アジレント・テクノロジー 次世代シーケンサー用ソリューション SureSelect Coding + プロモーター + エンハンサー 113.7 Mb の領域をキャプチャ V5 + Regulatory 次 世 代 シー ケン サ によるエクソーム 解 析 の 世 界 標 準、アジレント・テ クノロジー の SureSelect All Exon V5 の Coding 領域にプラスして、Regulatory 領域を同時にキャプチャ するデザインです。プロモーターや一 部のエンハンサー領域を、Coding 領域とともに Deep シーケンスすることにより、疾患研究に新しい知見をもたらす可能性があります。 また RNA-Seq や ChIP-Seq と組み合わせることで、制御領域の変異が遺伝子発現に与え る影 響をより詳 細に調べることができます。Coding 領域をキャプチャするプローブと、 Regulatory 領域をキャプチャするプローブのブレンド比を最適化し、より均一なカバレッジ を達成しています。 特 長 ● 定評あるエクソンシーケンスの V5 のターゲット領域に加えて、 プロモーターと一部のエンハンサー領域をキャプチャするデザイン。 ターゲット領域のサイズは、113.7 Mb ● イルミナシーケンサ、ライフテクノロジーズ Ion Proton 対応 ● 必要なゲノム DNA 量は 50 ng ∼ 3 µg Regulatory 領域の Deep シーケンスが可能に! Total Target Size:113.7 Mb Selected Regulatory Regions Coding Regions Human All Exon V5 Target Size 50 Mb # Genes 21,522 # Targeted Exons 357,999 • Promoter TSS~1 kb(17.1 Mb) • Selected Enhancer(40.8 Mb) • RegulomeDB Variants Category1 デザイン監修: (5.8 Mb) 東京大学大学院新領域創成科学研究科 鈴木 穣先生 イルミナ HiSeq2500を用いて、1レーン さらに本データを Coding 領域の 50 Mb と、追加された Regulatory 領域の 63.7 4 検体で癌セルラインサンプルをラン した例です。113.7 Mb の全ターゲッ トの98%以上が5 x、94%前後が10 x、 80% 前後が 20 x でカバーされてい Mb に分けて解析した例です。Coding 領域についてはターゲットの 90% 以上 が 20 x と高いカバレッジを示しています。Regulatory 領域についても、94% 以上が 10 x、80% 前後が 20 x でカバーされています。 ます。 図1 全ターゲット領域(113.7 Mb)のカバレッジ 図2 Coding 領域(50 Mb)のカバレッジ 図3 Regulatory 領域(63.7 Mb)のカバレッジ 型番 プロトコル 品名 931071 マニュアル用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 16 反応 931072 マニュアル用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応 931073 自動化用 SureSelect XT Human All Exon V5+Reg. キャプチャライブラリ, 96 反応 キット以外に必要になるものについては以下のウェブページの " サポート " の項をご参照ください。 http://AgilentGenomics.jp 販売店 [ お問い合わせ窓口 ] アジレント・テクノロジー株式会社 本社 / 〒 192-8510 東京都八王子市高倉町 9-1 ●カストマコンタクトセンタ 0120-477-111 mail:email_ [email protected] ※本資料に記載の情報、説明、製品資料等は 予告なしに変更されることがあります。 ※本資料記載の製品は全て研究用です。 その他の用途にご利用いただくことはできません。 www.agilent.com/chem/jp © Agilent Technologies, Inc. 2014 Printed in Japan. Jul. 01. 2014
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