Basıldığında KONTROLSUZ KOPYA niteliğindedir. ULUSAL MİKROBİYOLOJİ STANDARTLARI (UMS) Koagülaz Testi Hazırlayan Birim Klinik Bakteriyoloji Tanı Standartları Çalışma Grubu Onaylayan Birim Türkiye Halk Sağlığı Kurumu Kategori Bakteriyoloji Bölüm Test Prosedürleri Standart No B-TP-12 Sürüm No 1.1 Onay tarihi 01.01.2015 Geçerlilik tarihi 01.01.2018 Sürüm no Tarih Değişiklik Koagülaz testi İÇİNDEKİLER KAPSAM VE AMAÇ............................................................. 3 KISALTMALAR VE TANIMLAR .............................................. 3 GENEL BİLGİ ................................................................... 3 TEKNİK BİLGİLER ............................................................. 3 1 2 3 4 Test için asgari laboratuvar koşulları ................................ 3 Testin uygulanması ....................................................... 5 Sonuçların değerlendirilmesi/yorumlanması ...................... 6 Olası sorunlar/kısıtlılıklar ................................................ 6 KAYNAKLAR ..................................................................... 8 Sayfa 2 / 8 Ulusal Mikrobiyoloji Standartları 01.01.2015 /Sürüm: 1.1 / B-TP-12 / Test Prosedürleri / Bakteriyoloji Koagülaz testi Kapsam ve Amaç Stafilokok türlerinin en patojeni olan Staphylococcus aureus diğerlerinden koagülaz üretimi ile ayrılır. Bu UMS‟de koagülaz testinin dayandığı prensipler ile kullanım ve yorumlanmasına dair bir rehber sunulması hedeflenmiştir Kısaltmalar ve Tanımlar EDTA etilen diamin tetra-asetik asit PYR L-pirolidonil--naftilamid Genel Bilgi Koagülaz, fibrinojeni fibrin oluşturmak üzere aktive ederek pıhtı gelişimine neden olan termostabil trombin-benzeri bir maddedir ve üretimi bir test tüpünde stafilokok inoküle edilmiş plazmanın pıhtılaşması ile gösterilebilir. Bu madde hücre tarafından ortama salındığı için “serbest koagülaz” olarak da bilinmektedir (1,2). S. aureus‟un hücre duvarında ayrıca “bağlı koagülaz” veya “kümelenme (clumping) faktörü” olarak adlandırılan bir fibrinojen bağlayıcı yüzey reseptörü de bulunur. Bu faktörü taşıyan organizmalar doğrudan plazmanın fibrinojeni ile etkileşerek küme oluşturabildiğinden, lam testi ile gözlenebilir (1). Özetle; bağlı koagülaz lam testinde bakterinin aglütinasyonu şeklinde, serbest koagülaz ise tüp testinde pıhtı oluşumu şeklinde tespit edilebilir. Klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında en yaygın tercih edilen koagülaz testi lam testidir. Uygulanması kolay olmakla birlikte, bu faktör S.aureus‟un bazı kökenlerinde olmayabileceğinden lam testi ile negatif sonuç elde edilebilir. Bazen de kümelenme faktörü kapsül polisakkaritleri tarafından maskelenebilmektedir. Bu nedenlerle lam testinin negatif sonuç vermesi halinde doğrulama için tüp testine başvurulması gerekir. Yine de, laboratuvarlar için algoritması oldukça basit olduğundan, S. aureus tanısında koagülaz testleri hızlı bir şekilde ve yüksek bir doğruluk derecesi ile kullanılmaktadır (1). Teknik Bilgiler 1 Test için asgari laboratuvar koşulları 1.1. Laboratuvar güvenliği Bu UMS‟de bahsi geçen organizmalar ile ilgili işlemler asgari BGD2 laboratuvar şartlarında gerçekleştirilmelidir. Bütün kültürler enfeksiyöz kabul edilmeli ve daima standart önlemler uygulanmalı, önlemler risk değerlendirmesi ile de desteklenmelidir. Aerosol oluşturması muhtemel tüm laboratuvar çalışmaları bir biyolojik güvenlik kabininde gerçekleştirilmelidir (ayrıca bkz. “Ulusal Laboratuvar Güvenliği Rehberi”). Ulusal Mikrobiyoloji Standartları Bakteriyoloji / Test Prosedürleri / B-TP-12 / Sürüm: 1.1 / 01.01.2015 Sayfa 3 / 8 Koagülaz testi 1.2. Sorumluluklar ve asgari personel gerekleri Bu UMS‟yi kullanacak laboratuvar personeli; (i) testten önce, amaçlanan kullanım ile ilgili eğitim almış olmalı; (ii) uygulamaya tüm yönleriyle aşina olmalı, ve; (iii) daima tüm laboratuvar güvenlik kurallarına uymalıdır. 1.3. Örnek, Reaktif, Donanım Test mikroorganizmaları S. aureus olabileceği düşünülen bakteri izolatı - plak besiyerinde tek düşmüş koloni halinde ÖNEMLİ: Yanlış tanımlamayı önlemek için, koagülaz testi sadece katalaz pozitif, gram pozitif kok kümeleri şeklinde ön tanımlaması yapılmış olan klasik görünümlü beyaz-sarı, opak, hemolitik kolonilere uygulanmalıdır. Hemolizin taze (18 saatlik) kültürlerde gözlenebileceği hatırlanmalıdır (1). Reaktif Tavşan plazması, EDTA‟lı – ticari olarak temin edilir. Liyofilize veya donmuş preparat şeklinde olabilir; üretici firmanın önerisi doğrultusunda sulandırılmalı ve saklanmalıdır. NOT: Tüp testi için, vida kapaklı küçük tüplere plazmanın 0.5 mL alikotlar halinde ayrılması ve saklanması önerilir. ÖNEMLİ: Koagülaz testi için insan plazması kullanılmaz! Duyarlılığı düşüktür. Ayrıca HIV ve diğer patojen virüslerin bulaşması potansiyeli taşır. %5‟lik kalsiyum klorür (CaCl2) çözeltisi – isteğe bağlı Diğer gereç, donanım Lam veya siyah aglütinasyon kartı (serolojik testler için olan tipte) Test tüpleri – vida kapaklı, steril, küçük (ör., 1275mm) Öze – halka ya da iğne tipi; tek kullanımlık veya nikrom Damlalık veya tek kullanımlık Pastör pipeti Kesici delici atık kabı, enfeksiyöz atık kabı, eldiven 1.4. Kalite kontrol Her yeni açılan plazma lotu mutlaka kalite kontrol suşları ile test edilmelidir! Derin dondurucu ya da buzdolabında saklanmamış veya bulanık görünümlü plazma kesinlikle testte kullanılmaz! Kalite kontrol organizmaları (1): S. aureus ATCC 25923 – koagülaz pozitif (pozitif kontrol) S. epidermidis ATCC 12228 veya 14990 – koagülaz negatif (negatif kontrol) Sayfa 4 / 8 Ulusal Mikrobiyoloji Standartları 01.01.2015 /Sürüm: 1.1 / B-TP-12 / Test Prosedürleri / Bakteriyoloji Koagülaz testi 2 Testin uygulanması 2.1. Lam koagülaz testi Bir lam üzerine küçük bir damla (10-15 µL) distile su konur. Bir öze ile test edilecek koloniden alınır; lamın üzerindeki su ile homojen, koyu, süt-benzeri bir süspansiyon elde edecek şekilde karıştırılır. NOT: Yeterince koyu bir süspansiyon elde edilemez ise yanlış-negatif sonuç alma olasılığı vardır. Süspansiyon „otoaglütinasyon‟ olup olmadığı bakımından incelenir. NOT: Eğer suda süspansiyon oluşturulamıyor, kümelenmeler meydana geliyor ise, lam testi gerçekleştirilemez. Organizmanın kendiliğinden kümelenme (otoaglütinasyon) eğiliminde olduğundan bahsedilir. Bu durumda serbest koagülazı göstermek amacıyla tüp testi yapılmalıdır! 10-15 µL plazma eklenir, nazikçe karıştırılır. Hemen 10 saniye içinde gözle görülür bir kümelenme olup olmadığı incelenir. Test sonrası lam bir kesici-delici atık kabına, kart kullanıldıysa enfeksiyöz-atık kabına atılır. 2.2. Tüp koagülaz testi 0.5 mL plazma içeren tüp oda ısısına getirilir. İncelenecek stafilokok kolonisi öze ile alınır; plazma içinde homojenize edilir. NOT: Kan kültüründe üreme bulgusu ve mikroskopide gram pozitif küme yapmış kokların görülmesi halinde S.aureus‟un hızlı tanısı için plazma içeren tüpe 2 damla kan kültürü de inoküle edilebilir (1). Tüp 35-37°C‟de saat başı incelenerek 4 saate kadar inkübe edilir. Tüp içinde gevşek bir fibrin ağı oluşumu ya da tam bir pıhtılaşma olup olmadığı gözlenir. İnceleme yaparken tüp çalkalanmamalıdır! Pıhtı oluşumunu anlamak için tüp hafifçe eğilip sallanabilir. Eğer plazmada bir değişiklik yoksa gecikmiş koagülaz aktivitesi olasılığı için 22-25°C‟de 24 saat inkübasyonun ardından tekrar değerlendirme yapılır (3). ÖNEMLİ: S.aureus‟un fibrinolizinleri oluşan pıhtıyı eritebileceğinden dolayı, test tüpü 35°C‟de 4 saatten daha uzun tutulmamalıdır. Eğer mesai sonu vb. nedenlerle 4 saat uygun değilse, 22-25°C‟de 24 saat inkübasyon önerilir ki bu aynı zamanda sonuç almak bakımından daha duyarlı bir yöntem olarak kabul edilmektedir (4). Alternatif olarak; tüp 35°C‟de 24 saat inkübe edilir ve 1-2 damla %5 CaCl2ilave edilir. Eğer pıhtı oluşursa izolat “koagülaz negatif”tir; eğer pıhtı gözlenmez ise fibrinolizinin oluşmuş pıhtıyı erittiği kabul edilir ki bu sonuç izolatın “koagülaz pozitif” olduğunu doğrular (1). Ulusal Mikrobiyoloji Standartları Bakteriyoloji / Test Prosedürleri / B-TP-12 / Sürüm: 1.1 / 01.01.2015 Sayfa 5 / 8 Koagülaz testi 3 Sonuçların değerlendirilmesi/yorumlanması 3.1. Lam koagülaz testi Pozitif test – Plazma ilavesi ile 10 sn içinde aglütinasyon gözlenmesi Negatif test – 10 sn.de gözle görülür bir aglütinasyon olmaması 3.2. Tüp koagülaz testi Pozitif test – Aşağıdakilerden biri ile uyumlu sonuç: (a) Tüp içinde 24 saatten önce tam veya kısmi pıhtı oluşumu (b) 35°C‟de 24 saat inkübasyon sonunda tüpe 1-2 damla %5 CaCl2 ilave edildiğinde pıhtı oluşmaması Negatif test – Aşağıdakilerden biri ile uyumlu sonuç: (a) Tüp içinde 24 saatte 22-25°C‟de pıhtı oluşmaması (b) 35°C‟de 24 saat inkübasyon sonunda tüpe 1-2 damla %5 CaCl2 ilave edildiğinde pıhtı oluşması 3.3. Sonuçların raporlanması Koagülaz testi stafilokok tanımlamasında bazı durumlarda karar verdirici bir testtir. Buna göre elde edilen sonuçlar aşağıdaki şartlarda raporlanabilir: Katalaz pozitif, gram pozitif kok kümeleri izlenen organizma için eğer tüp testi pozitif ise izolat “Staphylococcus aureus” olarak rapor edilir. Mikroskopik olarak gram pozitif kok kümeleri izlenmiş kan kültüründen yapılan tüp koagülaz testi pozitif ise rapor -koloni elde edilip katalaz testi yapılıncaya kadar geçici olarak- “olası Staphylococcus aureus; doğrulama için inceleme devam ediyor” şeklinde düzenlenir. Krem-beyaz tipik koloni görünümü ile birlikte katalaz pozitif, gram pozitif kok kümeleri izlenen organizma için eğer tüp testi negatif ise izolat “koagülaz negatif stafilokok” olarak rapor edilir. Pozitif lam testi S. aureus olarak rapor edilir. Bununla birlikte test sonucu, (S.aureus„u S. lugdunensis ve S. schleiferi’den ayırt etmek gerektiğinden dolayı), kan gibi steril vücut bölgelerinden izole edilmiş hafif hemolitik veya hemolitik olmayan koloniler için tüp koagülaz testi ile de doğrulanmalıdır. Negatif lam testi kesin negatif sonuç rapor edilebilmesi için geçerli/yeterli değildir. Tüp testi ile doğrulanmalıdır! 4 Olası sorunlar/kısıtlılıklar Lam koagülaz testinde otoaglütinasyon olabilir. Aşırı karıştırma kümelenmenin çözülmesine neden olabilir. Sayfa 6 / 8 Ulusal Mikrobiyoloji Standartları 01.01.2015 /Sürüm: 1.1 / B-TP-12 / Test Prosedürleri / Bakteriyoloji Koagülaz testi Koagülaz testleri „mannitol salt agar‟da üremiş kolonilerden yapılmamalıdır. Sitratlı plazma sitratı kullanan organizmalar tarafından pıhtılaştırılabilir (yanlış pozitiflik). Bu nedenle EDTA, okzalat veya heparin içeren plazma kullanılmalıdır. Tüp testinde 35°C‟de inkübasyon süresinin uzamasının pıhtının çözülmesine neden olabileceği hatırlanmalıdır. Metisilin-rezistan S.aureus (MRSA) kökenlerinde bağlı koagülaz olmayabilir ve lam testi negatif çıkabilir (5). Bazı MRSA‟lar da zayıf pozitif olabilir. Lateks kitleri aynı zamanda Protein A‟yı da saptayabildiği için böyle suşların tanımlanmasında koagülaz testinden daha duyarlıdır. S. lugdunensis ve S. schleiferi lam koagülaz pozitiftir (özellikle insan plazması ile). Bunlar S. aureus‟tan güçlü PYR pozitifliği ve S. intermedius‟dan tüp koagülaz testlerinin negatif olması ile ayırt edilirler (Tablo 1) (1). Tüp testinde S. intermedius ve S. hyicus pozitif olabilir. Bunlar (sırasıyla) köpek ve domuz izolatlarıdır ancak nadiren insanda enfeksiyona yol açtıklarında S.aureus kadar ciddi hastalığa neden olabilirler. Ayırıcı tanı için bkz Tablo 1 (1). Tablo 1. Önemli ve/veya yaygın görülen, büyük beyaz-sarı koloniler oluşturabilen, katalaz pozitif, gram pozitif kokların temel biyokimyasal reaksiyonları* (1 no.lu kaynaktan uyarlanmıştır) Lam koag Tüp koag Basit Poli B (0.04U) (300U) VP+ V + R R - VP- V + R S + S. delphini (yunus) # VP- - + R NA NA S. hyicus (domuz) # VP- - V R R - S. lugdunensis Ornithin + V - R R + S. schleiferi Ornithin - + -+ R S + S. saprophyticus İdrar; novo R; nonhemolitik - - R S - S. epidermidis Nonhemolitik - - R R - S. haemolyticus Üreaz -, VP+, DNase - - - R S + S. caprae Üreaz +, DNase +, - - R S + Tür Bazı tipik özellikler S. aureus ssp aureus S. intermedius (köpek)# PYR$ Diğer koagülaz negatif Nonhemolitik veya gecikmiş R S V stafilokoklar hemoliz; novo V; üreaz V * +, izolatların %90‟dan fazlası 48 saat içinde pozitif; -, izolatların %90‟dan fazlası negatif; V, değişken (variable) ya da %10-90 arasında pozitif; -+, çoğu negatif ama nadiren pozitif izolatlar olabilir; koag, koagülaz; Basit, basitrasin; Poli, polimiksin B; PYR, L-pirolidonil-ß-naftilamid; VP, Voges-Proskauer; Novo, novobiyosin; NA, uygulanamaz ya da mevcut değil; R, rezistan; S, sensitif (duyarlı). $ # PYR verisi sıvı test içindir (disk test ile S. aureus standart suşlarının zayıf reaksiyon verdiği gözlemlendiği ve S. intermedius‟dan ayrımının mümkün olamayabileceği nedeniyle) klinik örneklerden nadiren izole edilebilirler. Ulusal Mikrobiyoloji Standartları Bakteriyoloji / Test Prosedürleri / B-TP-12 / Sürüm: 1.1 / 01.01.2015 Sayfa 7 / 8 Koagülaz testi Kaynaklar 1 York MK, Traylor MM, Hardy J, Henry M. Biochemical tests for the identification of aerobic bacteria. Coagulase test - rabbit plasma method. In: Garcia LS (ed in chief). Clinical Microbiology Procedures Handbook. 2nd ed. update, ASM Press, Washington D.C. 2007, p. 3.17.14.1 3.17.14.3 2 MacFaddin JF, ed. Biochemical tests for identification of medical bacteria. 3rd ed., Lippincott Williams and Wilkins, Philadelphia. 2000, p. 105–119. 3 Cowan ST. The classification of staphylococci by precipitation and biological reactions. J Pathol Bacteriol1938;46:31–45. 4 Baker JS, Bormann MA, Boudreau DH. Evaluation of various rapid agglutination methods for the identification of Staphylococcus aureus. J Clin Microbiol 1985;21:726–729 5 Lally R, Woolfrey B. Clumping factor defective MRSA. Eur J Clin Microbiol 1984;3:151–152 Sayfa 8 / 8 Ulusal Mikrobiyoloji Standartları 01.01.2015 /Sürüm: 1.1 / B-TP-12 / Test Prosedürleri / Bakteriyoloji
© Copyright 2024 Paperzz