Illumina社NGS platforms用ライブラリー調整キット より高感度でより多くのライブラリーを構築! ThruPLEX DNA-seqは拡張された多様な性能、より低いduplication率、 なおさらに優れたdiversityをともなったDNAライブラリーを作成するために、革新的なThruPLEX chemistryを利用して おります。 キットは、予め分注されバーコード化されたマイクロプレートか、チューブのどちらかで、最大96のdual、ま たは、single readの、Illumina社と互換性があるindexesで利用できます。 少ないinput量から始めて、ThruPLEX DNA-seqはGCバイアスを最小限に抑え、molecular complexityを改善し、再現性のあるシークエンシング 結果をもたらします。 ThruPLEX DNA-seqは、どんなDNA-seq アプリケーション(ChIP-seqならびにRNAseqアプ リケーションを含む)ででもご利用いただけます。そして、すべての主要なプラットフォームにおいて、頑強なtarget enrichmentパフォーマンスをご提供します。 *ThruPLEX DNA-seq Kit is by protected by U.S. Patents 7,803,550; 8,071,312; 8,399,199; 8,728,737 and corresponding foreign patents. Additional patents are pending. •拡張された多様な性能 – up to 96 indexes •最も少ない input からより高いパフォーマンス – 50 pg to 50 ng •速くて簡単なワークフロー – シングルチューブ、または、1ウェルにおいて、 約2時間で、3ステップ。移し変え不要。 •主要な target enrichment プラットホームと 互換性を持つ – Agilent社 SureSelect® 、 Roche社 NimbleGen®SeqCap®EZ、 IDT社 xGen®Lockdown® probes シンプルワークフロー:シングルチューブあるいはウェル、2時間、移し変え不要。 ThruPLEXワークフローの優位性:約2時間で高品質NGSライブラリー わずか50pgの断片化した二本鎖DNAまたはcDNAから始めて、ThruPLEX DNA-seqは、3シンプルステップ(平滑 末端化、アダプターライゲーション、高忠実ライブラリー増幅)で、index化されたライブラリーを作成します。 合理化されたワークフローはサンプルロスを防ぎ、陽性サンプルの同定を増幅し、シングルチューブあるいはウェルに おいて、約2時間でおこなわれます。 WE ARE VERY HAPPY WITH THE RESULTS AND WE PLAN TO START USING THRUPLEX DNASEQ AS A PART OF OUR CAPTURE WORKFLOWS. VARIANTS ARE CALLED WITH VERY EQUAL DISTRIBUTION ONLY A SMALL FRACTION OF LOW/HIGH COVERAGE EXTREMES. IN OUR CLASSIC SAMPLE PREPS, THE COVERAGE IS NOT THIS HOMOGENOUS, AND LOW TAIL IS MUCH LONGER. OUR LAB STAFF WAS PLEASED WITH THE CONVENIENCE OF THE THRUPLEX WORKFLOW LESS MANUAL STEPS. PEKKA ELLONEN, HEAD OF DNA SEQUENCING LABORATORY, INSTITUTE FOR MOLECULAR MEDICINE FINLAND FIMM ThruPLEX DNA-seq テクノロジー Step 1. 断片化された二本鎖DNA(0.05ng~50ng)は、非常に効 率的なプロセスにより修復される。 Step 2. 平滑末端のライゲーションが高効率で生じる。プライマーダ イマー構造とその後のバックグラウンドは、ヘアピンアダプ ターが5’末端をブロックし、一本鎖テールがなくなるので、 抑制される。 Step 3. バックグラウンドはライゲーション後の未使用アダプターを 破壊することによって抑制される。高忠実な増幅は、増幅を 通して生じるエラーを抑制する。 均一なCoverage GCバイアスが最小限なThruPLEX DNA-seq Kit 50 ngの input DNAで、human CHR 1由来のcoverageデータは、 ThruPLEX DNA-seqの優れた パフォーマンスを示す。 50 ng input DNAによる%GCの機能としてのヒトゲノムの相対的なcoverage (左) ThruPLEX DNA-seqは全範囲中、至る所で優れたcoverageがある。 (右) ThruPLEX DNA-seq (goldで示す) はテストされた他のキットと同じくらい 良いか、あるいはそれ以上のパフォーマンス。 最適coverageがこれらのグラフの中で1と等しくなければならないことに注目。 ヒトゲノムのGC構成分布は、赤いバーで表される。 ThruPLEX DNA-seqは他のNGSライブラリー調整キットを上回る NGSライブラリーは、挙げ られたライブラリー調整 キットを用いて、示された DNA量から用意され、 MiSeq, v3 flow cellでシー クエンスされた。 ThruPLEX DNA-seq は、 より少ないinput DNAで、 よりdiverseなライブラ リー(A)を産生した。 他のキットより少しの duplicates(B)であった (25M read pairs)。 他のキットと比べ、より低 くてより幅広い推薦された input幅を備えている(C)。 Ordering Information (価格 ; お問合せください) ThruPLEX® DNA-seq Kit is intended for Research Use Only. It may not be used for any other purposes including, but not limited to, use in diagnostics, forensics, therapeutics, or in humans. ThruPLEX® DNA-seq may not be transferred to third parties, resold, modified for resale or used to manufacture commercial products without prior written approval of Rubicon Genomics, Inc. ThruPLEX DNA-seq Kit is protected by U.S. Patents 7,803,550; 8,071,312; 8,399,199; 8,728,737 and corresponding foreign patents. Additional patents are pending. ThruPLEX® is a registered trademark of Rubicon Genomics, Inc. SureSelect® is a registered trademark of Agilent Technologies. NimbleGen® and SeqCap® are registered trademarks of Roche Diagnostics GmbH. xGen® and Lockdown® are registered trademarks of Integrated DNA Technologies, Inc. Illumina®, Nextera®, and MiSeq® are registered trademarks of Illumina, Inc. NEBNext® Ultra™ is a registered trademark of New England Biolabs. Illumina社 対応次世代シークエンサー HiSeq X Ten / HiSeq X Five HiSeq 4000 / 3000, HiSeq 2500 / 1500, HiSeq 2000 / 1000 NextSeq 500 MiSeq MiSeq FGx Genome Analyzer IIx 〒103-0013 東京都中央区日本橋人形町3-1-11 NNTビル3F リーセンテック株式会社 Tel:03-3660-0131 Fax:03-3660-0133 http://jp.recenttec.com
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