューブに紫色に着色されゲルに覆われ（6）抽出たタンパク質が用意されていた．その中に 50％の最終日は朝から先生，班員と共に広島大学霞キャアセトニトリル 100 μ L を加え，5 分間よく攪拌しンパスの医学部に移動し，実験を行った．抽出の為た後に溶媒を取り除いた．これにより紫色に着色さに 0.1％の TFA, 75％のアセトニトリル 20 μ L を加れたタンパク質の色素を取り除くことができる．色え，5 分間攪拌した後，また 5 分間静置した．マイ素が完全に抜けるまで数回この作業を繰り返し行っクロチューブから 0.5 μ L 採取し，質量分析を行った．た．板上に採取したものを乗せ，分析装置に読み込（2）脱水によるゲルの縮小ませた．数分後板上の画像をパソコン内に取り込むゲルが入ったマイクロチューブに 100％のアセトことができ，画像から正しく成分が現れている箇所ニトリル 100 μ L を加え，攪拌した後 5 分間静置を数個程度選び保存した．コンピュータがこの数個し，溶媒を取り除いた．この後ゲルをデシゲータにの成分分析データからタンパク質の質量分析を行っ入れ真空ポンプで減圧乾燥した．乾燥させることでた．ゲルが収縮され，タンパク質が糸のようになってい 3. 2. 2 実験結果，考察出力された結果の質量が最も多かった 4 箇所からる先端を見つけ出すことができた．実験していたタンパク質はウサギの筋肉の一部から（3）還元，アルキル化マイクロチューブに 10 mM の DTT in 25 mM の採取されたものであることが分かった． NH4HCO3 10 μ L を加え，ヒートブロックを用いて 60 長い時間をかけ，多くのの試薬を使い，同じ行程分間 56℃ でインキュベートした．その後室温に戻を何度も繰り返してはじめて，一つのの物質を見つし，溶媒を取り除いた．そして 55 mM の ICH2CONH2 けるということはとても達成感があった．普段の研 in 25 mM の NH4CO3 100 μ L を加え 30 間室温で攪究は一人で作業することがほとんどなので，班員た拌し，溶媒を取り除いた．次に前述の DTT と ICH2 ちと協力しながら行う実験はとても新鮮だった．ま CONH2 を取り除く作業を行った．25 mM の NH4CO3 た，実験を通して，自分の専攻している分野が他の 100 μ L を加え溶媒を取り除く作業を 2 回ほど繰り分野でどのように活かされているかを知ることがで返した．き，今後の研究の意欲を湧かせてくれた．今回，この講義でお世話になった広島大学の泉先（4）乾燥によるゲルの縮小再び，乾燥によるゲルの収縮を行った．先ほどと生をはじめとする先生方・事務の方・ともに学んだ同様に 100％のアセトニトリル 100 μ L を加え，攪仲間たちにこの場を借りて深く御礼申し上げます．拌した後 5 分間静置し，溶媒を取り除いた．そのまた，今回の合宿から講義に至るまでサポートして後，ゲルをデシゲータに入れ真空ポンプで減圧乾燥くれた本専攻の先生方にも深く御礼申し上げます． ― ５２ ―