制度の紹介等市街地再開発事業等の補助対象事業における消費税相当額の取り扱いについて国土交通省近年、市街地再開発事業や優良建築物等整備事２．本件通知の対象業等の民間事業者等に対する間接補助事業におけ本件通知の対象となるのは、民間事業者などのる消費税の取扱について、会計検査院より指摘を消費税法の定める課税事業者（消費税を納める義受ける事例が散見されるようになったため、住宅務が免除されることとなる小規模事業者が、届出局では消費税の取扱に関するルールの明確化を図により課税事業者となる場合を含む。）が補助対るとの趣旨で、「住宅局所管補助事業等における象事業を実施する場合である。消費税相当額の取扱について」（平成17年９月１市街地再開発組合などの消費税法別表第３に列日付け国住総第37号国土交通省住宅局長通知）を挙された法人及び地方公共団体（特別会計を設け発出したところである。本稿では、当該通知の内て事業を行う場合に限る。）の消費税の仕入控除容を紹介する。税額の計算においては、一般の事業者とは異なり、なお、都市・地域整備局所管の市街地再開発事補助金、交付金等の対価性の無い収入を「特定収業等についても平成18年３月６日付け事務連絡に入」として、これにより賄われる課税仕入れ等のより同様の取扱となることとされている。消費税額（特定収入に係る課税仕入れ等の消費税額）を仕入控除税額から控除するという調整を行１．本件通知の趣旨市街地再開発事業等の補助対象事業を実施した施行者については、当該施行者が消費税法の課税うこととなっている（消費税法第60条及び消費税法施行令第75条第３項）ため、従前通り補助対象額に消費税相当額を含めても差し支えない。事業者である場合には、保留床の処分により得らまた、施行者等が自ら住宅の賃貸を行う場合にれる売上が課税売上となること等から、補助対象は、家賃は非課税（消費税法第６条別表第１第13 施設の取得に係る消費税を、建築業者等に支払う号）となるため、消費税相当額を補助対象事業費ものの、その後に消費税の確定申告において当該に加えて差し支えない。但し、住宅の賃貸期間が消費税相当額を仕入れに係る消費税額として消費１ヶ月に満たない場合は除かれる（消費税法施行税納付額から控除できる（還付を受ける）場合が令第16条の２）。ある。なお、賃貸住宅事業を行う場合であっても、当本来、費用として支払う（負担する）消費税は該事業者が例えば駐車場経営など賃貸住宅以外の補助対象となるものであるが、上記のように補助事業につき消費税の確定申告を行う場合には、課対象事業における消費税相当額が仕入税額控除の税売上の割合に応じて、当該賃貸住宅の取得（仕対象となる場合には、施行者は実質的に消費税相入）に係る消費税相当額についても控除が受けら当額を負担しないこととなるため、結果として当れる場合があるため、留意されたい。該仕入控除税額を補助対象として交付された補助金が消費税として使われずに施行者に滞留するこ３．交付決定等の考え方ととなる。補助金とはあくまで費用として負担す一般的に「実質的に負担しないこととなる消費るものに対して補助するものであるという補助金税相当額」が明らかになる時期は個々の事業によ本来の趣旨に鑑み、実質的に負担しないものにつり様々である。そこで交付決定等の手続きに際しいては補助対象となり得ない。このため、交付決ては、それぞれの事業の中身・性格・時期等に応定等の取り扱いについては留意する必要がある。じて、下記の通り対応されたい。 ―2― 市街地再開発 2006年６月第434号 1 交付決定前に消費税仕入控除税額※が明らか 3 補助金の額の確定後、消費税の申告により消になる場合費税仕入控除税額が明らかになる場合費用として使われない補助金が施行者に滞留す上記12に拠りがたい場合には、まず、交付決ることを防ぐため、交付決定は、消費税仕入控除定については、返還条件（精算条件）を付したう税額を除いた額について行う。えで消費税仕入控除税額を含めて行う。実績報告及び補助金の額の確定についても、そのまま消費 2 実績報告の段階で消費税仕入控除税額が明ら税仕入控除税額を含めて行い、その後、消費税仕かになる場合入控除税額が確定した段階でその額の返還（精算）交付決定は、予算の限られた補助金の効率的執を行う。行の観点から、その時点で合理的に予想しうる消費税仕入控除税額の見込額を除いた額で行う。この後の実績報告及び補助金の額の確定においては、確定した消費税仕入控除税額を除いて行う。制度に関するご相談や制度についてご不明な点がございましたら、国土交通省都市・地域整備局市街地整備課、住宅局市街地建築課若しくは最寄りの地方整備局建政部等の都市・住宅整備担当課までお問い合わせください。 ※補助対象事業費に含まれる消費税相当額のうち、消費税法の規定により仕入に係る消費税額として控除できる部分の金額に補助率を乗じて得た金額市街地再開発 2006年６月第434号 ―3― （参考）平成17年９月１日国住総第37号 68 各都道府県知事各指定都市の長宛て国土交通省住宅局長住宅局所管補助事業等における消費税相当額の取扱について補助事業等の事業主体が、補助事業等を実施する過程において消費税法（昭和63年法律第108号）に規定する課税仕入れを行うときには、仕入れ先に対し消費税相当額を含む支払を行うが、事業主体の性格等によっては、確定申告の際に当該消費税相当額を仕入れに係る消費税額として税務署に納める消費税納付額から控除できる場合がある。本来、費用として支払う消費税は補助対象となるものであるが、補助事業における消費税相当額が仕入税額控除の対象となる事業主体に対する補助金の交付決定等の取扱は、下記によることとするので、遺憾のないよう周知徹底を図られたい。また、補助金以外の交付金等についても、該当するものがある場合には、これに準じて取り扱うこととされているので、御了知願いたい。記１．補助金の交付決定前の段階で当該補助金に係る消費税仕入控除税額（補助対象事業費に含まれる消費税相当額のうち、消費税法の規定により仕入れに係る消費税額として控除できる部分の金額に補助率を乗じて得た金額。以下同じ。）が明らかになる場合交付決定は、消費税仕入控除税額を除いた額について行う。２．補助事業の実績報告の段階で消費税仕入控除税額が明らかになる場合 1 交付決定は、消費税仕入控除税額の見込額を除いた額について行う。 2 実績報告及び補助金の額の確定は、確定した消費税仕入控除税額を除いた額について行うものとする。３．補助金の額の確定後、消費税の申告により消費税仕入控除税額が明らかになる場合 1 交付決定は、返還条件を付した上で消費税仕入控除税額を含めて行う。 2 実績報告及び補助金の額の確定は、消費税仕入控除税額を含む額について行う。 3 消費税仕入控除税額が確定した段階でその額を返還する。附則１．補助金の交付決定を変更する場合には、上記１から３までの区分を変更して差し支えない。２．消費税法別表第３に列挙された法人については、特定収入割合が100分の５を超える場合、消費税税相当額を補助対象事業費に含めても差し支えない（消費税法第60条及び消費税法施行令第75条第３項）。３．施行者等が自ら行う住宅の貸し付けは、非課税のため、消費税相当額を補助対象事業費に含めて差し支えない（消費税法第６条別表第１第13号）。但し、住宅の貸付けに係る期間が一月に満たない場合（消費税法施行令第16条の２）を除く。なお、貸付のための住宅の取得であっても、当該事業施行者が他の取引きにより消費税の確定申告を行う場合においては、課税売上割合に応じて、当該住宅の取得に係る消費税相当額についても控除が受けられることがあるので注意されたい。 ―4― 市街地再開発 2006年６月第434号