Amira for Life Sciences 3D 可視化・解析ソフトウェア Amira® は、コンピュータトモグラフィや顕微鏡の結果、MRI などの幅広い 3D データを、可視化、加工、評価をするための多角的かつ高性能な 3D ソフトウェ アプラットフォームです。Amira のスピードと柔軟性は分子・細胞生物学から 神経科学や生物工学までの、幅広い専門家たち向けの 3D 画像処理ワークフ ローをサポートします。 拡散テンソルイメージング(DTI)による人間の脳の可視化 画像提供:Prof. A. Brawanski, University Hospital of Regensburg 主な機能 入出力形式 · · Bio -Formats の導入によって 140 以上のファイル形 式に対応 ·· ビットマップ形式: TIFF、BMP、JPEG、PNG、SGI ·· 顕微鏡用規格: FEI、Leica*、Zeiss*、Bio-Rad*、Olympus*、MRC ·· 医用画像規格: DICOM、Analyze ·· 神経科学用規格: Nifti、Hoc、SWC ·· 分子生物学用規格: PDB など多数 ·· 有限要素モデリング用規格: FIDAP*、I-DEAS、Fluent、Abaqus ·· DTI に基づくファイバトラッキング ·· 強力なスクリプトインターフェース ·· 多数のマルチコア対応モジュール 可視化機能 ·· インタラクティブな高品質ボリューム可視化 ·· 直角や斜面などによる断面表示 ·· 同値線と同値面レンダリング ·· マルチチャンネル画像 ·· イメージ合成 ·· ベクトルとテンソルの可視化 ·· 任意の構造によるグリッドに対応 ·· 分子の可視化 ·· 形状モデリングと CAD 用規格: DXF、STL、VRML、Open Inventor ·· 柔軟な Raw データの読み込み ·· ・大規模データ対応 * 読み込みのみ 最大値投影処理と境界面再構築によるネズミの胸部画像 画像提供:Dr. E. Stepina and Dr. P. Hauff, Bayer Healthcare. 解析と計測 ·· 体積、面積および距離の測定 脊髄を抽出したボリュームレンダリング 画像提供:A. Ertürk, Max Planck Institute of Neurobiology. 処理機能 ·· 2D・3D 画像フィルタ · · デコンボリューション、 Z- d r o p 補正( Z 軸に基づく 輝 度 補正) ·· 手動/自動スライス整列 ·· 濃度測定(輝度の統計情報による) ·· フィラメントネットワークの統計情報 ·· 共局在解析 ·· 要素分割、数え上げ、形状解析 ·· 画像、ベクトル場、非構造グリッドでの数値演算 ·· MATLAB® 計算エンジンとの一体化 プレゼンテーション作成 ·· 動画作成 ·· 画像重ね合わせとモーフィング ·· キーフレーム・オブジェクトによるアニメーション ·· スケルトン化や微小管、導管、神経ネットワークのトラッキ ング ·· 単体およびタイル状配置スクリーンへの表示 ·· 手動/自動による分割 ·· 手動での分割用、フィラメントトラッキング用、3D イメー ジ合成と位置調整用の各専用作業ウィンドウ ·· サーフェス生成 ·· FEM グリッド生成 ·· テンソル計算 2 FEI Explore. Discover. Resolve. ·· 能動型/受動型立体画像 ·· 没入型環境への対応 Raw 画像 データ取得 コンピュータトモグラフィ (CT) 磁気共鳴トモグラフィ (MRI) 3D 顕微鏡&トモグラフィ その他形式 画像フィルタ &前処理 Amira 3D 診断 分割 " イメージから理解へ Amira の基本パッケージは、再構築さ れた形状あるいは時系列データを含 む 3D データへの幅広い可視化と加工 機能を提供します。3D での様々な後 処理機能を用いた、高性能で柔軟性 に富む 3D 可視化とシミュレーションの プラットフォームを提供します。 測定&解析 境界面再構築 コミュニケーション Explore. Discover. Resolve. FEI 3 ヘモクロビンの可視化画像提供:S. De Carlo (FEI Company) / NeCEN, Gorlaeus Labs, Leiden University. Amira の基本パッケージは多彩な機能を取り揃えてい ます。さらに、様々な分野における特定のニーズに向 けた拡張パッケージも用意しています。 XBioFormats は生命科学で使われるオリジナルファイ ルフォーマットをサポートするパッケージです。140 を 超えるファイルフォーマットから 3D や 4D 以上のデー タを読み込み(Glencoe Software との提携により BioFormats が機能提供)。これにより、最新の顕微鏡に 使われる専用ファイルフォーマットからデータを直接読 み込むことができます。 XImagePAQ は物体、細胞、組織状物に対する画像強 調処理機能、使いやすく自動化にも対応した分割機能、 さらに様々な測定および数量化機能を提供します。 XNeuro はテンソル可視化、方向性によるカラーマッピ ング(DEC)、ファイバトラッキングを含む拡散テンソル イメージング(DTI)向けの機能を提供します。さらに この拡張機能は、MR や CT による灌流画像の時系列 データ解析にも使用できます。 XMolecular を用いることによって、Amira は完全な分 子可視化ツールとなります。他の分子関連ソフトウェ アと比べて、Amira と XMolecular の組み合わせは、 Amira に備わる最先端の分子の可視化と編集機能にボ クセル表示とデータ処理の可能性をよりシームレスに 統合します。 XMesh は 3D 画像を有限要素法(FE)のための 3D 四面体モデルに変換するために使われます。同様に、 XMesh による結果表示では高性能なスカラー、ベク トルおよびテンソル場の表示機能モジュールを提供し ます。 XWind は生体力学などのための有限要素解析(FEA) や数値流体力学(CFD)シミュレーションによる数値解 の解析および可視化が可能です。また、XWind は一 般的なサードパーティソルバとのデータの入出力を実現 し、Amira XMesh の機能を補強でき、またシミュレー ション結果により高度な後処理を施すこともできます。 XL Volume はアウトオブコアによるデータ管理を効果 的に用いることにより、メモリ容量を超える画像の大規 模データの可視化をサポートします。この機能によって、 直角や斜面による断面表示やボリュームレンダリング、 同値面生成などの主な基本モジュールが引き続き大規 模データで利用できます。 XPand は C++ を利用した独自の可視化、データ処理 やファイル入出力のプログラムモジュールを作成できま す。この機能には手軽に使える入門用のウィザードも 含まれています。 XScreen はタイル状配置された大型ディスプレイや没 入型仮想現実環境での高機能な可視化に必要な拡張 機能です。この機能は 3D ナビゲーションデバイスやマ ルチスレッド処理、分散レンダリングをサポートします。 AmiraはWindows®、Mac OS®、Linuxでご利用いただけます。 本社(米国) 電話 +1 503 726 7500 Visualization Sciences Group(日本オフィス) 電話 03-3740-0970 ©2016 当社は常に製品の改良に努めており、仕様は予告なく変更されることがあります。 FEI および FEI のロゴ、Amira、Avizo、Open Inventor Avizo は、FEI カンパニーおよび関連会社の登録商標です。 その他の商標については、各所有者に帰属します BR0059-JA-05-2016 より詳しくはAvizo3D.com へ [email protected]
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